Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc06g071290.3.1
CDS Infomation

putative betaine aldehyde dehyrogenase
Sequence

ATGGCAAATCGTAATGTACCAATCCCTCGTCGACAGCTGTACATCGGCGGAGAATGGAGA
GAACCGGTCAAGAAGAACCGGATTCCGATAATCAATCCGGCTACTGAAGAAATCATCGGG
GATATTCCGGCGGCTACCGCGGAAGATGTGGATATAGCTGTGGAAGCAGCACGGAAAGCG
ATTGCGAGGGATGACTGGGGTTCTACAACAGGGGCACAACGCGCAAAATACCTCCGTGCT
ATTGCTGCTAAGGTACTGGAGAAGAAATCCGTACTTGCAACACTTGAATCCCTTGATAGT
GGAAAAACATTGTATGAGTCTGCTGCAGATATGGATGACGTTGCAGGATGTTTTGAGTAC
TATGCAGGCCTTGCTGAAGCTTTGGATTCGAGAAGGATGACTCCGGTTAATCTTAATTCA
GATTCATATAAAAGTTATGTTCTTAGAGAACCTCTTGGTGTTGTGGGATTGATAACTCCA
TGGAATTATCCATTGTTAATGGCCATATGGAAAGTTGCCCCTGCTCTGGCTGCTGGTTGT
GCAGCAATACTTAAGCCATCTGAACTAGCATCAATTACCTGTTTGGAGTTGGGTGAGATC
TGTAGAGAGATTGGTCTTCCTTCTGGTGCCCTTAACATTTTAACAGGATTGGGGCCTGAA
GCTGGTGGTCCTTTGGCATCTCATCCTCATGTGGACAAGATTTCATTTACAGGAAGTGGA
CCTACAGGATCTAAGATCATGACTGCTGCAGCTCAACTTGTTAAACCAGTTAGTCTTGAG
CTTGGTGGAAAAAGTCCAATCGTGGTGTTTGACGATATCGATAACCTTGATATAGCTGCT
GAGTGGACTCTTTTTGGCATCTTTGCAAATACTGGTCAAGTTTGTAGTGCAACATCACGG
CTTATAGTACAGGAAAACATTGCTTCTGCATTTATGGACAGACTGCTTAAGTGGACCAAA
AACATCAAAATCTCCGATCCTTTGGAAGAAGACTGCAAGCTTGGTCCTGTCGTCAGTGCT
GGACAATATGAGAAGGTATTGAAGTTCATCTCAAATGCCAAAAGTGAAGGTGCAACCATT
CTGTGTGGTGGCGAACGGCCTCAGCACTTGAAGAAAGGATATTATGTTCAGCCAACAATT
ATTACTGATGTTAATACCTCAATGGAAATCTGGAAAGAGGAAGTATTCGGACCCGTTCTT
TGTGTCAAAACATTCAAAACTGAAGAGCAAGCCATTGAACTAGCAAACGACACCAAGTAT
GGCTTGGGTGCTGCTGTTATGTCAAAAGACGTTAAAAGGTGTGAGAGGTTTACAAAGGCA
TTTCAGACAGGTATCATCTGGATTAACTGTTCACAGCCAACCTTTAATGAGCTACCATGG
GGTGGTAAAAAGCGTAGTGGTTTTGGACGTGATCTAGGGAAATGGGGTCTTGAAAATTTC
TTGAACATTAAGCAGGTGACAGAGTATACTTCTGCTGAACCATTGGCTTTTTATAAGTCA
CCTTCAAAGAATTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc06g071290.3.1
PEP Infomation

putative betaine aldehyde dehyrogenase
Sequence

MANRNVPIPRRQLYIGGEWREPVKKNRIPIINPATEEIIGDIPAATAEDVDIAVEAARKA
IARDDWGSTTGAQRAKYLRAIAAKVLEKKSVLATLESLDSGKTLYESAADMDDVAGCFEY
YAGLAEALDSRRMTPVNLNSDSYKSYVLREPLGVVGLITPWNYPLLMAIWKVAPALAAGC
AAILKPSELASITCLELGEICREIGLPSGALNILTGLGPEAGGPLASHPHVDKISFTGSG
PTGSKIMTAAAQLVKPVSLELGGKSPIVVFDDIDNLDIAAEWTLFGIFANTGQVCSATSR
LIVQENIASAFMDRLLKWTKNIKISDPLEEDCKLGPVVSAGQYEKVLKFISNAKSEGATI
LCGGERPQHLKKGYYVQPTIITDVNTSMEIWKEEVFGPVLCVKTFKTEEQAIELANDTKY
GLGAAVMSKDVKRCERFTKAFQTGIIWINCSQPTFNELPWGGKKRSGFGRDLGKWGLENF
LNIKQVTEYTSAEPLAFYKSPSKN*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc06g071290.3.1
Transcript Infomation

putative betaine aldehyde dehyrogenase
Sequence

ATTTAATTTGATTATTAACCATAACCATAAACAACTCTGAACTTTAACTCAATCCAAAAA
TATAACACCAATCCGTTATCTCAATCAACACGGACTCTAACCCGCATTTATACATGAAAA
AGATGGATAAGTGATGTTACTACTTACTACTATCCTTTCTAATTTTCCTATTTCATTCAT
TTCATGATTTCTCTCCAAAAAATAGTAACACTATCTAATTAATTTATTCCAAAAAAAATT
ATACATTTCTACGTTTGAAATATAATTTGAATTTAAATCAACATTAAACGAATAAAATTC
ATAAACATACAAATATAAGATTGTGAAATATTTTCGTCGAAACAACTTTCATAATAAAAT
CAATGTAGACGTTAAATCCTTTCGACTTCTTTTTTGCTCATTTCTTTATATGGTGGCTTT
TTATATGAACAAAAATCACTGATCTAACTACTCCCTGCGCCATTTTATCAGTTTTCTTTA
CGTAAGGGTGAGGTGATTGTATCGAGTTATGGCAAATCGTAATGTACCAATCCCTCGTCG
ACAGCTGTACATCGGCGGAGAATGGAGAGAACCGGTCAAGAAGAACCGGATTCCGATAAT
CAATCCGGCTACTGAAGAAATCATCGGGGATATTCCGGCGGCTACCGCGGAAGATGTGGA
TATAGCTGTGGAAGCAGCACGGAAAGCGATTGCGAGGGATGACTGGGGTTCTACAACAGG
GGCACAACGCGCAAAATACCTCCGTGCTATTGCTGCTAAGGTACTGGAGAAGAAATCCGT
ACTTGCAACACTTGAATCCCTTGATAGTGGAAAAACATTGTATGAGTCTGCTGCAGATAT
GGATGACGTTGCAGGATGTTTTGAGTACTATGCAGGCCTTGCTGAAGCTTTGGATTCGAG
AAGGATGACTCCGGTTAATCTTAATTCAGATTCATATAAAAGTTATGTTCTTAGAGAACC
TCTTGGTGTTGTGGGATTGATAACTCCATGGAATTATCCATTGTTAATGGCCATATGGAA
AGTTGCCCCTGCTCTGGCTGCTGGTTGTGCAGCAATACTTAAGCCATCTGAACTAGCATC
AATTACCTGTTTGGAGTTGGGTGAGATCTGTAGAGAGATTGGTCTTCCTTCTGGTGCCCT
TAACATTTTAACAGGATTGGGGCCTGAAGCTGGTGGTCCTTTGGCATCTCATCCTCATGT
GGACAAGATTTCATTTACAGGAAGTGGACCTACAGGATCTAAGATCATGACTGCTGCAGC
TCAACTTGTTAAACCAGTTAGTCTTGAGCTTGGTGGAAAAAGTCCAATCGTGGTGTTTGA
CGATATCGATAACCTTGATATAGCTGCTGAGTGGACTCTTTTTGGCATCTTTGCAAATAC
TGGTCAAGTTTGTAGTGCAACATCACGGCTTATAGTACAGGAAAACATTGCTTCTGCATT
TATGGACAGACTGCTTAAGTGGACCAAAAACATCAAAATCTCCGATCCTTTGGAAGAAGA
CTGCAAGCTTGGTCCTGTCGTCAGTGCTGGACAATATGAGAAGGTATTGAAGTTCATCTC
AAATGCCAAAAGTGAAGGTGCAACCATTCTGTGTGGTGGCGAACGGCCTCAGCACTTGAA
GAAAGGATATTATGTTCAGCCAACAATTATTACTGATGTTAATACCTCAATGGAAATCTG
GAAAGAGGAAGTATTCGGACCCGTTCTTTGTGTCAAAACATTCAAAACTGAAGAGCAAGC
CATTGAACTAGCAAACGACACCAAGTATGGCTTGGGTGCTGCTGTTATGTCAAAAGACGT
TAAAAGGTGTGAGAGGTTTACAAAGGCATTTCAGACAGGTATCATCTGGATTAACTGTTC
ACAGCCAACCTTTAATGAGCTACCATGGGGTGGTAAAAAGCGTAGTGGTTTTGGACGTGA
TCTAGGGAAATGGGGTCTTGAAAATTTCTTGAACATTAAGCAGGTGACAGAGTATACTTC
TGCTGAACCATTGGCTTTTTATAAGTCACCTTCAAAGAATTAG