Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc06g076340.3.1
CDS Infomation	Pumilio-like protein (AHRD V3.3 *** A0A0B0PMB1_GOSAR)
Sequence	ATGCTATCTGAATTTGGTCCAAGTCCAATGCTTAGAAACAATGATAATTCGTTTGGTGAT GAGTTTGAGCAAGAGATAGGAATGTTACTTCGTGAACAGAGGAGACAGGAAGCTGATGAT CATGAAAAAGAGCTGAATTTGTATAGAAGTGGGTCAGCTCCACCTACTATTGAGGGTTCT TTAAGTGCAGTAGGTGGGTTGTTTAACAATAATGGGTTCATGTCTGAAGAGGAGCTTAGG TCTGATCCTGCTTACTTATCATACTATTATGCGAATGTTAATCTTAACCCTAGGTTGCCT CCACCACTGTTGTCTAAGGAGGATTGGAGGTTTGCACAGAGGATGCAAGGAGGGAGTTCT GCAATTGGGGATAGGAGGAAGGTGAACAAGAATGATAATGGGAGTAGTAGTGGGAGGTCA CTCTTTGCTATGCCTCCGGGGTTTAACTCGATAAAAGCTGAGAACGAGAACGAGTCAGAC AAATTGCAGGGTTCAGTAGAGTGGGGTGGCGATGGGCTGATTGGGTTGCCAGGACTAGGA CTAGGTAGTAAACAGAAGAGCATTGCTGAAATATTTCAGGATGACTTGAGCCGTGCGACT CCTGCTCCTGGTCCCCCTTCACGACCAGCTAGCCGCAATGCTTTTGATGAAAGTAGTGAT AACTTAGGTTCAGCAGAAGCTGAGCTGTCTCACCTCCGTCATGAGTTTTCAACTTCAGAT CCTTTAAGGTCAGTATCCAATGGACAAGGCTCATCTGGTGTTCAACATGTTGGGGCGCCT GCTTCCTTTTCATATGCTGCTGCTTTGGGGGCTTCCTTATCAAGAAGCACTACTCCTGAT GCCCAGCGCATTGCTAGGGCTCCTAGCCCTTCCCTCACTCCTATCGGTGGAGGAAGGGGG GTAGGCAATTCTGAGAAGAGGAGTGCTAGTCCAAATTCATTTAATGGTGTCTCTCACACT GCCGAGTCTGCAGATCTGCTTGCTGCTTTGTCTAGCATGAATCTTTCAAATGGTAGTCAG AATAACTCTCAGCAGCATGCATATCTGAAGAGATCTGAATCTGCTCAGTTTAATATGTCG TCCAAATCTCACTCTGCTAAAGGACCATATATTGACACTGGTGCCGGCAACAATGGGCGG TCAGACCTTAACAGTTCTAACCATCATGACGATCTGCACAGATCTGCGGTTGCCTCTAAT AATTCTTATGTGAAAGGATCTCAAACATCCACACTGAATGGTGGAGGTGGTGTACTTTCT CAATATCCGCATATGGATAGTCCTTCCAATTATGGTTTAGGTAGTCATTCCGTCAATCCA GTGACAAGCCATCTTGGCAACTATAATCTGCCTCCTTTGTTTGAAACTGCTGCTGCCGCG TCTGGGATGGCTTTACCTGGAATGGACTCTCGAATGCTAGGGGCATCTCATTTGAACTCT GGGGTCTCAGAGCAGAATCTGGGCAGAATGGGAAATCATATGTCTGGAAGTGCTTTACAG GCATCCTTCATGGATCCTATGTATCTTCAGTACTTGACAGCTGAATATGTTGCACAGGTT TCCGCACTGAATGATCCTTCCATGGATAGGAATTACATGGGCAATTCTTATATGGACTTG TTTCAGAAAGCTTATCTTGGTAATGCACTATCTCCAAAGTCGCAATATGGTGTCCCACTC AGCAGTAAAGGTAGTGGTTCAAATCATCTTGGCTATTATGGCAATCCTGCATTTGGAGTT GGTTTATCATATCCTGGAAGTCCATTGGCAAGTTCTGTCGTTCCAAACTCTCCAGTCGGT CCTGGTAGTCCAATGAGGCACAGTGATTATAATATGAGGTTCTCTGGTGCAATGAGAAAC ATAACTTCAGGTGTAATCGGATCATGGCACTTGGATAACATGGAAAACAGCTTTGCTTCC TCTCTATTGGAAGAGTTCAAGAGTAATAAGACCAGGTGTTTTGAGCTTTCAGAAATTGCT GGTCACGTTGTCGAGTTCAGTGCGGACCAGTATGGTAGCCGGTTCATCCAACAAAAACTG GAAACTGCCACCCCTGAGGAGAAAAACATGGTTTTTCAGGAAATTATTCCCCAAGCTCTT ACTTTGATGACTGATGTTTTTGGTAATTACGTAATCCAGAAGTTTTTTGAACATGGAATG GCATCTCAGAGGAGAGAATTGGCTAGCAAACTCTTTAGCCATGTATTAACACTGAGCCTT CAGATGTACGGTTGCCGCGTGATTCAGAAGGCTATAGAAGTGGTAGATGTGGACCAGAAG ATTAAAATGGTTGAGGAGCTTGATGGTCATGTCATGCGCTGTGTACGAGATCAGAATGGG AATCATGTCGTCCAGAAGTGTATTGAATGTGTACCAGAAAAACACATTCAATTCATTGTC TCTACATTTTTTGGTCAAGTTGTGAATCTCTCTACCCATCCATATGGCTGTCGTGTAATT CAGAGAGTATTGGAACACTGCTGTGATGCAATTACACAAAGTAAAGTGATGGAAGAAATT CTGGGATCTGTTAGCATGTTGGCACAAGATCAGTATGGTAATTATGTTATTCAGCATGTC CTGGAGCATGGGAAGCCACACGAGCGTTCTGCTATTATTGAGGAACTAGCTGGGAAGATT GTGCAAATGAGCCAGCAGAAGTTCGCCTCTAATGTTGTTGAGAAGTGTCTAGCTTTTGGT GGTGCCAGCGAAAGACAGCTCCTGGTGGATGAGATGCTTGGCACGACTGATGAAAATGAA CCTCTTCAGGCAATGATGAAAGATCAGTTTGCAAATTACGTTGTACAGAAGGTGTTGGAA ACATGCAGTGATCAGCAACGCGAGCTGATCCTTTCTAGAATAAAGGTTCACTTGAATGCT CTGAAGAAATACACCTATGGAAAGCACATTGTTGCTCGTGTTGAGAAACTTGTTGCAGCT GGAGAACGAAGAATTGCTGCTCAGTCTCCAAATCTTGCTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc06g076340.3.1
PEP Infomation	Pumilio-like protein (AHRD V3.3 *** A0A0B0PMB1_GOSAR)
Sequence	MLSEFGPSPMLRNNDNSFGDEFEQEIGMLLREQRRQEADDHEKELNLYRSGSAPPTIEGS LSAVGGLFNNNGFMSEEELRSDPAYLSYYYANVNLNPRLPPPLLSKEDWRFAQRMQGGSS AIGDRRKVNKNDNGSSSGRSLFAMPPGFNSIKAENENESDKLQGSVEWGGDGLIGLPGLG LGSKQKSIAEIFQDDLSRATPAPGPPSRPASRNAFDESSDNLGSAEAELSHLRHEFSTSD PLRSVSNGQGSSGVQHVGAPASFSYAAALGASLSRSTTPDAQRIARAPSPSLTPIGGGRG VGNSEKRSASPNSFNGVSHTAESADLLAALSSMNLSNGSQNNSQQHAYLKRSESAQFNMS SKSHSAKGPYIDTGAGNNGRSDLNSSNHHDDLHRSAVASNNSYVKGSQTSTLNGGGGVLS QYPHMDSPSNYGLGSHSVNPVTSHLGNYNLPPLFETAAAASGMALPGMDSRMLGASHLNS GVSEQNLGRMGNHMSGSALQASFMDPMYLQYLTAEYVAQVSALNDPSMDRNYMGNSYMDL FQKAYLGNALSPKSQYGVPLSSKGSGSNHLGYYGNPAFGVGLSYPGSPLASSVVPNSPVG PGSPMRHSDYNMRFSGAMRNITSGVIGSWHLDNMENSFASSLLEEFKSNKTRCFELSEIA GHVVEFSADQYGSRFIQQKLETATPEEKNMVFQEIIPQALTLMTDVFGNYVIQKFFEHGM ASQRRELASKLFSHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVDVDQKIKMVEELDGHVMRCVRDQNG NHVVQKCIECVPEKHIQFIVSTFFGQVVNLSTHPYGCRVIQRVLEHCCDAITQSKVMEEI LGSVSMLAQDQYGNYVIQHVLEHGKPHERSAIIEELAGKIVQMSQQKFASNVVEKCLAFG GASERQLLVDEMLGTTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCSDQQRELILSRIKVHLNA LKKYTYGKHIVARVEKLVAAGERRIAAQSPNLA*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc06g076340.3.1
Transcript Infomation	Pumilio-like protein (AHRD V3.3 *** A0A0B0PMB1_GOSAR)
Sequence	AAAAAAAAAAGAGAAGAAAATGATAATCTTTTGTAGTGTTGAAAAACAAAACCCTAAAAC TACCTTATAACTACAATTCGCCGCAAAGATTGAATTTTTCTTGCACTCTCACTTTTTCTC TCTCTCCCACAACATATTCCATAAAATCCCCACAACCCCTTTACACCGCTTTCATTATCT TCATGTTTATACATAACTTTCATGGAGTTATGTGATCAAAGATTGGATTTTTCTTAAATT AAATTTTTGATTTTCATGTTTTGATATGTGGGGTTTTGGATTTTTGCTGTTTGTATCATA AAGTGTTGATCTTTTTAGCTTTCCTGGGTTGTTAGGGTTTGTTGGTATAAATTATATTTT GTTGTGGTGATGAGTAGAGTACTATAAAGTGATTGATATTTTCGTTTGTGTGTGAAAGAT GCTATCTGAATTTGGTCCAAGTCCAATGCTTAGAAACAATGATAATTCGTTTGGTGATGA GTTTGAGCAAGAGATAGGAATGTTACTTCGTGAACAGAGGAGACAGGAAGCTGATGATCA TGAAAAAGAGCTGAATTTGTATAGAAGTGGGTCAGCTCCACCTACTATTGAGGGTTCTTT AAGTGCAGTAGGTGGGTTGTTTAACAATAATGGGTTCATGTCTGAAGAGGAGCTTAGGTC TGATCCTGCTTACTTATCATACTATTATGCGAATGTTAATCTTAACCCTAGGTTGCCTCC ACCACTGTTGTCTAAGGAGGATTGGAGGTTTGCACAGAGGATGCAAGGAGGGAGTTCTGC AATTGGGGATAGGAGGAAGGTGAACAAGAATGATAATGGGAGTAGTAGTGGGAGGTCACT CTTTGCTATGCCTCCGGGGTTTAACTCGATAAAAGCTGAGAACGAGAACGAGTCAGACAA ATTGCAGGGTTCAGTAGAGTGGGGTGGCGATGGGCTGATTGGGTTGCCAGGACTAGGACT AGGTAGTAAACAGAAGAGCATTGCTGAAATATTTCAGGATGACTTGAGCCGTGCGACTCC TGCTCCTGGTCCCCCTTCACGACCAGCTAGCCGCAATGCTTTTGATGAAAGTAGTGATAA CTTAGGTTCAGCAGAAGCTGAGCTGTCTCACCTCCGTCATGAGTTTTCAACTTCAGATCC TTTAAGGTCAGTATCCAATGGACAAGGCTCATCTGGTGTTCAACATGTTGGGGCGCCTGC TTCCTTTTCATATGCTGCTGCTTTGGGGGCTTCCTTATCAAGAAGCACTACTCCTGATGC CCAGCGCATTGCTAGGGCTCCTAGCCCTTCCCTCACTCCTATCGGTGGAGGAAGGGGGGT AGGCAATTCTGAGAAGAGGAGTGCTAGTCCAAATTCATTTAATGGTGTCTCTCACACTGC CGAGTCTGCAGATCTGCTTGCTGCTTTGTCTAGCATGAATCTTTCAAATGGTAGTCAGAA TAACTCTCAGCAGCATGCATATCTGAAGAGATCTGAATCTGCTCAGTTTAATATGTCGTC CAAATCTCACTCTGCTAAAGGACCATATATTGACACTGGTGCCGGCAACAATGGGCGGTC AGACCTTAACAGTTCTAACCATCATGACGATCTGCACAGATCTGCGGTTGCCTCTAATAA TTCTTATGTGAAAGGATCTCAAACATCCACACTGAATGGTGGAGGTGGTGTACTTTCTCA ATATCCGCATATGGATAGTCCTTCCAATTATGGTTTAGGTAGTCATTCCGTCAATCCAGT GACAAGCCATCTTGGCAACTATAATCTGCCTCCTTTGTTTGAAACTGCTGCTGCCGCGTC TGGGATGGCTTTACCTGGAATGGACTCTCGAATGCTAGGGGCATCTCATTTGAACTCTGG GGTCTCAGAGCAGAATCTGGGCAGAATGGGAAATCATATGTCTGGAAGTGCTTTACAGGC ATCCTTCATGGATCCTATGTATCTTCAGTACTTGACAGCTGAATATGTTGCACAGGTTTC CGCACTGAATGATCCTTCCATGGATAGGAATTACATGGGCAATTCTTATATGGACTTGTT TCAGAAAGCTTATCTTGGTAATGCACTATCTCCAAAGTCGCAATATGGTGTCCCACTCAG CAGTAAAGGTAGTGGTTCAAATCATCTTGGCTATTATGGCAATCCTGCATTTGGAGTTGG TTTATCATATCCTGGAAGTCCATTGGCAAGTTCTGTCGTTCCAAACTCTCCAGTCGGTCC TGGTAGTCCAATGAGGCACAGTGATTATAATATGAGGTTCTCTGGTGCAATGAGAAACAT AACTTCAGGTGTAATCGGATCATGGCACTTGGATAACATGGAAAACAGCTTTGCTTCCTC TCTATTGGAAGAGTTCAAGAGTAATAAGACCAGGTGTTTTGAGCTTTCAGAAATTGCTGG TCACGTTGTCGAGTTCAGTGCGGACCAGTATGGTAGCCGGTTCATCCAACAAAAACTGGA AACTGCCACCCCTGAGGAGAAAAACATGGTTTTTCAGGAAATTATTCCCCAAGCTCTTAC TTTGATGACTGATGTTTTTGGTAATTACGTAATCCAGAAGTTTTTTGAACATGGAATGGC ATCTCAGAGGAGAGAATTGGCTAGCAAACTCTTTAGCCATGTATTAACACTGAGCCTTCA GATGTACGGTTGCCGCGTGATTCAGAAGGCTATAGAAGTGGTAGATGTGGACCAGAAGAT TAAAATGGTTGAGGAGCTTGATGGTCATGTCATGCGCTGTGTACGAGATCAGAATGGGAA TCATGTCGTCCAGAAGTGTATTGAATGTGTACCAGAAAAACACATTCAATTCATTGTCTC TACATTTTTTGGTCAAGTTGTGAATCTCTCTACCCATCCATATGGCTGTCGTGTAATTCA GAGAGTATTGGAACACTGCTGTGATGCAATTACACAAAGTAAAGTGATGGAAGAAATTCT GGGATCTGTTAGCATGTTGGCACAAGATCAGTATGGTAATTATGTTATTCAGCATGTCCT GGAGCATGGGAAGCCACACGAGCGTTCTGCTATTATTGAGGAACTAGCTGGGAAGATTGT GCAAATGAGCCAGCAGAAGTTCGCCTCTAATGTTGTTGAGAAGTGTCTAGCTTTTGGTGG TGCCAGCGAAAGACAGCTCCTGGTGGATGAGATGCTTGGCACGACTGATGAAAATGAACC TCTTCAGGCAATGATGAAAGATCAGTTTGCAAATTACGTTGTACAGAAGGTGTTGGAAAC ATGCAGTGATCAGCAACGCGAGCTGATCCTTTCTAGAATAAAGGTTCACTTGAATGCTCT GAAGAAATACACCTATGGAAAGCACATTGTTGCTCGTGTTGAGAAACTTGTTGCAGCTGG AGAACGAAGAATTGCTGCTCAGTCTCCAAATCTTGCTTAGCTTTTAGGAAAAAAGTTGTA CAGCTGACCGAGGCTAGTTTGAGCTACCTCTCTTCCTTTATTTCCCCCCGTATCTTGTGC TCTGGCTCTAGAACTCTCTTTGAGAGCATTATGGGCTGTGATTGCAAATAAAGTTGTTGC TTGTACTAGAGAACTGTATATTGTGTAGTTGGACGTTTATACATAGGATCAGGTATGCTG GGGCTCGGATGTCTAATATTCCTGATAGTCATGCAGAGGAAAATCAAGTCTCTAAACGGT GTATAAATGATAAAAAGGTGAGGTAGTTTTTATATCGACGAGACTGTACAAAAATGTCGC CATGTGGAAAGTTGATGTTTTAGGTGAAGCCAGAATTTTTATGTATGGTATTGACAACGT TCTATCATGGCCAAGTATGTCTCATTTCCTTCTATGTTTTGGTTTGCTTAACTTGCAACT TCAATGCTGTTATATTTGCTATGTTCGCTGTGTTGGCTTATCCAAATCATATTACA