Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc06g071490.2.1

CDS Infomation

Serine/threonine-protein kinase ATM (AHRD V3.3 *-* A0A0B0NJM8_GOSAR)

Sequence

ATGGAAACACAGAAGATTTCAGAAACCCTAGTGGAGGGTTCTGTGGATTATAAACCAATT
TTAAGCCAAACCCCAGATGGTAAAACCCTAGAAAAGGTATCTGTTGTATCTAGCTTAAGT
GAGAGTGGTGCTGTTTCTGAATTGGTCACAGTCACAGAGGTTCCATCAGGTGTTGGAAAT
GCTAATGTGCACAAGAATATAGCAAATGTGGTTGATGGAACTGAGTTAGAGTTAATGGGA
GTGGGGTTTGAGCAGAAGATAGTGGATGGATATGATAACATTGATTCAGAGGTTAAGAGT
GAGGAGAGGTTAGTGGATGGATATGATCACATTGATTCGGAGGGAGTTAAGAGTGAGGAA
AAGTTAGCAAATGTGGATAATAATAATGGTTTGGAGGGTGTTGATACTGAGCAGAAGCTA
GTCGACGGGCAGGGGACAGTTGAGAGTGAGAATAAGCTTGCAAATGTGGATGATTATAAT
GATCTTGAGGGAGTTGAGATCGAGAACAAGTTTGGAGATGTGGATGATACTATTGATTTA
GAGGCACTTGGCCTGGCGAACGAGGATGTTACACTTGATGGTCTGATGGAAGCAGGGACT
TTGAAACATGAAACTCAAGAATCGGGTGCTGAATTTAATGAGTCTCTTGATAATAGGGTT
GAGAAAATTGGTGTGGCTGATGCTGTGGAAGATATGGACAGGTCAAAGGTGCACATAAAT
GATTCTCCTACAAAGATAGAAGTTTCTGGAGATGGTATTTCTCTGACAGTGGATGTATTT
GGTCCAGATTGCACATTTTACATGGAAACTGACAACCCTATGGGTGTCAATGGTAATGAA
GCAGAAGGTGATGTCAGTGATAATCAAGAACACACTTTTGCTGTGGGTGACTTAGTATGG
GTAAAAATGAAGACTGACTTGTGGTGGCCGGGAATGATTTGTGATCCGCAAACATCGAAA
GATGCTGGGAAGTGTAATCAAGTGGATGGTTTCTTTGTTAAGCATTTTGGTAGCACTAGT
TCTGTTTGGTGCCGTCCATTCCAGTTAAAGCCCTTTATAGAGTATTTTGAGCTGATGTCT
CGCCAGAATAAGTCTAGAAGCTTTTATGGTGCAATAGAGAAGGCTTTGGGCGAGTATGGT
AGGCGCGTGAAACAGAAGATGACCTGTTCTTGTTTTTCAAAAGAAAATCAAGTTGCTGCT
CAAAATGTTCCTTCAAAGGAAGATGAGAATGGGGGTAGTGCTTTTTCGGCATCTCAATTT
GAGCCTTCAAAATTTCTCAAATTCATCAAATCACGTGCTTTGGGTCTTCTTAGCCCAAGT
GATATTGAGTTCACAGTTGCTGAAAATTGTCTATCGGCCTTTTACAGTTCAATAGGCCAT
AAGCAATTGCCTTTGTACAAACTCAGGCCAACAAGTAATCAGATATCAGCAAGCAAGGAT
GAAGATCTGGACAAGCTGTCTAGTGGTGATAGTGTCCTTAAGAGCTGTAGAAGTGGTTCT
GATGATCGTAAAATGACTGAGATGGAGCTGTCTGGCTCATTGGAGTCTCCTAGAGGAACG
AGGAGCATGATATCCCGTTCACAGATCTCGAATGAAAATGCTGGAGGAAAATCTGAAAAA
GGTTTTGAGTCACGAGAACGGAAGAAGAGCAAGTACCTGTCATATCCTTATGTAAACAGT
TGGGCCTCCCGTAAGAATTCACTTGGCCAGGGAGAAGATGAAACTGAAGATTGCGAGGAA
GTTACTCCTGGTGGAGTAAAGAGATCCTCCAATCCATCTATGGTCTCCACTCCAATTGGT
AACAGCAGTAATAAGACCTCACTAAGGAAATCGAGGAAATCTGTTAATGACAATGATATT
TGCAATAATGCAGATTTCAGTGCTGTCTCTTCGGCAGAAATGCTCCAAGGACTCCATCAG
ACAGCTCGTGATTGCTTCTTTCCTATTCAAAGCACGCGTTCCATTCCAATCCGGGATTTT
TACTTGAGTTTTAGAGCATTTAGAGATCCTGAAGTTCAGATAGATGAATACAAGGAAGCT
ACTTTAGGGTGTCCGGTAACTTTTCAGTCTGATAATAGTTTGGCCTCAGGAGGATATGAT
CTGCAAGTAGAAGGACAGCCTCCTCCGAATGTTCTTCCTAAGAAGAGAGGTGGAAAGAAA
AGTGATGGAATAAATGCAACTGGTCCCAAGTTTAGCTCTAAAACCAACTTACCTAGGATG
ACTGCAGATGGTACCAGTATGAATGGCTCTCCCCTGATTGATTCTGTACAGACAGGACCT
GATACACTCAAAAAAGGAGTAGTTCACAGACAGAGAAAGAAGGCGGCAATTGCAGCTGTA
GTTCATAATGAGATTGGGATATTAGGTGGACTACCAGACTTGAATGGAAACAACGCGGGC
TTGTCAGTTGAAAATATGCAGGTTATAGGTCCTGCTCCTACTCAAGGTAAACTTGAGCCT
AAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGGAAGAGTTGGTTTCCGAGAATCTGCCAGATCTGAGCAAA
GGGAACACCCAGTTCATTCCAATGCTGAAAAGTGTGGAAGTCACCGGCTCGTTACCCTTG
GAAGGTGGTCCTCAACCAGATAACATGTTGGGGGTACAGGGGGCGTCTTCCCTCCCGAAT
GCTGAACTTTTTGCTGGACAACCAAATGCCAATGGAATTCATGCTGCAGGTAGCTCATTA
CCAAATATTTCACAGATCACCGGTCTGGTTTCGTCTGCAAAAGGAGAAGGCAAGAAACGG
AAAAGGAAGGAGAAAGCATTAATTATTCAGAATACTTCTTCAGCTCTACCAGATTTGAAT
GGACAGGTCACCGATCCGAATTTGAAGGGAAAGGAGGTCACAGAAATGAGTTCTGTCTCA
GGTCAAGCTAAACCCAAGCAAAAAAGAAGAAGAGCTACTAAATCTGCTGCCATTGGGATA
CCCAATCCTAATGGAGATCACAACACTCTTCTGCTATACTTTACGCCGGGTTCACCAGTG
CCTTCTAAAGAGTATATCTGTGCTACTTTTGCCAGTTTTGGTCCGTTGGAGGAATCCAAA
ACTTTGTACCTTAATGATTCTACTGCCCAGGTGGTCTTTGCAAAGGATAGTGATGCTATG
GAAGCCTTGCAGAGTTTACAAAGCAGAAACCCGTTTGGACCTTCCCTTGTCAGTTATCGT
CTCCGTCATGTTTCAACTTCTCAGCCCGCAGCTTTACTTTCTGGAGCAGTACCTTCAAAT
GGCGAGGGACCTGATCTGGTTGTGATAAAACAGAATCTGGAGTCGATGACCACAATGCTT
GAGAAGGCTGGTGATAATATTTCCCCCGAGATAAAAGCCAAGTTGGAAAGCGAGAGTGAA
TGGATATTGGACAACCTCAATAATCAACTTCATCTTAAGTCAAAAGATGGGAGTCGATTA
AACGAATCGTCGATATCCGTTTTGCTCACACCTGAAAAACTTCGGAGATTAGGTGTTGGA
TATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc06g071490.2.1

PEP Infomation

Serine/threonine-protein kinase ATM (AHRD V3.3 *-* A0A0B0NJM8_GOSAR)

Sequence

METQKISETLVEGSVDYKPILSQTPDGKTLEKVSVVSSLSESGAVSELVTVTEVPSGVGN
ANVHKNIANVVDGTELELMGVGFEQKIVDGYDNIDSEVKSEERLVDGYDHIDSEGVKSEE
KLANVDNNNGLEGVDTEQKLVDGQGTVESENKLANVDDYNDLEGVEIENKFGDVDDTIDL
EALGLANEDVTLDGLMEAGTLKHETQESGAEFNESLDNRVEKIGVADAVEDMDRSKVHIN
DSPTKIEVSGDGISLTVDVFGPDCTFYMETDNPMGVNGNEAEGDVSDNQEHTFAVGDLVW
VKMKTDLWWPGMICDPQTSKDAGKCNQVDGFFVKHFGSTSSVWCRPFQLKPFIEYFELMS
RQNKSRSFYGAIEKALGEYGRRVKQKMTCSCFSKENQVAAQNVPSKEDENGGSAFSASQF
EPSKFLKFIKSRALGLLSPSDIEFTVAENCLSAFYSSIGHKQLPLYKLRPTSNQISASKD
EDLDKLSSGDSVLKSCRSGSDDRKMTEMELSGSLESPRGTRSMISRSQISNENAGGKSEK
GFESRERKKSKYLSYPYVNSWASRKNSLGQGEDETEDCEEVTPGGVKRSSNPSMVSTPIG
NSSNKTSLRKSRKSVNDNDICNNADFSAVSSAEMLQGLHQTARDCFFPIQSTRSIPIRDF
YLSFRAFRDPEVQIDEYKEATLGCPVTFQSDNSLASGGYDLQVEGQPPPNVLPKKRGGKK
SDGINATGPKFSSKTNLPRMTADGTSMNGSPLIDSVQTGPDTLKKGVVHRQRKKAAIAAV
VHNEIGILGGLPDLNGNNAGLSVENMQVIGPAPTQGKLEPKRRRRKKEELVSENLPDLSK
GNTQFIPMLKSVEVTGSLPLEGGPQPDNMLGVQGASSLPNAELFAGQPNANGIHAAGSSL
PNISQITGLVSSAKGEGKKRKRKEKALIIQNTSSALPDLNGQVTDPNLKGKEVTEMSSVS
GQAKPKQKRRRATKSAAIGIPNPNGDHNTLLLYFTPGSPVPSKEYICATFASFGPLEESK
TLYLNDSTAQVVFAKDSDAMEALQSLQSRNPFGPSLVSYRLRHVSTSQPAALLSGAVPSN
GEGPDLVVIKQNLESMTTMLEKAGDNISPEIKAKLESESEWILDNLNNQLHLKSKDGSRL
NESSISVLLTPEKLRRLGVGY*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc06g071490.2.1

Transcript Infomation

Serine/threonine-protein kinase ATM (AHRD V3.3 *-* A0A0B0NJM8_GOSAR)

Sequence

TAAAAAGTACTAGGAGAGAGTAAAAATATCTTAAGGTTTAAGAGAAGGAATCCAATTCCA
AAATGAACAAAATTGTCCCAATTCAAGAAGTGTCACTTTGGTGAAGCTACTCACTTGTTA
GGCTAAAGGAGAGCTGTAACACCGACTCACATACAACACAAAAACACACTGAAATCTACA
AGATTTAACCCCAAAAAAACCCCATTTTGATATACCACAAAACAAGAAAGAACACCCCTT
TTGATTGCTGTGGCAGAAGAAGAACAGAGAAAGAAGAGATGAACTGAGGGTTAGCTTTTG
ATTTGTGGTAAAGTTTGAGACTTTTAAGGTATTTGTTAGTAATGGAAACACAGAAGATTT
CAGAAACCCTAGTGGAGGGTTCTGTGGATTATAAACCAATTTTAAGCCAAACCCCAGATG
GTAAAACCCTAGAAAAGGTATCTGTTGTATCTAGCTTAAGTGAGAGTGGTGCTGTTTCTG
AATTGGTCACAGTCACAGAGGTTCCATCAGGTGTTGGAAATGCTAATGTGCACAAGAATA
TAGCAAATGTGGTTGATGGAACTGAGTTAGAGTTAATGGGAGTGGGGTTTGAGCAGAAGA
TAGTGGATGGATATGATAACATTGATTCAGAGGTTAAGAGTGAGGAGAGGTTAGTGGATG
GATATGATCACATTGATTCGGAGGGAGTTAAGAGTGAGGAAAAGTTAGCAAATGTGGATA
ATAATAATGGTTTGGAGGGTGTTGATACTGAGCAGAAGCTAGTCGACGGGCAGGGGACAG
TTGAGAGTGAGAATAAGCTTGCAAATGTGGATGATTATAATGATCTTGAGGGAGTTGAGA
TCGAGAACAAGTTTGGAGATGTGGATGATACTATTGATTTAGAGGCACTTGGCCTGGCGA
ACGAGGATGTTACACTTGATGGTCTGATGGAAGCAGGGACTTTGAAACATGAAACTCAAG
AATCGGGTGCTGAATTTAATGAGTCTCTTGATAATAGGGTTGAGAAAATTGGTGTGGCTG
ATGCTGTGGAAGATATGGACAGGTCAAAGGTGCACATAAATGATTCTCCTACAAAGATAG
AAGTTTCTGGAGATGGTATTTCTCTGACAGTGGATGTATTTGGTCCAGATTGCACATTTT
ACATGGAAACTGACAACCCTATGGGTGTCAATGGTAATGAAGCAGAAGGTGATGTCAGTG
ATAATCAAGAACACACTTTTGCTGTGGGTGACTTAGTATGGGTAAAAATGAAGACTGACT
TGTGGTGGCCGGGAATGATTTGTGATCCGCAAACATCGAAAGATGCTGGGAAGTGTAATC
AAGTGGATGGTTTCTTTGTTAAGCATTTTGGTAGCACTAGTTCTGTTTGGTGCCGTCCAT
TCCAGTTAAAGCCCTTTATAGAGTATTTTGAGCTGATGTCTCGCCAGAATAAGTCTAGAA
GCTTTTATGGTGCAATAGAGAAGGCTTTGGGCGAGTATGGTAGGCGCGTGAAACAGAAGA
TGACCTGTTCTTGTTTTTCAAAAGAAAATCAAGTTGCTGCTCAAAATGTTCCTTCAAAGG
AAGATGAGAATGGGGGTAGTGCTTTTTCGGCATCTCAATTTGAGCCTTCAAAATTTCTCA
AATTCATCAAATCACGTGCTTTGGGTCTTCTTAGCCCAAGTGATATTGAGTTCACAGTTG
CTGAAAATTGTCTATCGGCCTTTTACAGTTCAATAGGCCATAAGCAATTGCCTTTGTACA
AACTCAGGCCAACAAGTAATCAGATATCAGCAAGCAAGGATGAAGATCTGGACAAGCTGT
CTAGTGGTGATAGTGTCCTTAAGAGCTGTAGAAGTGGTTCTGATGATCGTAAAATGACTG
AGATGGAGCTGTCTGGCTCATTGGAGTCTCCTAGAGGAACGAGGAGCATGATATCCCGTT
CACAGATCTCGAATGAAAATGCTGGAGGAAAATCTGAAAAAGGTTTTGAGTCACGAGAAC
GGAAGAAGAGCAAGTACCTGTCATATCCTTATGTAAACAGTTGGGCCTCCCGTAAGAATT
CACTTGGCCAGGGAGAAGATGAAACTGAAGATTGCGAGGAAGTTACTCCTGGTGGAGTAA
AGAGATCCTCCAATCCATCTATGGTCTCCACTCCAATTGGTAACAGCAGTAATAAGACCT
CACTAAGGAAATCGAGGAAATCTGTTAATGACAATGATATTTGCAATAATGCAGATTTCA
GTGCTGTCTCTTCGGCAGAAATGCTCCAAGGACTCCATCAGACAGCTCGTGATTGCTTCT
TTCCTATTCAAAGCACGCGTTCCATTCCAATCCGGGATTTTTACTTGAGTTTTAGAGCAT
TTAGAGATCCTGAAGTTCAGATAGATGAATACAAGGAAGCTACTTTAGGGTGTCCGGTAA
CTTTTCAGTCTGATAATAGTTTGGCCTCAGGAGGATATGATCTGCAAGTAGAAGGACAGC
CTCCTCCGAATGTTCTTCCTAAGAAGAGAGGTGGAAAGAAAAGTGATGGAATAAATGCAA
CTGGTCCCAAGTTTAGCTCTAAAACCAACTTACCTAGGATGACTGCAGATGGTACCAGTA
TGAATGGCTCTCCCCTGATTGATTCTGTACAGACAGGACCTGATACACTCAAAAAAGGAG
TAGTTCACAGACAGAGAAAGAAGGCGGCAATTGCAGCTGTAGTTCATAATGAGATTGGGA
TATTAGGTGGACTACCAGACTTGAATGGAAACAACGCGGGCTTGTCAGTTGAAAATATGC
AGGTTATAGGTCCTGCTCCTACTCAAGGTAAACTTGAGCCTAAGAGGAGGAGGAGGAAGA
AGGAAGAGTTGGTTTCCGAGAATCTGCCAGATCTGAGCAAAGGGAACACCCAGTTCATTC
CAATGCTGAAAAGTGTGGAAGTCACCGGCTCGTTACCCTTGGAAGGTGGTCCTCAACCAG
ATAACATGTTGGGGGTACAGGGGGCGTCTTCCCTCCCGAATGCTGAACTTTTTGCTGGAC
AACCAAATGCCAATGGAATTCATGCTGCAGGTAGCTCATTACCAAATATTTCACAGATCA
CCGGTCTGGTTTCGTCTGCAAAAGGAGAAGGCAAGAAACGGAAAAGGAAGGAGAAAGCAT
TAATTATTCAGAATACTTCTTCAGCTCTACCAGATTTGAATGGACAGGTCACCGATCCGA
ATTTGAAGGGAAAGGAGGTCACAGAAATGAGTTCTGTCTCAGGTCAAGCTAAACCCAAGC
AAAAAAGAAGAAGAGCTACTAAATCTGCTGCCATTGGGATACCCAATCCTAATGGAGATC
ACAACACTCTTCTGCTATACTTTACGCCGGGTTCACCAGTGCCTTCTAAAGAGTATATCT
GTGCTACTTTTGCCAGTTTTGGTCCGTTGGAGGAATCCAAAACTTTGTACCTTAATGATT
CTACTGCCCAGGTGGTCTTTGCAAAGGATAGTGATGCTATGGAAGCCTTGCAGAGTTTAC
AAAGCAGAAACCCGTTTGGACCTTCCCTTGTCAGTTATCGTCTCCGTCATGTTTCAACTT
CTCAGCCCGCAGCTTTACTTTCTGGAGCAGTACCTTCAAATGGCGAGGGACCTGATCTGG
TTGTGATAAAACAGAATCTGGAGTCGATGACCACAATGCTTGAGAAGGCTGGTGATAATA
TTTCCCCCGAGATAAAAGCCAAGTTGGAAAGCGAGAGTGAATGGATATTGGACAACCTCA
ATAATCAACTTCATCTTAAGTCAAAAGATGGGAGTCGATTAAACGAATCGTCGATATCCG
TTTTGCTCACACCTGAAAAACTTCGGAGATTAGGTGTTGGATATTGA