Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc06g053370.2.1
CDS Infomation	Rhomboid protein (AHRD V3.3 *** E5GC88_CUCME)
Sequence	ATGGGGAAACCATTGTTTTATGAGATATTGGAGAAGCCAGCAACCAGTTGTGCAATTGGA ATATGTAGTGCAATTTGGTTTTATATTCAGAAGTCAAATATTGGTTATTCACATGTTGGT TTGAGTTATGAAACTGCTTTGGAGGGTCATTATTGGAGGATAATAACATCAGCACTTTCA CATATTAGTGTGCTTCATCTTGTTTTCAATATGAGTGCACTTTGGAGTCTTGGAGTTGTT GAACAATTGGGGCATTTAGGTCTTGGTGTGCAGTATTATCTTCATTATACACTGGTGTTG GTTGTTCTTTCGGGCATGCTTGTCATCGGAATGTACCATATCTTGATTCAGAAATTTAAG CTAGAGTATTTTCGGAGAGTTACTGCTGTTGGATATTCTTGTGTGGTGTTTGGTTGGATG ACGATTCTTTCGGTCAAGCAACCGTCGTCAAAGTTGAATCTTTTTGGTTTTCTTTCACTT CCGATCAGCTTTGCGCCATTTGAGTCGCTCATATTCACTTCCATTATTGTTCCTCAAGCG AGTTTTATTGGACATTTATCGGGAATTATTGTTGGTTATGCTGTTGGTTGGGGTTTGATA CATGGGATGAACAATTACTGGGCAGTTACAATGCTGGGATGGACTGTGCTTGTGTTTGTT TTCAGTTTGAAAAAGTCTGGTACATTTGATTTGAACTTTCTTGAGATTGAACCTGTCACG GATCCCTCTCTGCCTTCGGTACGTTTTTTCGCAGCTGGAACTGGTAGAAGTTTACAGATG AGTACGTTACCAGATGACTTGTTGATTATAACTGTGGTGTCGGAGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc06g053370.2.1
PEP Infomation	Rhomboid protein (AHRD V3.3 *** E5GC88_CUCME)
Sequence	MGKPLFYEILEKPATSCAIGICSAIWFYIQKSNIGYSHVGLSYETALEGHYWRIITSALS HISVLHLVFNMSALWSLGVVEQLGHLGLGVQYYLHYTLVLVVLSGMLVIGMYHILIQKFK LEYFRRVTAVGYSCVVFGWMTILSVKQPSSKLNLFGFLSLPISFAPFESLIFTSIIVPQA SFIGHLSGIIVGYAVGWGLIHGMNNYWAVTMLGWTVLVFVFSLKKSGTFDLNFLEIEPVT DPSLPSVRFFAAGTGRSLQMSTLPDDLLIITVVSE*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc06g053370.2.1
Transcript Infomation	Rhomboid protein (AHRD V3.3 *** E5GC88_CUCME)
Sequence	GCATTTGCTTGCGTATGTCACTCCAGAGGAGCCTCGACTCTTCTTCACAAGCGAAACAAC TAAAACCCCTCTTTCTAATTACATTGATTTTCTAGCAACATTTCCTCAAGAAATCTGATT GCAATCAAGAAATTCTGAAGTTGGGTTTGCTGATTTGGGTCTTTATGTGATTTGACGTTC AATAAATTAGTCTGAAGTGCAAGATTCTTGATTTTCTGATTTGGGGTTTTCTATATCTGT TTCAAGATTCAATTTTTCTGAGGATTCTGTATTGAATTTGATTAATGACATTACAAGAAG GTTAAATAAAGGGGAGGAAGTAGTGTATTTGTAAGCATTTTAGCAATAAAGTTGAAGAAG GAATTGTGAGTAACTGAGGGGGTTAAAGGTTTCTTCACATGGGGAAACCATTGTTTTATG AGATATTGGAGAAGCCAGCAACCAGTTGTGCAATTGGAATATGTAGTGCAATTTGGTTTT ATATTCAGAAGTCAAATATTGGTTATTCACATGTTGGTTTGAGTTATGAAACTGCTTTGG AGGGTCATTATTGGAGGATAATAACATCAGCACTTTCACATATTAGTGTGCTTCATCTTG TTTTCAATATGAGTGCACTTTGGAGTCTTGGAGTTGTTGAACAATTGGGGCATTTAGGTC TTGGTGTGCAGTATTATCTTCATTATACACTGGTGTTGGTTGTTCTTTCGGGCATGCTTG TCATCGGAATGTACCATATCTTGATTCAGAAATTTAAGCTAGAGTATTTTCGGAGAGTTA CTGCTGTTGGATATTCTTGTGTGGTGTTTGGTTGGATGACGATTCTTTCGGTCAAGCAAC CGTCGTCAAAGTTGAATCTTTTTGGTTTTCTTTCACTTCCGATCAGCTTTGCGCCATTTG AGTCGCTCATATTCACTTCCATTATTGTTCCTCAAGCGAGTTTTATTGGACATTTATCGG GAATTATTGTTGGTTATGCTGTTGGTTGGGGTTTGATACATGGGATGAACAATTACTGGG CAGTTACAATGCTGGGATGGACTGTGCTTGTGTTTGTTTTCAGTTTGAAAAAGTCTGGTA CATTTGATTTGAACTTTCTTGAGATTGAACCTGTCACGGATCCCTCTCTGCCTTCGGTAC GTTTTTTCGCAGCTGGAACTGGTAGAAGTTTACAGATGAGTACGTTACCAGATGACTTGT TGATTATAACTGTGGTGTCGGAGTAG