Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc06g076510.3.1
CDS Infomation	Phosphoserine phosphatase, putative (AHRD V3.3 *** B9RLN8_RICCO),Pfam:PF00702
Sequence	ATGGAGAGGTTGATGAGTTTTCAGGCGAATTCTGTTCATGCTGTATCAAGACGGCAAAGC TCGGTACTAGTTCCTACATTTTCTCGAAAAATTAGTAATACAAGAGTTTCTGTTCAACCA ATTGGAATGGTGAGGAATTCCAAATTGTTTAATTCCGTTGTTGCTTCAGTTCAGCCAATT GGAGCCTCTGCTGTAACCCCTTTTGACAACACATTGCCATCGAAAGAGGTTCTTGATGTT TGGCATAATGCGAATGCTGTATGCTTTGATGTGGATAGCACTGTGTGCATAGACGAGGGC ATTGATGAATTTGCGGAGTTTTGTGGTGCTGGAAAGGCTGTAGCGGAATGGACTGCTAGG GCCATGAATGGTTCTGTTCCATTTGAAGAAGCATTGGCAGTTCGTCTTTCTCTGATTAAC CCTTCATTATCCCAACTCCAGGATTTTCTTAAGAGACCTCCACGACTTTCTCCTGGCATT GATCTATTGGTCAAGAAGCTGAAGGATAATAATAAAGATGTTTATCTGGTCTCTGGAGGG TTTCGTCAAATGATCAATCCTGTTGCATCAATCCTCGGAATACCACTTGAAAATATCTTT GCCAATCAAATACTCTTTGGGAGCAACGGAGAATATGTTGGGTTTGATAAAAATGAGCCA ACTTCAAGGCGTGGCGGAAAGGCTACTGCAGTTCAACAAATAAGAAAGGCTCATGGATAC AAGTCACTAGTGATGATTGGTGATGGTGCTACTGATCTTGAGGCTCGTATGCCAGGTGGT GCGGACTTGTTTATTTGCTATGGCGGAATTCAACTACGGGAATCAGTTGCAGCTAAAGCT GATTGGTTGGTGTTTAATTTTAAGGACTTGATTAATTCATTGGTGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc06g076510.3.1
PEP Infomation	Phosphoserine phosphatase, putative (AHRD V3.3 *** B9RLN8_RICCO),Pfam:PF00702
Sequence	MERLMSFQANSVHAVSRRQSSVLVPTFSRKISNTRVSVQPIGMVRNSKLFNSVVASVQPI GASAVTPFDNTLPSKEVLDVWHNANAVCFDVDSTVCIDEGIDEFAEFCGAGKAVAEWTAR AMNGSVPFEEALAVRLSLINPSLSQLQDFLKRPPRLSPGIDLLVKKLKDNNKDVYLVSGG FRQMINPVASILGIPLENIFANQILFGSNGEYVGFDKNEPTSRRGGKATAVQQIRKAHGY KSLVMIGDGATDLEARMPGGADLFICYGGIQLRESVAAKADWLVFNFKDLINSLV*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc06g076510.3.1
Transcript Infomation	Phosphoserine phosphatase, putative (AHRD V3.3 *** B9RLN8_RICCO),Pfam:PF00702
Sequence	GAAAGTACCAAATTGCTAAAATCACATGGACCTGCTTTAGATAGTCCAATGGGCTCAGCC CATAAGTATCCACATCATATTTAACAGGCCCTTTCTTCTTAAAAAGGTCAGGCCCAAATG ATTTCGGATTCAGGCCCACTACTATAAGAACTGTACTCCGAGATACCCACCAACTACTCG ATCAGCATTTTGAGCAAAAGACAACTTTAACTTTACGCAAAAAGATTTGATTTTTAACGA CACCCATCTCCTATTTTTGTGAAATTCAAGAATATTAAGGTGTTTCAATGGAGAGGTTGA TGAGTTTTCAGGCGAATTCTGTTCATGCTGTATCAAGACGGCAAAGCTCGGTACTAGTTC CTACATTTTCTCGAAAAATTAGTAATACAAGAGTTTCTGTTCAACCAATTGGAATGGTGA GGAATTCCAAATTGTTTAATTCCGTTGTTGCTTCAGTTCAGCCAATTGGAGCCTCTGCTG TAACCCCTTTTGACAACACATTGCCATCGAAAGAGGTTCTTGATGTTTGGCATAATGCGA ATGCTGTATGCTTTGATGTGGATAGCACTGTGTGCATAGACGAGGGCATTGATGAATTTG CGGAGTTTTGTGGTGCTGGAAAGGCTGTAGCGGAATGGACTGCTAGGGCCATGAATGGTT CTGTTCCATTTGAAGAAGCATTGGCAGTTCGTCTTTCTCTGATTAACCCTTCATTATCCC AACTCCAGGATTTTCTTAAGAGACCTCCACGACTTTCTCCTGGCATTGATCTATTGGTCA AGAAGCTGAAGGATAATAATAAAGATGTTTATCTGGTCTCTGGAGGGTTTCGTCAAATGA TCAATCCTGTTGCATCAATCCTCGGAATACCACTTGAAAATATCTTTGCCAATCAAATAC TCTTTGGGAGCAACGGAGAATATGTTGGGTTTGATAAAAATGAGCCAACTTCAAGGCGTG GCGGAAAGGCTACTGCAGTTCAACAAATAAGAAAGGCTCATGGATACAAGTCACTAGTGA TGATTGGTGATGGTGCTACTGATCTTGAGGCTCGTATGCCAGGTGGTGCGGACTTGTTTA TTTGCTATGGCGGAATTCAACTACGGGAATCAGTTGCAGCTAAAGCTGATTGGTTGGTGT TTAATTTTAAGGACTTGATTAATTCATTGGTGTAATGTGCTATTGCATCTATACTCTTCC ATATCTATTTTGTTTGTGAAGGCTTATGCAGCATTAAATTTCTGTGTTGATGTCATTTCG TTTAGGTAGAGCAGAAAATGCCTTATATCAGACACTGAAAGGTCATATCGATTGGCAGTT TAGCGCTTATTTTGAACAGATTGCAGAATGGCACCAGAAATACTATTATTAGTAGTAATA CATTCTTTCACACATAAGAGTTCTCAAGGAAAATACATCAAACAGATAACAACCAACTAG TAAAACGACTCAGCGCACAAGACACAGACAGAAAATAAGTAAACTCAAAATCTTCGACAG TACACACTTGACTTAATACTACAGGTTTGTTCCCAACCAGAGCATTTAACCAGAGATCTC AATGGACTTGACCTCAGGCTTCTTCACCTCTTCCTTTGGAACAGTAACAGTAAGCACTCC ATTCTCCATAGACGCCTTAACTTGATCCATCTTTGCATTCTCCGGAAGTCTAAATCTCCT CATGAATTTCCCGCTGCTTCGCTCCATGCGATGCCACTTATCATTCTTATCTTCCTTCTC CACGTTCCTCTCTCCGCTGATCTGAAGAACCCTATCCTCCTCGACTTCCACTTTGACTTC CTCCTTCTTAAGCCCTGGAAGATCAACCTTGAACACATGAGCTTCTGGAGTTTCCTTCCA GTCTATTCGTGTGTTGGCAAATGCAGAGCTCTCCCCTGAATTGGTACTTGGGAAGCCTAA TTCCCTGAATGGATCAAATACGTCAATTGAAAATGGATCGAACATGCTGCTGCTTCGTCG ATCGCCGAAAATTCTTGGGATCAGAGACATTTTCAGTGAACTTTTTGAGAATTTTCTACG TTTTTTTGCTTGCTTGCTTTCGATTTTGATGGTTGATTGAAGAGGAGGTGGTAGTTATTT ATAGCTTCATTAGAGGAGTGTTTAGCAGTTTCTCCATACTTCTACTATCCACAGAGACAT TTCTAGATATTCCAAAAGCAGATGTGGAGAAGTTTCTGGATAGGCCCATCACACAATTGA AATATCGAAATTGGGCTTGTT