Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc06g073340.3.1

CDS Infomation

RING/U-box superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT1G05890.1)

Sequence

ATGGATTCAGAAGATGATATGCACGATGCTAATGATATGGAGTCGGTAGATGAGGATTTC
TACAGTGACGGTGATGCGGCAGATAGCGATGCTGATGTTGCTGATTATGATTTCATGGGT
AATGAAACCGATGATTCCGATGAACAAGCTGTTAGTCGTATGCAGAAAAATTATACTGTC
TTGAAAGAAGAAGATATACGTCAGCGACAGGAGGAGGATATGACGACAATTTCTACTCTT
CTCTCCATATCAAGAGAAGCTGCCTGTATATTACTTCGACGTTATAACTGGAGTGTGAAC
AAGGTGCATGAGGAGTGGTTTGCTGATGAAGAAAGAGTGCGCAAGTCTGCCGGCTTGTTG
GAGAAGCCTGTTGTCTCTCTTTCAAGAGTTATAGATGTGGTGTGTGGGATTTGCTTTGAC
AACTTCCTTCCTGCTGACATAATATCCCTCGGGTGCGGTCATCCTTTTTGTACTTCTTGC
TGGAAAGCTTACATTACCACATCCATCAACGATGGCCCTGGATGCTTGACGCTGCGATGT
CCTGACCCATCATGCGATGTCGCCATTGGTCAAGATATGATTGATACATTGACATCTGGT
GAAGATAAGGAGAAGTACTATCGTTACCTTCTTAGATCCTATATTGAGGACAATAGAAAG
ACAAAATGGTGTCCTGCTCCAGGTTGTGATTCTGCAATAGAATATGATCTTGGAAGTGGA
AGCTATGATGTTACTTGCAGTTGTTCCTTCAGTTTTTGTTGGAATTGTACAGAAGAGGCT
CATCGGCCCGTGGATTGTGATACAGTGTCAAAGTGGATTTTGAAAAACAGTGCCGAGTCG
GAGAACATGAATTGGATCTTGGCTAATTCCAAGCCCTGTCCAAAGTGCAAGAGACCAATC
GAGAAGAACCAAGGGTGTATGCACATGACTTGTACACCACCATGTAAATTTGAGTTCTGC
TGGTTGTGTCTTGGTGCATGGTCAGACCATGGTGAAAGGACTGGTGGATTTTATGCGTGT
AATCGCTATGAGTCAGCAAAGCAAGAGGGCGTGTATGATGAATCTGAGAGGAGGAGGGAG
ATGGCCAAAAACTCTCTGGAAAGATACACACATTACTATGAGCGTTGGGCAACCAATCAA
TCGTCAAGGCAAAAAGCCCTGGCAGATCTGCATCAAATGCAAAGTGTTCATCTTGAAAAG
CTTAGTGAATTACAGTCCCAACCCGAGTCACAATTGAAATTCATTATAGATTCCTGGCAA
CAGATAGTTGAATGTAGGAGAGTGTTAAAATGGACCTATGCATATGGATACTACCTACCG
GAACATGAGAAAGCGAAAAGGCAGTTTTTTGAGTACGTACAAGGTGAGGCAGAGGCTGGT
TTAGAAAGACTTCATCAATGTGCTGAAAAGGAACTCCAAACTTATCTTAATGCTGCAGGA
CCGACCAAGGATTTCAATGATTTCCGTACAAAGCTCGCTGGTTTAACAAGTGTCACGCGA
AACTACTTTGAAAATCTGGTTAGAGCACTGGAGAATGGTCTTGCTGATGTAGATTCCCAA
GGTGCTTGTAGTAAGGCACCCAGCTCAAAGAACACAACTGGTAGCAGCAAGGGCAAAGGA
GGAGGTAGGGGCAAGAACTCCACTAAGACGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc06g073340.3.1

PEP Infomation

RING/U-box superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT1G05890.1)

Sequence

MDSEDDMHDANDMESVDEDFYSDGDAADSDADVADYDFMGNETDDSDEQAVSRMQKNYTV
LKEEDIRQRQEEDMTTISTLLSISREAACILLRRYNWSVNKVHEEWFADEERVRKSAGLL
EKPVVSLSRVIDVVCGICFDNFLPADIISLGCGHPFCTSCWKAYITTSINDGPGCLTLRC
PDPSCDVAIGQDMIDTLTSGEDKEKYYRYLLRSYIEDNRKTKWCPAPGCDSAIEYDLGSG
SYDVTCSCSFSFCWNCTEEAHRPVDCDTVSKWILKNSAESENMNWILANSKPCPKCKRPI
EKNQGCMHMTCTPPCKFEFCWLCLGAWSDHGERTGGFYACNRYESAKQEGVYDESERRRE
MAKNSLERYTHYYERWATNQSSRQKALADLHQMQSVHLEKLSELQSQPESQLKFIIDSWQ
QIVECRRVLKWTYAYGYYLPEHEKAKRQFFEYVQGEAEAGLERLHQCAEKELQTYLNAAG
PTKDFNDFRTKLAGLTSVTRNYFENLVRALENGLADVDSQGACSKAPSSKNTTGSSKGKG
GGRGKNSTKT*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc06g073340.3.1

Transcript Infomation

RING/U-box superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT1G05890.1)

Sequence

TTTGGGCAATACTTACAACTGTTCCCTTTGAAAAACATTATATATATATATATACACAAA
ATAAATAAACTCAATCTCTATTCTTCCCTTTTGCCCACATCATAATCAACAACCTACTTT
TTTCCCCCAATTTTACTTTTCCAAGTTGAGCTAATTCGTGTTATTTGGCCTTTTAGGGTT
TCAAGCAACAATTTTCAGCTGTAGTTTTGGTGATTGATAATCTCTACTTGATGGATTCAG
AAGATGATATGCACGATGCTAATGATATGGAGTCGGTAGATGAGGATTTCTACAGTGACG
GTGATGCGGCAGATAGCGATGCTGATGTTGCTGATTATGATTTCATGGGTAATGAAACCG
ATGATTCCGATGAACAAGCTGTTAGTCGTATGCAGAAAAATTATACTGTCTTGAAAGAAG
AAGATATACGTCAGCGACAGGAGGAGGATATGACGACAATTTCTACTCTTCTCTCCATAT
CAAGAGAAGCTGCCTGTATATTACTTCGACGTTATAACTGGAGTGTGAACAAGGTGCATG
AGGAGTGGTTTGCTGATGAAGAAAGAGTGCGCAAGTCTGCCGGCTTGTTGGAGAAGCCTG
TTGTCTCTCTTTCAAGAGTTATAGATGTGGTGTGTGGGATTTGCTTTGACAACTTCCTTC
CTGCTGACATAATATCCCTCGGGTGCGGTCATCCTTTTTGTACTTCTTGCTGGAAAGCTT
ACATTACCACATCCATCAACGATGGCCCTGGATGCTTGACGCTGCGATGTCCTGACCCAT
CATGCGATGTCGCCATTGGTCAAGATATGATTGATACATTGACATCTGGTGAAGATAAGG
AGAAGTACTATCGTTACCTTCTTAGATCCTATATTGAGGACAATAGAAAGACAAAATGGT
GTCCTGCTCCAGGTTGTGATTCTGCAATAGAATATGATCTTGGAAGTGGAAGCTATGATG
TTACTTGCAGTTGTTCCTTCAGTTTTTGTTGGAATTGTACAGAAGAGGCTCATCGGCCCG
TGGATTGTGATACAGTGTCAAAGTGGATTTTGAAAAACAGTGCCGAGTCGGAGAACATGA
ATTGGATCTTGGCTAATTCCAAGCCCTGTCCAAAGTGCAAGAGACCAATCGAGAAGAACC
AAGGGTGTATGCACATGACTTGTACACCACCATGTAAATTTGAGTTCTGCTGGTTGTGTC
TTGGTGCATGGTCAGACCATGGTGAAAGGACTGGTGGATTTTATGCGTGTAATCGCTATG
AGTCAGCAAAGCAAGAGGGCGTGTATGATGAATCTGAGAGGAGGAGGGAGATGGCCAAAA
ACTCTCTGGAAAGATACACACATTACTATGAGCGTTGGGCAACCAATCAATCGTCAAGGC
AAAAAGCCCTGGCAGATCTGCATCAAATGCAAAGTGTTCATCTTGAAAAGCTTAGTGAAT
TACAGTCCCAACCCGAGTCACAATTGAAATTCATTATAGATTCCTGGCAACAGATAGTTG
AATGTAGGAGAGTGTTAAAATGGACCTATGCATATGGATACTACCTACCGGAACATGAGA
AAGCGAAAAGGCAGTTTTTTGAGTACGTACAAGGTGAGGCAGAGGCTGGTTTAGAAAGAC
TTCATCAATGTGCTGAAAAGGAACTCCAAACTTATCTTAATGCTGCAGGACCGACCAAGG
ATTTCAATGATTTCCGTACAAAGCTCGCTGGTTTAACAAGTGTCACGCGAAACTACTTTG
AAAATCTGGTTAGAGCACTGGAGAATGGTCTTGCTGATGTAGATTCCCAAGGTGCTTGTA
GTAAGGCACCCAGCTCAAAGAACACAACTGGTAGCAGCAAGGGCAAAGGAGGAGGTAGGG
GCAAGAACTCCACTAAGACGTGAGGGCCAAAGCAAACAAAACAACACTATCTATACTGTG
ATTTTGGGGGATAAATGATGTTCAGATGGGTAAGTTAAAGAATCTACTCAACGATACGAA
AACAAGAGAAGTTGATCCTCTCTAATTGAAGCCACCAATTGTCAGAGAACAGTATAGGTA
AAAAAGGACCCCTGTAACTGAAGTTTGCTCTTGTGCGTCTTCAAGGGTCAATTTAATTTA
TGGTTCTGTTGTAAATAGTCTGTGATAGAGTTAGGTGCAGAACTATTCCAACTCAACTCA
TCTCATCTTTCTGGGATGGTGGGTCAGTAGCTGCAAACAAAGCTGTGCTGTTGTTCTTGT
GATTTGTGTATAATGTTCCCTTGTGTGTATATAATGATATATGTTATTGTTTTTGGAATC
GTTCTTATCGTC