Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc06g065030.3.1
CDS Infomation	Transmembrane 9 superfamily member (AHRD V3.3 *** K4C7D2_SOLLC)
Sequence	ATGTTCTTCGTCTTCCAATTCTTCACCATTTTCATTATCTGTTCTTGCTTTTTAGCATGC CCAATTCTTGCAAAGTATCAAGAAAATGATTCTGTCACTTTATGGGTAAACAAAGCTGCA CCATATGTTAATCCACAAGAGACCTACAGTTATTATAGCCTTCCATATTGTCGTCCTGCT GCTGATGGTGATCATAAGTGGGGTGGCCTCGGCGGGGTTCTTGGAGGAAATGATCTTATT GATAGCCGAATTGATATAAAGTTTAAGAGAGATGTGGAGAAAAGATCAATTTGTGAACTT AAATTGGATGCATCAAAGATAGCACGGTTTAAGTATGCAATTGACAACTCGTATTGGTTT GAATTTTTTATGGATGATTTGCCAATATGGGGTTTCGTAGGTGAAGTGCATCCTCACAGA GTTGGACATAACACGCATGCATTGTACACACACAAGATGATTCAAATCGATTACAATAGA GACCAGATCATTCATATCAACCTGTCTCATGAGATGCCAAAACCATTGGAAGAAGGAAGG ACCTTGGATATGACATATTCTATTAAATGGTTCCCGATAAATATTAGTTATGAACAACGA TTCAATGTTTACCTGAATAACTACTTTTTTGAGAACGAGATCCATTGGTTCTCTGTATTC AATTCTATCATGATGGTAATTTTCCTCACTGGATTAGTGTCTATGATTTTAATGCGCACT CTTCGCAATGATTATGCAAAATATGCTCGTGAAAATGACGATATGGAGACTCAGGAAAGG GATGTACTTGAAGAGTCTGGTTGGAAGCTTGTCCATGGTGACGTTTTCCGACCTCCACAA AATCTGGCTCTCTTTTCAGCGGTTGTTGGGACTGGTGCTCAGCTTGCAACACTTGTTCTC CTTGTCATTTTATCTGCCTACTTTGGAAAGATGTACATGAGGAGAGGAGCAATTATTACA ACCTTTGTTGTATGTTATGCTCTTACATCATTCATCTCGGGATATGTGAGTGGTGGACTG TACTCTCGTAATGCTGGTGAAAACTGGATGAAGTCGATGTTCCTTACCGCGTCACTTTTC CCCTTTTTGTGCTTTGGGATAGGGTTCATTCTAAACACCATTGCTATATTTTATGGATCC ATAGCTGCTATTCCCCTTGGCACAATCGTAGTAGTTCTTGTTATTTGGGCTTTTATCTCC TTGCCTCTGTCCCTCCTTGGTACTGTTGTCGGAAGAAACTGGAGTGGTACTCCAAACAAT CCATGCCGTGTTAAGAATATTCCGCGTCCTATCCCTGAGAAGAAATGGTACCTAAGACCA TATGTTATTTCTCTGGTGGGAGGTCTTCTGCCCTTTGCAAGCATTTTTACTGAGATGTAT TACATCTTCGCTTCCTTCTGGACCTATATGCTGCACTACTATGTGTATGGATTCTTGCTC CTTGTGTTCATTGTTCTGATCATTGTCACTATTTGTGTGACAATTGTGGGAACATACTAT TTGCTGAACGCGGAGAACTATAATTGGCAATGGACTTCATTCTTTTCGGCTGCCTCCACT GCTCTATATGTCTACCTATATGCTATATATTACTATCATTCAAAGACTAAAATGTCTGGT CTCCTCCAGACCAGCTTTTATTTTGGCTACACTCTTATGTTCTGCCTTGGTGTCGGTATC CTATGTGGTGCTGTAGGGTATCTTGGCTCTAATTTGTTCATCAGGAGGATTTTTGGAAAC ATCAAATGTGATTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc06g065030.3.1
PEP Infomation	Transmembrane 9 superfamily member (AHRD V3.3 *** K4C7D2_SOLLC)
Sequence	MFFVFQFFTIFIICSCFLACPILAKYQENDSVTLWVNKAAPYVNPQETYSYYSLPYCRPA ADGDHKWGGLGGVLGGNDLIDSRIDIKFKRDVEKRSICELKLDASKIARFKYAIDNSYWF EFFMDDLPIWGFVGEVHPHRVGHNTHALYTHKMIQIDYNRDQIIHINLSHEMPKPLEEGR TLDMTYSIKWFPINISYEQRFNVYLNNYFFENEIHWFSVFNSIMMVIFLTGLVSMILMRT LRNDYAKYARENDDMETQERDVLEESGWKLVHGDVFRPPQNLALFSAVVGTGAQLATLVL LVILSAYFGKMYMRRGAIITTFVVCYALTSFISGYVSGGLYSRNAGENWMKSMFLTASLF PFLCFGIGFILNTIAIFYGSIAAIPLGTIVVVLVIWAFISLPLSLLGTVVGRNWSGTPNN PCRVKNIPRPIPEKKWYLRPYVISLVGGLLPFASIFTEMYYIFASFWTYMLHYYVYGFLL LVFIVLIIVTICVTIVGTYYLLNAENYNWQWTSFFSAASTALYVYLYAIYYYHSKTKMSG LLQTSFYFGYTLMFCLGVGILCGAVGYLGSNLFIRRIFGNIKCD*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc06g065030.3.1
Transcript Infomation	Transmembrane 9 superfamily member (AHRD V3.3 *** K4C7D2_SOLLC)
Sequence	GACAAAAGAAAATGGAAAAAAGAGTTGCCGCACTTTCTTCTCATTTTCTCATAGCTAACA GCACTGTAAAAACACAGTGGCTAACTCATTCCTTCTTGTTTTTCACACTGTTCAGATCAA AGCAATGTTCTTCGTCTTCCAATTCTTCACCATTTTCATTATCTGTTCTTGCTTTTTAGC ATGCCCAATTCTTGCAAAGTATCAAGAAAATGATTCTGTCACTTTATGGGTAAACAAAGC TGCACCATATGTTAATCCACAAGAGACCTACAGTTATTATAGCCTTCCATATTGTCGTCC TGCTGCTGATGGTGATCATAAGTGGGGTGGCCTCGGCGGGGTTCTTGGAGGAAATGATCT TATTGATAGCCGAATTGATATAAAGTTTAAGAGAGATGTGGAGAAAAGATCAATTTGTGA ACTTAAATTGGATGCATCAAAGATAGCACGGTTTAAGTATGCAATTGACAACTCGTATTG GTTTGAATTTTTTATGGATGATTTGCCAATATGGGGTTTCGTAGGTGAAGTGCATCCTCA CAGAGTTGGACATAACACGCATGCATTGTACACACACAAGATGATTCAAATCGATTACAA TAGAGACCAGATCATTCATATCAACCTGTCTCATGAGATGCCAAAACCATTGGAAGAAGG AAGGACCTTGGATATGACATATTCTATTAAATGGTTCCCGATAAATATTAGTTATGAACA ACGATTCAATGTTTACCTGAATAACTACTTTTTTGAGAACGAGATCCATTGGTTCTCTGT ATTCAATTCTATCATGATGGTAATTTTCCTCACTGGATTAGTGTCTATGATTTTAATGCG CACTCTTCGCAATGATTATGCAAAATATGCTCGTGAAAATGACGATATGGAGACTCAGGA AAGGGATGTACTTGAAGAGTCTGGTTGGAAGCTTGTCCATGGTGACGTTTTCCGACCTCC ACAAAATCTGGCTCTCTTTTCAGCGGTTGTTGGGACTGGTGCTCAGCTTGCAACACTTGT TCTCCTTGTCATTTTATCTGCCTACTTTGGAAAGATGTACATGAGGAGAGGAGCAATTAT TACAACCTTTGTTGTATGTTATGCTCTTACATCATTCATCTCGGGATATGTGAGTGGTGG ACTGTACTCTCGTAATGCTGGTGAAAACTGGATGAAGTCGATGTTCCTTACCGCGTCACT TTTCCCCTTTTTGTGCTTTGGGATAGGGTTCATTCTAAACACCATTGCTATATTTTATGG ATCCATAGCTGCTATTCCCCTTGGCACAATCGTAGTAGTTCTTGTTATTTGGGCTTTTAT CTCCTTGCCTCTGTCCCTCCTTGGTACTGTTGTCGGAAGAAACTGGAGTGGTACTCCAAA CAATCCATGCCGTGTTAAGAATATTCCGCGTCCTATCCCTGAGAAGAAATGGTACCTAAG ACCATATGTTATTTCTCTGGTGGGAGGTCTTCTGCCCTTTGCAAGCATTTTTACTGAGAT GTATTACATCTTCGCTTCCTTCTGGACCTATATGCTGCACTACTATGTGTATGGATTCTT GCTCCTTGTGTTCATTGTTCTGATCATTGTCACTATTTGTGTGACAATTGTGGGAACATA CTATTTGCTGAACGCGGAGAACTATAATTGGCAATGGACTTCATTCTTTTCGGCTGCCTC CACTGCTCTATATGTCTACCTATATGCTATATATTACTATCATTCAAAGACTAAAATGTC TGGTCTCCTCCAGACCAGCTTTTATTTTGGCTACACTCTTATGTTCTGCCTTGGTGTCGG TATCCTATGTGGTGCTGTAGGGTATCTTGGCTCTAATTTGTTCATCAGGAGGATTTTTGG AAACATCAAATGTGATTAAGTGCATGACAATGCACAAGACAGGTTGCTCTTTATAGCGTT CTACTCATCTGTTGAGTGCGAAGACTACGTATGTTCATGCTTGCCTTCACTGATCACAAA CTGTGAATGAAACATTAGATGGAGTTTCATTTTACATAGACAAGAACTAGCATTGTACAA TCTCTGGATACATTGGCAATCAGATTTCATGAAGCTATATGTTATATATGGCTGCTGACT TTAAAGACCCTTTGTAGATTCTTTTTACCTTTGTGTATTTTATATGATCTGTATAAAATT CTTTATTAGAAGACTGTTTTTTCCTTTGGATAAGATTGTCGATTTTATAATTATCTTTTA CTC