Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc06g075280.3.1

CDS Infomation

Vicilin-like antimicrobial peptides 2-2 (AHRD V3.3 *** W9SCA8_9ROSA)

Sequence

ATGGGAAATAGTAGGACCACATTGCTGCTTCTAGTGCTGCTACTTTTCGCAGCACTAGTG
TCCTTTGTTGGTGGCTATGAATATGAAGAGGAAAAAAGTGAGCAAAGGACACAAGGCGAA
AAATGGTTCTTGTTGCGTCAGCTACATAATGTTGTGAAAACTGATGCTGGATCTATGAGA
ATGGTGAAGGGTGGCTATCGAGCGGGTTCATTTTTACATAGTCCAATGCATATTGGTTTC
ATCTCCATGGAACCAAATAGCCTATTCATCCCTCAGTATCTTGATTCCGATCTTCTCCTT
TTTGTTCATCAAGGGGAAGCGAGAATTGGTAACATTCATAAGGATGAATTAGCGGAAAGG
AGTTTGAAACAGGGAGATGTGTACACAATTCCCGCTGGATCAGCTTTTTATTTGGAGAAT
AGTAATGAAAACCAGAGACTTCGCATAATTTGTAGTATTGGTATTTCCTCAGAATCCATG
GGATGGAATGCTTTCCAGTCCTATTTCATTGGCGGTGGAGTTCATACATCTATTCTTGCG
GGATTCGATCATACCACATTATCAACTGCTCTGAATGTATCGACAGCAGAATTAAAGACG
TTCTTGACCAGGCAAACTTCGGGGCCAATCGTGCATTTATCTAATTCTCATCAGTTAAAC
ATTTGGTTCAAATTCTTAGCCCAAGAACCCCATCAGAAACTAGCTCACTTGAAGAGGATT
GTGAATTTTAGGGAAGAATCTAACCACAAAGAGGAAGAATCAACATGGTCATTGAGGAAA
TTTCTGTTTAATCTATTAGACGGGGAAGACGTTGTCAAGAGAGTTAATCACGAAGCTCCA
TCAACGTACAATCTTTACAACAGAAATCCTGATTTCGAGAATGACTATGGATGGAGCAAG
GCATTGGATGAGTCTGATTATTCTCCTTTAGAACAATACGGCAATTGTGTCTATCTTGTC
AGTCTAACTTCGGGATCCATGATGGCACCTCATGTTAATCCAAGAGCAATAGAGTACGGA
ATAGTGTTGAAAGGGACCGGAAGGATCCAAATTGTGTATCCGAATGGTACTTTAGCTATG
AATGCAAGAGTACGAGAAGGGGACGTTTTTTGGGTGCCAAGGTACTTCCCCTTCTGCCAA
ATTGCTTCATCGAATGGCCCATTTGAGTTCTTCGGCTTCAGTACATCAGCAAGGAGGAAC
CATCCACAGTTCTTGGTGGGTAGGAACTCATTGATGCAGAGCTTAAGCGGGCCAGAATTT
GCAGCTTCATTTGGAATTGACGAGGAAAGGCTAAAGAGGATTGCCAACGCACAAAGTGAA
CAAGTTATCTTGCCCTCATCATCGTCGGATTCTCCTATGGAGATGAACTTAGGTTTTTAT
TAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc06g075280.3.1

PEP Infomation

Vicilin-like antimicrobial peptides 2-2 (AHRD V3.3 *** W9SCA8_9ROSA)

Sequence

MGNSRTTLLLLVLLLFAALVSFVGGYEYEEEKSEQRTQGEKWFLLRQLHNVVKTDAGSMR
MVKGGYRAGSFLHSPMHIGFISMEPNSLFIPQYLDSDLLLFVHQGEARIGNIHKDELAER
SLKQGDVYTIPAGSAFYLENSNENQRLRIICSIGISSESMGWNAFQSYFIGGGVHTSILA
GFDHTTLSTALNVSTAELKTFLTRQTSGPIVHLSNSHQLNIWFKFLAQEPHQKLAHLKRI
VNFREESNHKEEESTWSLRKFLFNLLDGEDVVKRVNHEAPSTYNLYNRNPDFENDYGWSK
ALDESDYSPLEQYGNCVYLVSLTSGSMMAPHVNPRAIEYGIVLKGTGRIQIVYPNGTLAM
NARVREGDVFWVPRYFPFCQIASSNGPFEFFGFSTSARRNHPQFLVGRNSLMQSLSGPEF
AASFGIDEERLKRIANAQSEQVILPSSSSDSPMEMNLGFY*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc06g075280.3.1

Transcript Infomation

Vicilin-like antimicrobial peptides 2-2 (AHRD V3.3 *** W9SCA8_9ROSA)

Sequence

AAGTTAATCGGACATCTTGTTGATTATTTTTGCCGGTGACTCGATTACATTTATAACTTT
GAAATTTATAATTTTGAGATTTCAATCATTTCTGTTAGAACCCTAAGTGGGTTTTGATTT
TGCGTTTGGAATTTGATATAGGAGATGGGTGACCATTCCTAGATAAACTTTTTTTAAAAA
AATAATGAGTATCCATGTATCGTGACAAAATTGTATTATTAGTATGGCAAAGTATAAGTT
TTTTTAATGAATTGTTTATGCTAAACATTTATTGAAAACCTTAATACAAGGGTAAAAATT
AGTATTTACATCTTCAAAAATTAATACATTTTCTTGGTGCACTAGAGTAGCTCTTTGAAT
TGGTCATGAAATTTGGCTACAATATTATTTGGTTCAGTATACAAGCTTCAACAAAATATT
TTTTAGGATCTAAACGTTAAGTAGACAAGAAAAGCCTAGTCATTTTGCATGGTTGACAAC
AACTCCCTTTAAAATCTCATCATTCCCTCTATATAAACAACTACAGATCCTTCATCCCTA
ACTGATTAAAGACAACTTGCTTTAGTGTAACATTTTGAAAATGGGAAATAGTAGGACCAC
ATTGCTGCTTCTAGTGCTGCTACTTTTCGCAGCACTAGTGTCCTTTGTTGGTGGCTATGA
ATATGAAGAGGAAAAAAGTGAGCAAAGGACACAAGGCGAAAAATGGTTCTTGTTGCGTCA
GCTACATAATGTTGTGAAAACTGATGCTGGATCTATGAGAATGGTGAAGGGTGGCTATCG
AGCGGGTTCATTTTTACATAGTCCAATGCATATTGGTTTCATCTCCATGGAACCAAATAG
CCTATTCATCCCTCAGTATCTTGATTCCGATCTTCTCCTTTTTGTTCATCAAGGGGAAGC
GAGAATTGGTAACATTCATAAGGATGAATTAGCGGAAAGGAGTTTGAAACAGGGAGATGT
GTACACAATTCCCGCTGGATCAGCTTTTTATTTGGAGAATAGTAATGAAAACCAGAGACT
TCGCATAATTTGTAGTATTGGTATTTCCTCAGAATCCATGGGATGGAATGCTTTCCAGTC
CTATTTCATTGGCGGTGGAGTTCATACATCTATTCTTGCGGGATTCGATCATACCACATT
ATCAACTGCTCTGAATGTATCGACAGCAGAATTAAAGACGTTCTTGACCAGGCAAACTTC
GGGGCCAATCGTGCATTTATCTAATTCTCATCAGTTAAACATTTGGTTCAAATTCTTAGC
CCAAGAACCCCATCAGAAACTAGCTCACTTGAAGAGGATTGTGAATTTTAGGGAAGAATC
TAACCACAAAGAGGAAGAATCAACATGGTCATTGAGGAAATTTCTGTTTAATCTATTAGA
CGGGGAAGACGTTGTCAAGAGAGTTAATCACGAAGCTCCATCAACGTACAATCTTTACAA
CAGAAATCCTGATTTCGAGAATGACTATGGATGGAGCAAGGCATTGGATGAGTCTGATTA
TTCTCCTTTAGAACAATACGGCAATTGTGTCTATCTTGTCAGTCTAACTTCGGGATCCAT
GATGGCACCTCATGTTAATCCAAGAGCAATAGAGTACGGAATAGTGTTGAAAGGGACCGG
AAGGATCCAAATTGTGTATCCGAATGGTACTTTAGCTATGAATGCAAGAGTACGAGAAGG
GGACGTTTTTTGGGTGCCAAGGTACTTCCCCTTCTGCCAAATTGCTTCATCGAATGGCCC
ATTTGAGTTCTTCGGCTTCAGTACATCAGCAAGGAGGAACCATCCACAGTTCTTGGTGGG
TAGGAACTCATTGATGCAGAGCTTAAGCGGGCCAGAATTTGCAGCTTCATTTGGAATTGA
CGAGGAAAGGCTAAAGAGGATTGCCAACGCACAAAGTGAACAAGTTATCTTGCCCTCATC
ATCGTCGGATTCTCCTATGGAGATGAACTTAGGTTTTTATTAGTTTAGTGGAGAATCTAG
TATGATTGACGCATTGCCCTTTTGAGTTGTGAATAAGACGGATTGTTTTTTTAATACATA
GTTTCTGTTTGTGGTTTGAGCCTCATTAACAAAATTCAAAATTTAACTGATTCTAGCTCA
GGAATTTATTTCATATTAAAAGTAACTTGTTTTTAATTGGTTTTTTAATTATTCATCACC
ATTTAATTTATTTATATCTTAGTGAATGATGCATTTTCTCAAGAATTACGTGGTTTGTTA
GTGTTAAATTGGAATGTGTTTTGACAAAAACCAATTTTTTTTTTTTTACAAAAGGCAAAA
TTATCAAAAATTTCACTTAATTAGTTTGATTTAGTTTAAATATTTTGAAATATCAACTTA
ATTGATTTGATTTCGCTTTAAAGGCTTTAGTGGCGAGAAAAGATAAGTTGTGAATGCCTT
AAAAAAGCAAAACAATATGTTGCAGCAAACACTTCATCGCCACAAAAACTACTTTT