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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc07g006320.3.1

CDS Infomation

auxin canalization protein (DUF828) (AHRD V3.3 *** AT5G57770.1)

Sequence

ATGGATCTTGATTCAAATCCAACAATCTCACAAGCACATCCCGAGACGATGGACTTCCTT
TCGCGCACTTGGTGCAACTTTGCAGTTCAAGCGTTCCAGCCGGAGATGCAAGATCAAGCT
CTCATTCTACATGAAACTTCAATCAAGAGTTTAAGCATTGATAATAAACCTCCTCTTCCT
AAAATGGATAAGAGCATGAAGATGGATGATGCAGATAATTCAATTCCGCCATGGAAATCC
AACGATGTCAAGTCGTGGATATGGATGCAGCAAGCCATGCATCCAGAGGTGAACTACAAC
AGCTATTTCCAGAAAAAATGGATGCCGTGGAACATAGGACCACTAAAGAATGTGTCAATC
AAGAAATGGATCAAAGAAATTAAGCAGAAGAGGAAAGAAGAAAAGAGATTACAGAAGGCT
GAAGTACATGCAGCGATATCAGTGGCAGGTGTTGCAGCTGCCTTAGCTGCCATCGCTGCT
GAAAACATGAACCATGATCAGTCAGGGTGTACCAAGGAGTCAGCTGTGGCCAGCGCAGCG
GCACTAGTTGCAGCACAATGTGCACAAGTGGCAGAAGCTATGGGGGCAAAACGGGACCAA
ATCAGCAGTGTGATTGGCTCAGCAATGACCGGCACAAGTGCAAGCGACATTCTGACGCTT
ACAGCTGCAGCTACAACTTCACTCAGAGGAGCAGAAACACTCAAAGCAAGATCTGGCTAC
AAGAATATTTTGAATGGAAGCACACCAGTTCTCCCAATTGAAGATAGCAACGACTACAAC
TTTAACCACGAGAAATGCAGATCAATTCTCTCCAAGGGGGCAGACCTCTATATTGAAAAA
TCAGAAGGAAGATCCAAGCTAAGGTCGGTGTCCATTATGTTAAATAGTGAAGCCAAGGTT
ATCCTAAGAACAAGGAAGCCAACTATGTTGAAGACCTTCTCAAGTCAAGCGGAAAGTGTC
GTATTAGACCTACATGCCGAGCTGTATAAGGATTCAAATGGAGCGGAAACTGATAGTTGC
TATCTTATTGTGCTAACAACAAACAGGGGAGTCATCAAGCTAGACATGATGGATGATTAC
CAGCGATACAAAATGTGGTCAATGACTATTAACCAAATGCTGACGCTGTCTACTTCATTT
ACAAAATATGAGCTCCAATATTACAAAAGCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc07g006320.3.1

PEP Infomation

auxin canalization protein (DUF828) (AHRD V3.3 *** AT5G57770.1)

Sequence

MDLDSNPTISQAHPETMDFLSRTWCNFAVQAFQPEMQDQALILHETSIKSLSIDNKPPLP
KMDKSMKMDDADNSIPPWKSNDVKSWIWMQQAMHPEVNYNSYFQKKWMPWNIGPLKNVSI
KKWIKEIKQKRKEEKRLQKAEVHAAISVAGVAAALAAIAAENMNHDQSGCTKESAVASAA
ALVAAQCAQVAEAMGAKRDQISSVIGSAMTGTSASDILTLTAAATTSLRGAETLKARSGY
KNILNGSTPVLPIEDSNDYNFNHEKCRSILSKGADLYIEKSEGRSKLRSVSIMLNSEAKV
ILRTRKPTMLKTFSSQAESVVLDLHAELYKDSNGAETDSCYLIVLTTNRGVIKLDMMDDY
QRYKMWSMTINQMLTLSTSFTKYELQYYKS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc07g006320.3.1

Transcript Infomation

auxin canalization protein (DUF828) (AHRD V3.3 *** AT5G57770.1)

Sequence

TCTTCACACATGCATTTTTGGAATTAGATACTAAAATAAGCTTTTACAAACTGTTATCTT
AAAGTAAAAGGTGGATTAATGATTCATGGAGGCTGGCTTGGCTTTGTATTCATAATAAAG
CTATGAATTGCCACTTTATAGATGTTAAATGGACCCTATGATGATAAACCAACAAAATAG
CTCAAAATAAGAGGTGATTTAACACTTTTTAAGCTTTCTATCTAATTTATACCTATTTAT
ATATCTCTTAAGTGAATTTAACATTCTATCAAAACTTCACTTACCTTATAACAACTGTAG
AGCAACTGTCCAGTCTTGGTTTAAGAAAAAGATGGATCTTGATTCAAATCCAACAATCTC
ACAAGCACATCCCGAGACGATGGACTTCCTTTCGCGCACTTGGTGCAACTTTGCAGTTCA
AGCGTTCCAGCCGGAGATGCAAGATCAAGCTCTCATTCTACATGAAACTTCAATCAAGAG
TTTAAGCATTGATAATAAACCTCCTCTTCCTAAAATGGATAAGAGCATGAAGATGGATGA
TGCAGATAATTCAATTCCGCCATGGAAATCCAACGATGTCAAGTCGTGGATATGGATGCA
GCAAGCCATGCATCCAGAGGTGAACTACAACAGCTATTTCCAGAAAAAATGGATGCCGTG
GAACATAGGACCACTAAAGAATGTGTCAATCAAGAAATGGATCAAAGAAATTAAGCAGAA
GAGGAAAGAAGAAAAGAGATTACAGAAGGCTGAAGTACATGCAGCGATATCAGTGGCAGG
TGTTGCAGCTGCCTTAGCTGCCATCGCTGCTGAAAACATGAACCATGATCAGTCAGGGTG
TACCAAGGAGTCAGCTGTGGCCAGCGCAGCGGCACTAGTTGCAGCACAATGTGCACAAGT
GGCAGAAGCTATGGGGGCAAAACGGGACCAAATCAGCAGTGTGATTGGCTCAGCAATGAC
CGGCACAAGTGCAAGCGACATTCTGACGCTTACAGCTGCAGCTACAACTTCACTCAGAGG
AGCAGAAACACTCAAAGCAAGATCTGGCTACAAGAATATTTTGAATGGAAGCACACCAGT
TCTCCCAATTGAAGATAGCAACGACTACAACTTTAACCACGAGAAATGCAGATCAATTCT
CTCCAAGGGGGCAGACCTCTATATTGAAAAATCAGAAGGAAGATCCAAGCTAAGGTCGGT
GTCCATTATGTTAAATAGTGAAGCCAAGGTTATCCTAAGAACAAGGAAGCCAACTATGTT
GAAGACCTTCTCAAGTCAAGCGGAAAGTGTCGTATTAGACCTACATGCCGAGCTGTATAA
GGATTCAAATGGAGCGGAAACTGATAGTTGCTATCTTATTGTGCTAACAACAAACAGGGG
AGTCATCAAGCTAGACATGATGGATGATTACCAGCGATACAAAATGTGGTCAATGACTAT
TAACCAAATGCTGACGCTGTCTACTTCATTTACAAAATATGAGCTCCAATATTACAAAAG
CTAATCTTCATAAAGATTTGTGGCATCAGCATATTTTTCACATGAGTTTTTTGTCATGTA
TAGGTTATAGTACTTAGCAACTTCGAAGTTGTCAGATCTGTTAATAGTTACATATCATGT
TCTTGTTTTTCCAATAAGTTACATGTTTGTTGATCATATTGTTTGCTTAAATCTTTATGA
TTTTTCATTTCTCACCTTGTTCACTTGGATATCCGTTTCCTGAGTCAATTATAATTATTC
TATTTGATGAATTAATTCTTCTGATTACAAGAATTCACCTAAAGCTCCTCAACAA