Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc06g068730.1.1
CDS Infomation	LOW QUALITY:Stress up-regulated Nod 19 (AHRD V3.3 *** A0A118K3L3_CYNCS)
Sequence	ATGACATTCGTTTCAAAGTGCAAGTTGCTTGTGCTGGTAGTCCTACTGCTAATAACGATT CGCTTAAGCTTACAAACTCGACTAAGAAATGAAAACAAAGTTAGAACTGCCACTTTCCTA TCACCAAAGTTTGTGCTCGAACCTGGATTAGTTGCTAACAAATTTTACAACAACATCGAT TTCCCTAATGGCCATATTGCTATCAAAAGTTTTGATGCTGAAGTAGTTGATGAGTCGAGG AACCCTGTCCCCCTTTATGAAACATATCTCCATCATTGGCTTGTGGTAAGATATTATCAA CAAAAAGGTATGGAGGTGTCAAAGTACCACGACAATCTGGGGTTCGAACAGTCAGATTAT ATATTAGTGAGGAACTCAGGGATATGTGATAGGGATCTCTTTCAATATTTTGGCCTTGGG TCTGAAACTCGCAAAACAGTACAATATGTTCCAGACCCTTATGGGATAGAGGTTGGTAAT CCTTTAGAAGTACCTCCTGGATATGAAGAGAGATGGTTGCTTAATGTACATGCAATTGAG ACACGAGGTTCCGAAGATAGGATGGGATGCACAGAATGCAGGTGTGATCTTTATAATGTT ACAAAGGATGAGTATGACCGAGATATAGAACCAAATTACATTGGAGGTTTGAGATGTTGT CATGACGAAACAAGATGCAGAACAAGAGAAGGGTTTCAGGGTGCGAAGAGAAGTTTGTAC CTGAAGTACACAATCAAATATGTTGATTGGCATGCCTTCATTAAGCCTGTTAAAATATAC ATTCTTGATGTCACTGATACATGGAAAAGGCGGAAATCAACAGGACTTATGCCCTCAAGG CATCATTGTCAGATTGAATATGAAGTTGAGTCATGTTCTGCTGCTGTTGCTAATAATGGA TGCATCCATACAAAAAAGATAAGTGTAACTTTGCCAAATGGTGGAAATGTTATTTATGGA GTTGCTCACCAGCATGCAGGTGGGGTTGGTTCAACCCTCCTTGGAGAGGATGGACGGGTT ATATGCTCATCTCTTCCAATCTATGGAGAAGGAAAGGAAGCAGGAAATGAGGCTGGTTAT ATTGTTGGTATGTCCAGTTGTTATCCCAGACCTGGCTCTGTCAAGATATCCAAGGGAGAA ACTCTGACTTTATTATCAAACTATAGCTGTGATCAAAGGCATACAGGAGTTATGGGCCTG TTCTATTTATTGGTTGCTGAAATGTCACGGCAATCTAGCTCTATCCTGCATTCTAAAGAC AACATCGGTGATATTGTCATACTACATAATGCTGTTTGGGCATTAGCAGGGTTCGGAATT GCAGCACTTGTTGCTGCAACTGTAACTTACCAACATCAGAGCGAAAGAGAAGAAGGGTGT GAATCGATCCTAATGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc06g068730.1.1
PEP Infomation	LOW QUALITY:Stress up-regulated Nod 19 (AHRD V3.3 *** A0A118K3L3_CYNCS)
Sequence	MTFVSKCKLLVLVVLLLITIRLSLQTRLRNENKVRTATFLSPKFVLEPGLVANKFYNNID FPNGHIAIKSFDAEVVDESRNPVPLYETYLHHWLVVRYYQQKGMEVSKYHDNLGFEQSDY ILVRNSGICDRDLFQYFGLGSETRKTVQYVPDPYGIEVGNPLEVPPGYEERWLLNVHAIE TRGSEDRMGCTECRCDLYNVTKDEYDRDIEPNYIGGLRCCHDETRCRTREGFQGAKRSLY LKYTIKYVDWHAFIKPVKIYILDVTDTWKRRKSTGLMPSRHHCQIEYEVESCSAAVANNG CIHTKKISVTLPNGGNVIYGVAHQHAGGVGSTLLGEDGRVICSSLPIYGEGKEAGNEAGY IVGMSSCYPRPGSVKISKGETLTLLSNYSCDQRHTGVMGLFYLLVAEMSRQSSSILHSKD NIGDIVILHNAVWALAGFGIAALVAATVTYQHQSEREEGCESILM*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc06g068730.1.1
Transcript Infomation	LOW QUALITY:Stress up-regulated Nod 19 (AHRD V3.3 *** A0A118K3L3_CYNCS)
Sequence	ATGACATTCGTTTCAAAGTGCAAGTTGCTTGTGCTGGTAGTCCTACTGCTAATAACGATT CGCTTAAGCTTACAAACTCGACTAAGAAATGAAAACAAAGTTAGAACTGCCACTTTCCTA TCACCAAAGTTTGTGCTCGAACCTGGATTAGTTGCTAACAAATTTTACAACAACATCGAT TTCCCTAATGGCCATATTGCTATCAAAAGTTTTGATGCTGAAGTAGTTGATGAGTCGAGG AACCCTGTCCCCCTTTATGAAACATATCTCCATCATTGGCTTGTGGTAAGATATTATCAA CAAAAAGGTATGGAGGTGTCAAAGTACCACGACAATCTGGGGTTCGAACAGTCAGATTAT ATATTAGTGAGGAACTCAGGGATATGTGATAGGGATCTCTTTCAATATTTTGGCCTTGGG TCTGAAACTCGCAAAACAGTACAATATGTTCCAGACCCTTATGGGATAGAGGTTGGTAAT CCTTTAGAAGTACCTCCTGGATATGAAGAGAGATGGTTGCTTAATGTACATGCAATTGAG ACACGAGGTTCCGAAGATAGGATGGGATGCACAGAATGCAGGTGTGATCTTTATAATGTT ACAAAGGATGAGTATGACCGAGATATAGAACCAAATTACATTGGAGGTTTGAGATGTTGT CATGACGAAACAAGATGCAGAACAAGAGAAGGGTTTCAGGGTGCGAAGAGAAGTTTGTAC CTGAAGTACACAATCAAATATGTTGATTGGCATGCCTTCATTAAGCCTGTTAAAATATAC ATTCTTGATGTCACTGATACATGGAAAAGGCGGAAATCAACAGGACTTATGCCCTCAAGG CATCATTGTCAGATTGAATATGAAGTTGAGTCATGTTCTGCTGCTGTTGCTAATAATGGA TGCATCCATACAAAAAAGATAAGTGTAACTTTGCCAAATGGTGGAAATGTTATTTATGGA GTTGCTCACCAGCATGCAGGTGGGGTTGGTTCAACCCTCCTTGGAGAGGATGGACGGGTT ATATGCTCATCTCTTCCAATCTATGGAGAAGGAAAGGAAGCAGGAAATGAGGCTGGTTAT ATTGTTGGTATGTCCAGTTGTTATCCCAGACCTGGCTCTGTCAAGATATCCAAGGGAGAA ACTCTGACTTTATTATCAAACTATAGCTGTGATCAAAGGCATACAGGAGTTATGGGCCTG TTCTATTTATTGGTTGCTGAAATGTCACGGCAATCTAGCTCTATCCTGCATTCTAAAGAC AACATCGGTGATATTGTCATACTACATAATGCTGTTTGGGCATTAGCAGGGTTCGGAATT GCAGCACTTGTTGCTGCAACTGTAACTTACCAACATCAGAGCGAAAGAGAAGAAGGGTGT GAATCGATCCTAATGTGA