Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc06g065260.3.1
CDS Infomation	Receptor-like protein kinase HSL1 (AHRD V3.3 *** W9T2E3_9ROSA)
Sequence	ATGGCCAGAATCCAAAAACTCCAAAACTCCCTCTCAATTCTTGCTGTTTTTTTGTTTTTG AATTTTTTTGTCCAGCCATGTAAGTCCTTAACATCAGAAACTGAGGCTCTTTTGCATTTC AAAGAGCAGCTTAATGACCCTTTGAATTACTTGGATTCTTGGAAGGACTCAGAATCTCCT TGCAAGTTCTATGGAATTACATGTGATAAAAATACTGGTCTTGTTATCGAAATTTCGCTT GATAATAAATCGCTTTCCGGGGTGATATCACCTTCAATCTTTTCACTCAAAAGTCTCACT TCTCTTGTGTTACCTTCAAATGCACTATCAGGGAAACTTCCTAGTGAAGTTACCAACTGC ACCAGTCTCAGAGTCTTGAATGTCACAGTAAATAACATGAACGGAACGATACCTGATTTG TCTAAGTTGACTAACTTAGAAGTGTTGGACTTGTCGATTAACTACTTTTCCGGGGAATTC CCATCTTGGGTTGGAAATATGACTGGTTTGGTTGCGCTAGGCCTCGGAGATAATGACTTT GTTGAATGTAAAATTCCTGAGACTCTTGGGAATTTAAAGAAAGTGTATTGGCTTTACCTG GCAGGTTCAAATTTGACAGGAGAAATCCCGGAATCCATTTTTGAAATGGAGGCACTAGGT ACATTGGATATTTCAAGAAATCAGATTTCTGGGAATTTCTCTAAGTCAGTAAGCAAGCTG AAAAAATTATGGAAAATTGAGCTGTTTCAGAATAAGTTGACAGGGGAACTTCCTGTAGAA CTGGCAGAGCTCTCTCTTTTGCAGGAATTTGATATCTCTAGCAACCATATGTATGGGAAG CTGCCTCCAGAAATTGGGAACCTGAAGAAGTTAACAGTTTTTCATGTATTCATGAATAAC TTCTCTGGTGAAATTCCTCCTGGTTTTGGAGATATGCAGCATCTTAATGGCTTTTCCGTG TACAGGAACAATTTTTCTGGGGCATTTCCAGCAAATCTTGGTCGGTTTTCGCCCCTGAAT AGCATAGACATATCTGAAAACAAGTTTACTGGTGGATTCCCAAAGTACTTGTGCCAAAAT GGGAACCTGCAGTTTTTGCTAGCTATTGAGAACAGTTTCTCAGGGGAGTTTCCGAGTACT TACTCGTCGTGCAAGCCTTTACAGAGATTGAGGGTCAGTAAGAATCAACTTTCTGGGAAA ATTCCCAGTGATGTATGGGGACTTCCAAATGTACTGATGGTGGATTTCAGTGATAACGAA TTCAGTGGAACTATGTCCCCGGAAATTGGGGCTGCTACTAGCCTGAATCAGTTGGTATTA TCAAATAACAGATTTTCAGGTGAGCTTCCAAAAGAACTTGGGAAACTCACACAGTTGGAA AGGCTTTACTTGGATAACAATAACTTCTCGGGTGCAATACCTTCTGAACTTGGAAAACTA AAGCAAATTTCATCTTTGCATTTGGAGAAAAACTCATTCTCCGGGACTATCCCATCAGAA TTGGGTGAATTTTCTAGGCTTGCAGACCTGAATCTTGCTTCAAATCTTCTTACAGGTAGC ATTCCCAATTCCTTATCAATAATGACCTCTTTGAACTCTCTGAATCTTTCACACAACAGA CTCACTGGTACAATACCAACTAGCTTGGACAATCTGAAGCTGTCTTCATTGGATCTCTCT AACAACCAGCTATCAGGAGAGGTATCATTAGATCTTTTAACGCTGGGAGGAGACAAGGCA TTAGCTGGTAACAAAGGACTTTGTATCGACCAAAGCATCAGATTCTCGATCAACTCAGGC TTGGACAGTTGTGGTGGAAAGGCTGCTAAACATAAGTTAAACAAACTAGTGGTATCTTGC ATTGTGTTGCTTTCCTTAGCGGTTCTAATGGGTGGCTTATTGCTCGTCAGTTACCTAAAC TATAAGCATAGTCATGACATAGACGATGAAGAAAAACTGGAGCAAGCCAAGGGAACAAAT GCAAAATGGAAGCTTGAGAGTTTCCACCCTGTGGAATTTGATGCAGATGAAGTCTGTGAT TTCGATGAGGACAATTTGATCGGAAGTGGAGGTACAGGAAAAGTTTATCGGTTAGACTTG AAGAAAGGTTGTGGAACAGTAGCTGTGAAGCAGCTGTGGAAGGGGATCGGTGTGAAAGTT TTGACAAGGGAAATGGAAATCTTGGGGAAAATCAGGCACAGAAATATAGTTAAGTTGTAT GCCAGTCTAATGAAAGAAGGTTCAAATATCTTGGTTTTTGAGTACTTGCCAAATGGTAAT CTTTTCGAGGCACTACACCGAGAGATCAAGGCTGGCAAACCAGAACTAGATTGGTACCAG AGATATAAAATAGCCCTTGGAGCTGCAAAAGGAATTGCTTATCTGCATCATGATTGTTGC CCTCCTATTATTCACAGAGATATCAAATCAACCAACATTCTACTTGATGAGTATTATGAA GCAAAAGTTTCAGATTTCGGGGTTGCAAAAGTTTCAGAAATTTCTTCTAGGGGATCCGAG TTCAGTTGTTTTGCAGGTACTCATGGTTACATGGCGCCTGAAATAGCATACACTCTCAGA GTGACAGAAAAGAACGACATTTACAGCTTTGGTGTCGTGCTATTGGAGCTAGTAACTGGA AGAAAACCAATAGAAGAAGCCTATGGAGAAGGAAAAGACTTGGTCTACTGGACCTCAACT CATCTAAATGACAAGGAAAGCATTAACAAAGTTCTTGATCAAAAGGTGGTATCTGACCTT GTTCAAGATGAAATGATCAAAGTGTTGAGAATTGCCACACTTTGTACTACTAAGCTTCCT AATTTGCGTCCCAGCATGAAAGAGGTTGTCAATATGCTCGTCGATGCTGAACCCTTGACG TTTAGATCTTCAAGCAAATCTGAGAAAAAAGGGAACAATTTTTCTGAGGTCTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc06g065260.3.1
PEP Infomation	Receptor-like protein kinase HSL1 (AHRD V3.3 *** W9T2E3_9ROSA)
Sequence	MARIQKLQNSLSILAVFLFLNFFVQPCKSLTSETEALLHFKEQLNDPLNYLDSWKDSESP CKFYGITCDKNTGLVIEISLDNKSLSGVISPSIFSLKSLTSLVLPSNALSGKLPSEVTNC TSLRVLNVTVNNMNGTIPDLSKLTNLEVLDLSINYFSGEFPSWVGNMTGLVALGLGDNDF VECKIPETLGNLKKVYWLYLAGSNLTGEIPESIFEMEALGTLDISRNQISGNFSKSVSKL KKLWKIELFQNKLTGELPVELAELSLLQEFDISSNHMYGKLPPEIGNLKKLTVFHVFMNN FSGEIPPGFGDMQHLNGFSVYRNNFSGAFPANLGRFSPLNSIDISENKFTGGFPKYLCQN GNLQFLLAIENSFSGEFPSTYSSCKPLQRLRVSKNQLSGKIPSDVWGLPNVLMVDFSDNE FSGTMSPEIGAATSLNQLVLSNNRFSGELPKELGKLTQLERLYLDNNNFSGAIPSELGKL KQISSLHLEKNSFSGTIPSELGEFSRLADLNLASNLLTGSIPNSLSIMTSLNSLNLSHNR LTGTIPTSLDNLKLSSLDLSNNQLSGEVSLDLLTLGGDKALAGNKGLCIDQSIRFSINSG LDSCGGKAAKHKLNKLVVSCIVLLSLAVLMGGLLLVSYLNYKHSHDIDDEEKLEQAKGTN AKWKLESFHPVEFDADEVCDFDEDNLIGSGGTGKVYRLDLKKGCGTVAVKQLWKGIGVKV LTREMEILGKIRHRNIVKLYASLMKEGSNILVFEYLPNGNLFEALHREIKAGKPELDWYQ RYKIALGAAKGIAYLHHDCCPPIIHRDIKSTNILLDEYYEAKVSDFGVAKVSEISSRGSE FSCFAGTHGYMAPEIAYTLRVTEKNDIYSFGVVLLELVTGRKPIEEAYGEGKDLVYWTST HLNDKESINKVLDQKVVSDLVQDEMIKVLRIATLCTTKLPNLRPSMKEVVNMLVDAEPLT FRSSSKSEKKGNNFSEV*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc06g065260.3.1
Transcript Infomation	Receptor-like protein kinase HSL1 (AHRD V3.3 *** W9T2E3_9ROSA)
Sequence	TCCTAATTAATAGTAACATACCTAGTATTTCAATTTTTTTTAAAAAAAAATATATAATTG TTTTTCCATATAGTAGGGCTTGAACAAATTTGTATGTGAGATTTGCTTGATTAGGTATGT ATATGAAACTGCATATTAAAAATAGAAAAAAAAATATTGAGTGAAAGCTTGCAAGAAATA TTTCAAGAAAATTGGGAAAATAAAATATTCAAGAAAATAATGGCTAAAAAAAGGTACGAT AAATTGTGAAGCAGAAAGTTGATGAAGTGAAAGCTTAGCATATCATAAAATTGTGTGGTG TTGGATAATATCTCACACACACATTATATTATTCATATCTCAATAATATTTTACATTGAC TTCCAGTCAACCCTACATAACTACTATAAAATATTGCATGTATGGTCCCCCATTCCTAAC CAACAATCCGATAACAAAAACACACCGATTGTGATAGAACGGTAAGTATTTTTTAAATTG AATTTTATTTATATAGTAGCAATATAAACATTCTATGTGAAATTTTTGATGATTAAATGC TAGGTCTGTTATATGTAGTAGACTATATAAACATCTTATATGAAATTATTTAATGTAAAT CTAAATTTAGTTAAATTCAAACTAATAAACATACATTGAACACCAAGTAATTAAAAAAAA CTAAAAATATTATTAACTTTGATTAAAAAAAAAATTGAATAACTTTTTATTGTTTGGTTA CACTAAAATATCTTTTAGAAAAGAAATACTCAAATCAAAAAGGATTTATAACAATTGGTC TAATCAATAGTTAAACATTATAATCAATTTTGTACTCAAATTTACTACACTATAGTTAAG TTTTAATACCTGTTTTATCGAGAGAGAAAAAATGTCATTCTTGAATCAAACATACACAAC AACAAAAAAAGTTACGATTCAAAATTGAAATATGATCATTTTATTTCTTAAAATAGAACT TTTAACAAAAGAAAAAAACATAATTAATACGAAAAAGGTAAGTTTATAATCGTGAAGATT TTAATAAATTTTTGAAACATCAAGTATTGATTTTGGCTTTTTAAATATGGTAAAGATATT ATATTCAATCCATATATGAAATAATGAAACTAATTTTTTGAAAAAAGAACTTAAAGTAGT AGTAACTTTAGCCTGTAGAATATCTCTCATATCTTTTGAGATTTTGGGATCAGTGACTGT ACTACGTTGATCTAAATTAGTAAAAATATTTGAAGAGCATAACCCCATAAATTAGATAGA TTTTAGGATTATTATATCCAATGATAAAGAAAATTATGTTTACGTATGTATTGCAATTTG ATTTATTATTGTAGAAAGTTATCTATATTAATTTTTTCCTTAAAATTACTAATTCTATTT ATATTATCTATAGCTGTGGTGAATTAGACATTTAATACGTACGAATGGTTAATTTCAGAT ATTAGCTAGCAAAAAGAGTTGTAATCCGTAATATACAATAACAATAATATATTTAATGAA ATTTCATAAAGTGAGTCTAAAGAAGGTAAAGTGTATGCACGTTATTATTACCTCATCGAG GTGGAGAGAGTATCACTAAAAAAATCACTCAAAACTAAATCGATAATCAAAAGAAAACAA GATAGTAATAACAAAAAGAATTGTAATATAAAATTTAGGTTTAAAAAAAAAACGATTTCA CCTTTATTTCTAAGACTTGAACTCAAAAACTATGGAATTCACTTGTTAATTCCCTCTTTT TCCTTGAAGGCCTAAAAAAGAATCTATTCATATACAGTTGATTCTCGAACAATAAATCTA ATATCAATATCCTATTACTCTCTAAAAAAAATCACTCAGAACTAAATCGATAATTAAAAG AAAACACGACACTAATAACAAAAAGAATTGTAATATAAGATTTAGATAGAAAAAAATCTA TTACACCTTTATTTTTAAGACTTAAACTCAAAAACTATGGAATTCACTTGTTAATCCTCG CTTTCTCTTTGAAGGCCTAAAAAAAAATTTATTCATATATAATTGATTCTCAAACAATAA ATTTAATATCAATATTCTATTAAAACTTGACCAAACATCTAACACTTGCGAATATATAAA AGTGTAACTCCTCACAAAATGAGTAGGTCTTAATCTCAACCAAAGTATTCTAAAAAGCTT TTATTCATTTTTTGTCACCTTCTTGTTGCATAACTCACCTTCATACAATATTGTTTTCTT TCATTAATTAATCATTTGCACTAATTAACACCCCCCCCCCCCTCCACCCCCCAAACACAC ACTTTTGCCTTATCTCTTCTTCTTGTCTTTTCTCAAATCATTTTGTGTTCCTACTAAAAC CTTATTTTTCTATAATCACTAAATAGACTAAAAACCAACAAACTCTTCATTCAGAAACTT CTTTTTCTTTTATCTATTTCTGGTGACTGACACTGCAAATTCCCATTTTCCCTTTAGAGG GGTCTCATTCAAATTTTTGAATTCTTTTGGGTATTCAAGAAAACAAAAAAGTTTGAAGCT TTCTGCCTCTTTATGTGTGAATAAATAAGAGAAACAGAAAATCATCTTACTATTTCAGCT GTTTCTTGGATGGACACCCATCATGGCAATAATGGAGTTCTTGATTGGATTTGTGTCCCC TCTTTGAAATGACCCTTTTGCCCTTCTCAAATTTCAAGAATGGCCAGAATCCAAAAACTC CAAAACTCCCTCTCAATTCTTGCTGTTTTTTTGTTTTTGAATTTTTTTGTCCAGCCATGT AAGTCCTTAACATCAGAAACTGAGGCTCTTTTGCATTTCAAAGAGCAGCTTAATGACCCT TTGAATTACTTGGATTCTTGGAAGGACTCAGAATCTCCTTGCAAGTTCTATGGAATTACA TGTGATAAAAATACTGGTCTTGTTATCGAAATTTCGCTTGATAATAAATCGCTTTCCGGG GTGATATCACCTTCAATCTTTTCACTCAAAAGTCTCACTTCTCTTGTGTTACCTTCAAAT GCACTATCAGGGAAACTTCCTAGTGAAGTTACCAACTGCACCAGTCTCAGAGTCTTGAAT GTCACAGTAAATAACATGAACGGAACGATACCTGATTTGTCTAAGTTGACTAACTTAGAA GTGTTGGACTTGTCGATTAACTACTTTTCCGGGGAATTCCCATCTTGGGTTGGAAATATG ACTGGTTTGGTTGCGCTAGGCCTCGGAGATAATGACTTTGTTGAATGTAAAATTCCTGAG ACTCTTGGGAATTTAAAGAAAGTGTATTGGCTTTACCTGGCAGGTTCAAATTTGACAGGA GAAATCCCGGAATCCATTTTTGAAATGGAGGCACTAGGTACATTGGATATTTCAAGAAAT CAGATTTCTGGGAATTTCTCTAAGTCAGTAAGCAAGCTGAAAAAATTATGGAAAATTGAG CTGTTTCAGAATAAGTTGACAGGGGAACTTCCTGTAGAACTGGCAGAGCTCTCTCTTTTG CAGGAATTTGATATCTCTAGCAACCATATGTATGGGAAGCTGCCTCCAGAAATTGGGAAC CTGAAGAAGTTAACAGTTTTTCATGTATTCATGAATAACTTCTCTGGTGAAATTCCTCCT GGTTTTGGAGATATGCAGCATCTTAATGGCTTTTCCGTGTACAGGAACAATTTTTCTGGG GCATTTCCAGCAAATCTTGGTCGGTTTTCGCCCCTGAATAGCATAGACATATCTGAAAAC AAGTTTACTGGTGGATTCCCAAAGTACTTGTGCCAAAATGGGAACCTGCAGTTTTTGCTA GCTATTGAGAACAGTTTCTCAGGGGAGTTTCCGAGTACTTACTCGTCGTGCAAGCCTTTA CAGAGATTGAGGGTCAGTAAGAATCAACTTTCTGGGAAAATTCCCAGTGATGTATGGGGA CTTCCAAATGTACTGATGGTGGATTTCAGTGATAACGAATTCAGTGGAACTATGTCCCCG GAAATTGGGGCTGCTACTAGCCTGAATCAGTTGGTATTATCAAATAACAGATTTTCAGGT GAGCTTCCAAAAGAACTTGGGAAACTCACACAGTTGGAAAGGCTTTACTTGGATAACAAT AACTTCTCGGGTGCAATACCTTCTGAACTTGGAAAACTAAAGCAAATTTCATCTTTGCAT TTGGAGAAAAACTCATTCTCCGGGACTATCCCATCAGAATTGGGTGAATTTTCTAGGCTT GCAGACCTGAATCTTGCTTCAAATCTTCTTACAGGTAGCATTCCCAATTCCTTATCAATA ATGACCTCTTTGAACTCTCTGAATCTTTCACACAACAGACTCACTGGTACAATACCAACT AGCTTGGACAATCTGAAGCTGTCTTCATTGGATCTCTCTAACAACCAGCTATCAGGAGAG GTATCATTAGATCTTTTAACGCTGGGAGGAGACAAGGCATTAGCTGGTAACAAAGGACTT TGTATCGACCAAAGCATCAGATTCTCGATCAACTCAGGCTTGGACAGTTGTGGTGGAAAG GCTGCTAAACATAAGTTAAACAAACTAGTGGTATCTTGCATTGTGTTGCTTTCCTTAGCG GTTCTAATGGGTGGCTTATTGCTCGTCAGTTACCTAAACTATAAGCATAGTCATGACATA GACGATGAAGAAAAACTGGAGCAAGCCAAGGGAACAAATGCAAAATGGAAGCTTGAGAGT TTCCACCCTGTGGAATTTGATGCAGATGAAGTCTGTGATTTCGATGAGGACAATTTGATC GGAAGTGGAGGTACAGGAAAAGTTTATCGGTTAGACTTGAAGAAAGGTTGTGGAACAGTA GCTGTGAAGCAGCTGTGGAAGGGGATCGGTGTGAAAGTTTTGACAAGGGAAATGGAAATC TTGGGGAAAATCAGGCACAGAAATATAGTTAAGTTGTATGCCAGTCTAATGAAAGAAGGT TCAAATATCTTGGTTTTTGAGTACTTGCCAAATGGTAATCTTTTCGAGGCACTACACCGA GAGATCAAGGCTGGCAAACCAGAACTAGATTGGTACCAGAGATATAAAATAGCCCTTGGA GCTGCAAAAGGAATTGCTTATCTGCATCATGATTGTTGCCCTCCTATTATTCACAGAGAT ATCAAATCAACCAACATTCTACTTGATGAGTATTATGAAGCAAAAGTTTCAGATTTCGGG GTTGCAAAAGTTTCAGAAATTTCTTCTAGGGGATCCGAGTTCAGTTGTTTTGCAGGTACT CATGGTTACATGGCGCCTGAAATAGCATACACTCTCAGAGTGACAGAAAAGAACGACATT TACAGCTTTGGTGTCGTGCTATTGGAGCTAGTAACTGGAAGAAAACCAATAGAAGAAGCC TATGGAGAAGGAAAAGACTTGGTCTACTGGACCTCAACTCATCTAAATGACAAGGAAAGC ATTAACAAAGTTCTTGATCAAAAGGTGGTATCTGACCTTGTTCAAGATGAAATGATCAAA GTGTTGAGAATTGCCACACTTTGTACTACTAAGCTTCCTAATTTGCGTCCCAGCATGAAA GAGGTTGTCAATATGCTCGTCGATGCTGAACCCTTGACGTTTAGATCTTCAAGCAAATCT GAGAAAAAAGGGAACAATTTTTCTGAGGTCTAGTTTCTCTTTTTTTTATATTGGGGTTTC CCTGTTGATAGTTGCTCTGTAGTATAATTCTCAAGTTAGTGTTAGGTATCTGATATACAT AAATTTATACCATGTGATGTGATATTCCACTTTCTTTATGTAAAAGTTCGAATTGTGTAA GATAAAATGTACTTTTTTTCTGCTGTGATTGGAAACTTCAGAAGTTGGATTAATCAGAAA TCTGGGTATTTATGTCCATGATTAAGAGTCCCAAATAGGCAAAAATACATGAGATATG