Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc06g050520.2.1
CDS Infomation	dehydration responsive element binding protein 1
Sequence	ATGGCTATTATGGATGAAGCTGCTAATATGGTTTGTGTGCCGTTGGATTATAGTAGAAAG AGGAAATCAAGGAGTAGAAGGGACAGAACAAAAAATGTGGAAGAGACACTAGCTAAATGG AAGGAGTATAATGAGAAACTAGACAATGAAGGGAAAGGGAAGCCAGTGCGTAAAGTTCCT GCTAAAGGTTCAAAGAAGGGGTGTATGAGAGGTAAAGGGGGACCAGAAAATTGGCGGTGT AAATACAGAGGTGTTAGACAGAGGATATGGGGTAAATGGGTTGCTGAGATTAGGGAACCT AAAAGAGGTAGTAGGTTATGGTTGGGTACATTTGGTACAGCAATTGAAGCTGCTTTAGCA TATGATGATGCTGCAAGAGCTATGTATGGTCCTTGTGCAAGGCTTAATTTGCCAAATTAC GCGTGTGATTCTGTATGTCCGGTTGATGGTGCTCTTCATGAAGCTGACACACCATTGAGC TCAGTGAAAGACGAAGGGACCGCGATGGATATTGTTGAACCTACGAGTATTGATGAAGAT ACGCTTAAGTCTGGATGGGATTGTCTAGATAAATTAAATATGGATGAGATGTTTGATGTA GATGAGCTATTGGCTATGTTAGATTCTACTCCAGTTTTCACCAAGGACTACAATTCAGAT GGAAAGCACAACAATATGGTATCAGATTCGCAATGTCAGGAGCCGAATGCAGTGGTAGAT CCTATGACTGTTGACTATGGCTTTGATTTTCTGAAACCAGGCAGGCAAGAAGATCTTAAT TTCAGTTCGGATGACCTTGCATTCATAGACTTGGATTCTGAACTTGTCGTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc06g050520.2.1
PEP Infomation	dehydration responsive element binding protein 1
Sequence	MAIMDEAANMVCVPLDYSRKRKSRSRRDRTKNVEETLAKWKEYNEKLDNEGKGKPVRKVP AKGSKKGCMRGKGGPENWRCKYRGVRQRIWGKWVAEIREPKRGSRLWLGTFGTAIEAALA YDDAARAMYGPCARLNLPNYACDSVCPVDGALHEADTPLSSVKDEGTAMDIVEPTSIDED TLKSGWDCLDKLNMDEMFDVDELLAMLDSTPVFTKDYNSDGKHNNMVSDSQCQEPNAVVD PMTVDYGFDFLKPGRQEDLNFSSDDLAFIDLDSELVV*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc06g050520.2.1
Transcript Infomation	dehydration responsive element binding protein 1
Sequence	ATGGCTATTATGGATGAAGCTGCTAATATGGTTTGTGTGCCGTTGGATTATAGTAGAAAG AGGAAATCAAGGAGTAGAAGGGACAGAACAAAAAATGTGGAAGAGACACTAGCTAAATGG AAGGAGTATAATGAGAAACTAGACAATGAAGGGAAAGGGAAGCCAGTGCGTAAAGTTCCT GCTAAAGGTTCAAAGAAGGGGTGTATGAGAGGTAAAGGGGGACCAGAAAATTGGCGGTGT AAATACAGAGGTGTTAGACAGAGGATATGGGGTAAATGGGTTGCTGAGATTAGGGAACCT AAAAGAGGTAGTAGGTTATGGTTGGGTACATTTGGTACAGCAATTGAAGCTGCTTTAGCA TATGATGATGCTGCAAGAGCTATGTATGGTCCTTGTGCAAGGCTTAATTTGCCAAATTAC GCGTGTGATTCTGTATGTCCGGTTGATGGTGCTCTTCATGAAGCTGACACACCATTGAGC TCAGTGAAAGACGAAGGGACCGCGATGGATATTGTTGAACCTACGAGTATTGATGAAGAT ACGCTTAAGTCTGGATGGGATTGTCTAGATAAATTAAATATGGATGAGATGTTTGATGTA GATGAGCTATTGGCTATGTTAGATTCTACTCCAGTTTTCACCAAGGACTACAATTCAGAT GGAAAGCACAACAATATGGTATCAGATTCGCAATGTCAGGAGCCGAATGCAGTGGTAGAT CCTATGACTGTTGACTATGGCTTTGATTTTCTGAAACCAGGCAGGCAAGAAGATCTTAAT TTCAGTTCGGATGACCTTGCATTCATAGACTTGGATTCTGAACTTGTCGTTTGA