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All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc06g076760.2.1
CDS Infomation

Laccase 1a
Sequence

ATGTTGGGCAAAATAGCAGAATGGCTGAAAATTTTGGTGGTATTGGCTTTCTTGTGGCCA
GTGTTGGTACTATGCAAAGGCAATATTCGTCATTACAAATTCAATGTGATGATGACAAAT
GTAACAAGATTATGCTCAACTAAGCCTACTGTAACAGTAAATGGCAAATTTCCTGGTCCA
AGTATTTATGCTAGGGAAGATGATACACTACTTATAAAAGTTGTTAACCAAGTTCACTAT
AATCTTTCCATCCACTGGCATGGTGTGAAACAACTTCGAACGTGTTGGGCCGATGGACCG
GCTTATATAGCCCAATGTCCAATACAGCCAGGAAAAAGCTATGTATACAATTTTACAGTA
AGAGAACAAAGAGGAACATTATTTTGGCATGCACATATACTTTGGCTTAGGGCTACTGTC
CATGGTGCTATTGTTATCCTCCCTAAGCTTGCTTTGCCCTACCCTTTCTCAAAGCCCAAA
AAGGAAGTTGTCATCATTTTAGGTGAATGGTGGAAGTCAGATGTTGAAGCTGTTGTTGAT
GAAGCAACACAATCAGGTTTGCCACCTAATATATCTGATGCTCACACCATCAATGGCCTT
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AAGAAGTACCTATTGAGAATCATCAATGCTGCACTAAATGAAGAACTTTTCTTCAAAATT
GCTGGCCATAACCTCACTGTGGAAGAAGTAGATGCTGCCTATGTTAAACCCTTTGAAACA
GAGACAATTTTAACAGCTCCAGGCCAAACAACAAATGTCATTTTATCAACAAATCATAAA
AATGGAAAATACTTAATGGTAACATCACCTTACATGGATTCACCAATCTTAGTAAACAAC
AAGGCAGCTACTGCAACATTACAATACACAGGCACAAACAATTCTTCCACAACATTCACC
GTGCCACCTCCTAGAAACGCCACCTCTATCGCGTTTAACTTCATGGATTCACTCCAGAGC
TTGAATTCGAAAAGATATCCAGCAAAAGTCCCAATCAAAATCAATCATTCTCTGTTTTTC
ATCATTAGTCTTGGACTCAACCCTTGTGCAACATGTTACAGGGGATTTCGAATCGTTGCA
GCTATTAATAATGTTACATTTGTTATGCCTAGTGTGTCACTACTTGGTACACATTTTTTA
AACAAAAGTGGAGTGTTTACTGATGATTTCCCTGGAAATCCACAAAATGTATTTGATTAT
ACTGGGGTTCCACCAGAAAATTTGAGGACTATTGAAGGGACTAAGCTTTATAGACTTGAG
TATAATTCTAATGTCCAAATAATATTGCAAGACACAGGATTATTGAGCCCTGAAAATCAT
CCAATGCATTTACATGGATTCAATTTTTTTGTTGTTGGAAGAGGCAAAGGAAATTTTAAT
CCAAAAGAAGATTTTAAAAAGTTCAATCTTGTTGATCCTGTTGAGAGGAATACTATTAAT
GCACCTTCTGGTGGTGGTTGGGTTGCTATTAGGTTCCGAGCGAATAATCCAGGTGTTTGG
TTTTTTCATTGCCATTTGGAGGTGCACACAACATGGGGACTTAAGATGGCTTTTGTGGTA
AATAATGGAAATGGACCTAATGAGTCTCTTTTACCTCCTCCAGAAGATATACCAAAATGT
TAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc06g076760.2.1
PEP Infomation

Laccase 1a
Sequence

MLGKIAEWLKILVVLAFLWPVLVLCKGNIRHYKFNVMMTNVTRLCSTKPTVTVNGKFPGP
SIYAREDDTLLIKVVNQVHYNLSIHWHGVKQLRTCWADGPAYIAQCPIQPGKSYVYNFTV
REQRGTLFWHAHILWLRATVHGAIVILPKLALPYPFSKPKKEVVIILGEWWKSDVEAVVD
EATQSGLPPNISDAHTINGLTGPVSTCLSQEGFNFQVEPGKKYLLRIINAALNEELFFKI
AGHNLTVEEVDAAYVKPFETETILTAPGQTTNVILSTNHKNGKYLMVTSPYMDSPILVNN
KAATATLQYTGTNNSSTTFTVPPPRNATSIAFNFMDSLQSLNSKRYPAKVPIKINHSLFF
IISLGLNPCATCYRGFRIVAAINNVTFVMPSVSLLGTHFLNKSGVFTDDFPGNPQNVFDY
TGVPPENLRTIEGTKLYRLEYNSNVQIILQDTGLLSPENHPMHLHGFNFFVVGRGKGNFN
PKEDFKKFNLVDPVERNTINAPSGGGWVAIRFRANNPGVWFFHCHLEVHTTWGLKMAFVV
NNGNGPNESLLPPPEDIPKC*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc06g076760.2.1
Transcript Infomation

Laccase 1a
Sequence

ATGTTGGGCAAAATAGCAGAATGGCTGAAAATTTTGGTGGTATTGGCTTTCTTGTGGCCA
GTGTTGGTACTATGCAAAGGCAATATTCGTCATTACAAATTCAATGTGATGATGACAAAT
GTAACAAGATTATGCTCAACTAAGCCTACTGTAACAGTAAATGGCAAATTTCCTGGTCCA
AGTATTTATGCTAGGGAAGATGATACACTACTTATAAAAGTTGTTAACCAAGTTCACTAT
AATCTTTCCATCCACTGGCATGGTGTGAAACAACTTCGAACGTGTTGGGCCGATGGACCG
GCTTATATAGCCCAATGTCCAATACAGCCAGGAAAAAGCTATGTATACAATTTTACAGTA
AGAGAACAAAGAGGAACATTATTTTGGCATGCACATATACTTTGGCTTAGGGCTACTGTC
CATGGTGCTATTGTTATCCTCCCTAAGCTTGCTTTGCCCTACCCTTTCTCAAAGCCCAAA
AAGGAAGTTGTCATCATTTTAGGTGAATGGTGGAAGTCAGATGTTGAAGCTGTTGTTGAT
GAAGCAACACAATCAGGTTTGCCACCTAATATATCTGATGCTCACACCATCAATGGCCTT
ACTGGTCCTGTCTCTACTTGTTTATCACAAGAAGGGTTCAATTTCCAAGTGGAACCAGGC
AAGAAGTACCTATTGAGAATCATCAATGCTGCACTAAATGAAGAACTTTTCTTCAAAATT
GCTGGCCATAACCTCACTGTGGAAGAAGTAGATGCTGCCTATGTTAAACCCTTTGAAACA
GAGACAATTTTAACAGCTCCAGGCCAAACAACAAATGTCATTTTATCAACAAATCATAAA
AATGGAAAATACTTAATGGTAACATCACCTTACATGGATTCACCAATCTTAGTAAACAAC
AAGGCAGCTACTGCAACATTACAATACACAGGCACAAACAATTCTTCCACAACATTCACC
GTGCCACCTCCTAGAAACGCCACCTCTATCGCGTTTAACTTCATGGATTCACTCCAGAGC
TTGAATTCGAAAAGATATCCAGCAAAAGTCCCAATCAAAATCAATCATTCTCTGTTTTTC
ATCATTAGTCTTGGACTCAACCCTTGTGCAACATGTTACAGGGGATTTCGAATCGTTGCA
GCTATTAATAATGTTACATTTGTTATGCCTAGTGTGTCACTACTTGGTACACATTTTTTA
AACAAAAGTGGAGTGTTTACTGATGATTTCCCTGGAAATCCACAAAATGTATTTGATTAT
ACTGGGGTTCCACCAGAAAATTTGAGGACTATTGAAGGGACTAAGCTTTATAGACTTGAG
TATAATTCTAATGTCCAAATAATATTGCAAGACACAGGATTATTGAGCCCTGAAAATCAT
CCAATGCATTTACATGGATTCAATTTTTTTGTTGTTGGAAGAGGCAAAGGAAATTTTAAT
CCAAAAGAAGATTTTAAAAAGTTCAATCTTGTTGATCCTGTTGAGAGGAATACTATTAAT
GCACCTTCTGGTGGTGGTTGGGTTGCTATTAGGTTCCGAGCGAATAATCCAGGTGTTTGG
TTTTTTCATTGCCATTTGGAGGTGCACACAACATGGGGACTTAAGATGGCTTTTGTGGTA
AATAATGGAAATGGACCTAATGAGTCTCTTTTACCTCCTCCAGAAGATATACCAAAATGT
TAAAAGTTTTTTCTATATTTTATGTGTGTATATTTTCAGATTTGATTCTCTTGTTTAAGC
AAGCAAAAAAAAAAAAAACCTGCTATGAGTAAACAATTTGCTTCTTTTTAAAAAAAGGTT
TGAATATCATAGGGTAAAGTTTGTATTATGTGAATTTATTTTATGCTAATGTTTTGTGAG
AAGTTGTAAATAATATTAGAGGTACTTGGCTATTTTTCTAGTACAAAGTAGAAAAGTGGT
TATTTGTGTATTTCACGCATAATGTATATCAACGAAGAAATTGCAT