Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc06g074240.2.1
CDS Infomation

Beta-carotene
Sequence

ATGGCGATAGTGTATGCGGTTGTGGCGAGAGGCACAACGGTGCTGGCGGAGTTCAGTGCC
GTGACGGGGAACACCGGGGCGGTGGCGCGGCGGATATTGGAGAAGCTTCCAAATGAAACG
GAATCGAGGCTTTGTTTCTCTCAGGATCGGACTGAAAATTCTGTTAGTCATTTGAGTTAT
CCTTCACTCCTGCCACTAACGAATGCTGTTCTAGGGAGGATTCCGTTCTCATACTTGGAG
GATATTCAGATGAGGTTCATGAAGAACTATGGTAAGGTGGCTTCTTATGCTCCTGCCTAT
TCCATGAATGATGAATTCTCAAGGGTCTTGCATCAGCAAATGGAGTTCTTTTCAAGTAAT
CCAAGTGCAGATACACTAAATCGTGTCAGAGGAGAAGTTGGTGAGGCAAGTATTGAGTCC
ATGGATGCATGCATTAACTCTCCACAATATCCACAGTTTATTAAATTATCAATGATACGC
ACCATCATGGTTGATAATATTGAGAAAATACTTGAGAGGGGGGATCGGATTGAGCTACTC
GTTGACAAAACAGGAACAATGCAAGACAATGCATTTCACTTCAGGAAACAGTCGAAGCGC
CTTAGGAGAGCTCTTTGGATGAAAAACGCAAAGCTCCTCTTTCTTGATTTAGCACCCACA
TCAAAGCCAGAGTCTTTAGATGTTAACATCTCATGGGTTGATCCTAATTCGAATCGGGCT
CAATTCGACGTGATCATTATCGGAGCTGGCCCTGCTGGGCTCAGGCTAGCTGAACAAGTA
TGTTGTGTTGACCCTTCACCACTCTCCATGTGGCCAAATAATTATGGTGTTTGGGTTGAT
GAGTTTGAGAATTTAGGACTGGAAGATTGTTTAGATCATAAATGGCCTATGACTTGTGTG
CATATAAATGATAACAAAACTAAGTATTTGGGAAGACCATATGGTAGAGTTAGTAGAAAG
AAGCTGAAGTTGAAATTGTTGAATAGTTGTGTTGAGAACAGAGTGAAGTTTTATAAAGCT
AAGGTTTGGAAAGTGGAACATGAAGAATTTGAGTCTTCAATTGTTTGTGATGATGGTAAG
AAGATAAGAGGTAGTTTGGTTGTGGATGCAAGTGGTTTTGCTAGTGATTTTATAGAGTAT
GACAGGCCAAGAAACCATGGTTATCAAATTGCTCATGGGGTTTTAGTAGAAGTTGATAAT
CATCCATTTGATTTGGATAAAATGGTGCTTATGGATTGGAGGGATTCTCATTTGGGTAAT
GAGCCATATTTAAGGGTGAATAATGCTAAAGAACCAACATTCTTGTATGCAATGCCATTT
GATAGAGATTTGGTTTTCTTGGAAGAGACTTCTTTGGTGAGTCGTCCTGTTTTATCGTAT
ATGGAAGTAAAAAGAAGGATGGTGGCAAGATTAAGGCATTTGGGGATCAAAGTGAAAAGT
GTTATTGAGGAAGAGAAATGTGTGATCCCTATGGGAGGACCACTTCCGCGGATTCCTCAA
AATGTTATGGCTATTGGTGGGAATTCAGGGATAGTTCATCCATCAACAGGGTACATGGTG
GCTAGGAGCATGGCTTTAGCACCAGTACTAGCTGAAGCCATCGTCGAGGGGCTTGGCTCA
ACAAGAATGATAAGAGGGTCTCAACTTTACCATAGAGTTTGGAATGGTTTGTGGCCTTTG
GATAGAAGATGTGTTAGAGAATGTTATTCATTTGGGATGGAGACATTGTTGAAGCTTGAT
TTGAAAGGGACTAGGAGATTGTTTGACGCTTTCTTTGATCTTGATCCTAAATACTGGCAA
GGGTTCCTTTCTTCAAGATTGTCTGTCAAAGAACTTGGTTTACTCAGCTTGTGTCTTTTC
GGACATGGCTCAAACATGACTAGGTTGGATATTGTTACAAAATGTCCTCTTCCTTTGGTT
AGACTGATTGGCAATCTAGCAATAGAGAGCCTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc06g074240.2.1
PEP Infomation

Beta-carotene
Sequence

MAIVYAVVARGTTVLAEFSAVTGNTGAVARRILEKLPNETESRLCFSQDRTENSVSHLSY
PSLLPLTNAVLGRIPFSYLEDIQMRFMKNYGKVASYAPAYSMNDEFSRVLHQQMEFFSSN
PSADTLNRVRGEVGEASIESMDACINSPQYPQFIKLSMIRTIMVDNIEKILERGDRIELL
VDKTGTMQDNAFHFRKQSKRLRRALWMKNAKLLFLDLAPTSKPESLDVNISWVDPNSNRA
QFDVIIIGAGPAGLRLAEQVCCVDPSPLSMWPNNYGVWVDEFENLGLEDCLDHKWPMTCV
HINDNKTKYLGRPYGRVSRKKLKLKLLNSCVENRVKFYKAKVWKVEHEEFESSIVCDDGK
KIRGSLVVDASGFASDFIEYDRPRNHGYQIAHGVLVEVDNHPFDLDKMVLMDWRDSHLGN
EPYLRVNNAKEPTFLYAMPFDRDLVFLEETSLVSRPVLSYMEVKRRMVARLRHLGIKVKS
VIEEEKCVIPMGGPLPRIPQNVMAIGGNSGIVHPSTGYMVARSMALAPVLAEAIVEGLGS
TRMIRGSQLYHRVWNGLWPLDRRCVRECYSFGMETLLKLDLKGTRRLFDAFFDLDPKYWQ
GFLSSRLSVKELGLLSLCLFGHGSNMTRLDIVTKCPLPLVRLIGNLAIESL*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc06g074240.2.1
Transcript Infomation

Beta-carotene
Sequence

ATGGCGATAGTGTATGCGGTTGTGGCGAGAGGCACAACGGTGCTGGCGGAGTTCAGTGCC
GTGACGGGGAACACCGGGGCGGTGGCGCGGCGGATATTGGAGAAGCTTCCAAATGAAACG
GAATCGAGGCTTTGTTTCTCTCAGGATCGGACTGAAAATTCTGTTAGTCATTTGAGTTAT
CCTTCACTCCTGCCACTAACGAATGCTGTTCTAGGGAGGATTCCGTTCTCATACTTGGAG
GATATTCAGATGAGGTTCATGAAGAACTATGGTAAGGTGGCTTCTTATGCTCCTGCCTAT
TCCATGAATGATGAATTCTCAAGGGTCTTGCATCAGCAAATGGAGTTCTTTTCAAGTAAT
CCAAGTGCAGATACACTAAATCGTGTCAGAGGAGAAGTTGGTGAGGCAAGTATTGAGTCC
ATGGATGCATGCATTAACTCTCCACAATATCCACAGTTTATTAAATTATCAATGATACGC
ACCATCATGGTTGATAATATTGAGAAAATACTTGAGAGGGGGGATCGGATTGAGCTACTC
GTTGACAAAACAGGAACAATGCAAGACAATGCATTTCACTTCAGGAAACAGTCGAAGCGC
CTTAGGAGAGCTCTTTGGATGAAAAACGCAAAGCTCCTCTTTCTTGATTTAGCACCCACA
TCAAAGCCAGAGTCTTTAGATGTTAACATCTCATGGGTTGATCCTAATTCGAATCGGGCT
CAATTCGACGTGATCATTATCGGAGCTGGCCCTGCTGGGCTCAGGCTAGCTGAACAAGTA
TGTTGTGTTGACCCTTCACCACTCTCCATGTGGCCAAATAATTATGGTGTTTGGGTTGAT
GAGTTTGAGAATTTAGGACTGGAAGATTGTTTAGATCATAAATGGCCTATGACTTGTGTG
CATATAAATGATAACAAAACTAAGTATTTGGGAAGACCATATGGTAGAGTTAGTAGAAAG
AAGCTGAAGTTGAAATTGTTGAATAGTTGTGTTGAGAACAGAGTGAAGTTTTATAAAGCT
AAGGTTTGGAAAGTGGAACATGAAGAATTTGAGTCTTCAATTGTTTGTGATGATGGTAAG
AAGATAAGAGGTAGTTTGGTTGTGGATGCAAGTGGTTTTGCTAGTGATTTTATAGAGTAT
GACAGGCCAAGAAACCATGGTTATCAAATTGCTCATGGGGTTTTAGTAGAAGTTGATAAT
CATCCATTTGATTTGGATAAAATGGTGCTTATGGATTGGAGGGATTCTCATTTGGGTAAT
GAGCCATATTTAAGGGTGAATAATGCTAAAGAACCAACATTCTTGTATGCAATGCCATTT
GATAGAGATTTGGTTTTCTTGGAAGAGACTTCTTTGGTGAGTCGTCCTGTTTTATCGTAT
ATGGAAGTAAAAAGAAGGATGGTGGCAAGATTAAGGCATTTGGGGATCAAAGTGAAAAGT
GTTATTGAGGAAGAGAAATGTGTGATCCCTATGGGAGGACCACTTCCGCGGATTCCTCAA
AATGTTATGGCTATTGGTGGGAATTCAGGGATAGTTCATCCATCAACAGGGTACATGGTG
GCTAGGAGCATGGCTTTAGCACCAGTACTAGCTGAAGCCATCGTCGAGGGGCTTGGCTCA
ACAAGAATGATAAGAGGGTCTCAACTTTACCATAGAGTTTGGAATGGTTTGTGGCCTTTG
GATAGAAGATGTGTTAGAGAATGTTATTCATTTGGGATGGAGACATTGTTGAAGCTTGAT
TTGAAAGGGACTAGGAGATTGTTTGACGCTTTCTTTGATCTTGATCCTAAATACTGGCAA
GGGTTCCTTTCTTCAAGATTGTCTGTCAAAGAACTTGGTTTACTCAGCTTGTGTCTTTTC
GGACATGGCTCAAACATGACTAGGTTGGATATTGTTACAAAATGTCCTCTTCCTTTGGTT
AGACTGATTGGCAATCTAGCAATAGAGAGCCTTTGA