Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc06g066120.3.1

CDS Infomation

Endoglucanase (AHRD V3.3 *** B9RQY0_RICCO)

Sequence

ATGAACACCAACATTTCTATATTGAAGGCATTTAGAACCTTTGTTGTAGCATGGTTCATT
ATATTTGAAGGTGTACATGGAGATATTAATTATCAAGAGGCTCTTACCAAATCCCTTATT
TTTTTGGAGGCACAAAGATCAGGGAAACTTCCTCCTAATCATAGACCTTCATGGAGAGGA
GATTCTGCCCTTCAAGATGGAAAATCTGCTAATGTGGACCTTGTTGGAGGATACTATGAT
GCTGGAGATAATGTAAAATATGGGCTTCCAATGGCTTTCACTATAACAACCTTAGCATGG
GCTGCTATTGCTTATCACTCACAGCTCCAATCTGCTGGAGAATTGGAAAATGTTCGCTCT
GCCATCAAATGGGGCACTGATTATTTCTTGAAAGCTAGTGTCAAGCGCAATTGCCTCTAC
GTCCAGGTTGGGGATCCAGTGAAAGATCATGAATGTTGGACAAGGCCAGAGAACATGAAA
ACGCCGAGAACTGTGCTAATGATAGACCAGAAAAATCCTGGAACAGAAATTGCTGCTGAG
ACTTCTGCAGCAATGGCTGCTGCTTCTATTGTATTTCGTGGAACTGATCTTTCCTATTCC
CGTAAACTTCTCAATAAAGCCAAACAGCTTTTTCAGTTTGGCAAGAGCTATAAAGGAACC
TATGATGGGGAATGTCCTTTCTATTGCTCCTTCTCTGGCTTTCATGATGAGTTGTTGTGG
GCTGCAACATGGTTGTATAGAGCAACCAAGAGGCCAACATACTTGGAATTCATCACAGAA
GAGGCTACTACTGCTACTGTAGCTGAATTTAGCTGGGACCTTAAATATGCTGGAGCTCAA
ATACTCCTATCTAAGTTCTATTTTGAAGGGGAGAAAGATTTAGCAAACTTTAAGCAACAA
GCTGATGGTTTTATTTGCTCAAACCATCCTCAAAGTCCCCATCACCAGGTTCACATGTCT
CCAGGGGGTCTGATTCACCTTAGAGATGGAGCCAATTCTCAATATGTTACTGGTGCAGCT
TTTCTGTTCAGTGCTTATAGTGATTATCTAGCAAAGTACAAGCAAACGGTCAGTTGTGGT
GATAAAAAGTTCAATTCTGCTGATCTCATGGCTTTTGCCAAGCAACAGATGGACTATCTA
TTAGGGAAAAACCCGAGAGGAAAATCATACATGGTTGGTTTTGGGAACAAACCTCCAACT
CAAGCTCATCATAGAGGTTCCTCTGTTCCACAAATGTCTCCAAATAAATTGGTGGACTGC
TCCATGAGTTTTGTTAATTGGTATAACACTGAAAAGCCCAATGCTAATGAGCTAACAGGT
GCCATTGTTGGTGGTCCTGATAAAAATGATAACTTTGAAGATCGTCGTTCAAGTTCATCC
ATGACTGAGCCAACAACATATACAAATTCTTTGGCCGTTGGTGTCCTTGCAAAGCTCACG
AAGCACCATTCCTCGTCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc06g066120.3.1

PEP Infomation

Endoglucanase (AHRD V3.3 *** B9RQY0_RICCO)

Sequence

MNTNISILKAFRTFVVAWFIIFEGVHGDINYQEALTKSLIFLEAQRSGKLPPNHRPSWRG
DSALQDGKSANVDLVGGYYDAGDNVKYGLPMAFTITTLAWAAIAYHSQLQSAGELENVRS
AIKWGTDYFLKASVKRNCLYVQVGDPVKDHECWTRPENMKTPRTVLMIDQKNPGTEIAAE
TSAAMAAASIVFRGTDLSYSRKLLNKAKQLFQFGKSYKGTYDGECPFYCSFSGFHDELLW
AATWLYRATKRPTYLEFITEEATTATVAEFSWDLKYAGAQILLSKFYFEGEKDLANFKQQ
ADGFICSNHPQSPHHQVHMSPGGLIHLRDGANSQYVTGAAFLFSAYSDYLAKYKQTVSCG
DKKFNSADLMAFAKQQMDYLLGKNPRGKSYMVGFGNKPPTQAHHRGSSVPQMSPNKLVDC
SMSFVNWYNTEKPNANELTGAIVGGPDKNDNFEDRRSSSSMTEPTTYTNSLAVGVLAKLT
KHHSSS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc06g066120.3.1

Transcript Infomation

Endoglucanase (AHRD V3.3 *** B9RQY0_RICCO)

Sequence

ATAATATTTTATAAATTCTGACTAGGGTTTTTCCATATTCTTGGTTGAAGGGGGTAATAA
TTTCTAATTACTCCAAATTAGAAAAGGATAAGGGGATAATGCGTACATAATTCAAATTCT
ACACCAAACGTCCATAACTAACTTAATATTATTTTCCCGCCATTCTAATTTCACAAAGCC
TAGACCTCAGGACCAAAAAATAAAAAATCTTAAACAAACACCATTACTATTTAACTTCCT
AGTGAATGGGTAGTATCTATTGTTCCTTTATTTCCTCTCTTTTACTAATCCAAATTAATG
ATAATCATCTTTTATTTTCATAATCATCATTTTTTTTATCCTTAATTATTCGTTTATTAA
ATCATGAACACCAACATTTCTATATTGAAGGCATTTAGAACCTTTGTTGTAGCATGGTTC
ATTATATTTGAAGGTGTACATGGAGATATTAATTATCAAGAGGCTCTTACCAAATCCCTT
ATTTTTTTGGAGGCACAAAGATCAGGGAAACTTCCTCCTAATCATAGACCTTCATGGAGA
GGAGATTCTGCCCTTCAAGATGGAAAATCTGCTAATGTGGACCTTGTTGGAGGATACTAT
GATGCTGGAGATAATGTAAAATATGGGCTTCCAATGGCTTTCACTATAACAACCTTAGCA
TGGGCTGCTATTGCTTATCACTCACAGCTCCAATCTGCTGGAGAATTGGAAAATGTTCGC
TCTGCCATCAAATGGGGCACTGATTATTTCTTGAAAGCTAGTGTCAAGCGCAATTGCCTC
TACGTCCAGGTTGGGGATCCAGTGAAAGATCATGAATGTTGGACAAGGCCAGAGAACATG
AAAACGCCGAGAACTGTGCTAATGATAGACCAGAAAAATCCTGGAACAGAAATTGCTGCT
GAGACTTCTGCAGCAATGGCTGCTGCTTCTATTGTATTTCGTGGAACTGATCTTTCCTAT
TCCCGTAAACTTCTCAATAAAGCCAAACAGCTTTTTCAGTTTGGCAAGAGCTATAAAGGA
ACCTATGATGGGGAATGTCCTTTCTATTGCTCCTTCTCTGGCTTTCATGATGAGTTGTTG
TGGGCTGCAACATGGTTGTATAGAGCAACCAAGAGGCCAACATACTTGGAATTCATCACA
GAAGAGGCTACTACTGCTACTGTAGCTGAATTTAGCTGGGACCTTAAATATGCTGGAGCT
CAAATACTCCTATCTAAGTTCTATTTTGAAGGGGAGAAAGATTTAGCAAACTTTAAGCAA
CAAGCTGATGGTTTTATTTGCTCAAACCATCCTCAAAGTCCCCATCACCAGGTTCACATG
TCTCCAGGGGGTCTGATTCACCTTAGAGATGGAGCCAATTCTCAATATGTTACTGGTGCA
GCTTTTCTGTTCAGTGCTTATAGTGATTATCTAGCAAAGTACAAGCAAACGGTCAGTTGT
GGTGATAAAAAGTTCAATTCTGCTGATCTCATGGCTTTTGCCAAGCAACAGATGGACTAT
CTATTAGGGAAAAACCCGAGAGGAAAATCATACATGGTTGGTTTTGGGAACAAACCTCCA
ACTCAAGCTCATCATAGAGGTTCCTCTGTTCCACAAATGTCTCCAAATAAATTGGTGGAC
TGCTCCATGAGTTTTGTTAATTGGTATAACACTGAAAAGCCCAATGCTAATGAGCTAACA
GGTGCCATTGTTGGTGGTCCTGATAAAAATGATAACTTTGAAGATCGTCGTTCAAGTTCA
TCCATGACTGAGCCAACAACATATACAAATTCTTTGGCCGTTGGTGTCCTTGCAAAGCTC
ACGAAGCACCATTCCTCGTCTTGATCACCTAAGTAGATTTTCGTCATGGGGAAGATTTAC
GAGGGTGTATAAGCTATTTTTGCAGATGAATTTGAGAGTCTATCTAATGTCTTTTTAGGT
CCTATATAGTGACAAGCTGGGTAGCTGGCTGCAAGGAAACGAGCATATAAGCTCGAGTTT
GTCTCCCTTTTCTACTGATTCATGTGTTTTACTTAGAATAGGTTTCTTTTGATGATCTAG
ATCTGCAATATTGATTAGTACAAAAGATTGAAGTGTGCACCCAAGAACGTGGTGGTTTTA
CATATGAATGTTGTGTATATTTGTATGCAGACAGTATTTTGTATATAAAAGTCTTTCCAA
TTGTGAGTTAGTTTCTAACCGTGGGTTGCACTTTCGTATGAAATCTAACAACACATACAT
GTATATGGCAATCATTTTCCATTTCCTTTCGACGAAAGAGCAAGAAGCTTCAAGCTAGAG
TTCGAGCATGACAATAAAATCCTCGCGGGTCAAGATTACACTCCCCAAACCAGTAGTACT
TGACAGGTAAAACATTGTTTGACAAACGAGAGGGAAAAACACAACAGATGAGTCATATTA
ATAAAGAAACCATAGATCAATCATAATAACAAACTTAACTTTGCAGGATATACAAAATCG
CCTTTCTTGATCAACTATACAACTTGTTCATTGATTAAACTAATAAGGGGCTGCACGTGA
GATCATCTTTGTCACGCACTGCCTACATACCCAAAAACAAACCCTTAAGAGGGATCAAGC
TCATACATACTTCTTCACAAAAATTACATATCATTTTTTTAAAATTATGGACCGGGCAAT
TGCCTCACGAATTAATGATTGCCGATCTTGAATGTCACCTTCTGGATTGGTTTGTGCAGA
AGGGACATTGAACCACTTTTCCTCTTCCTTGTCTTTGCAGTGTTGGCTGCTTTGGATGAA
TGCAACAGAAAAGGATGGTTCAAGAGCATGTCTGCAGTCCAACGCGTGCTCGGATTCTTC
ACAAGACATTTTTCCAGAAAATCTTGAGCCTCATTATATAACTTCGAATTTTGAAACTTT
GGTTCCTCAAACTTGATTTTGTTCAACACAACATCACCGTTGGCAGTTTTGTCCCTGCCC
ACAAGGAGAATGTTGTCACAGTGAATAATTCCATTGTTGTGAATGCAACTAAGTCCTGGA
AGAACATTCTTCGTGTGTTTCTTAACTTCAAACTCCGGCAGTGAATTGCAGTTTGAAAGA
TATAAGTTGTAAAGATATACTTTGTCCTCAAAAGAGACCTTAGCTCCGTAACAGTGAACA
GTGCAAGGAGAATGTTTGAACATTCGGAGGATTTTGACTTCTTCTTTCAACGAATGAGAA
GCACTCAAGTTGCAAGATTTGACGGCAATGAGAGATGGAAGAGTAACACCACGAAATAGT
GCATTGGACGTACAAGCTAACGAGACGACACCATAACTACCTTCTCCAAGAGTAATAATG
CCTCTCTTCCACAATAATTTCGCCATTGAATGTGCAATGTGTTGGTAGTATACTACAGTA
ATGTACATATTTGTAATGAGAGTGATTTACACCCACAAGTTCATATCTTGAGCAAAAAGT
TTTGCAACACTTACCAAAAAGTAAAATCAAATCTTTTCAAGTAGTGTCAATAGGTGTAGT
GTACTCAAGTATTATTAGTGAAGATGAAAAGCCAATAATACAATTATGTTGATTTTTGAT
TTATTTTTTCATAACAATTTTAAAATTGTCATATAATATTAGATTTTCCATTAAACTAAA
TATTAATTGATTAATTTATTCGAGTCCTATTATATTAAATTTAATTTTTAACCGGTTTAG
AAATTACCAATATAAAATACACATCACCTCAAATTAATCATTTAATTTGTCTTAAAAAGA
GTGAAAGAAAAATCAACTCATATCAATCTAGTGTTAGTAGGTGTAGTGTGCTCAAGTACT
TTTAGTAATAGTCCAATTCCGTCGATTTTGATTCCTTTTTTTTTTCACGTAATAATTTTT
AACAGTTATCACGTAAAATTAT