Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc06g062480.3.1
CDS Infomation	Protein EARLY FLOWERING 3-like protein (AHRD V3.3 *** A0A0B0MJA5_GOSAR)
Sequence	ATGAAGACGGAAAAAGAGGAAGAGAGGCATATGGATCCTTTGTTTCCTAGATTACATATA AATGATACAGACAAAGGAGGTCCAAGAGCACCCCCTAGAAACAAAATGGCTCTTTGTGAA CAGTCGTCATCCAGATCGCCTCAAAGTTTCACCTCTAGTTCTACTCCTGCAACCATGCAA ATGCTACCTAATAGTGGAAACTCTATTTCTGCAGCATCTTCTACTCTTGTTGGTTGCAAC AAAAGGAATTATTTTCTCCACAATTCATCTGAGTCTTCTCATTTGGTTGAGATACCTCCC TTTTCTTCTGGAGGGATAAATTTTACTATGAGACATCCTGATGTTCCACCAGTCAAGTCG CTAAATCCTCAAGTTTTATGTCTTAAAGGGAATTTGCATGCTACATCTCAGCTTAATCCC ATTCAGCAACACAGTTTATCATACTATAATAGTAACCCTTCTGCCAATAAATTAGGAAGG GAAAATGATTTTTGTGGTCCAAATTTCGTCACATCAGGGAAACCTCTATATCATGGTAAC ATACATAAAAGTGCAGACAAGGAAAAAATGGTTATAACAAACTCCAAACCTTCTTTGAAA TTTCAAAGCGTTTTCGAAAAGCAATATAAGGATACAGACAGGATGCAACTAAATTGCAGG GAGCATAGTGGAAGTCAAGCTGGAGATCAAGCAAAGTACCAAAAGAGAGAACATTGTGTT AAACTACCTGCTCCTCATCTGTCAACTATAGAGACAACTGTGGTGCATGAAACTCCAACT CCAGGACATAGCAAGCTAAATATTAGTAAATCATTTGTATCAAGTGCTCCAGAAAACAGA TGTGGTCTAGTAGGTGACTTGAATAGATGTAGTGATTCTAATTCTGAATCTGATGAAGAC TCTTGGATTTTACACAAAAGGAAGGCTGCAGAAGATGTTACTAATGCGAAGCATGAAGAT GCCTCGACTAAGAGATGTGCTTCAATAATGGAAGGTCCGTCGTGTTCCTTTCTGCCTCAC GGAAACAGCCATCAGAGTCCGAAGAGAGCTAAATCCTCTTCTGACTGTCCTGAAGACCAG ATTAGTGGGGCTCCAGATGTAGCAGGTGAAGAGAGAAGTGAAGGGATCTCAGAAGCTTCC TCCTTGAACTCTAGATTAGTAGAAAAAATGTCTTCAGATAATGTCATAGCATTGATAGGT CAAGAGATATTCTGGAAAACAAGAAGAACCATTGCACACCAGCAGCGGATCTTTGCAATA CAACTATTTGAGCTACACAGACTAACACAGGTTCAGAAAATGATAGCCAGATCACCAGAT ATATTTTTCAAAGACAACTTCTATCTCCACCAACCTTCTATCAAATTTTCTTCTTTGAAG AATTTAGCATGTGATGATGTTCTTGAACCTCCTGTCGTGGAACAAAAAATTTCTACAAAA CCAAACAATTTTGAGCTTACGACAGATAATGTTTATCTTCCCCTCCGCAAAGATAATGAT AAGAAGAATATACCACAGCAATCATCTCAAAAACTAAATGTAGGGACACCAACATCGAGA TCTTTTTTATCGGATCCAAAATTAGCACCTCGATCCTTCCAACCACCTCCTGGATATCAG TATTTAGTTCCAATAAGGTCACCTTCTGAAGGACTTATTTATAAACCTTATACAGGACCT TGTCCACCGCCTGGAGGGATCATAGCGCCAGCTTATGGTAGTTGCAGGCCTGTGACTTTA TCTCCACCTATAGGTGGAGACTTCGCGAATGTGCCTTATAGTGTACCGACTTCCCACAAG CAGGGTGCTGGGATTTTTCCTGGTCCTGCACTCTTTGATCCATCCTGCATTCAACCGTAT TCCATGCCTGTGATAAAGCCATCTGCTTCAAGTTCAGCTATCGAGCAAATGAATCCACTT TCCAGGATCAGGTCAAGTGAGAAGGAGAATAGTCCACTTATGCATGAGGTCAACTTAGTT AGGCCTCATCAAAAATCATGCAACATATCATGCCAGAAGAGTGCGGTCATGTCAGATTGT GATCGAATTATTCAGGCGGATAGAGGGAGTGACATGCAAGGAAGTACCGCAAGTAGTCCT CCTGAGAGGGTGCAAAAGGGTGCACTTTCTCTTTTTCCTGTCACACCAACTGCAAAAGGT TCAGATCAACCAGTTCAGGATAACGACACGGAGCAGCAAATTCAAGTCATCAAGGTTGTG CCCCATAATCCAAAGTCAGCATCTGAATCTGCAGCGCGGATTTTTAGATCTATACAAGAA GAAAGGAAAATGAATTACTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc06g062480.3.1
PEP Infomation	Protein EARLY FLOWERING 3-like protein (AHRD V3.3 *** A0A0B0MJA5_GOSAR)
Sequence	MKTEKEEERHMDPLFPRLHINDTDKGGPRAPPRNKMALCEQSSSRSPQSFTSSSTPATMQ MLPNSGNSISAASSTLVGCNKRNYFLHNSSESSHLVEIPPFSSGGINFTMRHPDVPPVKS LNPQVLCLKGNLHATSQLNPIQQHSLSYYNSNPSANKLGRENDFCGPNFVTSGKPLYHGN IHKSADKEKMVITNSKPSLKFQSVFEKQYKDTDRMQLNCREHSGSQAGDQAKYQKREHCV KLPAPHLSTIETTVVHETPTPGHSKLNISKSFVSSAPENRCGLVGDLNRCSDSNSESDED SWILHKRKAAEDVTNAKHEDASTKRCASIMEGPSCSFLPHGNSHQSPKRAKSSSDCPEDQ ISGAPDVAGEERSEGISEASSLNSRLVEKMSSDNVIALIGQEIFWKTRRTIAHQQRIFAI QLFELHRLTQVQKMIARSPDIFFKDNFYLHQPSIKFSSLKNLACDDVLEPPVVEQKISTK PNNFELTTDNVYLPLRKDNDKKNIPQQSSQKLNVGTPTSRSFLSDPKLAPRSFQPPPGYQ YLVPIRSPSEGLIYKPYTGPCPPPGGIIAPAYGSCRPVTLSPPIGGDFANVPYSVPTSHK QGAGIFPGPALFDPSCIQPYSMPVIKPSASSSAIEQMNPLSRIRSSEKENSPLMHEVNLV RPHQKSCNISCQKSAVMSDCDRIIQADRGSDMQGSTASSPPERVQKGALSLFPVTPTAKG SDQPVQDNDTEQQIQVIKVVPHNPKSASESAARIFRSIQEERKMNY*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc06g062480.3.1
Transcript Infomation	Protein EARLY FLOWERING 3-like protein (AHRD V3.3 *** A0A0B0MJA5_GOSAR)
Sequence	AGGCGAAAATGAATCAAGTGCTCTATAACTTAATTAGTTCTATCAATCCTCTTATGTTTT TTTTTATCATTTTTTTAGCGATACGTGAGTGAATTTCTTTCTACTATTTTCTTAGCGATA TATGCACAAGTTATTAAGTGTCGCGCTTGTATTTAGTTGAAGACTAATAAGGTCATAAAA TTTTCCAAATACTTTTTTTGAGTCTCTATTTAATTTATACTCACTGCTTAAAAAATTTAT AAATATCTATCTAGTCAAAATATTATATTACTTTGGAAATTTTCGTTTGAAGTTTGACCA TAAAATGTTTCACATTTTCATCTAAATTAGATATTTTTATATGATGTTATGACCTATAAA CCTTTAGATATAAATTTACTCTAAAAAGTTAATAAGATTAATATTTAAGATATTTGCTTA TTAAATTTGTAGATTTGAGAGAAAGTCTCTACGAATTTTTTAAACACCACTTTTTTTCAC AAACTTTTTAAATATCACTTTTTTCAATTCGATCAAAATTGGAGTACCAAATAACAAGAC CACTTAAATATAAATATTCTTATTTAAAGGTTAAACTTTAAAAATTTTATCATATAATAA GTTGAATTATGTTTGATATTACCATTTGCAAGAAATGTAGGAACTTTCAACTTTTAGCTC TCTTTCGAATTATAACTGCTATATCAACTACTTCCATTGTCAATTGGGTCCATGATCAAT GATTTATTTGTTAAGGTGAACATTCTATATCTTATTTGGTGATTATGGCTCTTTCATGGT GATGAAATAATGCAAAAGAGCAAGCGACACAAAGTGATATCGTCAAAATTTTGAAGTTAA AATATATACATATAAAATTTGGTTTCAATAGAGGTTTGATGGAAACTTATCAAAAGCGGA TACTGGTTAAATAATACGTAGATTAGAGCATCTGAATAGGTTTTCTTTATGTATCAAATG TACTATTACGAATCATAATTTTAAAAACACATTAAAGGTTGATGCACGTCCATGAACCCT CATATTTGGGCTATATATTTACCCAGAATCAACTCATACATATTTACCCCAGAATCAGCT CAATTACTAGACGATAAATTATCGAGTTAATATGAATGATTCAAATGAGTTATATTTAAT TTTAATAAGCTTATTTTATTGGTTTCCACATTCAACGTAGCCTTATCTTTATTAACACTC CTATTTCAACTACATATTTAGCCGAAATGAGCTATTAAACGATAAATTATCGATCGAGTT AACATGGATGACTTGAACGGGCCATATTTTGATGAGTTTCCACATTCAACCTTCTATTTA TTGACGCTCGTATTTGGGCTGCATGTCTAGCACGAATTAACTCAATGATTAGACGGCAAA ATTAACGAGTTAATATGCATGGCTTGAACGAGTCATATTTTCATGAGATCTAAAAAATTA TAAAATAGCCTTTTTAAGTAGAATTAAATAATAAAAGTACCCGTCATATAATTACTAGAA AACGTGTTAATTGAATAACAGTATAGAAAATAGTTTGAGATGGATGATGCGATATAATAA GCGACGGGTTCGGGTAAGTTTTTAGTCCGTCGAGGAAAAAGCGTATGGTGAGATTTGGCA GATATTTCGTAAAAAGATTGGACAATTTCTTACATGTGGTTTAACGACGGGTACACAGTT GTTTCGGCATTTGCATTTATATTATTTATATTATAGAGAGAAAGAAAAGGAGAGCGAGTC AGTCACTATTAATCTGTTCCTTTTAATTGCAACAAAAATATTTACCTACTGCTATTAACT AATAATTCTCTGCCTTTTAACTTCCCTTACTCATGGAAGTTCCACTAATTCTCTACCCAC CTCACATTCCCCTCATTTCATTCTCCTTCTCATCTATTTCTTGATGTGATCTTCTTCTAA GATTTCCTCTTTATATTTCCATATTGTTTTATGTGCTAAAAAGCATTTTAGATTGGGATC CTCTATTCCAGGAAGTCGAAAATTTGCTCACATGAACATTCAGTTTTCGCCTATCAAACT GTAATTCCATGTGGTTTTGCTTATTACTACTGATTTACGGTCAAAAGAATCAATCTTTTG AGGTGGGATGACTAATTGTTGCGGTTAGTGGAACAGAGATTTGGGTTGTTAGTGTTCAGC TATGAAATGGTTCATCCTTTTATGTTAGGGTTCATCTTAATTAACACGCGAAGCAAGCAG TGAAAAATGAAGACGGAAAAAGAGGAAGAGAGGCATATGGATCCTTTGTTTCCTAGATTA CATATAAATGATACAGACAAAGGAGGTCCAAGAGCACCCCCTAGAAACAAAATGGCTCTT TGTGAACAGTCGTCATCCAGATCGCCTCAAAGTTTCACCTCTAGTTCTACTCCTGCAACC ATGCAAATGCTACCTAATAGTGGAAACTCTATTTCTGCAGCATCTTCTACTCTTGTTGGT TGCAACAAAAGGAATTATTTTCTCCACAATTCATCTGAGTCTTCTCATTTGGTTGAGATA CCTCCCTTTTCTTCTGGAGGGATAAATTTTACTATGAGACATCCTGATGTTCCACCAGTC AAGTCGCTAAATCCTCAAGTTTTATGTCTTAAAGGGAATTTGCATGCTACATCTCAGCTT AATCCCATTCAGCAACACAGTTTATCATACTATAATAGTAACCCTTCTGCCAATAAATTA GGAAGGGAAAATGATTTTTGTGGTCCAAATTTCGTCACATCAGGGAAACCTCTATATCAT GGTAACATACATAAAAGTGCAGACAAGGAAAAAATGGTTATAACAAACTCCAAACCTTCT TTGAAATTTCAAAGCGTTTTCGAAAAGCAATATAAGGATACAGACAGGATGCAACTAAAT TGCAGGGAGCATAGTGGAAGTCAAGCTGGAGATCAAGCAAAGTACCAAAAGAGAGAACAT TGTGTTAAACTACCTGCTCCTCATCTGTCAACTATAGAGACAACTGTGGTGCATGAAACT CCAACTCCAGGACATAGCAAGCTAAATATTAGTAAATCATTTGTATCAAGTGCTCCAGAA AACAGATGTGGTCTAGTAGGTGACTTGAATAGATGTAGTGATTCTAATTCTGAATCTGAT GAAGACTCTTGGATTTTACACAAAAGGAAGGCTGCAGAAGATGTTACTAATGCGAAGCAT GAAGATGCCTCGACTAAGAGATGTGCTTCAATAATGGAAGGTCCGTCGTGTTCCTTTCTG CCTCACGGAAACAGCCATCAGAGTCCGAAGAGAGCTAAATCCTCTTCTGACTGTCCTGAA GACCAGATTAGTGGGGCTCCAGATGTAGCAGGTGAAGAGAGAAGTGAAGGGATCTCAGAA GCTTCCTCCTTGAACTCTAGATTAGTAGAAAAAATGTCTTCAGATAATGTCATAGCATTG ATAGGTCAAGAGATATTCTGGAAAACAAGAAGAACCATTGCACACCAGCAGCGGATCTTT GCAATACAACTATTTGAGCTACACAGACTAACACAGGTTCAGAAAATGATAGCCAGATCA CCAGATATATTTTTCAAAGACAACTTCTATCTCCACCAACCTTCTATCAAATTTTCTTCT TTGAAGAATTTAGCATGTGATGATGTTCTTGAACCTCCTGTCGTGGAACAAAAAATTTCT ACAAAACCAAACAATTTTGAGCTTACGACAGATAATGTTTATCTTCCCCTCCGCAAAGAT AATGATAAGAAGAATATACCACAGCAATCATCTCAAAAACTAAATGTAGGGACACCAACA TCGAGATCTTTTTTATCGGATCCAAAATTAGCACCTCGATCCTTCCAACCACCTCCTGGA TATCAGTATTTAGTTCCAATAAGGTCACCTTCTGAAGGACTTATTTATAAACCTTATACA GGACCTTGTCCACCGCCTGGAGGGATCATAGCGCCAGCTTATGGTAGTTGCAGGCCTGTG ACTTTATCTCCACCTATAGGTGGAGACTTCGCGAATGTGCCTTATAGTGTACCGACTTCC CACAAGCAGGGTGCTGGGATTTTTCCTGGTCCTGCACTCTTTGATCCATCCTGCATTCAA CCGTATTCCATGCCTGTGATAAAGCCATCTGCTTCAAGTTCAGCTATCGAGCAAATGAAT CCACTTTCCAGGATCAGGTCAAGTGAGAAGGAGAATAGTCCACTTATGCATGAGGTCAAC TTAGTTAGGCCTCATCAAAAATCATGCAACATATCATGCCAGAAGAGTGCGGTCATGTCA GATTGTGATCGAATTATTCAGGCGGATAGAGGGAGTGACATGCAAGGAAGTACCGCAAGT AGTCCTCCTGAGAGGGTGCAAAAGGGTGCACTTTCTCTTTTTCCTGTCACACCAACTGCA AAAGGTTCAGATCAACCAGTTCAGGATAACGACACGGAGCAGCAAATTCAAGTCATCAAG GTTGTGCCCCATAATCCAAAGTCAGCATCTGAATCTGCAGCGCGGATTTTTAGATCTATA CAAGAAGAAAGGAAAATGAATTACTAGTATGCAAAACCTTACAACTTAATGTTGTAAGAA AAGCCTTTTCTTCTGTATGTTTTCCCTTATCTAAATTTCCCTCATTTTATAGTTTACCTC TTGGATTAAAGGCTCTTTACTGTGAATATATTCAATGGAAAGTGAAAAGCAATACAGGTT CATTCTTTTTCTACTACTTCATTCTCTTGATTTTCTCTTTCAATCATCCTGCTCCATCAT ACTTTCTGACTCTGTACATTCAAACTTGCTAAATGTGTTGGACGGCGGTAAGGATACATG AAAAATGTATAGTTTTAAACATGTTTTCTTAGATTACAAAAAAGAAAGAGATCAACTTCT CTGAATGAAATTAAGGTGGAAGTTGGTGGAGGAATGTAGCATAATATATACAATGTCTTG TAAGTAGCTTTCTTTAGTTTACCGATTCTACACACATGAATAGTCTTAGTATGTAAATGA TTCCCTACAACCCTTTGTTAAACAAAACTTTAGTGTCGACCATTCGCTTGTGTCAAATAA TTATTAAGTTCAGTTTTGTTTCCACAAATGGTGTTTTGAGTCAAAATGGTATTGACGTTA CATACTGCAAATAGAGGATCTAAATTGTGATAGATGTGAAAAAGTTTATACATGCAAGTA CAGTAGACCTCCAACTCGAATATTAAATACTGGGATTTTGATATAATAGATCATAAATAT CGATATATCTTTAGTATAACATGACAATGTCTATCATGTGATGAGGCCTTCAGCAATCAT GTATGTTTAAGGCTGATTTTTATACTTGGATATATCAGATAACAAAGCAATGGAATTTCA GAAGCCTAGATACTTGGACGATAGTTTTAATAAAGGATCTAATGCACTGGGAGAAAATTT TCTAGCAAAAAGTAGACAATATGAAGTCGTCTGGTTACTGTAGACACATCTCCTCTGGCC TTCCGAAAGTTGCTTCATAAACTTATCTGTAACATCAGCCTTTCCAAATGTAGCAGGATG AGCACCGCCTCTATGCCAGTCTACCCAAGTGAGACTGGTATTTGTCAGGAGATGAGGGGA TTGGATGTGCAGCATTGTTGGGAAATAGTGTTCATCAACATAGCATGCTGGTTTGCAGAA CTGTTTGAATTTAGGGTAGTATATGTCATCTGTAACAATGTCAACAGCCAATTTCCTGTT AACCTCAAACCACTGAGATCCTTTACGCCATTGAGTGATTTTAACCACAGGTGACATCTT CCAATTGTAACGCCCTCTTCCAACAGAACTAGGATCATCAAACACATTCACAAAACTGTA CTTGGATTCTGATATGTATCGATAGATAACACTGAAGTTGTGGAGAGGAATGCACGACTC TGATAGGATTATAAACCATTCGTTGGAGATATCAAGCAATGCATTAGCAAGAAGCCGTCT TTCAGCATCAGTGATACTAATTTTCCCCCACTCTGCCACCTACGCGAAATCAAACCCATA CAATTACTACCAAGTACAGTAATAGCCTCCGAGGTGAATTCTCAAATGTATCATCTCAAC TCATAATTATTATTTCTAAATGAGAACATGACATCAGAACAATATATATCAACCTCTCAC GTGTTGAAGCACAATTTGGAAGTTCAGGGAAACTAATTTTTTTTGAATAAAATTTGTACA ATAACATTATTACCTGACTAGGAACTTGCCTGCCATAAAACACAGATGAAGTTGGGAAAT CAGGGTTGTAAGATGGTAAATTATGAATGTAGATTGAATAAAACTCTTCATTCCCTTTGA AAAACCTCTCCCACAACGGAGCCAAAGGCAGAGGCCCTCTCGTTAAGAACAAGAACGCGA TTTTAGGTGTTCTCTTAAAAGGCAATTTTTTCATTTGAGGAACAAATGAAGCCCTCCAAA AAAGCTCAGCATCATTCATTGAATGATGCAAGTTTGATAGAGGCTTAATCCAATTCTCTA AACTATTTTGTTGTTCAAAACATGGAGATTGTACCACAGGGAGTACCTTTTTCAATTCTG AAAATCTAAGCATAAACATACTTAAAATTGATAAAGCAATTCCTAAACCCAAAAACAACA AGAGAAACTGAAGCACTTTTAATGATAAAGGCTTGTTGTCTTTGCCATTCTCCAAAATCC CCATATTCGCAAACTCAACTTTCAATCGAACACCAAATCGGCAAAAAGAAAAAAAAAATC TGTCAATTCTCCTTTTTTCTTATGTAGTTAAAAAAAAATCCATTACTCATTAAGAAAATT AATTAAATTAGCAAAAGCTTTTAAAATTTAAAACAGATATTATCAAAATGTGAAGCTGCT ATTTTGTCATTAACAAGAAAAAAATAAGAAGAAGAAGATAAAAAACTAAAATCCAAGCCA CAATAATGAGACGTTTGGGTTTGAACTTTGAAGAAGAAAACTAATTCTTGTTTCAACAGA GTTGACAAAATCTTGAAATAAAAATTTCTTATGAAAAATTTATTGGAAGTCTGTGCACAG TTCCCAATGTTGATGTTCTCTTCTCATGGGGTTTTATTATGGAGGCGTCCTTTTCTCTAC ACATAATTGTCTTTTAAATTTGCCTTTGAAATTTCCGATTTGTGGCCTTTTGTCCAAAAT TTTAATGTTTTTAGCCTTTTCAAAATGAATATTTTTTAGGTTAGTTTGACTAATTTTTGA GAACTAAATTATATTATAATAATTTTAATATTTTAATTTCATAAAAAATATTACTATAAA TTGCAAAAAAAAATTATATCACAATGGTGTGAAAATAATATTAAAACATTGATTAAATTG TTTGCGAGTATATAAACTGCTTAAATAGAGATTATAGATTTTTTTTTTTGTAAAATTAGA AATAGACTATTAAATAACCAGTTATTTGAATCTCAAAAGTCGAAAGTAAAAAATATTTTG AAGGGAGTAAAATCACAAAAAGGTTTTAAAATTTAAACTTTTACCAAACCAAACTTCACT TACTATTTTTATAATTTTCTTTTGCAAAAAACAAATTCTCAAAAGAATAAAACAAAAAGG AAGGAAATATTCACTTTCTTTTTAGGCCAAAAAAATATTTAAAATGTGAGAAAATTTCCG AAACAAAAAAGGTACCTTAATATCAAATGAAGGCATTTATATTTGTAACCATTAATTCTA ATTTTAAACTGTTGCATCAAATTCTCTTAATCATAAAATTGTAATTCGTATTATTTTTTT ACTATGATATGGGGTTTTAGTTAAAGGATCAATAAGTCGATTCACATAAAAGAAAAAAAT TAGAAGTGTTGATTCTCATGTATAATCTAGTCTTGTTGTTTTCAAACAAGAGATTTCTAA GCAATTAATTATGTTTTGATTATTCGTTCCTTCACATATTTTTCTATTCCTTTTTTAGTC ATAGTCAAATTTTAGTTTGAAGTATTTAATTAGTTATACATGTGCAATATTAGCAAAGAA TACGCTGTAACAG