Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc07g008450.3.1
CDS Infomation	ARM repeat superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT4G38120.3)
Sequence	ATGAGTTCTAGTTCTTGGCCTGTTTTATTTGACTCCTTGAGGAGCATAGTTGAAACTCTT GAGAAAGCTAATACTGCTGATGTTTCTGTGGCTAGAGCCATAAAAGAATGTTCTGAGACT TCAAGATGTCTTTTGGCTGCAACAGAGAGAACAGGTTTGTTAGCTGAACACATACAACTG CTAAATTTCCTGCTCAGAATTGTTTCCAGTCTTCAACCAGAGGCAAGTAATTTGTCAAAT TCAAGAGGCAAGAAAAACATATCTGGTTACAACAGTTTATGGGAAGTTGAAATAGTAGCT TTTACTATGATTGGCGAACTATATTCGAGATATGGATCTTCTTTACCAGTTGACACTTGG CAATCAACAATTGAGATCCTTAGAAACATTTTGGAAACGGTGGCATCTAAGGGGCTTGTT AAGGAAGACGGAGCCACTGCCCGGTTTTATACCTCACTTCTACATTGTCTGCACTTGGTT CTTACAGATTCCAAGGGACCGTTGTCTGGCCATGTGGCAGGTCTTGTTGTGGCTTTGAGG AATTTTATTCATTATGGCCTTGCTAATAAATCACACAGTATGATTGCCATCACTGATAAG AAGAAAATTACTTCTGTGAGCACGAAGACAGATTTGACTGTATCAACAACATCACAAACG GGCCGATATATGCCTCCCCACTTACGGAATAAAAATCTGAAAAATTTTCAGTTGAAGGAT GAGAAATCATTAACGATGTCATCTGATTCAGAAAACAGCGATAGTGATGGATCAGGGAGG GGTACTTGCAATGCACCCTATGGAAAGACTAGATTAGCTGCGATCATTTGTATCCAGGAC CTTTGCCTAGCGGATCCAAAATCATTTACAGCTCAGTGGACAATGCTCTTACCATCTAGT GATGTCCTACAGCCAAGGAGGTATGAGGCAACACTGATGAGTTGTTTGCTGTTCGATCCA TTTCTTAAGGCACGGGTTGCAGCTGCCTCTGCCATCAGGGCTATGCTGGATGCTCCGTCC TCTGTTTTTCTTCAGGTTGCAGAATTCAAGGAGTCAGCTAAATGTGGGTCATTTATGGCA CTATCCAGCTCTCTTGGACAGATTTTAATGCAGTTGCACTCAGGGACTTTATACTTAATC AAACGTGAAACACACAGTGGATTGCTAGCGTCCTTGTTCAAAATTTTGATGCTTTTGATA TCATCTACACCGTATTCTAGAATGCCTCGTGAACTGTTGCCAACAGTTCTCACTTCTATT CAAGTTAGGATTGAAGAAGGCTTTTTGTCCAGAAGTGACCAGAATATCTTATTGGCAACC GCAATCAACTGCTTAAGTGCAGCCTTGTCAGTCTCACCACTTTCAATTGAAGTCAAAGAT ATGCTTGTGGCAGAAGTATCAGCAGGTTCAATCAGTATTAAATCGAAGTCGGGCATTTTG TTTACGTTGTTTCGGTATTGTGACCCAGGAGTAAGCCCACCAGTAGGCTTTGAGGCACTT CAGGCCGTCAGAGCTGTGGCACACAACTATCCTAGCGTGATGATCCTGTGTTGGGAAAAG ATTTCCCTTTTAGTTCATGGAGTCTTGACCTCCTCTTCTGAGATAAGGTCTTGGAGGGAT AATGTTGGAAACTCAAATGAGCCAATTGGAGACAAAGTCATAACCGCTTCAATCAAGGTG TTGGATGAATGTCTTCGTGCAATCTCTGGATTTAAGGGAACTGAAGATCTTCCGAGTGAT ATATCACTTGATAGCCCCTTTACGTCTGACTATGTCAAATCAAAAACAATCTCATCGGCT CCATCTTATGGGCCACATGATTGTGTAGTAAATAGTGATGGAGCTGAAAAGCTGTCAGGA AGTGAGCAGTGGTTGGAAGCAATAGTTCGGCATTTGCCTCTTATACTTCAGCATTCTTCT CCAATGGTGAGGGCTGCATCAGTTACTTGTTTTGCTGGAATTACTTCCACAGTTTTCTTT TCTCTACCAAAGGATAAACAAGACTTCATCATGAGCTCTTGTGTTAAAACTGCAAAAGGT GATGAGGTTCCGAATGTTAGGTCAGCTGCTTGTCGTGCTATTGGTGTAATTGCTTGTTTT CCACACATTTTTCAAAGTGCAGAGATTTTCGACAAGTTCATTTCTCCTGCTGTGGACAAC AGTCGTGATTCCTCAGTGTCGGTTCGCATAACAGCTTCATGGGCTTTAGCTAATATATGT GATGCACTTCGCCACCATGTTGATGTACATGGATTTGAGAAATTCTCTTCAGTGAGCTCA CAGTCGATTTCCTTGCTGATTGACTGTGCTTTACAACTTACGAACGATAATGACAAGGTT AAAGCAAATGCTGTGAGAGCATTGGGTAACCTTTCAAGAGTTGTTAGGTTTTCAAGTCAA TCATTTGCTTATGACAGGCAAGCAGATTCAATGGTCGTATCTTCTAGGGGAAAGCCCACA AAAGGTTTGTCCATTAGCGAGGATCTGGGAGAAAGTCGAAGTTCATGTAACGCTTACTTG GAAAGTTCTAAATGGCTCGAGAAGATGGTGCAAGCATTTATTTCTTGTGTTACAACTGGA AACGTTAAGGTACAGTGGAATGTTTGCTATTCACTTAGCAACTTGTTTTCCAATCCAACG TTGAAGCTGGAAAACATGGTCTGGGCATCATCAGTTTTTAGCATTCTTTTGCTGCTCCTC CGTGATTCCTCCAATTTTAAGATTAGGATACAAGCAGCTGCAGCTTTGGCTGTTCCAGCA ACCTTAAATGATTATGGCAGATCATTCTTTAGTGTCCTTCAAGGTGTGCAGCATGTTGTC GAGAGTCTCAGTTCTGATGAGATATCGTCACCATCAAATTTGAAATATCGATTGGCGCTT GAAAAGCAGCTGACCTCAACTATGCTGCATTTGCTTGGCCTCACTTCCAAAACAGATGAT CGTCATGTCCATGAGTTCCTAATGAAAAAATCATCCTTCTTCGAGGAGTGGCTTAAGTTG GTCTGCATGTCTCTTGAGAAATCACCTAACCAGTTTGAGGCTGAATACTACTCTTCTGTA AACCACAAGAAAGATGTAATATTCAGAGCGGTTAGGTCACTTATTGAGGTGTATGAAGTG CATGATCTTCACGCTGTTGTACAAAGGTTTCACAAACTGTCCAACATCCTATAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc07g008450.3.1
PEP Infomation	ARM repeat superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT4G38120.3)
Sequence	MSSSSWPVLFDSLRSIVETLEKANTADVSVARAIKECSETSRCLLAATERTGLLAEHIQL LNFLLRIVSSLQPEASNLSNSRGKKNISGYNSLWEVEIVAFTMIGELYSRYGSSLPVDTW QSTIEILRNILETVASKGLVKEDGATARFYTSLLHCLHLVLTDSKGPLSGHVAGLVVALR NFIHYGLANKSHSMIAITDKKKITSVSTKTDLTVSTTSQTGRYMPPHLRNKNLKNFQLKD EKSLTMSSDSENSDSDGSGRGTCNAPYGKTRLAAIICIQDLCLADPKSFTAQWTMLLPSS DVLQPRRYEATLMSCLLFDPFLKARVAAASAIRAMLDAPSSVFLQVAEFKESAKCGSFMA LSSSLGQILMQLHSGTLYLIKRETHSGLLASLFKILMLLISSTPYSRMPRELLPTVLTSI QVRIEEGFLSRSDQNILLATAINCLSAALSVSPLSIEVKDMLVAEVSAGSISIKSKSGIL FTLFRYCDPGVSPPVGFEALQAVRAVAHNYPSVMILCWEKISLLVHGVLTSSSEIRSWRD NVGNSNEPIGDKVITASIKVLDECLRAISGFKGTEDLPSDISLDSPFTSDYVKSKTISSA PSYGPHDCVVNSDGAEKLSGSEQWLEAIVRHLPLILQHSSPMVRAASVTCFAGITSTVFF SLPKDKQDFIMSSCVKTAKGDEVPNVRSAACRAIGVIACFPHIFQSAEIFDKFISPAVDN SRDSSVSVRITASWALANICDALRHHVDVHGFEKFSSVSSQSISLLIDCALQLTNDNDKV KANAVRALGNLSRVVRFSSQSFAYDRQADSMVVSSRGKPTKGLSISEDLGESRSSCNAYL ESSKWLEKMVQAFISCVTTGNVKVQWNVCYSLSNLFSNPTLKLENMVWASSVFSILLLLL RDSSNFKIRIQAAAALAVPATLNDYGRSFFSVLQGVQHVVESLSSDEISSPSNLKYRLAL EKQLTSTMLHLLGLTSKTDDRHVHEFLMKKSSFFEEWLKLVCMSLEKSPNQFEAEYYSSV NHKKDVIFRAVRSLIEVYEVHDLHAVVQRFHKLSNIL*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc07g008450.3.1
Transcript Infomation	ARM repeat superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT4G38120.3)
Sequence	ATATTAGATTTTTAATAAAAAGTCGAATTAAGAATTTGAATACATTTAAGATTTTAGGAA TAAAACTAACATTTCAAGTCGAATTTAATCGATTAATACTTCTTCAGTTCTTAAAAAATT AAATCAATGAAGTTGAATCTGTCCTCCTCTTGAGCACGCTGCCACTTCAGTTTCACGTCT CTCTAAAGACCACCGCAACTCCGCCATAGCCAAGAGTGGAGTTGTACAGAATCTCCGTTT TCTCCTTTCTCTAATTCTCTCTTTAACTACCAGATCCAGGTAACAAACGAAGGGCACCTG CGAGGGTTGGGTTGCTCTTTTGATGTTTATTTAATAGTTGCTGGAATAAGTCAATTATAA TTCTGACGTAAATTGGAGCAACTTCACCGGCCAGTTAGGGTGATTATCACTTAGGTGAAG AAGAAGTAGTGCTGAACGAATTTGAATTCTGGTCGGATTGTTTCGAACTTGGCTACAATG AGTTTGGGCTTGTTGGGGACTTTATAAGATATACTATGCCAATAATCCTGATTTTTGAAA AATGAGTTCTAGTTCTTGGCCTGTTTTATTTGACTCCTTGAGGAGCATAGTTGAAACTCT TGAGAAAGCTAATACTGCTGATGTTTCTGTGGCTAGAGCCATAAAAGAATGTTCTGAGAC TTCAAGATGTCTTTTGGCTGCAACAGAGAGAACAGGTTTGTTAGCTGAACACATACAACT GCTAAATTTCCTGCTCAGAATTGTTTCCAGTCTTCAACCAGAGGCAAGTAATTTGTCAAA TTCAAGAGGCAAGAAAAACATATCTGGTTACAACAGTTTATGGGAAGTTGAAATAGTAGC TTTTACTATGATTGGCGAACTATATTCGAGATATGGATCTTCTTTACCAGTTGACACTTG GCAATCAACAATTGAGATCCTTAGAAACATTTTGGAAACGGTGGCATCTAAGGGGCTTGT TAAGGAAGACGGAGCCACTGCCCGGTTTTATACCTCACTTCTACATTGTCTGCACTTGGT TCTTACAGATTCCAAGGGACCGTTGTCTGGCCATGTGGCAGGTCTTGTTGTGGCTTTGAG GAATTTTATTCATTATGGCCTTGCTAATAAATCACACAGTATGATTGCCATCACTGATAA GAAGAAAATTACTTCTGTGAGCACGAAGACAGATTTGACTGTATCAACAACATCACAAAC GGGCCGATATATGCCTCCCCACTTACGGAATAAAAATCTGAAAAATTTTCAGTTGAAGGA TGAGAAATCATTAACGATGTCATCTGATTCAGAAAACAGCGATAGTGATGGATCAGGGAG GGGTACTTGCAATGCACCCTATGGAAAGACTAGATTAGCTGCGATCATTTGTATCCAGGA CCTTTGCCTAGCGGATCCAAAATCATTTACAGCTCAGTGGACAATGCTCTTACCATCTAG TGATGTCCTACAGCCAAGGAGGTATGAGGCAACACTGATGAGTTGTTTGCTGTTCGATCC ATTTCTTAAGGCACGGGTTGCAGCTGCCTCTGCCATCAGGGCTATGCTGGATGCTCCGTC CTCTGTTTTTCTTCAGGTTGCAGAATTCAAGGAGTCAGCTAAATGTGGGTCATTTATGGC ACTATCCAGCTCTCTTGGACAGATTTTAATGCAGTTGCACTCAGGGACTTTATACTTAAT CAAACGTGAAACACACAGTGGATTGCTAGCGTCCTTGTTCAAAATTTTGATGCTTTTGAT ATCATCTACACCGTATTCTAGAATGCCTCGTGAACTGTTGCCAACAGTTCTCACTTCTAT TCAAGTTAGGATTGAAGAAGGCTTTTTGTCCAGAAGTGACCAGAATATCTTATTGGCAAC CGCAATCAACTGCTTAAGTGCAGCCTTGTCAGTCTCACCACTTTCAATTGAAGTCAAAGA TATGCTTGTGGCAGAAGTATCAGCAGGTTCAATCAGTATTAAATCGAAGTCGGGCATTTT GTTTACGTTGTTTCGGTATTGTGACCCAGGAGTAAGCCCACCAGTAGGCTTTGAGGCACT TCAGGCCGTCAGAGCTGTGGCACACAACTATCCTAGCGTGATGATCCTGTGTTGGGAAAA GATTTCCCTTTTAGTTCATGGAGTCTTGACCTCCTCTTCTGAGATAAGGTCTTGGAGGGA TAATGTTGGAAACTCAAATGAGCCAATTGGAGACAAAGTCATAACCGCTTCAATCAAGGT GTTGGATGAATGTCTTCGTGCAATCTCTGGATTTAAGGGAACTGAAGATCTTCCGAGTGA TATATCACTTGATAGCCCCTTTACGTCTGACTATGTCAAATCAAAAACAATCTCATCGGC TCCATCTTATGGGCCACATGATTGTGTAGTAAATAGTGATGGAGCTGAAAAGCTGTCAGG AAGTGAGCAGTGGTTGGAAGCAATAGTTCGGCATTTGCCTCTTATACTTCAGCATTCTTC TCCAATGGTGAGGGCTGCATCAGTTACTTGTTTTGCTGGAATTACTTCCACAGTTTTCTT TTCTCTACCAAAGGATAAACAAGACTTCATCATGAGCTCTTGTGTTAAAACTGCAAAAGG TGATGAGGTTCCGAATGTTAGGTCAGCTGCTTGTCGTGCTATTGGTGTAATTGCTTGTTT TCCACACATTTTTCAAAGTGCAGAGATTTTCGACAAGTTCATTTCTCCTGCTGTGGACAA CAGTCGTGATTCCTCAGTGTCGGTTCGCATAACAGCTTCATGGGCTTTAGCTAATATATG TGATGCACTTCGCCACCATGTTGATGTACATGGATTTGAGAAATTCTCTTCAGTGAGCTC ACAGTCGATTTCCTTGCTGATTGACTGTGCTTTACAACTTACGAACGATAATGACAAGGT TAAAGCAAATGCTGTGAGAGCATTGGGTAACCTTTCAAGAGTTGTTAGGTTTTCAAGTCA ATCATTTGCTTATGACAGGCAAGCAGATTCAATGGTCGTATCTTCTAGGGGAAAGCCCAC AAAAGGTTTGTCCATTAGCGAGGATCTGGGAGAAAGTCGAAGTTCATGTAACGCTTACTT GGAAAGTTCTAAATGGCTCGAGAAGATGGTGCAAGCATTTATTTCTTGTGTTACAACTGG AAACGTTAAGGTACAGTGGAATGTTTGCTATTCACTTAGCAACTTGTTTTCCAATCCAAC GTTGAAGCTGGAAAACATGGTCTGGGCATCATCAGTTTTTAGCATTCTTTTGCTGCTCCT CCGTGATTCCTCCAATTTTAAGATTAGGATACAAGCAGCTGCAGCTTTGGCTGTTCCAGC AACCTTAAATGATTATGGCAGATCATTCTTTAGTGTCCTTCAAGGTGTGCAGCATGTTGT CGAGAGTCTCAGTTCTGATGAGATATCGTCACCATCAAATTTGAAATATCGATTGGCGCT TGAAAAGCAGCTGACCTCAACTATGCTGCATTTGCTTGGCCTCACTTCCAAAACAGATGA TCGTCATGTCCATGAGTTCCTAATGAAAAAATCATCCTTCTTCGAGGAGTGGCTTAAGTT GGTCTGCATGTCTCTTGAGAAATCACCTAACCAGTTTGAGGCTGAATACTACTCTTCTGT AAACCACAAGAAAGATGTAATATTCAGAGCGGTTAGGTCACTTATTGAGGTGTATGAAGT GCATGATCTTCACGCTGTTGTACAAAGGTTTCACAAACTGTCCAACATCCTATAACAGGG TTTCCAGGTTTCCAGTTTTTGGTTCCTACTTTTTCTTGGTTGGTCTGGTGTGGATTTTCT CCAGCTGCTGCTTCTTGAACTGGTTAGCCCTGTCCCAGTCAAGGCTGTACCTTAGCTCTG CAATTTCACCATTTGACCCTCTTGATCGAATCACACCACTGACAACCGTAGAATAGTCTG CCGAACAAAGTGGTGGTTTCTTTGTATGTGCATTTCCATCAGAAGACCCAAATGGTTGCT GTCAGCGGAAGGATGAACACAAAAGCTTCCAATGATTACTTGTAGATTAGTCTGCGAATG AAGTGATCATCTTCTTTGAACGTGCATTTCCATGGACGTTGTGAATGGTAGCAATTAGCA AAAGGACGAGAAACTCGGTATGATAACCTGTAAATTAGCCTGATGAACAACTTGATAGTG TTATCATTGGTTGTGCATCTCACCAGTCTCTTAAATGGTCCTAGCAGCAGGATGAGCAGA CTATTTTCCCCAGTACCCTCTGGTTTTCAACTTGCTCAAAACTCTATTAAGCCTGGAGCA ATATGTTGTTGAGTCATCTGGTGTTTATTGTGCTTTCTGTATAACAATGTGAATTCCCAT TCTCTGTGCAAGACATTTTGACAGATTGTAATTATAGGCAGAATTACTTAACTGGCATAT TGTTAAAACTTGAACGACTCGCGTCGTTTAAATTTTAAATGTTTGGGTTAAATATTAAGC TTGGATAGTCCCAACTCAGACCCATATATTTGAAATTCAAAAACTTACAACATGATTATT CAGATACTTCCAAAGTGCCATACTCTGATT