Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc06g051010.1.1

CDS Infomation

LOW QUALITY:Peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)asparagine amidase A protein (AHRD V3.3 *** AT5G05480.1)

Sequence

ATGGCGATTCTCATCTTCTTCTTCATCACTATCAGCTTTATTGCTCCATCTTCATCTTCT
TTACCTGAACACCATTTTCACTTTACCAAAACTGGTCTTCGCCACAACACTTCATCGCAG
CCACAGCAATACATAGAAATCAGTCGTCCATTGTCATTCACAAATCTCCCTCCTTCTTGT
ACTTTTCATATCCTTACTCATGATTTCGCCTATACCATGGGTCTCCCGCCGGTCTCTGCT
TCTTACTCTCCTCCGGCCAATTGCTCCTGGACTCATGTGGCTCTTCAGTTTAATGTTTCT
TCTAAAGGAGAGCAATACGATCGAATCGCCGCCATTTGGCTTGATGGCGCCGAGCTCCTC
CGTACCAGCACCGCTGAGCCTACCGATGACGGTATTTTCTGGACTGTAACGAAGGATGTT
ACCAGGTACTCCTCCATCCTGGTCAACGAGAATATATCTCTTTCTGTCATGATGGAAAAT
CTGGTCAACGATGTTTATACCGGTGTTTATCAGGTTAATATTAGTTTCCTCTACTATAAT
AGTAAGAAAATGGATGTTTCGTTATCGAACAGTTATAATCGGAAAATGAAGCCGGATAAT
GAGATTGAAAAACCGGCAGATATGATAATACCAATATCGGGAAATGGAAGTGAAGGATTT
TGGTTTCGAATTATGAATGAATCAGATCTGCATGGGCAGAGTGTTATTATTCCGAAAAAT
ACATACAAAGCTGTGATTGAGATTTACGTATCATCACACGGGTATGATGAGTTTTGGTAC
ACGAATCCGCCTGATTCATACATACAAATGAATAATTTAACTACTAAGAGAGGCCATGGA
TCGTACAGGGAAGTTTTGGTGAATATAGATAGGATGTTGGTTGGATCTGTAATTCCATTT
CCTGTTATTTTCACTGGCGGAATTAATCCTATGTACTGGGGACCACTAGTTTCGATTGGG
GCATTTGATCTTCCTTCGTATGACATTGATTTAACACCATATTTGGGGCTTTTACTCGAC
CGTCAAGCTCATTTTCTAGAGCTTGGGGTGAATGACAGTATCCCATTCTGGCTTGTGGGT
GCTAATTTGCACCTGTGGGTGGATAACAATTGTGTATTGCCTTGTGAAGTGCAGGCTAAA
GTTATTGATTTCGGTACCCCTAAGTTTAACATTGAGCGATCTTCGAGTTTTCTAGGCCTG
GATGGATCATTTGAGGTTGAGATTAAGAGGAAGAGTGAGATTTCTTATTGGGTGAACTCA
ACAACAGGAAAATTGACTACTATAATCAAGCGAGAATTGAAGTTCAAGAACGAAATGAAC
TTTTATCTAAGCGGAACTGAGAAAAAGATTAAGCAAAAAGTGGAGGAAGAGATTGAAGTT
AGCGTATTGTCTAATAGTGGTGGCACGATCTCTAAAACCAAAGTGAAGAGGAAGTTTCCG
CTTACTATAACATCTAAGACTATATCATCAATGGAGAATGATACGACCTTGATGCTTTCT
GATTTGGATCATGAATGGAAGGAGAAGAAGAAGTTGGATGGAGGTCCTTCAACCTCATTG
AAAAATCGGCAGCAATGCAATGGATGGGTGGTTGTTCAAGGTCGCAATGTTTTACATGGT
GGGGCAACCACTCAACAAACTTATTCTTACGACAATGAAGCTGATTGCTATTCTCGAACC
GTTTCAGCTGCCAATGGCAAGCTTATGAATGACACTGCAAACATTCTTTGTGCAGCAGCT
CCTTTGAAGTTTGGTTCATTTTCTGCTTTGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc06g051010.1.1

PEP Infomation

LOW QUALITY:Peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)asparagine amidase A protein (AHRD V3.3 *** AT5G05480.1)

Sequence

MAILIFFFITISFIAPSSSSLPEHHFHFTKTGLRHNTSSQPQQYIEISRPLSFTNLPPSC
TFHILTHDFAYTMGLPPVSASYSPPANCSWTHVALQFNVSSKGEQYDRIAAIWLDGAELL
RTSTAEPTDDGIFWTVTKDVTRYSSILVNENISLSVMMENLVNDVYTGVYQVNISFLYYN
SKKMDVSLSNSYNRKMKPDNEIEKPADMIIPISGNGSEGFWFRIMNESDLHGQSVIIPKN
TYKAVIEIYVSSHGYDEFWYTNPPDSYIQMNNLTTKRGHGSYREVLVNIDRMLVGSVIPF
PVIFTGGINPMYWGPLVSIGAFDLPSYDIDLTPYLGLLLDRQAHFLELGVNDSIPFWLVG
ANLHLWVDNNCVLPCEVQAKVIDFGTPKFNIERSSSFLGLDGSFEVEIKRKSEISYWVNS
TTGKLTTIIKRELKFKNEMNFYLSGTEKKIKQKVEEEIEVSVLSNSGGTISKTKVKRKFP
LTITSKTISSMENDTTLMLSDLDHEWKEKKKLDGGPSTSLKNRQQCNGWVVVQGRNVLHG
GATTQQTYSYDNEADCYSRTVSAANGKLMNDTANILCAAAPLKFGSFSAL*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc06g051010.1.1

Transcript Infomation

LOW QUALITY:Peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)asparagine amidase A protein (AHRD V3.3 *** AT5G05480.1)

Sequence

ATGGCGATTCTCATCTTCTTCTTCATCACTATCAGCTTTATTGCTCCATCTTCATCTTCT
TTACCTGAACACCATTTTCACTTTACCAAAACTGGTCTTCGCCACAACACTTCATCGCAG
CCACAGCAATACATAGAAATCAGTCGTCCATTGTCATTCACAAATCTCCCTCCTTCTTGT
ACTTTTCATATCCTTACTCATGATTTCGCCTATACCATGGGTCTCCCGCCGGTCTCTGCT
TCTTACTCTCCTCCGGCCAATTGCTCCTGGACTCATGTGGCTCTTCAGTTTAATGTTTCT
TCTAAAGGAGAGCAATACGATCGAATCGCCGCCATTTGGCTTGATGGCGCCGAGCTCCTC
CGTACCAGCACCGCTGAGCCTACCGATGACGGTATTTTCTGGACTGTAACGAAGGATGTT
ACCAGGTACTCCTCCATCCTGGTCAACGAGAATATATCTCTTTCTGTCATGATGGAAAAT
CTGGTCAACGATGTTTATACCGGTGTTTATCAGGTTAATATTAGTTTCCTCTACTATAAT
AGTAAGAAAATGGATGTTTCGTTATCGAACAGTTATAATCGGAAAATGAAGCCGGATAAT
GAGATTGAAAAACCGGCAGATATGATAATACCAATATCGGGAAATGGAAGTGAAGGATTT
TGGTTTCGAATTATGAATGAATCAGATCTGCATGGGCAGAGTGTTATTATTCCGAAAAAT
ACATACAAAGCTGTGATTGAGATTTACGTATCATCACACGGGTATGATGAGTTTTGGTAC
ACGAATCCGCCTGATTCATACATACAAATGAATAATTTAACTACTAAGAGAGGCCATGGA
TCGTACAGGGAAGTTTTGGTGAATATAGATAGGATGTTGGTTGGATCTGTAATTCCATTT
CCTGTTATTTTCACTGGCGGAATTAATCCTATGTACTGGGGACCACTAGTTTCGATTGGG
GCATTTGATCTTCCTTCGTATGACATTGATTTAACACCATATTTGGGGCTTTTACTCGAC
CGTCAAGCTCATTTTCTAGAGCTTGGGGTGAATGACAGTATCCCATTCTGGCTTGTGGGT
GCTAATTTGCACCTGTGGGTGGATAACAATTGTGTATTGCCTTGTGAAGTGCAGGCTAAA
GTTATTGATTTCGGTACCCCTAAGTTTAACATTGAGCGATCTTCGAGTTTTCTAGGCCTG
GATGGATCATTTGAGGTTGAGATTAAGAGGAAGAGTGAGATTTCTTATTGGGTGAACTCA
ACAACAGGAAAATTGACTACTATAATCAAGCGAGAATTGAAGTTCAAGAACGAAATGAAC
TTTTATCTAAGCGGAACTGAGAAAAAGATTAAGCAAAAAGTGGAGGAAGAGATTGAAGTT
AGCGTATTGTCTAATAGTGGTGGCACGATCTCTAAAACCAAAGTGAAGAGGAAGTTTCCG
CTTACTATAACATCTAAGACTATATCATCAATGGAGAATGATACGACCTTGATGCTTTCT
GATTTGGATCATGAATGGAAGGAGAAGAAGAAGTTGGATGGAGGTCCTTCAACCTCATTG
AAAAATCGGCAGCAATGCAATGGATGGGTGGTTGTTCAAGGTCGCAATGTTTTACATGGT
GGGGCAACCACTCAACAAACTTATTCTTACGACAATGAAGCTGATTGCTATTCTCGAACC
GTTTCAGCTGCCAATGGCAAGCTTATGAATGACACTGCAAACATTCTTTGTGCAGCAGCT
CCTTTGAAGTTTGGTTCATTTTCTGCTTTGTGA