Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc06g075490.1.1
CDS Infomation	Major facilitator superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT3G45660.2)
Sequence	ATGGAGGCTCCATCAGTGGCACAATTACCGGGAAGAACCGGAGGATGGATCACCTTCCCC TTTATCATAGCGACCACGGTCGGGTTGGCCCTATCATTTGTGGGTTGGACCAGCAATCTT ATTGTGTATCTTATTAAGGAATTTGATGTGGGGAGTATTGATGCTGCTCAAATATCAAAT TTAGTTAATGGTGCTGGAAGCTTAACTCCTGTCATTGCTGCAATTATTGCTGACTCTTTT CTTGGTTGTTTCACTACCATTTGGATTTCATCCATCATCTCATTATTGGGCACAATCCTT TTAGCTTTAACAGCTACAGTTGATTCTTTAAGGCCTAAACCATGTGAAGTTGGTTCAACC TCATGTACCCCTAAACGAATAGGTCAATATGTTGTGCTCTATACAGCCATAGTTCTAGCA ACATTGGGTAGTGGTGGTATCCGATCAACCCTTGCGACGATTGGAGCCAATCAGCTAGCT GATAAACCAAAGGATCAAGGGATTTTCTTCAATTGGTTCTTCTTCTTTTGGTATTTTGCT TCTGTTATAGGATCAACGGCTATTGTGTATGTTCAAGATAACGTCAGCTGGAAAGCTGGA TTTTTCATTTGTGCAGCCTCCAATATTGTTGCTTTAGTCATTTTCCTATTGGGAAGCAAA TTTTACACTAAGTTTAAGCCACAAGGAAGTCCATTTACCAGTTTGGCTCGTGTTATTGTT GCTTGTATTACCAAAAGACAACTTGCACTTGCATCGATTCCGGAGGATTTCTTCCAAGGA TGTAATGTAGTACCTAAAGCATTACCTGTTGTACCTTCCAGGACCTTCAGGTTTTTGAAC CATGCTGCCATTATAAGTGAAGGTGACGTAAAATCAGACGGTTCAATAAGTAATCGATGG AGGCTATGTTCAGTACAAGAAATAGAAGATTTCAAAACCTTAATTAAAATCTTACCGCTT TGGTCTACTAGTTTTTTTCTTGCCACAACAATTGGCGTACAAGCAAGCTTGTCAATCCTT CAAGCCTTAGCAATGAACCGCCACATAGGACCCAATTTCCAAATCCCAGCTGGATCCGTA CTCGTTTTTGTCCTCCTATCTACTACTCTATTCCTCGCCCTGTTCGATAAATTTATTTTA CCTACGTGGAAGAATTTGACTGGAAAATCACTTACACCTCTCCAGCGAATTGGGATTGGA CACGTGCTCAATTTTTTGAGTATGGGTGTTTCAGCCTTAGTCGAGTCAAAGAGACTAAAT GTAGCAAAATCAAATGAAGGTTCCAACATTGTGCCCATGTCAGTGTTATGGCTTGTGCCA CAATTAGTCATCGTTGGTATTGCGGAGGCACTTTATTTTCCTGGACAAGTATCATTGTAC TACCAAGAGTTTCCAATAACCTTAAAGAACTTGGCGATCGCGATGATTTCCGTGCTTGTT GGTATATCATTTTACTTGGCTACTGCTCTGATCGATGTTGTTAGAAGAACAAGTAGATGG TTACCAGGTGACATAAATAATGGAAGGGTGGACAATGTGTACTGGATATTGGTTATAGGG GGAGTAGTCAACTTTGGTTACTATGTAATATGTGCTTGGTATTACAAGTATCAAAACCTC AAGCAAGTTGATTCTCCTTATGATGAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc06g075490.1.1
PEP Infomation	Major facilitator superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT3G45660.2)
Sequence	MEAPSVAQLPGRTGGWITFPFIIATTVGLALSFVGWTSNLIVYLIKEFDVGSIDAAQISN LVNGAGSLTPVIAAIIADSFLGCFTTIWISSIISLLGTILLALTATVDSLRPKPCEVGST SCTPKRIGQYVVLYTAIVLATLGSGGIRSTLATIGANQLADKPKDQGIFFNWFFFFWYFA SVIGSTAIVYVQDNVSWKAGFFICAASNIVALVIFLLGSKFYTKFKPQGSPFTSLARVIV ACITKRQLALASIPEDFFQGCNVVPKALPVVPSRTFRFLNHAAIISEGDVKSDGSISNRW RLCSVQEIEDFKTLIKILPLWSTSFFLATTIGVQASLSILQALAMNRHIGPNFQIPAGSV LVFVLLSTTLFLALFDKFILPTWKNLTGKSLTPLQRIGIGHVLNFLSMGVSALVESKRLN VAKSNEGSNIVPMSVLWLVPQLVIVGIAEALYFPGQVSLYYQEFPITLKNLAIAMISVLV GISFYLATALIDVVRRTSRWLPGDINNGRVDNVYWILVIGGVVNFGYYVICAWYYKYQNL KQVDSPYDE*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc06g075490.1.1
Transcript Infomation	Major facilitator superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT3G45660.2)
Sequence	ATGGAGGCTCCATCAGTGGCACAATTACCGGGAAGAACCGGAGGATGGATCACCTTCCCC TTTATCATAGCGACCACGGTCGGGTTGGCCCTATCATTTGTGGGTTGGACCAGCAATCTT ATTGTGTATCTTATTAAGGAATTTGATGTGGGGAGTATTGATGCTGCTCAAATATCAAAT TTAGTTAATGGTGCTGGAAGCTTAACTCCTGTCATTGCTGCAATTATTGCTGACTCTTTT CTTGGTTGTTTCACTACCATTTGGATTTCATCCATCATCTCATTATTGGGCACAATCCTT TTAGCTTTAACAGCTACAGTTGATTCTTTAAGGCCTAAACCATGTGAAGTTGGTTCAACC TCATGTACCCCTAAACGAATAGGTCAATATGTTGTGCTCTATACAGCCATAGTTCTAGCA ACATTGGGTAGTGGTGGTATCCGATCAACCCTTGCGACGATTGGAGCCAATCAGCTAGCT GATAAACCAAAGGATCAAGGGATTTTCTTCAATTGGTTCTTCTTCTTTTGGTATTTTGCT TCTGTTATAGGATCAACGGCTATTGTGTATGTTCAAGATAACGTCAGCTGGAAAGCTGGA TTTTTCATTTGTGCAGCCTCCAATATTGTTGCTTTAGTCATTTTCCTATTGGGAAGCAAA TTTTACACTAAGTTTAAGCCACAAGGAAGTCCATTTACCAGTTTGGCTCGTGTTATTGTT GCTTGTATTACCAAAAGACAACTTGCACTTGCATCGATTCCGGAGGATTTCTTCCAAGGA TGTAATGTAGTACCTAAAGCATTACCTGTTGTACCTTCCAGGACCTTCAGGTTTTTGAAC CATGCTGCCATTATAAGTGAAGGTGACGTAAAATCAGACGGTTCAATAAGTAATCGATGG AGGCTATGTTCAGTACAAGAAATAGAAGATTTCAAAACCTTAATTAAAATCTTACCGCTT TGGTCTACTAGTTTTTTTCTTGCCACAACAATTGGCGTACAAGCAAGCTTGTCAATCCTT CAAGCCTTAGCAATGAACCGCCACATAGGACCCAATTTCCAAATCCCAGCTGGATCCGTA CTCGTTTTTGTCCTCCTATCTACTACTCTATTCCTCGCCCTGTTCGATAAATTTATTTTA CCTACGTGGAAGAATTTGACTGGAAAATCACTTACACCTCTCCAGCGAATTGGGATTGGA CACGTGCTCAATTTTTTGAGTATGGGTGTTTCAGCCTTAGTCGAGTCAAAGAGACTAAAT GTAGCAAAATCAAATGAAGGTTCCAACATTGTGCCCATGTCAGTGTTATGGCTTGTGCCA CAATTAGTCATCGTTGGTATTGCGGAGGCACTTTATTTTCCTGGACAAGTATCATTGTAC TACCAAGAGTTTCCAATAACCTTAAAGAACTTGGCGATCGCGATGATTTCCGTGCTTGTT GGTATATCATTTTACTTGGCTACTGCTCTGATCGATGTTGTTAGAAGAACAAGTAGATGG TTACCAGGTGACATAAATAATGGAAGGGTGGACAATGTGTACTGGATATTGGTTATAGGG GGAGTAGTCAACTTTGGTTACTATGTAATATGTGCTTGGTATTACAAGTATCAAAACCTC AAGCAAGTTGATTCTCCTTATGATGAGTGA