Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc06g073350.3.1
CDS Infomation	Calcium-dependent protein kinase, putative (AHRD V3.3 *** B9T5K7_RICCO)
Sequence	ATGTTGTTGTTATTAACAATTTCAAACACTTGTATCCGATTACATAACCGTTTATCAACT ATTTACGGTCAGCTAATTCGAACGGGGTTATGTTTTTGTAATAGGTATGAGTTTGGGAAG GAGTTAGGAAGAGGGGAATTTGGTATAACATACCAATGTGTAGACAAGACAAGTGGGGAA AATGTGGCATGTAAGACAATAGCAAAGAGCAAATTGAGAACAGAGATAGATGTTGAAGAT GTGAGGAGGGAGGTTGTTATTATGAGGCATTTGCCTAAACACCCTAATATTGTTAGCTAC AAAGAAGTTTATGAAGATAAAGATGCTGTTTATCTTGTTATGGAACTCTGTGAAGGTGGA GAATTATTTGATAGAATTGTTGCAAGAGGACATTATACTGAAAGAGCTGCTGCTCTTGTT ACTAAAACTATTCTTGAAGTTGTTCAGGTATGCCACAAGCATGGGGTAATTCATAGAGAC CTTAAACCTGAGAACTTTTTATATGCCAATGTAAATGAAAATGCCCAATTAAAAGCTATT GATTTTGGACTTTCCATTTTCTTTGAACCTGGTCAGAGATTTGGTGAAATAGTAGGAAGC CCGTATTACATGGCTCCGGAAGTTCTTAGAAGAAATTATGGACCAGAAGTTGATGTATGG AGTGCTGGGGTTATTCTCTACATTTTGTTATGTGGTGTTCCCCCTTTTTGGGCAGAAACT GAAGAAGGAATTGCACATGCAATAGTGAAAGGTACAATAGACTTCAACAGAGATCCATGG CCAAGAGTATCTGATGAAGCTAAAGATCTTGTCAAAGGAATGCTTGATGCTAATCCTTAC AACAGGTTTACTGTTGAAGAAGTACTTGATCATCACTGGATACAGAATGCAGACAAGGTG TCTAATGTTTGTTTGGGAGAAGGTGTGAGAACCAAGATCAAGCAATTCACGTTGATGAAT AAATTCAAGAAGAAAGTTCTAAGAGTTGTAGCAGATAACTTACCGCTAGATCAAGTACAC GGTATAAAACAAATGTTTTACATGATGGACACTGACAAAAATGGAAACTTAAGTTTCCAA GAACTCAAAGATGGTCTACATATGATGGGACAAACTGTTGCTGAACCTGAAGTCCACTTG TTAATGGATGCTGCTGATGTTGATGGAAATGGAATGTTGAATTGTGAGGAATTTGTTACA ATGGCTGTGCACTTACAAAGGCTAAGCAATGATGATCATCTTAAACAAGCATTTCTCCAA TTTGACAAGAATAAAAGTGGATTTATTGAGTATGAAGACTTGAAAATCTCTTTGTTTGAT GATAGTCTTGCCCCACAAAATGATCAAGTTATTAATGACATCATATTTGATGCTGATTTG GATAAGGATGGAAGGATAAGTTATCAAGATTTCAAGGTTATGATGTCAACAGGGACAGAT TGGAAAATGGGTTCACGTCAATACTCAAAAGCAATGCTGAATGCACTTAGCATGAGACTT TTCAAAGACAAATCCATGCAATTGACAAATTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc06g073350.3.1
PEP Infomation	Calcium-dependent protein kinase, putative (AHRD V3.3 *** B9T5K7_RICCO)
Sequence	MLLLLTISNTCIRLHNRLSTIYGQLIRTGLCFCNRYEFGKELGRGEFGITYQCVDKTSGE NVACKTIAKSKLRTEIDVEDVRREVVIMRHLPKHPNIVSYKEVYEDKDAVYLVMELCEGG ELFDRIVARGHYTERAAALVTKTILEVVQVCHKHGVIHRDLKPENFLYANVNENAQLKAI DFGLSIFFEPGQRFGEIVGSPYYMAPEVLRRNYGPEVDVWSAGVILYILLCGVPPFWAET EEGIAHAIVKGTIDFNRDPWPRVSDEAKDLVKGMLDANPYNRFTVEEVLDHHWIQNADKV SNVCLGEGVRTKIKQFTLMNKFKKKVLRVVADNLPLDQVHGIKQMFYMMDTDKNGNLSFQ ELKDGLHMMGQTVAEPEVHLLMDAADVDGNGMLNCEEFVTMAVHLQRLSNDDHLKQAFLQ FDKNKSGFIEYEDLKISLFDDSLAPQNDQVINDIIFDADLDKDGRISYQDFKVMMSTGTD WKMGSRQYSKAMLNALSMRLFKDKSMQLTN*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc06g073350.3.1
Transcript Infomation	Calcium-dependent protein kinase, putative (AHRD V3.3 *** B9T5K7_RICCO)
Sequence	ATGTTGTTGTTATTAACAATTTCAAACACTTGTATCCGATTACATAACCGTTTATCAACT ATTTACGGTCAGCTAATTCGAACGGGGTTATGTTTTTGTAATAGGTATGAGTTTGGGAAG GAGTTAGGAAGAGGGGAATTTGGTATAACATACCAATGTGTAGACAAGACAAGTGGGGAA AATGTGGCATGTAAGACAATAGCAAAGAGCAAATTGAGAACAGAGATAGATGTTGAAGAT GTGAGGAGGGAGGTTGTTATTATGAGGCATTTGCCTAAACACCCTAATATTGTTAGCTAC AAAGAAGTTTATGAAGATAAAGATGCTGTTTATCTTGTTATGGAACTCTGTGAAGGTGGA GAATTATTTGATAGAATTGTTGCAAGAGGACATTATACTGAAAGAGCTGCTGCTCTTGTT ACTAAAACTATTCTTGAAGTTGTTCAGGTATGCCACAAGCATGGGGTAATTCATAGAGAC CTTAAACCTGAGAACTTTTTATATGCCAATGTAAATGAAAATGCCCAATTAAAAGCTATT GATTTTGGACTTTCCATTTTCTTTGAACCTGGTCAGAGATTTGGTGAAATAGTAGGAAGC CCGTATTACATGGCTCCGGAAGTTCTTAGAAGAAATTATGGACCAGAAGTTGATGTATGG AGTGCTGGGGTTATTCTCTACATTTTGTTATGTGGTGTTCCCCCTTTTTGGGCAGAAACT GAAGAAGGAATTGCACATGCAATAGTGAAAGGTACAATAGACTTCAACAGAGATCCATGG CCAAGAGTATCTGATGAAGCTAAAGATCTTGTCAAAGGAATGCTTGATGCTAATCCTTAC AACAGGTTTACTGTTGAAGAAGTACTTGATCATCACTGGATACAGAATGCAGACAAGGTG TCTAATGTTTGTTTGGGAGAAGGTGTGAGAACCAAGATCAAGCAATTCACGTTGATGAAT AAATTCAAGAAGAAAGTTCTAAGAGTTGTAGCAGATAACTTACCGCTAGATCAAGTACAC GGTATAAAACAAATGTTTTACATGATGGACACTGACAAAAATGGAAACTTAAGTTTCCAA GAACTCAAAGATGGTCTACATATGATGGGACAAACTGTTGCTGAACCTGAAGTCCACTTG TTAATGGATGCTGCTGATGTTGATGGAAATGGAATGTTGAATTGTGAGGAATTTGTTACA ATGGCTGTGCACTTACAAAGGCTAAGCAATGATGATCATCTTAAACAAGCATTTCTCCAA TTTGACAAGAATAAAAGTGGATTTATTGAGTATGAAGACTTGAAAATCTCTTTGTTTGAT GATAGTCTTGCCCCACAAAATGATCAAGTTATTAATGACATCATATTTGATGCTGATTTG GATAAGGATGGAAGGATAAGTTATCAAGATTTCAAGGTTATGATGTCAACAGGGACAGAT TGGAAAATGGGTTCACGTCAATACTCAAAAGCAATGCTGAATGCACTTAGCATGAGACTT TTCAAAGACAAATCCATGCAATTGACAAATTAA