Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc06g069380.3.1
CDS Infomation	O-fucosyltransferase family protein (AHRD V3.3 *** AT5G15740.1)
Sequence	ATGGGGCTAAAAGTAACAGCTTTAGCAGAAAGACGTTTGGAAAAACTAAAAAGTTCTATG TCATCCAAGTCTAGAATGAAGTTATGGATGATAAGGATCACAACATCAGTGCTTATATGG ATTTGCTTAGTTCAATTAACGATATTTGGAGAGACTTGGGGTCCTAGAGTTTTAAAAGGC TGGCCCCCTTGTCTTTCTCACGAATCAGCTGCAGTACTGGCTGTTAAATCGTCGTCTGAG GTCCCTGCTAGAGTTCTTCCACCAAAGAGGGTTTACAGGAATAATGGTTACCTCATGGTT TCATGCAATGGTGGGCTTAATCAAATGCGGTCAGCGGTTAGTAGCTTTTGTGATATGGTT GCTATAGCAAGATATTTGAATGTGACTCTTATTGTTCCCGAGCTGGATAAAACCTCTTTT TGGGCTGATCCAAGTGAATTTCAAGACATATTTGATGTTGATCATTTCATAATGTCCTTG AGAGATGAAGTTCGAATATTGAAGGAGCTACCTCCAAGACTAAAGAGGAGGGTAGAGTTA GGAGTGACTCATACTATGGCTCCTATTAGTTGGTCTGACATTTCCTACTACCATAATCAG ATTCTTCCCTTAATTCAGCAGTATAAAGTAGTTCATTTGAACAGGACTGATGCTCGGCTT GCCAATAATGGACAACCTATGGAAGTTCAAAAGCTACGATGCAGAGTTAATTTTGGTGCA TTGAAATTCACCCCTCAAATTGAAGAGTTGGGTAGAAAGGTTGTCAGAATACTTAGGCAA GAGGGTCCATTTATGGTTCTGCACCTGAGATACGAAATGGATATGTTAGCTTTCTCTGGC TGTACTCAGGGATGCAAGCAGGAAGAGGTGGAAGAGTTAACAAGAATGAGATATGCTTAT CCATGGTGGAAAGAAAAAATCATAAATTCAGATTTGAAAAGAAGAGATGGTCTGTGTCCT TTGACACCTGAGGAAACTGCTCTTACTTTAAGGGCATTGAACATTGATCCTAGTATTCAA GTGTACATTGCGGCTGGAGAGATTTATGGCGGAGAAAGGAGAATGGCTAGTCTTGCTGCA GCTTATCCTAATTTGGTAAGGAAGGAGACACTACTCGAGCCCTCTGAGCTGAGGTTCTTT CAAAATCACTCCTCCCAAATGGCAGCATTAGACTATCTTGTTTCCTTGGAGAGCGATATC TTTGTTCCTACATATGATGGAAACATGGCCAAAGTTGTTGAAGGACATCGCAGATATCTT GGATACAAGAAAACTATCTTGTTAGACAGAAAGCATCTGGTGGATTTAATAGACCAACAT AATGCTGGATCATTGACATGGGATGAGTTCTCTACCGCTGTTAAGGAAGCTCACTCTGAA CGTATGGGCAACCCAACAAAGAGATTGGTCATTCAAGACAGACCTAAAGAGGAGGATTAT TTTTACTCCAACCCATGGGAGTGCTTAAAACCATCTTATGAAGATGAACTTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc06g069380.3.1
PEP Infomation	O-fucosyltransferase family protein (AHRD V3.3 *** AT5G15740.1)
Sequence	MGLKVTALAERRLEKLKSSMSSKSRMKLWMIRITTSVLIWICLVQLTIFGETWGPRVLKG WPPCLSHESAAVLAVKSSSEVPARVLPPKRVYRNNGYLMVSCNGGLNQMRSAVSSFCDMV AIARYLNVTLIVPELDKTSFWADPSEFQDIFDVDHFIMSLRDEVRILKELPPRLKRRVEL GVTHTMAPISWSDISYYHNQILPLIQQYKVVHLNRTDARLANNGQPMEVQKLRCRVNFGA LKFTPQIEELGRKVVRILRQEGPFMVLHLRYEMDMLAFSGCTQGCKQEEVEELTRMRYAY PWWKEKIINSDLKRRDGLCPLTPEETALTLRALNIDPSIQVYIAAGEIYGGERRMASLAA AYPNLVRKETLLEPSELRFFQNHSSQMAALDYLVSLESDIFVPTYDGNMAKVVEGHRRYL GYKKTILLDRKHLVDLIDQHNAGSLTWDEFSTAVKEAHSERMGNPTKRLVIQDRPKEEDY FYSNPWECLKPSYEDEL*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc06g069380.3.1
Transcript Infomation	O-fucosyltransferase family protein (AHRD V3.3 *** AT5G15740.1)
Sequence	CATTTCTCTCTCTTTTTTTCCCTTTCTCATCAAATTTCTTTTTTCCCTCTCCGGTCACCG GCTTTTCAACATTCCGGCAACATCACCGCCGTCCTGACACCAACTCCTCTAGATATCCCC ACGTATTCCACATTCATTGCTAGTCAGTGTATTTTATTGATTTCTCCTTTTTAAAAAGTT TCAAAATTATTGGGATTCGCTTCCCTGATCAGTTAAAGATTGCCGCATTTTGTAGAATAT ACTTGTAAGGTGCGAAAGAGTTAGGGATTTTTCTTCTCTTCATCGAAACTATCGTCTTTG GAAGGTTTCAGAATCCATGTTTTGCTCAAGTTTCTGAAAGAGAAAATTTCTCATTGACGT TCGGGTTTCTATATTTTTGTAACTCCTTATCTTCTTTCTTCAACTTTTTTTATAAAAGCA TTTCTGGGTATCAAAAAAAGTAGGATTTTGATTGATTTTTGGATCCTACATTACCCAAAA AAAGTGACTTTTTTTTCTTTTGGTATATTGATTGTTTGTGATGAGTGATTGAGGAAAACA AATAAGTAATACAACTTGTGAGTTGAATAGTAAGGGGAAATGTTCTGAGAAAGTAGGGGT GGGGGAATTTGGGCATAATGGGGCTAAAAGTAACAGCTTTAGCAGAAAGACGTTTGGAAA AACTAAAAAGTTCTATGTCATCCAAGTCTAGAATGAAGTTATGGATGATAAGGATCACAA CATCAGTGCTTATATGGATTTGCTTAGTTCAATTAACGATATTTGGAGAGACTTGGGGTC CTAGAGTTTTAAAAGGCTGGCCCCCTTGTCTTTCTCACGAATCAGCTGCAGTACTGGCTG TTAAATCGTCGTCTGAGGTCCCTGCTAGAGTTCTTCCACCAAAGAGGGTTTACAGGAATA ATGGTTACCTCATGGTTTCATGCAATGGTGGGCTTAATCAAATGCGGTCAGCGGTTAGTA GCTTTTGTGATATGGTTGCTATAGCAAGATATTTGAATGTGACTCTTATTGTTCCCGAGC TGGATAAAACCTCTTTTTGGGCTGATCCAAGTGAATTTCAAGACATATTTGATGTTGATC ATTTCATAATGTCCTTGAGAGATGAAGTTCGAATATTGAAGGAGCTACCTCCAAGACTAA AGAGGAGGGTAGAGTTAGGAGTGACTCATACTATGGCTCCTATTAGTTGGTCTGACATTT CCTACTACCATAATCAGATTCTTCCCTTAATTCAGCAGTATAAAGTAGTTCATTTGAACA GGACTGATGCTCGGCTTGCCAATAATGGACAACCTATGGAAGTTCAAAAGCTACGATGCA GAGTTAATTTTGGTGCATTGAAATTCACCCCTCAAATTGAAGAGTTGGGTAGAAAGGTTG TCAGAATACTTAGGCAAGAGGGTCCATTTATGGTTCTGCACCTGAGATACGAAATGGATA TGTTAGCTTTCTCTGGCTGTACTCAGGGATGCAAGCAGGAAGAGGTGGAAGAGTTAACAA GAATGAGATATGCTTATCCATGGTGGAAAGAAAAAATCATAAATTCAGATTTGAAAAGAA GAGATGGTCTGTGTCCTTTGACACCTGAGGAAACTGCTCTTACTTTAAGGGCATTGAACA TTGATCCTAGTATTCAAGTGTACATTGCGGCTGGAGAGATTTATGGCGGAGAAAGGAGAA TGGCTAGTCTTGCTGCAGCTTATCCTAATTTGGTAAGGAAGGAGACACTACTCGAGCCCT CTGAGCTGAGGTTCTTTCAAAATCACTCCTCCCAAATGGCAGCATTAGACTATCTTGTTT CCTTGGAGAGCGATATCTTTGTTCCTACATATGATGGAAACATGGCCAAAGTTGTTGAAG GACATCGCAGATATCTTGGATACAAGAAAACTATCTTGTTAGACAGAAAGCATCTGGTGG ATTTAATAGACCAACATAATGCTGGATCATTGACATGGGATGAGTTCTCTACCGCTGTTA AGGAAGCTCACTCTGAACGTATGGGCAACCCAACAAAGAGATTGGTCATTCAAGACAGAC CTAAAGAGGAGGATTATTTTTACTCCAACCCATGGGAGTGCTTAAAACCATCTTATGAAG ATGAACTTTAAGCAGCATGTAAATTATGATGGTGGTAACATTGCATTATAGAGAAGTACT TCCGCGCACTGACATATTTGGAGGACATACTTGTCAACACTCGAAAACATTGTGCTGCAA TTTGCTTCTGAGGACGACTGTTGCGGCGCGATACACTTGAAATCCTGAGATCCTCAGAAG CATTTGGAAAAGGGTTTATATTAAAATGTTCTTCTTTTTTTCCTTCAGAAACTCAATAAT TGAATACATGTATAGAAAACTGTCCTGCCATTGCAAGGATATATTATCAATGGCAGTATA CACAGAAGGGTACAATATAGATTTGTTTTGCCAGGACTTTTGGATTTGTCATATTTAAAG TTCCACTCAATACCACACTAGTTGACTCACTCAGTCTCCTCCATTCTTTTCTACGTAAAT ATTACTCTAGTCAGACTCCACTTGTTGAGATGTTATTGTGTGTTATATTTAACGATATGG TTAAGGTTATTCACTCCTTCTCTCATGATCTTTGTGTGTATAATGTCACATTGACATAAT TAGTGATCATATATAATTAGACAAAATATATACAAGCTGATTCGGATACTAGAAAGTTCA AAGCTTTGAATTATTATTTTAATAGAAGTGCAATTATTTTAACCTTAAATAGACTGTTTA ATTTTATGGCTGAAATAAGAGTACGATTATTTTAATAATAGCACTTTACAACCCATTGGC ATTAAAAGAAAAAAGGTCGAAAGAACACAAAAGGCAACCAGATAAAAAGACGTTTGTTTT TTTTTCTTTTTCCTCTTTTAATATTTGTCGTCAAATGAGTAATCATTATGATTAATAATT TAACATGTAGGGTGGATGATAATTTTATTTTCTTGAAGAAAAACAAAAATAGAGTATCTA GTATTCAT