Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc06g083230.3.1
CDS Infomation

GTP cyclohydrolase 1
Sequence

ATGGGCGCATTAGATGAAGGGCACTATCATGCAGAAATAGACAACGAAGTTAGTTTTGAG
CTTGGCTTTGAAACTCAGCCTGAAACACTGGTTATTCAGGATGCTGTTAGAGTCCTATTG
CAGGGTTTGGGTGAAGATATCAATAGGGAAGGAATCAAGAAAACCCCTTTTCGTGTTGCT
AAGGCTCTAAGACAAGGAACAAGAGGTTACAAACAAAAAGTGAATGATATTGTTCATGGC
GCATTATTCCCTGAAGCTGGATTGGAGGGTGGAAGTGGTCAGGCTGGAGGAGTTGGTGGG
CTTGTGATTGTTCGAGATCTTGATCTCTTTTCGTATTGTGAGTCTTGCTTGCTTCCATTC
CAGGTTAAGTGTCATGTAGGTTATGTCCCATCTGGAAAAAGGGTTGTAGGATTAAGCAAG
CTTTCTCGGGTTGCTGATATTTTTGCAAAACGGCTCCAAAGTCCACAGCGCCTTGCTGAT
GAAGTTTGCACTGCTTTGCAGCATGGAATCAAGCCAACAGGCGTTGCTGTGGTTCTACAG
TGTATGCATATTCATTTTCCAAATTTTGAATCAGCATTTCTCGACTCGACTTCCCAAGGA
TGGGTAAAGATAACAGCTACCTCAGGTTCTGGTGTTTTTGAAGATGGGAATGCTGATGTT
TGGACTGATTTCTGGAGTCTACTGAAATTCAGAGGTATTAGCATAGACAATGCTCATCGT
AGATCCTCTGGCCAATCATGGTGCCCATCTCAATCTTGTGGCATGCCAGGACAAGCAAAT
TCAGCTATGACAAATGCAGTGAATTCAATACTTAAATCCCTGGGTGAAGATCCATTGAGA
GAAGAGCTTGTAGAAACCCCATCTCGGTTTGTGAAGTGGTTCATGAACTTTAGAAACTCT
AATTTGGAGATGAAACTGAATGGCTTTGTTCGAAGTAGAATAGACACTCGAAGTCCTCAG
GGTGGTAATTTTAATGATGGCATCTGCTCTGAGCTCAATTTGTCATTCTGGTCTCAGTGC
GAACATCATCTACTCCCTTTTCAAGGCGTTGTGCACATTGGTTATCACTCTTCAGATGGA
GTCAACCCGGTCGGAAGACCTCTAGTGCAATCAGTAGTACATTTTTATGGCTTTAAACTC
CAAGTACAGGAAAGGGTAACCAGACAAATAGCTGAGACTGTTTCATCATTCTTAGGTGAA
GACATTATCGTAGTTGTGGAAGCAAATCACACCTGTATGATATCTAGAGGAATCGAGAAA
TTTGGAAGCAACACAGCCACATTTGCTGTGTTGGGTCGATTTTCCACTGACCCTGTTGCA
AGAGCAAAATTTTTGCAGAGCCTCCCAGACTCTGGTTCTGCAGGAAGATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc06g083230.3.1
PEP Infomation

GTP cyclohydrolase 1
Sequence

MGALDEGHYHAEIDNEVSFELGFETQPETLVIQDAVRVLLQGLGEDINREGIKKTPFRVA
KALRQGTRGYKQKVNDIVHGALFPEAGLEGGSGQAGGVGGLVIVRDLDLFSYCESCLLPF
QVKCHVGYVPSGKRVVGLSKLSRVADIFAKRLQSPQRLADEVCTALQHGIKPTGVAVVLQ
CMHIHFPNFESAFLDSTSQGWVKITATSGSGVFEDGNADVWTDFWSLLKFRGISIDNAHR
RSSGQSWCPSQSCGMPGQANSAMTNAVNSILKSLGEDPLREELVETPSRFVKWFMNFRNS
NLEMKLNGFVRSRIDTRSPQGGNFNDGICSELNLSFWSQCEHHLLPFQGVVHIGYHSSDG
VNPVGRPLVQSVVHFYGFKLQVQERVTRQIAETVSSFLGEDIIVVVEANHTCMISRGIEK
FGSNTATFAVLGRFSTDPVARAKFLQSLPDSGSAGR*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc06g083230.3.1
Transcript Infomation

GTP cyclohydrolase 1
Sequence

TACATATAGAACGTTGTGATATATATCAATTTAATGTATATTGTATCATTTCTCAAGTCC
TTCCCCTTTTTTCTTTATGCTCTTTTTATCGTGGTCATCACCAACTTTTCTTTTTTGAGG
TTGGTGAAAAGTTCATTTTTAAAATTGGAATCCAGTGTGAAAAATAAATTAATTAAAAGA
ATCCTTTCCAGCAAATTAAAGTCTATCTTTTTTTTTTACCAACTACAAAGTCAAGTTAAA
TGCGCCAAACACACTATCAATAAAAGCAAGAAATTAACCAAGCTAACATCACTTGACAGA
AACTTTATTGGTAAACTTAATCATTACTTGACGTTAAAAAAGCCACTGTTAATTTGACTT
GAATTCTAAATGTATTTTATGAGTTTTGCTTGTGATTTCGCCGGAAAAGCTTGTTGTGTG
ATACGGTTGAAATCGATAGAAGTATGTTCTCGTAAAGTCTGTGATTATCCTTCTTTATCC
ACATAATTATATATAATTTTTTTTATCTCAAATTTATCATTGAACAACCTATTTATATAA
AGTATTTTTGAATTATTAAAATTGCTTTATTGATAAAATCCGATTCTCTCCTTCCTTACC
CCCACCAAAAGTTAAAAGGAGGAAATCATGTCTTCTCATGCATTTTACAAAGCTCCACCA
AATCACAGTGAAGATTATTATTATCCATTTCTATGCCATGCTTATGCTTTCAAAAATGGT
AAATTTGGTCCCACAGAGTTGAAATTGAAGAGCAATATGAGGATTTTGCCATATTTAAGT
AGAAGACAAAATGATGAGTTTGTTTAGTGGTCACTGCTCACTGGCCACTTTAATTGGTGT
ATAGAAGATAACAACATTCACCAATGCACCACCCATTTTTAGTCCATTTAATAATTTAAA
TTTTAAATTAATAATTTTATATTTTAAATAAAAAAAATATTCATTTTTATGTCATGTATC
AGATTAAACTATATTTAATTTTAATTAATAAATAATTATCTTTTAAATCGCTAATAGTTT
AAAAATAAACTTAATAATTTACCTTAAATTAAAGGTACAACTTAATTTTGTAAGCAAGTA
GTGCCGTGATAGAATTAAGTAAAGCTTTCCACACATTCCAATATCAACTGCAACCTTACA
TTTTTTTTAATTTTTTTTTATGTTTTTATTTATTTAAGTATTTTTTTATTATTAAAAGAA
AACATTTTTTTAAATACTGCAAAGTTGTTGTAGTAATGCATATGCATCTCATCTCCAGAT
CCCTATAGTATATGTTCATCAACAGCAGCCCTACAAATCCCTTTTCATCCCTATTTTGGT
CAAATTTTCCTCATTTGGGTCATTGGGTGTCTCAAATTTGGAATCTTTGGCTAAAATCTT
TCGAATTAAAGATTCAATTTTTGTTCTTGTTCTTGATTCATCACCTGTGATTCAGGTGGT
AAGATCTGTTTTATTATTTCGTTTTGTGTGTCAATGGGCGCATTAGATGAAGGGCACTAT
CATGCAGAAATAGACAACGAAGTTAGTTTTGAGCTTGGCTTTGAAACTCAGCCTGAAACA
CTGGTTATTCAGGATGCTGTTAGAGTCCTATTGCAGGGTTTGGGTGAAGATATCAATAGG
GAAGGAATCAAGAAAACCCCTTTTCGTGTTGCTAAGGCTCTAAGACAAGGAACAAGAGGT
TACAAACAAAAAGTGAATGATATTGTTCATGGCGCATTATTCCCTGAAGCTGGATTGGAG
GGTGGAAGTGGTCAGGCTGGAGGAGTTGGTGGGCTTGTGATTGTTCGAGATCTTGATCTC
TTTTCGTATTGTGAGTCTTGCTTGCTTCCATTCCAGGTTAAGTGTCATGTAGGTTATGTC
CCATCTGGAAAAAGGGTTGTAGGATTAAGCAAGCTTTCTCGGGTTGCTGATATTTTTGCA
AAACGGCTCCAAAGTCCACAGCGCCTTGCTGATGAAGTTTGCACTGCTTTGCAGCATGGA
ATCAAGCCAACAGGCGTTGCTGTGGTTCTACAGTGTATGCATATTCATTTTCCAAATTTT
GAATCAGCATTTCTCGACTCGACTTCCCAAGGATGGGTAAAGATAACAGCTACCTCAGGT
TCTGGTGTTTTTGAAGATGGGAATGCTGATGTTTGGACTGATTTCTGGAGTCTACTGAAA
TTCAGAGGTATTAGCATAGACAATGCTCATCGTAGATCCTCTGGCCAATCATGGTGCCCA
TCTCAATCTTGTGGCATGCCAGGACAAGCAAATTCAGCTATGACAAATGCAGTGAATTCA
ATACTTAAATCCCTGGGTGAAGATCCATTGAGAGAAGAGCTTGTAGAAACCCCATCTCGG
TTTGTGAAGTGGTTCATGAACTTTAGAAACTCTAATTTGGAGATGAAACTGAATGGCTTT
GTTCGAAGTAGAATAGACACTCGAAGTCCTCAGGGTGGTAATTTTAATGATGGCATCTGC
TCTGAGCTCAATTTGTCATTCTGGTCTCAGTGCGAACATCATCTACTCCCTTTTCAAGGC
GTTGTGCACATTGGTTATCACTCTTCAGATGGAGTCAACCCGGTCGGAAGACCTCTAGTG
CAATCAGTAGTACATTTTTATGGCTTTAAACTCCAAGTACAGGAAAGGGTAACCAGACAA
ATAGCTGAGACTGTTTCATCATTCTTAGGTGAAGACATTATCGTAGTTGTGGAAGCAAAT
CACACCTGTATGATATCTAGAGGAATCGAGAAATTTGGAAGCAACACAGCCACATTTGCT
GTGTTGGGTCGATTTTCCACTGACCCTGTTGCAAGAGCAAAATTTTTGCAGAGCCTCCCA
GACTCTGGTTCTGCAGGAAGATGATGTCTTTTCCCAAAGGATATATACAGGCTACAGCAA
GCTAAGTACTTGTCGTACGGATGACTCAGGTAAAACTGAAGGAATCGAGAAGCAAACTCG
CGCTGAATTCAAGAATGGAGGTTCTTTGCTCGGTACATGAAGTCCTGTTTTTACTTCTAC
AGCATAGTGATAAATGAGGTTATGAAATTTTATCCATTTTTTTTCATCCTTGTAATATGT
AGCATGAGCAAGGGTCTATACCAGCAATATTTTTAAGTTGCCCTTGGTTTTTCATTTGTA
ATGCAGTTGCCATTGATTGATGTGTCCATACCTGGCACATTGTGCCTTATAATGTGCCTT
ATTATAGCACACATATATATGATGTTTTCCAACCATTTCTGCAATATTAATGTTACTGAA
GTCCCGATTGAATTCATTTCA