Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc06g053750.3.1
CDS Infomation	MATH domain-containing protein (AHRD V3.3 *** W9QVS1_9ROSA)
Sequence	ATGGCTTCAAGCGCAAGCGAGGAGGCAGGAATAGGGAAGTCTCTGGAGGGAGTGTCAAAG GGGCAGCAGCGGTGTCAATATAGTGAAACGTTGGCAGAACGAAGGTACTGTGAGCAGATG GAAAATGGAACTCCGTCAACATCACCTCCATACTGGGACAGTGATGACGAAGATGATTGT GGACCTAAACCGGTTGAGCTATATGGAAAATATACCTGGAAGATTGATAAATTTTCACAA ATTAACAAGAGAGAACTTCGGAGTAATACTTTTGAGGTTGGCGGCTACAAATGGTACATT TTGATTTATCCTCAGGGATGTGATGTCTGCAATCATCTCTCTTTGTTTCTGTGTGTGGCT AATCATGACAAGCTTCTTCCAGGCTGGAGTCATCTTGCACAATTTACTATAGCTGTGGTT AACAGAGATCCGAGGAAGTCCAAGTATTCAGATACATTGCATCGTTTCTGGAAGAAAGAA CATGATTGGGGATGGAAAAAATTTATGGACCTCTCCAGAGTTGTAGATGGATTTATTGAT TCTGATACCCTCATTATCAAAGCTCAAGTTCAAGTCATCAGGGAGAAAGCAGAGCGTCCT TTCCATTGCCTTGATTGTCAGTATCGACGAGAACTTGTTAGGGTGTATTTAACGAATGTT GAGCAAACTTGCCGTCGTTTTGTGGAAGAGCGACGAGGAAAGCTTGGGAAATTAATAGGG GATAAAACTAGATGGTCGAGTTTCTGTGCTTTTTGGCTGGGAATAGACCAAAATTCTAGA CGCCGCATGTCCAGAGAGAAATCAGATCGGATTTTGAAAATGGTGGTCAAGAACTTCTTC ATAGAAAAAGAGGTTACGTCTACTCTTGTGATGGATTCGTTGTACAGTGGGCTTAAAGCT CTGGTAGACCAGACTAATGGACAGACAGGTAAAGGGAAACATTTAGATGCAGTGGAACAA ACAGTTCCTATTGTTTACCTGGAGAAAGACATGTTTGTCTTGGTGGATGATGTCTTGCTG TTGCTTGAGAGGGCTGTTTTGGAGCCGTTGCCTCCGAAGGATGAGAGAGGTCCTCAGAAC CGTACAAAGGATGCTGCTTCTGGAGAGGGCACGAACAGAGATCACATTCAGCGTGATGAG AGGCGCTTAACTGAACTAGGTCGGCGAACTATTGAAATATTTGTGCTTGCGCATATTTTC AGTAAAATAGAGGTTGCATATAAGGAAGCTGTTGCATTAAAGAGGCAAGAGGAACTCATC CGTGAAGAGGCTGCTTGGCTGGCTGAAACTGAGAAGAAAGCTAAACGAGCATCCGAGAAG GAAAAGAAGTCGAAGAAAAAACAGTCTAAACAGAAGCGGAATATCCGGAAAGCAAAGGAT AAGGAGAGAAATGAAAAATCTGATGTTATGGTGCATGATAAGATTGAAGTTGATGGTCCC ATTGGTGAAGGAAATGAGTACATGGCTGAGATGCCAGGACAAGTACTTGGTAAATCAGAT GTACTGGGAGAGGTTTCTGATATTTCTGATTCTATAGACTCCATAATTCATCCTGATTCA GAAGACAGAAATGCAAGTCCTGTCAACTGGGATACTGATACCTCAGAGGTGCATCCATCT GTGGAAGCTGGTTCTAGCAGGTTAATTGGCCTTCCAGCTTCGCAGAATGTGATAGCAGGA AGGATAAGTCCTTCCATGATGGATGATAGTTCATCAACGTGTTCCACTGACTCAATTGTT TCAGTAGTTATTAATGGAACCCACAGAGGTTTTCCTTTGATCCAGAAAAACCAGAAATTA CCTAGCAGAGGGAGAAATGAACGAAGCAGGTCAACTTGTAAGGCAGCTGATTGGGCTAGT GAAACACTTGGTCAGACGTCGGATGTTGTTTCAGATGATGGTCAGCTAAGTGATACATCT GTAAGCTGTGAGGCAACAGGATATGAGTGTCAGGCTACTGCACTTCCTTCGTGTGAGCAG CAAGCAACTAACAAGAAAGTAGCAGTTTTGCAGCAGAGAAATCTAATTGATGATAGAGAG AAATCTTCCATATTGAAGCCCAGCAGTGTCCAGTCTCCTTCTAGAAGCCCTCAAAAAAGT ACAGTATCTGCTGTTCTGTCAAAGGAAAGTTTGAAAATCTCGGTCACTAGTGATCCTATC TTGGTCAAAAGTTCATTTTCAGATAGTCCTCAGCTGACTGATAAATCAGGTCCGATGGTT GTCTCAGCTGAAACTTCCGTGATGTTGAAGGCTGATCCTCATAAAGCTGTAGAGGTAAAA CCCTTGAAGAAGCCCTTGCCACAGCCTGCTTCAATTTCAACTGAGAAGTCCCTGTCTAAA CAAGTAACTACTTCTGCCACAGCTGAAAGGTCCATCTCTAGACAAGTGCCTGCCCAGTCG AGACCTTCGAGTGCTCCTCTAGTTACTGATCCTAGACCTCCTTCCCCTGTTGTGTCCATG GTTCAGGCAACACAGTTATTGCCTCGTTCAGTTAGTGCAGCTGGTCGATTGGGTCCTGAT CCTTCACCAGCAACACATAGTTATGTTCGTCAGTCCTATAGAAATGCAATTATGGGCGGT CTTATTTCTGGAAGTCCGGTTGGTTTTAGTCAGCCTCATTCTCCAAGTTTAGCCGTTAAT TCACCACATCCATACTCTCAATCACCTTCACTGACTTCTGGTCTAATGTTGTCGCCTGGG GGGCTGGAAAGAACAGAACATAGATCTGCTGGACCAAGCTTTTCTTATGGAATGGTGAAT GAGGATACTTCATGGAATGGACAGAAATGGGAGAGTTCTGGAAGTTATAGTAGGTCAGTA TCACATCCTTTCGTCTTACATGACATCCAGGAATCTGATATGTTAAAGCCTGTTAACAGC AGGACCCATGATCATCTTCCATCTGAGCTTCCTGCCTGCACTTCTGGTTGTCAGTCCCAG AGTGTATTGGCCGATGAATTTCCACATCTTGATATAATCAATGACTTGCTGAACGATGAG AATGGAGCTGGAAAGGCTTCTGAACCAAACTCGGGCTGGCAAAGATATAGCAACCATCTA AATCGTCAGTTCAGTTATCCGGGTGATATTAGCATGGCAAGTGATCTAGGTCCCTCAACT CACTCCTGTAGGTTTGAGCGAACAAGAAGCTATCACGATGAGCTACAACATTACTATTCT GGAGGCACTTATAATAGTATTAGGAATATGATTCCGCAGCCTAATCCACAATTTGTAAAT GGGCAGATTGATCAGTTAGTTCATGACCAGTGGCAGTTGATGCATTCTGATCCATCTTTT CTTGGAATGGGAAATGGTCATACTGATACTGGTTACCTGTACCACAACCCTGATTATTCA AATATGGCATGTGGTGTAAATAGGTATAGAGTATTTAGGCCTTCCAATGGGTTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc06g053750.3.1
PEP Infomation	MATH domain-containing protein (AHRD V3.3 *** W9QVS1_9ROSA)
Sequence	MASSASEEAGIGKSLEGVSKGQQRCQYSETLAERRYCEQMENGTPSTSPPYWDSDDEDDC GPKPVELYGKYTWKIDKFSQINKRELRSNTFEVGGYKWYILIYPQGCDVCNHLSLFLCVA NHDKLLPGWSHLAQFTIAVVNRDPRKSKYSDTLHRFWKKEHDWGWKKFMDLSRVVDGFID SDTLIIKAQVQVIREKAERPFHCLDCQYRRELVRVYLTNVEQTCRRFVEERRGKLGKLIG DKTRWSSFCAFWLGIDQNSRRRMSREKSDRILKMVVKNFFIEKEVTSTLVMDSLYSGLKA LVDQTNGQTGKGKHLDAVEQTVPIVYLEKDMFVLVDDVLLLLERAVLEPLPPKDERGPQN RTKDAASGEGTNRDHIQRDERRLTELGRRTIEIFVLAHIFSKIEVAYKEAVALKRQEELI REEAAWLAETEKKAKRASEKEKKSKKKQSKQKRNIRKAKDKERNEKSDVMVHDKIEVDGP IGEGNEYMAEMPGQVLGKSDVLGEVSDISDSIDSIIHPDSEDRNASPVNWDTDTSEVHPS VEAGSSRLIGLPASQNVIAGRISPSMMDDSSSTCSTDSIVSVVINGTHRGFPLIQKNQKL PSRGRNERSRSTCKAADWASETLGQTSDVVSDDGQLSDTSVSCEATGYECQATALPSCEQ QATNKKVAVLQQRNLIDDREKSSILKPSSVQSPSRSPQKSTVSAVLSKESLKISVTSDPI LVKSSFSDSPQLTDKSGPMVVSAETSVMLKADPHKAVEVKPLKKPLPQPASISTEKSLSK QVTTSATAERSISRQVPAQSRPSSAPLVTDPRPPSPVVSMVQATQLLPRSVSAAGRLGPD PSPATHSYVRQSYRNAIMGGLISGSPVGFSQPHSPSLAVNSPHPYSQSPSLTSGLMLSPG GLERTEHRSAGPSFSYGMVNEDTSWNGQKWESSGSYSRSVSHPFVLHDIQESDMLKPVNS RTHDHLPSELPACTSGCQSQSVLADEFPHLDIINDLLNDENGAGKASEPNSGWQRYSNHL NRQFSYPGDISMASDLGPSTHSCRFERTRSYHDELQHYYSGGTYNSIRNMIPQPNPQFVN GQIDQLVHDQWQLMHSDPSFLGMGNGHTDTGYLYHNPDYSNMACGVNRYRVFRPSNGF*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc06g053750.3.1
Transcript Infomation	MATH domain-containing protein (AHRD V3.3 *** W9QVS1_9ROSA)
Sequence	AAACATAATATTTTTATATGATTTATAGTTTCCGCCTCTGTCCTGCTGCTTCTTCAACCT CTGCAATCCCTCCTCACTTTCTCCTTAGCTGCCATTCCGCCATTGACACACCTCTCTTTT TTTAATTCAGGTGAAGTTGGTGGAGTGAGAAATGGCTTCAAGCGCAAGCGAGGAGGCAGG AATAGGGAAGTCTCTGGAGGGAGTGTCAAAGGGGCAGCAGCGGTGTCAATATAGTGAAAC GTTGGCAGAACGAAGGTACTGTGAGCAGATGGAAAATGGAACTCCGTCAACATCACCTCC ATACTGGGACAGTGATGACGAAGATGATTGTGGACCTAAACCGGTTGAGCTATATGGAAA ATATACCTGGAAGATTGATAAATTTTCACAAATTAACAAGAGAGAACTTCGGAGTAATAC TTTTGAGGTTGGCGGCTACAAATGGTACATTTTGATTTATCCTCAGGGATGTGATGTCTG CAATCATCTCTCTTTGTTTCTGTGTGTGGCTAATCATGACAAGCTTCTTCCAGGCTGGAG TCATCTTGCACAATTTACTATAGCTGTGGTTAACAGAGATCCGAGGAAGTCCAAGTATTC AGATACATTGCATCGTTTCTGGAAGAAAGAACATGATTGGGGATGGAAAAAATTTATGGA CCTCTCCAGAGTTGTAGATGGATTTATTGATTCTGATACCCTCATTATCAAAGCTCAAGT TCAAGTCATCAGGGAGAAAGCAGAGCGTCCTTTCCATTGCCTTGATTGTCAGTATCGACG AGAACTTGTTAGGGTGTATTTAACGAATGTTGAGCAAACTTGCCGTCGTTTTGTGGAAGA GCGACGAGGAAAGCTTGGGAAATTAATAGGGGATAAAACTAGATGGTCGAGTTTCTGTGC TTTTTGGCTGGGAATAGACCAAAATTCTAGACGCCGCATGTCCAGAGAGAAATCAGATCG GATTTTGAAAATGGTGGTCAAGAACTTCTTCATAGAAAAAGAGGTTACGTCTACTCTTGT GATGGATTCGTTGTACAGTGGGCTTAAAGCTCTGGTAGACCAGACTAATGGACAGACAGG TAAAGGGAAACATTTAGATGCAGTGGAACAAACAGTTCCTATTGTTTACCTGGAGAAAGA CATGTTTGTCTTGGTGGATGATGTCTTGCTGTTGCTTGAGAGGGCTGTTTTGGAGCCGTT GCCTCCGAAGGATGAGAGAGGTCCTCAGAACCGTACAAAGGATGCTGCTTCTGGAGAGGG CACGAACAGAGATCACATTCAGCGTGATGAGAGGCGCTTAACTGAACTAGGTCGGCGAAC TATTGAAATATTTGTGCTTGCGCATATTTTCAGTAAAATAGAGGTTGCATATAAGGAAGC TGTTGCATTAAAGAGGCAAGAGGAACTCATCCGTGAAGAGGCTGCTTGGCTGGCTGAAAC TGAGAAGAAAGCTAAACGAGCATCCGAGAAGGAAAAGAAGTCGAAGAAAAAACAGTCTAA ACAGAAGCGGAATATCCGGAAAGCAAAGGATAAGGAGAGAAATGAAAAATCTGATGTTAT GGTGCATGATAAGATTGAAGTTGATGGTCCCATTGGTGAAGGAAATGAGTACATGGCTGA GATGCCAGGACAAGTACTTGGTAAATCAGATGTACTGGGAGAGGTTTCTGATATTTCTGA TTCTATAGACTCCATAATTCATCCTGATTCAGAAGACAGAAATGCAAGTCCTGTCAACTG GGATACTGATACCTCAGAGGTGCATCCATCTGTGGAAGCTGGTTCTAGCAGGTTAATTGG CCTTCCAGCTTCGCAGAATGTGATAGCAGGAAGGATAAGTCCTTCCATGATGGATGATAG TTCATCAACGTGTTCCACTGACTCAATTGTTTCAGTAGTTATTAATGGAACCCACAGAGG TTTTCCTTTGATCCAGAAAAACCAGAAATTACCTAGCAGAGGGAGAAATGAACGAAGCAG GTCAACTTGTAAGGCAGCTGATTGGGCTAGTGAAACACTTGGTCAGACGTCGGATGTTGT TTCAGATGATGGTCAGCTAAGTGATACATCTGTAAGCTGTGAGGCAACAGGATATGAGTG TCAGGCTACTGCACTTCCTTCGTGTGAGCAGCAAGCAACTAACAAGAAAGTAGCAGTTTT GCAGCAGAGAAATCTAATTGATGATAGAGAGAAATCTTCCATATTGAAGCCCAGCAGTGT CCAGTCTCCTTCTAGAAGCCCTCAAAAAAGTACAGTATCTGCTGTTCTGTCAAAGGAAAG TTTGAAAATCTCGGTCACTAGTGATCCTATCTTGGTCAAAAGTTCATTTTCAGATAGTCC TCAGCTGACTGATAAATCAGGTCCGATGGTTGTCTCAGCTGAAACTTCCGTGATGTTGAA GGCTGATCCTCATAAAGCTGTAGAGGTAAAACCCTTGAAGAAGCCCTTGCCACAGCCTGC TTCAATTTCAACTGAGAAGTCCCTGTCTAAACAAGTAACTACTTCTGCCACAGCTGAAAG GTCCATCTCTAGACAAGTGCCTGCCCAGTCGAGACCTTCGAGTGCTCCTCTAGTTACTGA TCCTAGACCTCCTTCCCCTGTTGTGTCCATGGTTCAGGCAACACAGTTATTGCCTCGTTC AGTTAGTGCAGCTGGTCGATTGGGTCCTGATCCTTCACCAGCAACACATAGTTATGTTCG TCAGTCCTATAGAAATGCAATTATGGGCGGTCTTATTTCTGGAAGTCCGGTTGGTTTTAG TCAGCCTCATTCTCCAAGTTTAGCCGTTAATTCACCACATCCATACTCTCAATCACCTTC ACTGACTTCTGGTCTAATGTTGTCGCCTGGGGGGCTGGAAAGAACAGAACATAGATCTGC TGGACCAAGCTTTTCTTATGGAATGGTGAATGAGGATACTTCATGGAATGGACAGAAATG GGAGAGTTCTGGAAGTTATAGTAGGTCAGTATCACATCCTTTCGTCTTACATGACATCCA GGAATCTGATATGTTAAAGCCTGTTAACAGCAGGACCCATGATCATCTTCCATCTGAGCT TCCTGCCTGCACTTCTGGTTGTCAGTCCCAGAGTGTATTGGCCGATGAATTTCCACATCT TGATATAATCAATGACTTGCTGAACGATGAGAATGGAGCTGGAAAGGCTTCTGAACCAAA CTCGGGCTGGCAAAGATATAGCAACCATCTAAATCGTCAGTTCAGTTATCCGGGTGATAT TAGCATGGCAAGTGATCTAGGTCCCTCAACTCACTCCTGTAGGTTTGAGCGAACAAGAAG CTATCACGATGAGCTACAACATTACTATTCTGGAGGCACTTATAATAGTATTAGGAATAT GATTCCGCAGCCTAATCCACAATTTGTAAATGGGCAGATTGATCAGTTAGTTCATGACCA GTGGCAGTTGATGCATTCTGATCCATCTTTTCTTGGAATGGGAAATGGTCATACTGATAC TGGTTACCTGTACCACAACCCTGATTATTCAAATATGGCATGTGGTGTAAATAGGTATAG AGTATTTAGGCCTTCCAATGGGTTTTGAAAGCTAGCTCTTTAATGAGGGAGCTTAGCCCC GAAACATTTGACTCTTCTCTGCCGTAATGTGTCTTTAGGTTTAGAGGCGAGGTTGTAGCC CTTGTGTAAAGAGTGATTCTGCCCTCATATTTTTAAGCTTTTGAAATCCACCGTATTGGC TTTTGGATGTTTTAAAAGTTGGTGTCTTCATATATATAAGCACATTATCGGTTCCATTGT GGTAGATAGCATCTGAAGTGGAATTACCAACCCAACTACTCCGACTCGTTGGAAGAATCA ACTTACATCTCCATCCTTCATTTCTTTCGATCGTCGTTGGAATTTCTCAACACTTAAAAA GAGTTCCATTTTACATCTTGTAAAGGTACTAGGTTGTTACATGAAAAAGATTTGATGAAT TTACAATCTCTTCAAAGAGGTCCAGTCCCTTCATCTGGACCATCCGGTTGCACAAATATC CCGGGTAATAGTGGTTCCGGGTCGGGTAATTGCCCACTCATTAATGAAATGCACTTTGCG GGTCATACGTTAAGGCCTAGTACGGTTATCATCGTTGTGTGAGCTCACTTATATTGTCTG TCTCATATATACATTTCGAGAAAAAGAAATATTAGTGGACATATTAGCGAGATGGTGTCT TATTTGTTTTATTTTTTTCACTTTTTATATATTTACTTTGCAATTTGTGGGAATAACTCC TTTTTGGATTGTCTTTTGGGAGGGTTTCCAATGTATTCATTTGTTAGTAAATTATGCACA GAGAGATATTCATTTGATAATGTTTGTATCTATATAGTCAATAAATAAATATTTACCAAT TTGTTAATTAATAGTACAAAAATTCTTTTTTATATTTCTTGGATCTTCTCCAAATGTGTC TACAATATACTTGACGTGACATACATAATGCATATAATTAATTAACTTAATTTGATCATA CACACATATAAAATAAATAACTATTCTGTAAAAAATACATTTGATTGTATAAAAGATATT TTCGCGTTGATGATATATACAAATGAATGTTATACATAAGTTCAGAGAGTTTAAATCGGA GGATGACATTTAAAATTTAAAACATAGAGATTTCACCAAATTCTTTTGCGTGACGCACAA ATTAATTAATCTAAGCAACAAAATTGACAACTCTTATACCTAAAATTAGTATTAATTCTA AATTAAGGTTCTTAAGAATATTGAAACAGTAGAGATAATTAGTGTATTACTTATTGGATA ACATTGATTTAATGAGTCTTTTTCTATTTATTTTCTTTTGTGGAAGATGACTTAGCATGC AACACAAGTTTACTTGCGTATTCAATTTATAAAGAACAAAGTCAGATGACAATTAGGAAT TGGTAGCTCCATATTCCTTCCTAATTATTAACTAATTATTATGAAAACACCAAATTTTAA GAACAAGTAACAAAAATTTGGTGTTAACATGTTAGGGGTTTGGCTTGGACTTTCTCTTAT CCATTCAATCGATGCAAAAAAAAAAAGTTTATAGAAGGGGAATAGATCACATAATAGAAA GAATTAATAGCAACAAATTGAATCAGGTATAACAGAGAGTGTACGTAGATTGATCGCTCT TATTTACAGAATATAACATCTAGTACTTATAAATTTATTTAATGAGTGAGCCTTTTAACA AAAAATTAGGCGGAGGGGAAAGAGAAATTACGGGGTAGAGAATTAAACTCTCTCTAACAA TGTTAAAAATGAAGATAACCAATCAATTGAGTCTCTCAACCTATTAATTATATAGTAGAA TCGTCACTTGTACGATGTTATTGTTTGTGTCAATAAAAAATACACGAACTCGATCGCATC TAACAACATCATTGATCTATTTTAATAACAACATTTGCAGTCACAAAACGGTTTTTGGTA TGTGGATTTTGTAGTAAATAGTAATGGCTTCAAAGTCTCCTTAGTAAATTTTCTTTAATT AACAAAATAAAAAGATGAAATTCTAGGGGATTGCTTGTAATATATAAACTCCTAACTCTT TTACGTGCCCAAAATTACTTCCTTTTTTTTTTCATTTTTTATTCCTCATTTTTAGTTATG ATAGGACTTTTCATTGGGAATAATACTTTGATATGTAAATTGGCAGCATCAATTTGATAG TAGAAAAATGTAATCCCTTATCTTAATTTTTTTTTTTGAGAAAATAACACTTGAAAATTA AAAAATAATTTGTTGCGAATGATATGATGTGAATTAACATCTATCTAAATATGTGAGTAC AAACGTTAATGTTTAAATTTGGAAGAAAAAAATGATTTTTTATCTTGGTTACTATTATGA TTTATAGTTATATTTTTTTCTCACTTAATAACAACAACAAAATCAGTGTAATCTATGTTG TTTCTTTAACTCGATTATTAAATTATCTTCTTGTTGTTTCTGCTTGTTGCCACTTGCCTC TTTTTTTG