Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc06g033920.1.1
CDS Infomation	Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family protein (AHRD V3.3 *** AT3G24240.1)
Sequence	ATGGAGTACCAAAAATTGATAGTGGCTTTCTGTTTCCACTCTCTTCTTATACTTTTTGTC CATCAATCTCAGCTTACATATGCTGGGAAACATCTCTGTGCGCGTGATGAAGCTTTTTAT TTGCTTCAACTTAAGCAAGGCCTCACCGTTGATCCACATGCTTATTTCTATGGTTGTGAC AGTGAGGCCGAAGCCAAGACTTTGTCCTGGAATGCTACAAGAGATTGTTGTGAATGGGGT GGTGTTACTTGCAATGTATTTACAGGTCATGTCATAGGCCTCGATCTTTCTTCGAGCTGT CTTAGGGGAACCATCGATGCTAACAGCACCCTCAAAAAACTTGGTCATCTTCAAAGACTC AACCTTGCATACAACGAGTTGAGTGACTTTCCACTTGGAAATAGCATTAGTCAACTCAGT AGTTTGACGCATCTCAATCTTTCGCATTCTGGAAATATGATGCAGATCCCAGCAGGATTA ACAAACTTGTCTAAATTGGTTTCACTTGACCTCTCCTGGCACACTAAATTACAATTTGGT TTAACAACGTTCAGAAGTTTGCTTCAAGACTTAACCAATTTGGAGGTACTGTTGCTTGAC AACGTGGACGTTTTTGGGAACATAAGTGAGTTACCTAAGAACCTTTCTTCTTCCCTTAGG TACTTAAGTCTTGGAGACACCAACATGTTTGGGAACATAGGTGAGTCTGAGATTTTTCAT CTACCAAACTTGCAAGTGCTGAGATTGGGAAATAATCCTTTATTAACAGGCACTTTGCCG AATTACCGTTGGAATTTCAGTGAAAGTGTTTTAGAGTTGGACTTCTCTAATACTGGTATT TTTGGGAAGCTACCTGGTTCAATTGCTAATCTCCATTATCTTTGGCGTTTGAACCTCCGT AATTGCCATTTATCCGGCTCGATTCCAGTATCCCTTGGCAACCTCACTACAATCAGAGAG TTGATACTTACACGTAACAACTTTACTGGTAATGTTCCCTCAACTATCTCACAATTAAAC AAACTCGTATACTTAGATCTCTCTTCCAACCATTTTCGAGGATCGATTCCAGAATCTATT GGCAACCTCACTGCAATCACAGTGCTGGATCTTTCATATAACAGCTTCACAGGAAATGTT CCCTCAACTATCCAAAAGATGAACAAACTTAGCGACTTATCTCTCTCTTCCAATAATTTT GGAGGTTCGATTCCAGACATCTTTGCCAACATTTCAGAGCTATCATTTTTAGGTTTTCAC ACTAACAATTTCACTGGCCCCCTCCCATATTCCATTACAACCTTGACACGCCTTGCAACA TTATACTTGCAAAACAATTCGCTAACTAGACCACTTCCCTCTAATATAAGCGGATTTCAG GAGCTGACAGTGCTCGATTTGTCATTTAATTGTTTCACTGGCGCAGCACCCTCTTGGTTA TTCCATCTTCCATCCTTATATAATTTATATGTTCAACACAATCAATTAACCGGGAAATTG CCAAATGAGCTCAAGAGCAATTATGTAGAATACTCAGATATTAATCTTTCATACAACAAC CTGCAAGGTGAAATTCCTGATTGGATGTTTTCTCCAAGATTGGGTAGACTGGATCTCTCT CATAACTTCCTCACAGGCTTTGTAATACAAGTATGGCCCTCAGGAAGCTTACGATACCTT AATCTGGAAAACAATTTTCTTCAAGGGTCTTTGTATCAGTCCTTTTGTGACATGGTTATG CTTGAAATCCTCATTTTGGCTCAGAACAATTTCAGTGGTTCAATCCCAGATTGTTTGGGT AACTCCAAAAGTCTCATTTATATTTTAGACTTGCGAATGAACAAATTTCATGGAGAGATA CCAAGATTCTTACCTACACGGTTAGAGTATCTTGGTTTATATGGCAATCAATTGACGGGA CAAGTCCCCCGATCCTTGGTTAACTATACAAGCTTGGAAGCTATTGATTTGGGGAACAAC AAGTTAAATGACACGTTCCCCATATGGCTGGAGAAATTTCCATACCTACGAGTTCTGATT CTGAAATCAAATCTCTTTCACGGTCCAATTGGTGATTTCGAGTCCGAATTTCCATTTCCT GAGTTACGAATCTTTGACCTTTCCTGCAATGGGTTCACAGGAACTTTGCCATCTAAGTTT TTCAAAAGTTTCAGAGGTATGATGGATGTGAATGAAAAAAAAACAGGAATTACTCAAGTT ACTAAAAGGACTCTCAGAGGTTATCTTTACCATGTTAGTTTGATGATAAAAGGTAATGAG TTTAATATGAGAATCACGCCAATCATGACGAGTGTTGATCTATCAAGCAACAGGTTTGAA GGAGATATTCCAAATTCCATTGGAAGTCTGAGCTCACTTGTCTTACTCAACTTGTCTCAC AACATTTTCCATGGTCATATTCCTGCAGAATTTACAAAGTTGCAGCAGCTCGAAGCATTA GATATCTCATGGAACAGACTCATCGGAGAAATTCCAGGTCCATTGTCGAGTTTGACATTT CTTGAGGTGTTAAACCTTTCGTACAATCATCTGGCTGGGCGCATTCCTATTGGGAAACAG TTCAATACATTTCCAAATGATTCATACTGTGGAAATCCTGGATTATGTGGATTTCCACTG TCAAAGGAATGTGGAAACAATAATGAGTCACCACTTGAACACGAAGATGATGATTCATTT TTTATGAGCGGGTTCACATGGGAAGCAGTTGTAATAGGTTATGGTTGTGGTATGATATTT GGATTGTTGATAGGCGGCCTCATGTTTCTATTGGGAAAACCAAAATGGTATGTGAACTTT GCTGAAGATATTGCTCAACAAATTAGTGCTAAGAAGGGGACAAGGCAAAAGAAGAGACGT CAAAGACGTGGTCCACGATGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc06g033920.1.1
PEP Infomation	Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family protein (AHRD V3.3 *** AT3G24240.1)
Sequence	MEYQKLIVAFCFHSLLILFVHQSQLTYAGKHLCARDEAFYLLQLKQGLTVDPHAYFYGCD SEAEAKTLSWNATRDCCEWGGVTCNVFTGHVIGLDLSSSCLRGTIDANSTLKKLGHLQRL NLAYNELSDFPLGNSISQLSSLTHLNLSHSGNMMQIPAGLTNLSKLVSLDLSWHTKLQFG LTTFRSLLQDLTNLEVLLLDNVDVFGNISELPKNLSSSLRYLSLGDTNMFGNIGESEIFH LPNLQVLRLGNNPLLTGTLPNYRWNFSESVLELDFSNTGIFGKLPGSIANLHYLWRLNLR NCHLSGSIPVSLGNLTTIRELILTRNNFTGNVPSTISQLNKLVYLDLSSNHFRGSIPESI GNLTAITVLDLSYNSFTGNVPSTIQKMNKLSDLSLSSNNFGGSIPDIFANISELSFLGFH TNNFTGPLPYSITTLTRLATLYLQNNSLTRPLPSNISGFQELTVLDLSFNCFTGAAPSWL FHLPSLYNLYVQHNQLTGKLPNELKSNYVEYSDINLSYNNLQGEIPDWMFSPRLGRLDLS HNFLTGFVIQVWPSGSLRYLNLENNFLQGSLYQSFCDMVMLEILILAQNNFSGSIPDCLG NSKSLIYILDLRMNKFHGEIPRFLPTRLEYLGLYGNQLTGQVPRSLVNYTSLEAIDLGNN KLNDTFPIWLEKFPYLRVLILKSNLFHGPIGDFESEFPFPELRIFDLSCNGFTGTLPSKF FKSFRGMMDVNEKKTGITQVTKRTLRGYLYHVSLMIKGNEFNMRITPIMTSVDLSSNRFE GDIPNSIGSLSSLVLLNLSHNIFHGHIPAEFTKLQQLEALDISWNRLIGEIPGPLSSLTF LEVLNLSYNHLAGRIPIGKQFNTFPNDSYCGNPGLCGFPLSKECGNNNESPLEHEDDDSF FMSGFTWEAVVIGYGCGMIFGLLIGGLMFLLGKPKWYVNFAEDIAQQISAKKGTRQKKRR QRRGPR*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc06g033920.1.1
Transcript Infomation	Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family protein (AHRD V3.3 *** AT3G24240.1)
Sequence	ATGGAGTACCAAAAATTGATAGTGGCTTTCTGTTTCCACTCTCTTCTTATACTTTTTGTC CATCAATCTCAGCTTACATATGCTGGGAAACATCTCTGTGCGCGTGATGAAGCTTTTTAT TTGCTTCAACTTAAGCAAGGCCTCACCGTTGATCCACATGCTTATTTCTATGGTTGTGAC AGTGAGGCCGAAGCCAAGACTTTGTCCTGGAATGCTACAAGAGATTGTTGTGAATGGGGT GGTGTTACTTGCAATGTATTTACAGGTCATGTCATAGGCCTCGATCTTTCTTCGAGCTGT CTTAGGGGAACCATCGATGCTAACAGCACCCTCAAAAAACTTGGTCATCTTCAAAGACTC AACCTTGCATACAACGAGTTGAGTGACTTTCCACTTGGAAATAGCATTAGTCAACTCAGT AGTTTGACGCATCTCAATCTTTCGCATTCTGGAAATATGATGCAGATCCCAGCAGGATTA ACAAACTTGTCTAAATTGGTTTCACTTGACCTCTCCTGGCACACTAAATTACAATTTGGT TTAACAACGTTCAGAAGTTTGCTTCAAGACTTAACCAATTTGGAGGTACTGTTGCTTGAC AACGTGGACGTTTTTGGGAACATAAGTGAGTTACCTAAGAACCTTTCTTCTTCCCTTAGG TACTTAAGTCTTGGAGACACCAACATGTTTGGGAACATAGGTGAGTCTGAGATTTTTCAT CTACCAAACTTGCAAGTGCTGAGATTGGGAAATAATCCTTTATTAACAGGCACTTTGCCG AATTACCGTTGGAATTTCAGTGAAAGTGTTTTAGAGTTGGACTTCTCTAATACTGGTATT TTTGGGAAGCTACCTGGTTCAATTGCTAATCTCCATTATCTTTGGCGTTTGAACCTCCGT AATTGCCATTTATCCGGCTCGATTCCAGTATCCCTTGGCAACCTCACTACAATCAGAGAG TTGATACTTACACGTAACAACTTTACTGGTAATGTTCCCTCAACTATCTCACAATTAAAC AAACTCGTATACTTAGATCTCTCTTCCAACCATTTTCGAGGATCGATTCCAGAATCTATT GGCAACCTCACTGCAATCACAGTGCTGGATCTTTCATATAACAGCTTCACAGGAAATGTT CCCTCAACTATCCAAAAGATGAACAAACTTAGCGACTTATCTCTCTCTTCCAATAATTTT GGAGGTTCGATTCCAGACATCTTTGCCAACATTTCAGAGCTATCATTTTTAGGTTTTCAC ACTAACAATTTCACTGGCCCCCTCCCATATTCCATTACAACCTTGACACGCCTTGCAACA TTATACTTGCAAAACAATTCGCTAACTAGACCACTTCCCTCTAATATAAGCGGATTTCAG GAGCTGACAGTGCTCGATTTGTCATTTAATTGTTTCACTGGCGCAGCACCCTCTTGGTTA TTCCATCTTCCATCCTTATATAATTTATATGTTCAACACAATCAATTAACCGGGAAATTG CCAAATGAGCTCAAGAGCAATTATGTAGAATACTCAGATATTAATCTTTCATACAACAAC CTGCAAGGTGAAATTCCTGATTGGATGTTTTCTCCAAGATTGGGTAGACTGGATCTCTCT CATAACTTCCTCACAGGCTTTGTAATACAAGTATGGCCCTCAGGAAGCTTACGATACCTT AATCTGGAAAACAATTTTCTTCAAGGGTCTTTGTATCAGTCCTTTTGTGACATGGTTATG CTTGAAATCCTCATTTTGGCTCAGAACAATTTCAGTGGTTCAATCCCAGATTGTTTGGGT AACTCCAAAAGTCTCATTTATATTTTAGACTTGCGAATGAACAAATTTCATGGAGAGATA CCAAGATTCTTACCTACACGGTTAGAGTATCTTGGTTTATATGGCAATCAATTGACGGGA CAAGTCCCCCGATCCTTGGTTAACTATACAAGCTTGGAAGCTATTGATTTGGGGAACAAC AAGTTAAATGACACGTTCCCCATATGGCTGGAGAAATTTCCATACCTACGAGTTCTGATT CTGAAATCAAATCTCTTTCACGGTCCAATTGGTGATTTCGAGTCCGAATTTCCATTTCCT GAGTTACGAATCTTTGACCTTTCCTGCAATGGGTTCACAGGAACTTTGCCATCTAAGTTT TTCAAAAGTTTCAGAGGTATGATGGATGTGAATGAAAAAAAAACAGGAATTACTCAAGTT ACTAAAAGGACTCTCAGAGGTTATCTTTACCATGTTAGTTTGATGATAAAAGGTAATGAG TTTAATATGAGAATCACGCCAATCATGACGAGTGTTGATCTATCAAGCAACAGGTTTGAA GGAGATATTCCAAATTCCATTGGAAGTCTGAGCTCACTTGTCTTACTCAACTTGTCTCAC AACATTTTCCATGGTCATATTCCTGCAGAATTTACAAAGTTGCAGCAGCTCGAAGCATTA GATATCTCATGGAACAGACTCATCGGAGAAATTCCAGGTCCATTGTCGAGTTTGACATTT CTTGAGGTGTTAAACCTTTCGTACAATCATCTGGCTGGGCGCATTCCTATTGGGAAACAG TTCAATACATTTCCAAATGATTCATACTGTGGAAATCCTGGATTATGTGGATTTCCACTG TCAAAGGAATGTGGAAACAATAATGAGTCACCACTTGAACACGAAGATGATGATTCATTT TTTATGAGCGGGTTCACATGGGAAGCAGTTGTAATAGGTTATGGTTGTGGTATGATATTT GGATTGTTGATAGGCGGCCTCATGTTTCTATTGGGAAAACCAAAATGGTATGTGAACTTT GCTGAAGATATTGCTCAACAAATTAGTGCTAAGAAGGGGACAAGGCAAAAGAAGAGACGT CAAAGACGTGGTCCACGATGA