Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc06g082010.3.1
CDS Infomation

Zinc finger transcription factor 48
Sequence

ATGTGTAGTGGTTCTGGGAGTGAAGTTTGTTCTACTGAATTAGCCATGGAAGGTAAAATT
CAGAAGCAAAAAGAACTTGTCCCTGATTTCTCCCTTTTGCTCGAGTTGTCGGCCTCGGAT
GATATTAGAAACTTCCAGAAGGCTGTAGAAGAGGAAGGCCATGACATCAATGAGGTGGGC
TTATGGTATGTTAGGAGAGTTGGTGTAAAGAAGATGGGATATGAGGAGAGGACACCCCTT
ATGGTTGCTGCTACTTTTGGCAGCAAACAGGTGCTGAGTTATATGCTTGAGAAGGGTTGT
GTTGATGTTAATCAAGCTTGTGGTTCGGATAGGGCTACTGCGCTTCACTGCGCAATTTCT
GGTGGCTCTGCAGCTTTGCTTGAGGTTGTCAAGCTCTTGGTTGATGCTTCTGCTGATGTG
AATTTGGTGGATTCAAACGGGAAACGAGCTGTTGACCTGATCTCTGGTCAGAGTTGTTGC
CTCAACTCTAGGAGGAAGATACTGGAGCACTTGCTTGGAGGATCCAGCACCGACGAGGTG
ATTGATCAGATCATTTCTGAACAAGCAGAGGAACAACTGTTGTTGACTCCAACTGTATCT
AAATTTGGGATCGAGAAGAAAGAGTATCCTGTCGATCCCTCTCTTCCGGACATAAAGAAT
GGGATATATGGGACTGATGACTTTAGAATGTACATATTTAAGGTGAAACCGTGCTCGAGA
GCATACTCCCATGATTGGACAGAGTGCCCCTTTGTTCACCCTGGTGAAAACGCTAGAAGG
CGTGACCCTAGTAAGTACCACTATAGTTGTGTCCCTTGTCCAGACTTTCGCAAGGGGACA
TGCCAAAGGGGAGACTCTTGTGAGTATGCACATGGTATTTTTGAGTGCTGGCTTCACCCT
GCACAATACCGGACCCGTATGTGCAAGGATGAAACAAATTGCAATAGGAGGGTTTGTTTC
TTTGCCCACAAACCTGAAGAACTTCGACCCTTGTATCCTTCCACGGGGTCTGCTGTTCTT
TCCCCTAGATCATATTCCAGTGGCGCGTCGTCATTGGATATCACATCGATTACTCCACTA
GCCCTTGGCTCTCCATCAGTTATGGTACCTCCTACTTCAACTCCACCTATGTCTCCTTCT
GCAGGAGCTTCTTCTGTGGGTGGATCTTTGTGGACCTGCCAGTCCAGCCCTGCAACTCCA
ACCTTGCAACTGCCGATTAGTCGGTTAAAAACCGCAATCAATGCCAGAGACATGGATATA
GGTAATGGTTATCTGATGCAAGATCAGCTGATGGATGAGTTATCTGCTCTTTCTTCGCCA
TCCAGGTGGAATAGTTCTTCAGCCAAAGCTGCTGCTTTTGCAGCTTCTTTAAATGATCGA
AACGGTGAATTCAGTAGGCATGGTGGATTGAACCCCTCTAATCTTGATGATATAATAGCA
AACCTTGATGCCAAGATACTGTCTCAGCTGCAAGGACTATCACTTGATGCTGCATCTCCC
CAGCTGCAATCTCCCAAAGGGATGCAGATGCGACAGAACATGAACCAGCAACATATGTCA
AGCTATTCCTCCAGTCAATCCTCACCGTCTTTTAGGACATCATCTTCATATGGAATTGAT
CCATCTAATGCTGCAGCGACAGCAGTTTTGAGTTCAAGGGCAGCTGCATTTGCCAAGCGA
AGCCAGAGTTTCATTGATCGAAGTGGTGCAGGCCGTCTTCCTAATGCATCCGCTGTGCCT
TCTAACCTCTCAGGTTGGGGTTCACCTGATGGTAAATTGGACTGGGGCATCCAGAAGGAA
GAGCTCAATAAGTTGAGAAAATCTGCTTCCTTTGGTTTACGGAGCAGTGGCAGTAGGTTT
CCTACTACAAGTGAATCCTCAGTTTCTGACTCGCTCGTTGAGCCTGATGTCTCTTGGGTT
CAATCTCCGCATTCCCCTTCTATGACTTCGAGACAATTGGCTACGATGGAAGATCAACAG
TATCGGTTGAATACTAGTCGAGGTTCTGAGACAATGCCAACATGGGTAGACCAGCTATAC
ATGGAGCAGGAGCAGATTGTGCATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc06g082010.3.1
PEP Infomation

Zinc finger transcription factor 48
Sequence

MCSGSGSEVCSTELAMEGKIQKQKELVPDFSLLLELSASDDIRNFQKAVEEEGHDINEVG
LWYVRRVGVKKMGYEERTPLMVAATFGSKQVLSYMLEKGCVDVNQACGSDRATALHCAIS
GGSAALLEVVKLLVDASADVNLVDSNGKRAVDLISGQSCCLNSRRKILEHLLGGSSTDEV
IDQIISEQAEEQLLLTPTVSKFGIEKKEYPVDPSLPDIKNGIYGTDDFRMYIFKVKPCSR
AYSHDWTECPFVHPGENARRRDPSKYHYSCVPCPDFRKGTCQRGDSCEYAHGIFECWLHP
AQYRTRMCKDETNCNRRVCFFAHKPEELRPLYPSTGSAVLSPRSYSSGASSLDITSITPL
ALGSPSVMVPPTSTPPMSPSAGASSVGGSLWTCQSSPATPTLQLPISRLKTAINARDMDI
GNGYLMQDQLMDELSALSSPSRWNSSSAKAAAFAASLNDRNGEFSRHGGLNPSNLDDIIA
NLDAKILSQLQGLSLDAASPQLQSPKGMQMRQNMNQQHMSSYSSSQSSPSFRTSSSYGID
PSNAAATAVLSSRAAAFAKRSQSFIDRSGAGRLPNASAVPSNLSGWGSPDGKLDWGIQKE
ELNKLRKSASFGLRSSGSRFPTTSESSVSDSLVEPDVSWVQSPHSPSMTSRQLATMEDQQ
YRLNTSRGSETMPTWVDQLYMEQEQIVH*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc06g082010.3.1
Transcript Infomation

Zinc finger transcription factor 48
Sequence

AAATTATTTATTCACTTTATTAACAAAATATATTTGTTCTACATTTCTTTATTTAATTGT
ATAATTTTACATTGAATTTTTGCGTTCTCTCACTCTCCACCTGTCCCACTGTTTGATGGT
TCGTACGTTTTTGTTGTAGTTAAAAGGAGGATTTCTAGTTACCTCCATTAGCAACTCATT
TCTTGTTCGTGTGTTGCTCCTTTCTCTCTCCACAACATTTGGGGTTCTAAACCCTCCTTT
ATATATTTTTCTATGCAAGAGTTGAGAGAGAAGTACAGACCCTATTCATGTGTAGTGGTT
CTGGGAGTGAAGTTTGTTCTACTGAATTAGCCATGGAAGGTAAAATTCAGAAGCAAAAAG
AACTTGTCCCTGATTTCTCCCTTTTGCTCGAGTTGTCGGCCTCGGATGATATTAGAAACT
TCCAGAAGGCTGTAGAAGAGGAAGGCCATGACATCAATGAGGTGGGCTTATGGTATGTTA
GGAGAGTTGGTGTAAAGAAGATGGGATATGAGGAGAGGACACCCCTTATGGTTGCTGCTA
CTTTTGGCAGCAAACAGGTGCTGAGTTATATGCTTGAGAAGGGTTGTGTTGATGTTAATC
AAGCTTGTGGTTCGGATAGGGCTACTGCGCTTCACTGCGCAATTTCTGGTGGCTCTGCAG
CTTTGCTTGAGGTTGTCAAGCTCTTGGTTGATGCTTCTGCTGATGTGAATTTGGTGGATT
CAAACGGGAAACGAGCTGTTGACCTGATCTCTGGTCAGAGTTGTTGCCTCAACTCTAGGA
GGAAGATACTGGAGCACTTGCTTGGAGGATCCAGCACCGACGAGGTGATTGATCAGATCA
TTTCTGAACAAGCAGAGGAACAACTGTTGTTGACTCCAACTGTATCTAAATTTGGGATCG
AGAAGAAAGAGTATCCTGTCGATCCCTCTCTTCCGGACATAAAGAATGGGATATATGGGA
CTGATGACTTTAGAATGTACATATTTAAGGTGAAACCGTGCTCGAGAGCATACTCCCATG
ATTGGACAGAGTGCCCCTTTGTTCACCCTGGTGAAAACGCTAGAAGGCGTGACCCTAGTA
AGTACCACTATAGTTGTGTCCCTTGTCCAGACTTTCGCAAGGGGACATGCCAAAGGGGAG
ACTCTTGTGAGTATGCACATGGTATTTTTGAGTGCTGGCTTCACCCTGCACAATACCGGA
CCCGTATGTGCAAGGATGAAACAAATTGCAATAGGAGGGTTTGTTTCTTTGCCCACAAAC
CTGAAGAACTTCGACCCTTGTATCCTTCCACGGGGTCTGCTGTTCTTTCCCCTAGATCAT
ATTCCAGTGGCGCGTCGTCATTGGATATCACATCGATTACTCCACTAGCCCTTGGCTCTC
CATCAGTTATGGTACCTCCTACTTCAACTCCACCTATGTCTCCTTCTGCAGGAGCTTCTT
CTGTGGGTGGATCTTTGTGGACCTGCCAGTCCAGCCCTGCAACTCCAACCTTGCAACTGC
CGATTAGTCGGTTAAAAACCGCAATCAATGCCAGAGACATGGATATAGGTAATGGTTATC
TGATGCAAGATCAGCTGATGGATGAGTTATCTGCTCTTTCTTCGCCATCCAGGTGGAATA
GTTCTTCAGCCAAAGCTGCTGCTTTTGCAGCTTCTTTAAATGATCGAAACGGTGAATTCA
GTAGGCATGGTGGATTGAACCCCTCTAATCTTGATGATATAATAGCAAACCTTGATGCCA
AGATACTGTCTCAGCTGCAAGGACTATCACTTGATGCTGCATCTCCCCAGCTGCAATCTC
CCAAAGGGATGCAGATGCGACAGAACATGAACCAGCAACATATGTCAAGCTATTCCTCCA
GTCAATCCTCACCGTCTTTTAGGACATCATCTTCATATGGAATTGATCCATCTAATGCTG
CAGCGACAGCAGTTTTGAGTTCAAGGGCAGCTGCATTTGCCAAGCGAAGCCAGAGTTTCA
TTGATCGAAGTGGTGCAGGCCGTCTTCCTAATGCATCCGCTGTGCCTTCTAACCTCTCAG
GTTGGGGTTCACCTGATGGTAAATTGGACTGGGGCATCCAGAAGGAAGAGCTCAATAAGT
TGAGAAAATCTGCTTCCTTTGGTTTACGGAGCAGTGGCAGTAGGTTTCCTACTACAAGTG
AATCCTCAGTTTCTGACTCGCTCGTTGAGCCTGATGTCTCTTGGGTTCAATCTCCGCATT
CCCCTTCTATGACTTCGAGACAATTGGCTACGATGGAAGATCAACAGTATCGGTTGAATA
CTAGTCGAGGTTCTGAGACAATGCCAACATGGGTAGACCAGCTATACATGGAGCAGGAGC
AGATTGTGCATTGATACTGCTCATGGAGTAATATCTAACAAGTTCTTTTGCAATTTTTTG
TATTCTTTTTCGTTATGATAAGCAGATAGGGGGCTACACAAAGGTCTTTCTTTGGACAGG
GTGGAAGAATTCTGCTCTTACAAATATTTGTATCTTTTATTTTTTATTTTTAAGTTCAGA
ATTTTGATTAATCTCATCACTATAGACTATGTAACACGGCAATGAATAATGATACAAATG
AAATTACTCTGATTCAAAAGCCAACATATCAAATTACACCTTCCTACATTATTTTTTGTT
ATAGTTATATGGTTTGTGATTTGTCTGAAATAAGTGTATGCAACGGGATGAAATTTGATT
ATTCAGAACGTATAATTGTCAGCGTACACGAATGATAAATTCTAGATAGATTGAACCATC
AAATATTATCAATCTCAAAGGTCTCATTTCAAGCAGACGCAGATTAGGATTTACCTGTTA
TGAGTTTGAAATTTTAGTCATTTTATATTGTCAAGTTTTAAATTAATAATTTATATACAT
TTGATGAATTTTGAATAGAAGTATTTGTTCAACCGAACTTATTACTTATATACCAGCTTA
TCACCTTATTTCAAGGGCTCAGAAATAAAAAAGAAAAGAAAATTAATTTTCAAGAAGAAA
AGTTTTATCGATTTTATGAACCCTACATAACATAAGTTTGGATTAATTGAGTCAAAATAT
TGAATGATGAATTTGGAGTGCTAAAGGTAGGGCAGGCCAAATTCAGAGATTTATGAAAAG
GCGGTGCAATGAATAATGTGATGCAATATTTGGAGACAGTTCAAATCAAGTGGCAATATT
TTAATTAGTCAATTGGCTTCAAAAGTCAAAAGTAGGAAAAGATGTAGAAATTTAATAGAG
CCGCCCGATCCTATCTATTGGATAATAGATTGACGTTTACTTGCTAAATTATGGCCGGCA
ATATGGACTTTGGACCAGTTGAGTTTGTGCGACCGATAAAAATAAATAA