Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc06g054120.2.1
CDS Infomation	Major facilitator superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT2G32040.1)
Sequence	ATGTCAGTCACCGTTGCAATGCCGGAAGACCCAGTCCAACAAGAAAATGATGCTGAACCG TTGCTTCATTCTACAGACCGAAATGAAGATCTCCTGACAACCACTAGCAATGAAGATTCT AGTTCATCTGATAAAACTTGCTGTCACAAGGACAAAAATTCTATTAGCTCAGCCAGATGC TTCGGGGTGGAGCTAACCCCAGATAACATTGCTGTTGCTATGGTATATTTTGTTCAAGGG GTCTTGGGCCTTTCAGATCTTGCTGTTAGCTTTTATTTGAAAGATGACCTACACCTAGAC CCTGCAGAGGCAGCTGTGATATCTGGTTTCTCATCATTGCCATGGCTTATAAAGCCGTTA TATGGATTCATCAGTGATTCCTTCCCACTCTTTGGATACCGGAGAAGGTCATATTTGGTA CTATCTGGACTTCTTGGAGCACTCTCATGGTTTTTGATGGCCACCTTTGTAGACAGCAAG TATGGTGCTGCTTTCTGCATACTTATTGGTTCTCTTTCTGTTGCTTTCTCAGATGTTGTT GTAGATTCCATGGTCGTTGAAAGGGCACGTGGTGAGTCCCAAAGCATGTCAGGATCTCTT CAGTCACTTTGCTGGGGTTCTTCAGCATGTGGTGGAATTTTCAGTTCTTACTTCAGTGGA TCCCTTGTGGAAGTTTATGGCGTGAGGTCCGTTTTTGGTGTAACAGCATTACTTCCACTG ATAACATCTGCAGTATCTTTGCTTGTGAAAGAGGAGCCTGTACTTGGCCCAGCAAGGAAT CTCTCTTTAAGAAATGGCTTCTTTGAGAGTTCAAAAAGTAGCATTATCCAGTTATGGGGA GCTGTTAAGCAGCCTAATGTTTTTCTTCCCACACTATTTATTTTCCTATTTCAGACAACA CCACAGTCAGGTTCTGCTACGTTTTTCTTCATAACCAATAAACTTGGTTTCACTCCAGAA TTTTTAGGCCGCCTTAAGCTTGTTACTTCAGTTGCATCACTTATTGGTGTTGCACTTTAC AATGGTTTCTTAAAGAAAGTTCCTTTAAGGAAAATATTCCTTGTGACAACTATTATTGGT TCAGCTCTTGGGATGACACAGGTTCTGCTGGTAACTGGATTAAACCGAAAGTTTGGCATT AGTGATGAGTGGTTTTCAATTGGGGATTCCTTGATTCTATCTGTTCTTGGTCAGGCTTTC TTCATGCCTGTTCTTGTATTAGCTGCAAGAATATGTCCAATGGGAATGGAGGCTACTTTC TTTGCAACCCTTATGTCCATAGCCAATGGGGGAGGTACCCTTGGGGGCCTACTTGGTGCA GGTCTAACTCACATCCTTGGTGTCACCAAGGACAAATTTGATAACTTGGCTATCCTAATA ACTATCTGCAATCTCAGCTCCCTACTGCCTTTACCACTACTTGGCCTTCTTCCTCGAGAT GAACCCGATTCAGAGGAGAATACTGATATTGAGATGACGCCATATTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc06g054120.2.1
PEP Infomation	Major facilitator superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT2G32040.1)
Sequence	MSVTVAMPEDPVQQENDAEPLLHSTDRNEDLLTTTSNEDSSSSDKTCCHKDKNSISSARC FGVELTPDNIAVAMVYFVQGVLGLSDLAVSFYLKDDLHLDPAEAAVISGFSSLPWLIKPL YGFISDSFPLFGYRRRSYLVLSGLLGALSWFLMATFVDSKYGAAFCILIGSLSVAFSDVV VDSMVVERARGESQSMSGSLQSLCWGSSACGGIFSSYFSGSLVEVYGVRSVFGVTALLPL ITSAVSLLVKEEPVLGPARNLSLRNGFFESSKSSIIQLWGAVKQPNVFLPTLFIFLFQTT PQSGSATFFFITNKLGFTPEFLGRLKLVTSVASLIGVALYNGFLKKVPLRKIFLVTTIIG SALGMTQVLLVTGLNRKFGISDEWFSIGDSLILSVLGQAFFMPVLVLAARICPMGMEATF FATLMSIANGGGTLGGLLGAGLTHILGVTKDKFDNLAILITICNLSSLLPLPLLGLLPRD EPDSEENTDIEMTPY*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc06g054120.2.1
Transcript Infomation	Major facilitator superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT2G32040.1)
Sequence	TTTATGAAGCCATTCTAATATTCCATTTTTCTTATTAAAACCAGAGAGGGGAATACGAAC GACGAACAGAAAAAATTAGTTTTAAAATGGCTGCGTTGACATTCTCAATACTACCCTTCC GATCCTTGCTCTAATTCGCCGGAAAACGGCATTCCGTCGTCATCTTCACCTGACATCAAA ATGTCAGTCACCGTTGCAATGCCGGAAGACCCAGTCCAACAAGAAAATGATGCTGAACCG TTGCTTCATTCTACAGACCGAAATGAAGATCTCCTGACAACCACTAGCAATGAAGATTCT AGTTCATCTGATAAAACTTGCTGTCACAAGGACAAAAATTCTATTAGCTCAGCCAGATGC TTCGGGGTGGAGCTAACCCCAGATAACATTGCTGTTGCTATGGTATATTTTGTTCAAGGG GTCTTGGGCCTTTCAGATCTTGCTGTTAGCTTTTATTTGAAAGATGACCTACACCTAGAC CCTGCAGAGGCAGCTGTGATATCTGGTTTCTCATCATTGCCATGGCTTATAAAGCCGTTA TATGGATTCATCAGTGATTCCTTCCCACTCTTTGGATACCGGAGAAGGTCATATTTGGTA CTATCTGGACTTCTTGGAGCACTCTCATGGTTTTTGATGGCCACCTTTGTAGACAGCAAG TATGGTGCTGCTTTCTGCATACTTATTGGTTCTCTTTCTGTTGCTTTCTCAGATGTTGTT GTAGATTCCATGGTCGTTGAAAGGGCACGTGGTGAGTCCCAAAGCATGTCAGGATCTCTT CAGTCACTTTGCTGGGGTTCTTCAGCATGTGGTGGAATTTTCAGTTCTTACTTCAGTGGA TCCCTTGTGGAAGTTTATGGCGTGAGGTCCGTTTTTGGTGTAACAGCATTACTTCCACTG ATAACATCTGCAGTATCTTTGCTTGTGAAAGAGGAGCCTGTACTTGGCCCAGCAAGGAAT CTCTCTTTAAGAAATGGCTTCTTTGAGAGTTCAAAAAGTAGCATTATCCAGTTATGGGGA GCTGTTAAGCAGCCTAATGTTTTTCTTCCCACACTATTTATTTTCCTATTTCAGACAACA CCACAGTCAGGTTCTGCTACGTTTTTCTTCATAACCAATAAACTTGGTTTCACTCCAGAA TTTTTAGGCCGCCTTAAGCTTGTTACTTCAGTTGCATCACTTATTGGTGTTGCACTTTAC AATGGTTTCTTAAAGAAAGTTCCTTTAAGGAAAATATTCCTTGTGACAACTATTATTGGT TCAGCTCTTGGGATGACACAGGTTCTGCTGGTAACTGGATTAAACCGAAAGTTTGGCATT AGTGATGAGTGGTTTTCAATTGGGGATTCCTTGATTCTATCTGTTCTTGGTCAGGCTTTC TTCATGCCTGTTCTTGTATTAGCTGCAAGAATATGTCCAATGGGAATGGAGGCTACTTTC TTTGCAACCCTTATGTCCATAGCCAATGGGGGAGGTACCCTTGGGGGCCTACTTGGTGCA GGTCTAACTCACATCCTTGGTGTCACCAAGGACAAATTTGATAACTTGGCTATCCTAATA ACTATCTGCAATCTCAGCTCCCTACTGCCTTTACCACTACTTGGCCTTCTTCCTCGAGAT GAACCCGATTCAGAGGAGAATACTGATATTGAGATGACGCCATATTGAATTCATTCTTTC TCTGCATATAACATGTTGACATGAAATTGCTAATGTGGCCTCAAACGTGGTTGATCGATT TAACTGCAGCTTTTTAGATACCAGTAGGAGAGATTTTTTACTCAGTAGGTGAGAACTCAC TCATGTAATTCCTCACTACCTCAAGACATCACGACACAAAAATGTAGAGATTAGTAATAT TTACTAGTACTAGTTTTTAAGCTTACATACATACAGTAGTCCTATATTCTTTTTCTTC