Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc06g060150.3.1
CDS Infomation	replication factor C subunit 3 (AHRD V3.3 *** AT1G77470.1)
Sequence	ATGGCGGAGACTATCTCGTCAATGGATATCGACGACGACAAAATTGACACAAAACCAAGC AAGGGCAAAAATATAGTCTCCAATACTGAACCGAAATCAGTTCCTTGGGTCGAAAAGTTT CGTCCTCAGTCTTTATCAGACGTTGCTGCTCATCGCGATATTGTTGAAACAATTGATAGG CTTGCGAGTAGTAACCGGTTACCGCATTTGCTGCTTTATGGACCTCCTGGAACTGGAAAG ACATCTACAATTCTTGCTCTTGCTCGGAAGTTATATGGATCTCAGATGCAAAATATGGTT TTAGAGCTGAATGCCTCTGATGATCGTGGGATTGATGTGGTGCGCCAGCAGATTCAGGAC TTTGCTAGTACTCAGAGCATCTCATTTGGTGCAAAGTCAGCGGTTAAGCTAGTTCTATTG GATGAAGCAGATGCAATGACAAAGGATGCACAGTTTGCTCTGCGTCGAGTGATTGAGAGA TATACAAGAAACACTAGGTTTGCCTTGATATGTAACAATGTCAACAAGGTTATTCCTGCC CTACAATCACGATGTACACGATTTAGGTTCGCTCCACTCGATGCAGTTCATGTCTCTGAG CGGCTGAAACATGTTGTTGAGGCTGAACAGCTTGATGTCCCTGAGGGTGGTTTAAAGGCA CTTGTACGATTAAGCAATGGTGACATGCGAAAAGCTTTAAACATTTTACAGTCAACTCAC ATGGCTTCTCAGCAAATTTCAGAAGATGCTGTCTATCTGTGCACTGGAAACCCATTGCCC AAGGACATTGAGCAGATCTCTTACTGGCTTCTGAATGAGCCCTTTGCTATCAGTTGCAAA CGAATATCAGAAATCAAGACACGAAAAGGGTTGGCTCTGGTGGATATCGTGAGAGAAGTA ACCATGTTTGTCTTCAAGATTAAGATGCCGGCAAATGTTCGAGTTCAGCTGATCAATGAG ATGGCTGATATTGAGTATAGGTTGACTTTTGGTTGCAATGATAAGTTGCAGCTTGGATCA CTGATTTCTGCTTTTACACGAGCAAGATCTGCACTTGTTGCAGCTGCAAAGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc06g060150.3.1
PEP Infomation	replication factor C subunit 3 (AHRD V3.3 *** AT1G77470.1)
Sequence	MAETISSMDIDDDKIDTKPSKGKNIVSNTEPKSVPWVEKFRPQSLSDVAAHRDIVETIDR LASSNRLPHLLLYGPPGTGKTSTILALARKLYGSQMQNMVLELNASDDRGIDVVRQQIQD FASTQSISFGAKSAVKLVLLDEADAMTKDAQFALRRVIERYTRNTRFALICNNVNKVIPA LQSRCTRFRFAPLDAVHVSERLKHVVEAEQLDVPEGGLKALVRLSNGDMRKALNILQSTH MASQQISEDAVYLCTGNPLPKDIEQISYWLLNEPFAISCKRISEIKTRKGLALVDIVREV TMFVFKIKMPANVRVQLINEMADIEYRLTFGCNDKLQLGSLISAFTRARSALVAAAK*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc06g060150.3.1
Transcript Infomation	replication factor C subunit 3 (AHRD V3.3 *** AT1G77470.1)
Sequence	TCCAAATATTGCTATTGTTCATTTGTTCTTGAAATACCCACTCCTAGGGTTTAAGGAAGT GAGAGAATTGAGTAAAGCTGAAAATGGCGGAGACTATCTCGTCAATGGATATCGACGACG ACAAAATTGACACAAAACCAAGCAAGGGCAAAAATATAGTCTCCAATACTGAACCGAAAT CAGTTCCTTGGGTCGAAAAGTTTCGTCCTCAGTCTTTATCAGACGTTGCTGCTCATCGCG ATATTGTTGAAACAATTGATAGGCTTGCGAGTAGTAACCGGTTACCGCATTTGCTGCTTT ATGGACCTCCTGGAACTGGAAAGACATCTACAATTCTTGCTCTTGCTCGGAAGTTATATG GATCTCAGATGCAAAATATGGTTTTAGAGCTGAATGCCTCTGATGATCGTGGGATTGATG TGGTGCGCCAGCAGATTCAGGACTTTGCTAGTACTCAGAGCATCTCATTTGGTGCAAAGT CAGCGGTTAAGCTAGTTCTATTGGATGAAGCAGATGCAATGACAAAGGATGCACAGTTTG CTCTGCGTCGAGTGATTGAGAGATATACAAGAAACACTAGGTTTGCCTTGATATGTAACA ATGTCAACAAGGTTATTCCTGCCCTACAATCACGATGTACACGATTTAGGTTCGCTCCAC TCGATGCAGTTCATGTCTCTGAGCGGCTGAAACATGTTGTTGAGGCTGAACAGCTTGATG TCCCTGAGGGTGGTTTAAAGGCACTTGTACGATTAAGCAATGGTGACATGCGAAAAGCTT TAAACATTTTACAGTCAACTCACATGGCTTCTCAGCAAATTTCAGAAGATGCTGTCTATC TGTGCACTGGAAACCCATTGCCCAAGGACATTGAGCAGATCTCTTACTGGCTTCTGAATG AGCCCTTTGCTATCAGTTGCAAACGAATATCAGAAATCAAGACACGAAAAGGGTTGGCTC TGGTGGATATCGTGAGAGAAGTAACCATGTTTGTCTTCAAGATTAAGATGCCGGCAAATG TTCGAGTTCAGCTGATCAATGAGATGGCTGATATTGAGTATAGGTTGACTTTTGGTTGCA ATGATAAGTTGCAGCTTGGATCACTGATTTCTGCTTTTACACGAGCAAGATCTGCACTTG TTGCAGCTGCAAAGTAATCATGTTGAACAACCTGGTGGCTTGCCCCGCCCGCTGAAAAAT TTGCAATGTTTTAAGATTTTGTGCTATGCAAAATATTGGGAATGTAGGTTTTTAAGCTTC TTAGTATAGTATTGTAGAAAAGATCTCCCAAATGTAAAGTGCAATATTGTTCCAAGTGCT TTGCTGTTCTTGCACATTGTAGCTAAATTTTATATACAAGCTTTGCTCTGTTTTGAGGTT CGTTTTCCTATTTAAATTGTACATTCAGGCATTTTGTGTTGTGCTGCTTGGATAACTTGA CATGGAGGACATGTCCATATTCCATTTTGTTGCTAAGCACACATGGAAAGTGACCATATT TCATGTTGGCTGTGGTCTGTGTTATTGGTGATGAAACTATGAACAATTTCGGAGATCTAC GTCCTCATGCTCGAGGAGACCAACCATATGCTCTTGCAATTGGTTTGTGTTGGTAAACAC AGTGCTGGTATGCACAATGACGAATGGCCATTATAAAAGATTTGCAAACCCATGGATGGG ATAATCTTCTCAAGGAGATCTCTATTTTATATTTATATACTGCTAATAGCTACAGAAGAA TCTATACAGTGTGGTGCTTAAATAGCCAAGACTAACATTCTAGCATGGGAACTTACCCCT AGACTTTGGCCCTCACAAATCTGGAAGTCTTCAGCACCAGAGGCAGTGATGCTGTTAGTA CTACAAAACTGAGCGGTCGGCAGATGTTGATTGATGTGCTCTTGCTTTAGCCTCGGATGT GAACAAATTGTTGCTCGTTAGGGGATTCATATACCTCTTCTCAGTGCTCTGTTGATTGGT TACCAGATCCAGCACCGAAACGGGGACTCAAAGTTGCATTATATCTGTCTTGGTTCACAC TTCACTTGACACTTTCATTAGACGACCTATTTGACCAGGTGATCTCAACCTCTAGAGTCT GGGATGAACCATTGTAGCGTTCATGACTGAGGCTGAAAATATCACTGTGTATGCCTTCAT TAACCACTTTATCAATTTGGATCGTTACAGTCCCAAGCGTACTCTGAAACACAACAATTC ATCGTATCAGCATTGTGAACAACTCACTACACTCTTCTCATCCTACTAAGAGCTGCAATA TTTACACACAGTATTTATCCCTGCTTTTTTTAAAAAAATTAGTATCTTTGTTTCAGACTG TTAGTAGCAGCTGCAACAGTGAACCTTTTTGCACACTGTAGTTGGAGTTGAATTGGATAT TCTAAATTTAGCATCATGAATCCCAAAAATGATGAAATTAGTTACCTTTCCAAATGTAGT TCTGCCTTTGCATGAGATCTGTAACTTTTGTCCCTTCGGTGGAACATCAAAAGCCCATGT GAATCCTTCATTCCATTCTGGGGATGTACTGCGACTAACAACCTGATAATAAACCAGATT GTTAATAAATTTCAGATAAGAAAAATTAATGATATACATGTATGTGTTTTTGGTGCATCA CGTAACACAAATTAGTATCTCAGTAAGTGGATAAAATTACATGTAACTTCCGGAGGTTTA GAAATGTTATACAGTACTTTCTAGAAAACTTTTATAGCAGCAAGGATAAAATTGGAAAAA AGTTAATTAAAATCTTTGTTTGTTTTCTGAAATGACAAGTATTTGGAACAGTAATGTTCA ACAAAAGTGACAAATGTAAACAAGACCAGGGGGAGTTTGGCCATAAGAAAGTAAAACCAT TGGTGAATAGTAAGTCTTTTATTTCATCAACAATAACAATGCTGACTCATTACCTTAGTT TGTCGTGCCGGACCATTGCCAATAGTCAACCGACAAAATGGATTTGTTCCTCCCATGACA TGTCTTAGATTGTCCGCACGCTTAATGGTGACAGTCAAACAACCTGGTAAGCAATGCAGC AGTCTTTCTGCTCTATCATGGAAACCTGGGGGGCTAGTTTTTATCAGCATTTGTAGGATG GGAATGGCTTCAGCTGCAACCATTGCTTGAGATTTTGACACATCAATTGGCATTGTTGAC CAGGATTGTTGGAGTAAGCACAATGTGGTCAATACTGAATCCTGAGCAGCCTCGCTGCCA GATTTCAGTGCTGTCACCAGATGAGGGATACAAAGGGTCCCCGCTTCAGAAATTAGGAGC TTCGGAAAATTGGAGAAAATGATAAAAATGCACTTCAAGATCTCTTCATTTGCAGTTGCA GTGGGGCACAATTCCTTCTCTAGTGCCGCTGCATGACAATGCATTAAAAATGTTTTAGGC AGACAAGTAGGGAAAGAAACACTTATACCACATCCCAGGACTGAACTAAAAGATATGGAA GGATAAGAACAGAACAAAGCACAAACAAGAAGATCTGCAGTTTGCAGCTTGAATTATCTG GACAGTTAAACTTGAAAATTGATGTGTCAAATTCATGAATCGGAAGGATTTACTGCTTCA GTTGTAGAAGTTGAAGTATAGCATGGGAACAAATACACTGACTAAAAAACATCATACATC TAGCTGTCTTCATTTACTGTTTATTTTATCCTGCAGCTTTAGGTTTCAGGTCCATTTTTC CTGTTCTCCTTAATCATTTTTAACTTCTGCTACTTCTTTTTGTAGTAAAAAGGGTTAAGG CAGAGTGAGTCATTGTAAATTTTACACTCCGACAATTTCATGACAGTCCTTGATCTCGGA AAGCCAACTTATTATGACCAATTGATTTAGCTTCCTAAGTTATTCCGAGTGTGTTGGCTT TCCTTAAGGGCGTGAACACAACTATAAATTGTAGACACTTGGATCAAAAGATTAAAAAGT TTAATATCCCTGGGAAAAATATTGGAGCACAGAATTAGGTATATAGACTTTCTGGGTCTC AAGCACTCTCATATGAGGTTCTTTTTAAGTAGGTAACAATTGGTTTTCGGTGCAATCCTA TTTATTATGTTAATATATTTGACGCAACTAGTGGCATCTAGTTTGACATTTTTCAAAGAA TCACTGATTAAAAAAAGGAACGAACATTTTATTTTATAAGCAACATACCTGTCAAAGATC TGATAAGTTCAGTTGATGCATAATCCTTAAGCGTGTGATTCGAGAACAAAAACCTTATGA GCAGAGCTGCCTGGACTGTAATTTCTGAATTAGGGGATAGAAGAAGTTCTTGAACTACTA GTATTCCACCTGATTCTGCGACAGCTCTTCTGTTGGTTCGACTGTGCATGACAAAATTTT GCAATGCACAAACTGCCACCATTTTCATTTCTTCCGTTGGTTGATCTTCAAGCAAAGTTA TCAGTGCTCGACAGGCACAGACAGAATCACTTGCTCTAGCAAGTCCTTCATGCTGGGAGA GATCACCAAGTGCAAGAGCAGCAAGAAGTCTTGCGGGCTGCAATAAAGTCTGTGGATCTA GTAAATATTGTGCCAGAGGTGCTATTGCATACTTAGATACCTTCAATTCTCTTATTCGGA CGTTGTTGAATAGAGCTTCAATCAGACCTGCTGATGCTTCTTCAAACTGGTGAGATCTTA GCAGATCTAGAAGAGCATCTACAGCACCGGCTTCAGCCATCAGTTCACCGTTTGATAGAT CAGTCTTTTCATGAGCTATTAGAGCATTTAGTGCAAGAGTAACAGTGCTCTCAACTGTTG AATACAACATCTTTACAAGAACCACCAGGGGAACCTTGAGGTAATAATCAGCGTTAGATT GTATGACATTGCAAAGAATCATAGCTGCTGACTCCCATAATGTATCAGGGGGTAAGGGAT CATCTTGAACGATAACCTTTGAAAGCTCAAAAATGCCACCAGCATCAGCAACTTCCTTTG GCCATCTTAATGAGATATTTTCCAAAGCACTAATTGCCGTTTGTTGCAAATTCAAGATAC CAATGCCTGCGAGCTGCACTAGGGGCACTACTGCATTTTTTGATGTTATATCTTGCTTGA AATGCTCTTGTGCAAGGAGGTGGGACAGTAGTTCAGTACCAAGCTGCTGAATAGATTGAG CTGGGGATTCAAGAAAGGAAATCAGAGGCTGAATGACCTGGCTAGGAGTAAGTTTTAGAG TGGCAAGACATTGTGGCTTCTCTAGAATATTTACAAGAGTTTGCAACGCACTGTGCTGTC CCCACAACCCAAAATCTGGACGTTGCAAAACCGTGAAAAGAGGTTCTACGATTTTTGCAG CAGATGGACTTCTTGAAATAGCACTACTATTTGTCAAGACACGGAAGAGTTCTGCAATTG TGCAGCATAAGGAACTGGATGCAGTGGGCAGTAGCTCAAGACAATTTTCTAATAGTCCTG CTTTCACCATATCCAACTTGCGGGGAGTTCGGTCTTTACCCAGCTTAATAAGTGCGAAAA TAGTCGCTTCAATGAGCCGATGGTTTGATCCAGACACCAGATGAACCAGAATACCAACAA TCTCATTAGCTGATGCAAGGTCTACCGGATGTTCATCATCTAAAAACCTCTCGAAAGCAC AAATAGCTGATTCAACTGCTCTTTCCACATCTGATTGCATAAGCAGCACAAGGGGATCTA AGCATTCAGAAGCAACAGACAATTCTCTGATGTTAGGATCACCAAAAAGTACAAAGCATA ATTCAGCAGCATCACTTTTCATTTCCATCGAAGAAGATGATGACAGAATTTTATATAAAC TCTCAAGAGAATTCCCATCTAAATCAGCCATCACTGCTGCTTTAGCATCATTCCCCGAAG TCAACTTGACCAAGGAACTAAGGGCAGTATATTGTTCACTTTCTGATGCAGTATCAAGCA TGTCTGCCAAAGGTTGAATTGCTTGATTTGATGCTTCAGAATTTCTAATGTTCTCATTAT CAAAGAGTTCATTTAAAGCCCTAGCAGCACTCAGCTTTGCACTCTTCGACCCCAAACGAA GGACAGCAATCAGTTGAACAGAGCAACTAACCGCAGCTTCGTGTTGAATAAGAACAGAAT TGCTAAATATAATTCTCAGTAGTTCAGAGATTGTTGCCTCAGTCAAGTCCTGAGGGCTCA AAGATAGATTCTTCGCTAGAGCATCCAGTGCGCCAGCTTCAGCCATGATTGATTTATTTT CATCATTACCATCAGCAATTTGAGTCAAGAGACGAACCGCTAATGGGGGTGCACCTGCTC TATCTGGAAGTGGTTTTAACAGATCTACCAATAAAGGGATGGTCCTGCGTGCAGTCGAAC CAACTCTCACTTCTTCAATTTCAAAGAGGACTTCCAGAGAAACCTGATCTGGGTATCTTA CTAATGAAAATTCTTCAGATAGAGCAACAAGATTTGGCATATCTATTTCAATGTGACCAA TCAAGCTTATCAGACCAGTGATTGCACCTGAATTTACAACAGTAAGATTTATTCCCTTTT TCCGATGACAGACAAGACTGGCTATTGCCTGAGCAGCAAAAAGTCTGACAATCATTTCAT CTGATTTGAGAAGAAGTGCAAGTGAAGGTATAATGCGCATGGTTGTTGGAGAGGATATAA TGTTGGGGTTCTGGAATAAAATAGCTAATAGCAGTGCGCTGATCCACATGCTCTCTGCAT CTTCTGCCTGCCATGACAAATATCTCTTCAGCACAATGACCGAATATAAACTTTAAGCAA ATCATGAGAACCAACATTACTTCCAAAGAATTAAATTGAATAAAGGTGACACTGAAAATA ATTATCCTTTATTGTCCATCTTTTGGTCACTTTATTAACTATAGTTTCAGTGATATATTT CTGTGCCTTAAGAGAGGGTAACTTACACATGAAGAGGTGCATGGGAAGTCTTACATTTGA CCAACTACAATGGTCTCGTTAGAGATATAATACACCATATACCATGAGTATATTGACAAA ACAGTGCCTCAATATAATCCGAAAATAGATGGAGGACAGAAAAGCTAGTAGAAAGAAGAA GAAAATCTGCACTTCAGATATTCTTGCTCTTGTAATGATTCTCAAAATTGGAACTCAGTG AAAATATATCCAAGACTACTTCTTCCATGCACATTTATTATATGATTGATATGGCAGGTG ACTAGAGATAGTGAAATAAATGT