Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc07g007030.1.1
CDS Infomation	Transmembrane 9 superfamily member (AHRD V3.3 *** A0A0V0IRK7_SOLCH)
Sequence	ATGAGATCTTTTGAGAAATTCAAGATTTGGGTTTTGTTAATCTGCTTGGTATCTGAATTG TGTTATGGGTTTTATCTGCCTGGAAGTTACCCTCATAAATATGGGGTTGGTGATTTGTTG AATGTTAAGGTGAATTCATTGACTTCAATTGACACTGAGTTGCCTTATAGTTATTATAGT TTACCTTTTTGCCAACCACAAGAGGGTGTGAAGGATAGTGCTGAGAATCTTGGTGAGCTT CTTATGGGTGATAGAATTGAGAATTCTCCTTATAGGTTTAAGATGTATACTAATGAGACT GAGATTTTCATGTGTCAAACTAAACCTTTGTCTGGCGAGGAGTTTAAGCTTTTGAAGAAG AGGATTGATGAGATGTATCAAGTTAATTTGATTCTTGATAATTTGCCTGCTATTCGATAT ACAAGGAAGGAAGGTTATTTCTTGCGGTGGACTGGTTATCCGGTTGGGATCAAGGTTCAA GATGCGTATTACGTGTTTAATCACTTGAAGTTTACGGTTCTTGTTCATAAGTATGAAGAG ACCAATGTGGCTCGGGTTATGGGTACTGGGGATGGAGCTGAGGTGATCTCTACAGTTGGA AAGGATGGATCTGAGGAACCTGGTTATATGGTTGTTGGGTTTGAGGTTGTTCCTTGTAGT GTTCAACATGCTCCTGATTCGGCAAAGAACTTGAAAATGTACAATAAGTACCCGAATCCA ATTAAGTGCGACCCAACAACTGTTGCCATGGCTATTAAAGAAAATGAGCCTGTTTCGTTT ACTTATGAGGTGAACTTTGTGGAAAGTGACATTAAGTGGCCATCAAGATGGGATGCGTAT TTGAAGATGGAAGGTGCAAAGGTGCACTGGTTCTCTATCCTTAACTCCCTTATGGTGATC ACTTTCTTGGCTGGAATTGTGCTTGTAATCTTCTTGAGGACTGTCAGGCGGGATCTTACA AGGTATGAGGAACTTGACAAAGAGGCTCAAGCTCAGATGAATGAGGAGTTATCCGGGTGG AAACTTGTGGTGAGTGATGTTTTCAGGGCTCCAAGTAATCCAGCACTTTTGTGTGCGATG GTTGGAGATGGGGTTCAAATTCTAGGGATGGGTGTTGTGACTATCATGTTTGCTGCCCTC GGATTTATGTCCCCAGCTTCTCGTGGAACATTGATTACTGGTATGCTATTCTTCTATATG ATTCTTGGTATTGCAGCTGGTTATGTTGCTGTTCGCCTCTGGAGGACAATCTTCTGTGGC GATCACAAGGGTTGGATTTCAGTCTCATGGAAAGCTGCTTGTTTCTTCCCTGGAATTGCT TTTCTCATTCTAACCACATTGAACTTCCTGCTATGGGGTAGTCACAGCACAGGGGCCATA CCATTTTCTCTGTTTGTTGTCCTCATTTTACTTTGGTTCTGCATTTCCGTTCCTCTAACC CTGGTCGGTGGTTATTTCGGGGCAAAGGCTCCTCACATTGAATACCCAGTCCGAACCAAC CAGATCCCCCGTGAAATCCCACCACAAAAATATCCATCTTGGCTTTTAGTTTTGGGTGCA GGCACCCTTCCTTTCGGTACTCTGTTCATTGAGCTCTTCTTCATCATGTCAAGTCTCTGG ATGGGTCGTGTCTACTATGTCTTTGGCTTCCTCCTCATTGTCATGATCCTTCTCGTCGTT GTCTGTGCTGAGGTGTCTCTTGTTCTTACTTACATGCATCTTTGTGTGGAGGACTGGAAA TGGTGGTGGAAATCCTTCTTTGCCTCCGGATCAGTTGCTATATACATTTTCCTCTATTCC GTTAACTATCTAATCTTCGATCTCAAGAGCTTGAGCGGGCCTGTTTCTGCTACCCTTTAC CTTGGATATTCCCTCTTTATGGTACTTGCCATCATGCTCGCGACAGGCACAGTCGGGTTT CTTTCCTCCTTCTGGTTTGTACATTACTTGTTCTCTTCAGTGAAGCTGGATTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc07g007030.1.1
PEP Infomation	Transmembrane 9 superfamily member (AHRD V3.3 *** A0A0V0IRK7_SOLCH)
Sequence	MRSFEKFKIWVLLICLVSELCYGFYLPGSYPHKYGVGDLLNVKVNSLTSIDTELPYSYYS LPFCQPQEGVKDSAENLGELLMGDRIENSPYRFKMYTNETEIFMCQTKPLSGEEFKLLKK RIDEMYQVNLILDNLPAIRYTRKEGYFLRWTGYPVGIKVQDAYYVFNHLKFTVLVHKYEE TNVARVMGTGDGAEVISTVGKDGSEEPGYMVVGFEVVPCSVQHAPDSAKNLKMYNKYPNP IKCDPTTVAMAIKENEPVSFTYEVNFVESDIKWPSRWDAYLKMEGAKVHWFSILNSLMVI TFLAGIVLVIFLRTVRRDLTRYEELDKEAQAQMNEELSGWKLVVSDVFRAPSNPALLCAM VGDGVQILGMGVVTIMFAALGFMSPASRGTLITGMLFFYMILGIAAGYVAVRLWRTIFCG DHKGWISVSWKAACFFPGIAFLILTTLNFLLWGSHSTGAIPFSLFVVLILLWFCISVPLT LVGGYFGAKAPHIEYPVRTNQIPREIPPQKYPSWLLVLGAGTLPFGTLFIELFFIMSSLW MGRVYYVFGFLLIVMILLVVVCAEVSLVLTYMHLCVEDWKWWWKSFFASGSVAIYIFLYS VNYLIFDLKSLSGPVSATLYLGYSLFMVLAIMLATGTVGFLSSFWFVHYLFSSVKLD*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc07g007030.1.1
Transcript Infomation	Transmembrane 9 superfamily member (AHRD V3.3 *** A0A0V0IRK7_SOLCH)
Sequence	ATGAGATCTTTTGAGAAATTCAAGATTTGGGTTTTGTTAATCTGCTTGGTATCTGAATTG TGTTATGGGTTTTATCTGCCTGGAAGTTACCCTCATAAATATGGGGTTGGTGATTTGTTG AATGTTAAGGTGAATTCATTGACTTCAATTGACACTGAGTTGCCTTATAGTTATTATAGT TTACCTTTTTGCCAACCACAAGAGGGTGTGAAGGATAGTGCTGAGAATCTTGGTGAGCTT CTTATGGGTGATAGAATTGAGAATTCTCCTTATAGGTTTAAGATGTATACTAATGAGACT GAGATTTTCATGTGTCAAACTAAACCTTTGTCTGGCGAGGAGTTTAAGCTTTTGAAGAAG AGGATTGATGAGATGTATCAAGTTAATTTGATTCTTGATAATTTGCCTGCTATTCGATAT ACAAGGAAGGAAGGTTATTTCTTGCGGTGGACTGGTTATCCGGTTGGGATCAAGGTTCAA GATGCGTATTACGTGTTTAATCACTTGAAGTTTACGGTTCTTGTTCATAAGTATGAAGAG ACCAATGTGGCTCGGGTTATGGGTACTGGGGATGGAGCTGAGGTGATCTCTACAGTTGGA AAGGATGGATCTGAGGAACCTGGTTATATGGTTGTTGGGTTTGAGGTTGTTCCTTGTAGT GTTCAACATGCTCCTGATTCGGCAAAGAACTTGAAAATGTACAATAAGTACCCGAATCCA ATTAAGTGCGACCCAACAACTGTTGCCATGGCTATTAAAGAAAATGAGCCTGTTTCGTTT ACTTATGAGGTGAACTTTGTGGAAAGTGACATTAAGTGGCCATCAAGATGGGATGCGTAT TTGAAGATGGAAGGTGCAAAGGTGCACTGGTTCTCTATCCTTAACTCCCTTATGGTGATC ACTTTCTTGGCTGGAATTGTGCTTGTAATCTTCTTGAGGACTGTCAGGCGGGATCTTACA AGGTATGAGGAACTTGACAAAGAGGCTCAAGCTCAGATGAATGAGGAGTTATCCGGGTGG AAACTTGTGGTGAGTGATGTTTTCAGGGCTCCAAGTAATCCAGCACTTTTGTGTGCGATG GTTGGAGATGGGGTTCAAATTCTAGGGATGGGTGTTGTGACTATCATGTTTGCTGCCCTC GGATTTATGTCCCCAGCTTCTCGTGGAACATTGATTACTGGTATGCTATTCTTCTATATG ATTCTTGGTATTGCAGCTGGTTATGTTGCTGTTCGCCTCTGGAGGACAATCTTCTGTGGC GATCACAAGGGTTGGATTTCAGTCTCATGGAAAGCTGCTTGTTTCTTCCCTGGAATTGCT TTTCTCATTCTAACCACATTGAACTTCCTGCTATGGGGTAGTCACAGCACAGGGGCCATA CCATTTTCTCTGTTTGTTGTCCTCATTTTACTTTGGTTCTGCATTTCCGTTCCTCTAACC CTGGTCGGTGGTTATTTCGGGGCAAAGGCTCCTCACATTGAATACCCAGTCCGAACCAAC CAGATCCCCCGTGAAATCCCACCACAAAAATATCCATCTTGGCTTTTAGTTTTGGGTGCA GGCACCCTTCCTTTCGGTACTCTGTTCATTGAGCTCTTCTTCATCATGTCAAGTCTCTGG ATGGGTCGTGTCTACTATGTCTTTGGCTTCCTCCTCATTGTCATGATCCTTCTCGTCGTT GTCTGTGCTGAGGTGTCTCTTGTTCTTACTTACATGCATCTTTGTGTGGAGGACTGGAAA TGGTGGTGGAAATCCTTCTTTGCCTCCGGATCAGTTGCTATATACATTTTCCTCTATTCC GTTAACTATCTAATCTTCGATCTCAAGAGCTTGAGCGGGCCTGTTTCTGCTACCCTTTAC CTTGGATATTCCCTCTTTATGGTACTTGCCATCATGCTCGCGACAGGCACAGTCGGGTTT CTTTCCTCCTTCTGGTTTGTACATTACTTGTTCTCTTCAGTGAAGCTGGATTAA