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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc06g066080.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XZP2_CYNCS)

Sequence

ATGCAGCATTTACCTTCAAAATCAAAGCTATTCCATTCACTTCACACATCACTATCACTA
TCACTCACCAGCAAGAACCGAGCAGCAGAGCAGAATTGCTTATCTCTCCTCCAACTTTGC
GATTCTCTGCCTAAACTACTTCAACTTCAATCCCATATCTTCAAATTAGGCCTGCAAAGT
AACCCCCTTGTGCTCACAAAATTCACTTCCATTTCCTCTGAACTTAACGCCATTGCTCAC
GCTTCATCATTCATCTTTTCCCCATATGTTGAAACCCATTACTTTGATACCTTTCTTTTC
AACACCATTATCAGAAGTTACGCTGTAACTAGTTATTTTAAGGATAATGCTTTGTGTTTG
TATGGTAAAATGTTAAGTTATGGTATTTGGCCTAATAAGTTTACGTACCCTTTTGTGCTT
AAGGCTTGTGCTGGGATTGGTGAGTTGAAATTAGGCCAGACTGTTCATGGGTCAGTGGTG
AAACTTGGGTTTGATGATGATTCTCATGTTTTGAATACTATGATTCATATGTATTGTTGC
TGTGATGGTGGGGTTGAGTATGGGCGGAAGGTGTTTGATGAAATGCCTAACTGGGATTCG
GTAGGGTGGAGTGCCATGATAGGTGGTTATGTGAGATGGGGTTTGTCTAGTGAGGCTGTA
GGGTTGTTTAGAGAAATGCAGGTTGTTGGGATAGAACCTGATGAAGTTACGATGGTTTGT
TTGTTGTCTGCCTGCATAGATTTGGGTGCGCTTGAGCTAGGGAAGTGGCTCGAGGCATAT
ATCGAGAGGGAGAATGTTCCAAAGAGTGTTGTTCTTTGGAATGCTTTAATTGATATGTTT
GCAAAATGTGGTGATGTTGATAAAGCTCTAAGTTTGTTCAGGAGCATGAGTCGAAGGAAT
ATTGTTTCTTGGACTTCAGTTATAGATGGTATGGCGATGCATGGCCGGGGAACTGAGGCT
GTTTCTTTATTTGAGGAGATGAAGAATGATGGGGTTGTACCTGATGGTGTTTCCTTTATT
GGGTTACTTACTGCTTGTAGCCATTCGGCCTTAGTTGAGCAAGGTAAGGGATACTTTTAT
TCGATGACAAAGGAATTCGGGATTTCACCTAAGATAGAACACTACGGATGCATGGTTGAT
CTGTTATGTAGAGCTGGACATGTGCAAGAAGCATTGGATTTTGTTAAGAGAATGCCGATT
AAGCCAAATCCGGTAATTTGGAGAACACTTATTACTGCTTGCCGTGCTCATGGTGAGCTG
ACGATTGGTGAAAAAATAACAAAAGAGCTGATAAAATATGAGCCTATGCATGAATCTAAT
TACGTAATGCTTTCTAACATTTATGCAAAAATGTTTTCTTGGGAAAAGAAGACCATGATT
AGGGAAGTTATGGCAAAGAAGGGAATGAGAAAGGTTCCAGGGAGCACTATGATTGAACTA
TACAACAAAATCTATGAATTTGTGTCAGGAGATAAAAGTCATAGTGAGTACAAAATTATT
CATCAGATGGTGGATGATATTGGGAAAGAGATTAGAAAAGCTGGATTTGTTGCTTCAACA
TCAGAAGTGTTGCTTGATATCGATGAAGAAGATAAAGAAGGAGCTGTAAATAGGCATAGT
GAAAAGCTTGCTATTGCATTTGCCCTTATGAAGACACCTCCTGGAACTCCTATCCGAATC
GTGAAAAACTTACGAGTCTGTGAAGATTGCCACTCTGCGACTAAATTCATTTCGAAGACT
TACAAGCGAGAAATATTGGTCAGGGACAGAAACCGATTTCACCGTTTCGTAGATGGGGTT
TGCTCATGCAAAGACTTTTGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc06g066080.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XZP2_CYNCS)

Sequence

MQHLPSKSKLFHSLHTSLSLSLTSKNRAAEQNCLSLLQLCDSLPKLLQLQSHIFKLGLQS
NPLVLTKFTSISSELNAIAHASSFIFSPYVETHYFDTFLFNTIIRSYAVTSYFKDNALCL
YGKMLSYGIWPNKFTYPFVLKACAGIGELKLGQTVHGSVVKLGFDDDSHVLNTMIHMYCC
CDGGVEYGRKVFDEMPNWDSVGWSAMIGGYVRWGLSSEAVGLFREMQVVGIEPDEVTMVC
LLSACIDLGALELGKWLEAYIERENVPKSVVLWNALIDMFAKCGDVDKALSLFRSMSRRN
IVSWTSVIDGMAMHGRGTEAVSLFEEMKNDGVVPDGVSFIGLLTACSHSALVEQGKGYFY
SMTKEFGISPKIEHYGCMVDLLCRAGHVQEALDFVKRMPIKPNPVIWRTLITACRAHGEL
TIGEKITKELIKYEPMHESNYVMLSNIYAKMFSWEKKTMIREVMAKKGMRKVPGSTMIEL
YNKIYEFVSGDKSHSEYKIIHQMVDDIGKEIRKAGFVASTSEVLLDIDEEDKEGAVNRHS
EKLAIAFALMKTPPGTPIRIVKNLRVCEDCHSATKFISKTYKREILVRDRNRFHRFVDGV
CSCKDFW*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc06g066080.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XZP2_CYNCS)

Sequence

ATGCAGCATTTACCTTCAAAATCAAAGCTATTCCATTCACTTCACACATCACTATCACTA
TCACTCACCAGCAAGAACCGAGCAGCAGAGCAGAATTGCTTATCTCTCCTCCAACTTTGC
GATTCTCTGCCTAAACTACTTCAACTTCAATCCCATATCTTCAAATTAGGCCTGCAAAGT
AACCCCCTTGTGCTCACAAAATTCACTTCCATTTCCTCTGAACTTAACGCCATTGCTCAC
GCTTCATCATTCATCTTTTCCCCATATGTTGAAACCCATTACTTTGATACCTTTCTTTTC
AACACCATTATCAGAAGTTACGCTGTAACTAGTTATTTTAAGGATAATGCTTTGTGTTTG
TATGGTAAAATGTTAAGTTATGGTATTTGGCCTAATAAGTTTACGTACCCTTTTGTGCTT
AAGGCTTGTGCTGGGATTGGTGAGTTGAAATTAGGCCAGACTGTTCATGGGTCAGTGGTG
AAACTTGGGTTTGATGATGATTCTCATGTTTTGAATACTATGATTCATATGTATTGTTGC
TGTGATGGTGGGGTTGAGTATGGGCGGAAGGTGTTTGATGAAATGCCTAACTGGGATTCG
GTAGGGTGGAGTGCCATGATAGGTGGTTATGTGAGATGGGGTTTGTCTAGTGAGGCTGTA
GGGTTGTTTAGAGAAATGCAGGTTGTTGGGATAGAACCTGATGAAGTTACGATGGTTTGT
TTGTTGTCTGCCTGCATAGATTTGGGTGCGCTTGAGCTAGGGAAGTGGCTCGAGGCATAT
ATCGAGAGGGAGAATGTTCCAAAGAGTGTTGTTCTTTGGAATGCTTTAATTGATATGTTT
GCAAAATGTGGTGATGTTGATAAAGCTCTAAGTTTGTTCAGGAGCATGAGTCGAAGGAAT
ATTGTTTCTTGGACTTCAGTTATAGATGGTATGGCGATGCATGGCCGGGGAACTGAGGCT
GTTTCTTTATTTGAGGAGATGAAGAATGATGGGGTTGTACCTGATGGTGTTTCCTTTATT
GGGTTACTTACTGCTTGTAGCCATTCGGCCTTAGTTGAGCAAGGTAAGGGATACTTTTAT
TCGATGACAAAGGAATTCGGGATTTCACCTAAGATAGAACACTACGGATGCATGGTTGAT
CTGTTATGTAGAGCTGGACATGTGCAAGAAGCATTGGATTTTGTTAAGAGAATGCCGATT
AAGCCAAATCCGGTAATTTGGAGAACACTTATTACTGCTTGCCGTGCTCATGGTGAGCTG
ACGATTGGTGAAAAAATAACAAAAGAGCTGATAAAATATGAGCCTATGCATGAATCTAAT
TACGTAATGCTTTCTAACATTTATGCAAAAATGTTTTCTTGGGAAAAGAAGACCATGATT
AGGGAAGTTATGGCAAAGAAGGGAATGAGAAAGGTTCCAGGGAGCACTATGATTGAACTA
TACAACAAAATCTATGAATTTGTGTCAGGAGATAAAAGTCATAGTGAGTACAAAATTATT
CATCAGATGGTGGATGATATTGGGAAAGAGATTAGAAAAGCTGGATTTGTTGCTTCAACA
TCAGAAGTGTTGCTTGATATCGATGAAGAAGATAAAGAAGGAGCTGTAAATAGGCATAGT
GAAAAGCTTGCTATTGCATTTGCCCTTATGAAGACACCTCCTGGAACTCCTATCCGAATC
GTGAAAAACTTACGAGTCTGTGAAGATTGCCACTCTGCGACTAAATTCATTTCGAAGACT
TACAAGCGAGAAATATTGGTCAGGGACAGAAACCGATTTCACCGTTTCGTAGATGGGGTT
TGCTCATGCAAAGACTTTTGGTAG