Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc06g009280.1.1
CDS Infomation	ABC transporter B family protein (AHRD V3.3 *** G7IBR0_MEDTR)
Sequence	ATGGGTGAAGGGAATGATTTGAATGAAAATAATACAGTTCCTTTTTACAAGCTGAATGAA GCCTCATCAGAAGAACAAGATAATGCAGGAGGCAAACAGGATTCAAACATGATCAAACAA ATACAAACAGTTCCTTTTTACAAGCTCTTTTCCTTTGCGGATTCAACGGATATAGTTTTG ATGATCATTGGAACTATTGGAGCTATTGGAAATGGATTGTCAATCCCCTTCATGACTGTT CTTTTCGGAGAATTGACTGATTCTTTTGGACAAAACCAAAATAACAAAGATGTGCTTCGA CTGGTCTCTAAGATCTCCTTGAAAATGGTTTACTTAGCTGTGGCATGTGGGGTAGCTGCG TTTCTTCAGGTTGCTTGTTGGATGATATCCGGTGAAAGACAAGCTTCTCGAATAAGGAGT TTGTATCTGAAAACTATTTTACAACAAGATATTGCTTTCTATGATAACGAAACAAATACA GGAGAGGTGGTTGGGAGGATGTCTGGTGACACTGTACTTATACAAGACGCGATGGGTGAA AAGGTAGGGAAATGTGTACAGCTGATATCAACATTCATCGGGGGGTTTGCCATTGCATTT ACCCAAGGATGGCTTCTCACGTTTGTTATGTTATCGATCATTCCTCTACTTATAATATCT GGTGGTGTGATGTCCCTCATGTTATCAAGGATGGCGTCGAGTGGACAAGAAGCTTATGCC AAGGCTGCAGGGGTGGTTGAACAGACAATTGGATCCATTAGAATAGTTGCATCATTTACA GGGGAGAAGAAGGCTATAGCCGACTACAACGAGTCTTTAATCAAAGCTTATCATTCAGGT GCAAAAGAAGGGCTGGCAAGTGGATTAGGTCTTGGCTCACTTTTTGCTCTTATGTACTGT AGCTATGCTTTGGCTATTTGGTATGGTGCAAGGCTCATCTTGGAAAAAGGATATACAGGT GGTCAGGTTATCAATATAATTGTTGCTGTGTTAACTGCTTCCATGTCCCTAGGACAGGCA TCTCCGTGTATGTCTGCATTCGCTGCAGGTCAAGCAGCAGCTTTCAAGATGTTCGAAACC ATTGAGAGAAAGCCGGAGATAGATGCTTATGATACCAATGGAAAAATATTGAATGACATT CGTGGCAATATTGAATTGAATGATGTGTACTTCAGTTACCCAGCCAGACCTGATGAGAAA ATATTTGGTGGATTTTCATTATTTGTACCAAGTGGCACAACTGCAGCTTTGGTTGGGCAA AGTGGAAGTGGGAAGTCAACAGTCATAAGTCTAATAGAAAGATTTTATGATCCTCAATCT GGTCAAGTTCTGATTGATGGAATTAATCTCAAGGACTTCCAGCTTAAGTGGATCAGGGGA AAGATTGGTCTTGTGAGCCAAGAACCTGTGCTTTTCACAGCAAGCATTAAGGAAAATATT GTGTATGGAAAGTACGATGCTACTCCTGAAGAGATCAGAGCTGCAGTTAAGTTAGCAAAT GCCGCAAAGTTCTTAGATAAACTCCCACAGGGTCTAGACACCATGGTTGGAGAACATGGA ACTCAACTTTCTGGTGGGCAAAAGCAAAGAATTGCCATTGCAAGAGCAATTTTAAAAGAT CCACGAATATTACTGCTAGATGAAGCAACAAGTGCATTAGATGCAGAATCTGAGAGAGTT GTACAAGAAGCATTGGATAGAATTATGATCAACAGAACAACCGTCATAGTTGCACATCGA TTGACCACAGTTAGGAATGCTGATATGATTGCAGTCATCCATAGGGGAAAAGTTGTTGAA AAAGGCACACATTCCGAACTACTCAAGGATCCAGAGGGAGGGTACTCTCAGCTTATACGC TTACAAGAAGTGAACAAAGAAACAGAAAAATCAGGCTTAGATGAGAGGGGCAGATTACAT AAGTCTATGGAATCTGGTAGACAGTCAAGTAAAAGGATGTCACTATTACGATCTGTCAGT CGGAGTTCATCTGGTGTAGGAAATAGCAGCAGCCGTTCACTCTCCATCTCATTTTCTTTT CCTAATGGACTTAGTGTATCTGAAACAGCTAATGAAGACAGAGAAACAGGTATCCAGGAA GTATCTGGAAAGCCATTAAATGTCCCCATCAGTCGCTTAGCCTATCTCAACAAGCCTGAG GCACCTGTGATCATTATTGGAACAGTGGCTGCAATTATTAATGGTGCTATACTTCCAATT TTCGGCATCTTATTAGCTACCGTGATCAAAATATTTTATAAGCCACCAGAAGAACTTAGG AAGGACTCGAGGTTTTGGGCTGAAATGTTTGTACTTCTTGCAGCTGTAACTTTAATTGCA TTTCCTGCAAGGTCGTACCTTTTCGGTATAGCTGGTTGTAAGTTGGTAAGAAGAATTAGA TCATTGTGCTTTGAGAAGTTGGTCCACATGGAGGTAGGATGGTTTGATGAACCTGAGAAC TCCACTGGTATCATTGGCGCTAGGCTTTCTGCTGATGCAGCAGCAGTCCGTGGCTTAGTA GGAGATGCACTTGCTCAAATGGTCCAAGATAGTGCAACAGCACTTATAGGTTTAGCTATT GCTTTTGAAGCAAGTTGGCAGTTGGCACTTATCGTTCTTGTTATGATACCTCTAATTGGA TTAAGTGGATATCTCCAAATGAAATTTATGACAGGGTTCAGTGCAGATGCAAAGACAATG TATGCGGAAGCAAGTCAAGTTGCGAATGATGCTGTTGGAAGTATAAGAACTGTTGCATCA TTTTGTGCAGAAGAGAAGGTGATGGAAACATACAGAGGGAAGTGTGAAGGCCCATTGAAG GCAGGAATCAAGCAAGGTTTGATTAGCGGAATGGGCTTTGGTGTATCAAATACTTTGATG TTTTGTGTATATGCAACCAGTTTTTATGCTGGAGCTCTTCTTGTTCAGAATGGCAAAATC ACCTTTGCAGACGTTTACCGTGTTTTCTTTGCTCTGTCAACAGCAGCTATAGGAATTTCC CAGTCAAGCTCATTGGCTCCAGATTCAACCAAGGCCAAGAATGCAGCTGCTTCGATATTT GCTATTCTAGACAGAAAATCAAAAGTAGATCCAAGTGATGAGTCTGGTAAGACACTGGAG AATGTGAAGGGAGATATCGAGCTGAGGCACGTAAGCTTTAAGTATCCAACGAGGCCAGAT GTTCAAATTTTAAGAGACCTTTGCTTAACCATCCGCAGTGGACAGACGGTTGCTTTAGTT GGGGAGAGCGGATGTGGAAAGTCTACTGTAATATCTTTGCTGCAAAGGTTTTATGATCCT GATTCAGGCCAGATTTCGTTGGACGGAATAGAGATTCAGAAATTCCAGGTAAAATGGCTA AGGCAGCAAATGGGGCTTGTAAGCCAAGAGCCAGTGTTGTTCAACGACACAATTCGAGCC AATATTGCCTATGGAAAGGAAGGAAATGCAATTGAAGCAGAAGTTTTAGCAGCAGCAGAA CTAGCAAATGCCCACAAGTTCATCAGTGGTCTGCAACAGGGTTATGATACGACAGTGGGA GAGCGAGGAACTCAGCTGTCCGGTGGGCAAAAGCAACGAGTGGCTATAGCGAGGGCCATA TTGAAAAATCCAAAAATCCTACTATTAGATGAGGCTACAAGTGCATTGGATGCAGAATCA GAGCGAATAGTTCAAGATGCACTTGACAGGGTGGTGGTAAATCGTACAACCGTGGTTGTA GCACATAGATTATCTACCATCAAAGGAGCAGATGTGATTGCTGTTTTTAAAAATGGAGTT ATCGTGGAGAAAGGGAAACACGATACTCTTATCAACATCAAGGATGGCTTTTATTCCTCT TTGGTGGCTCTCCACACGCGTTCTACCTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc06g009280.1.1
PEP Infomation	ABC transporter B family protein (AHRD V3.3 *** G7IBR0_MEDTR)
Sequence	MGEGNDLNENNTVPFYKLNEASSEEQDNAGGKQDSNMIKQIQTVPFYKLFSFADSTDIVL MIIGTIGAIGNGLSIPFMTVLFGELTDSFGQNQNNKDVLRLVSKISLKMVYLAVACGVAA FLQVACWMISGERQASRIRSLYLKTILQQDIAFYDNETNTGEVVGRMSGDTVLIQDAMGE KVGKCVQLISTFIGGFAIAFTQGWLLTFVMLSIIPLLIISGGVMSLMLSRMASSGQEAYA KAAGVVEQTIGSIRIVASFTGEKKAIADYNESLIKAYHSGAKEGLASGLGLGSLFALMYC SYALAIWYGARLILEKGYTGGQVINIIVAVLTASMSLGQASPCMSAFAAGQAAAFKMFET IERKPEIDAYDTNGKILNDIRGNIELNDVYFSYPARPDEKIFGGFSLFVPSGTTAALVGQ SGSGKSTVISLIERFYDPQSGQVLIDGINLKDFQLKWIRGKIGLVSQEPVLFTASIKENI VYGKYDATPEEIRAAVKLANAAKFLDKLPQGLDTMVGEHGTQLSGGQKQRIAIARAILKD PRILLLDEATSALDAESERVVQEALDRIMINRTTVIVAHRLTTVRNADMIAVIHRGKVVE KGTHSELLKDPEGGYSQLIRLQEVNKETEKSGLDERGRLHKSMESGRQSSKRMSLLRSVS RSSSGVGNSSSRSLSISFSFPNGLSVSETANEDRETGIQEVSGKPLNVPISRLAYLNKPE APVIIIGTVAAIINGAILPIFGILLATVIKIFYKPPEELRKDSRFWAEMFVLLAAVTLIA FPARSYLFGIAGCKLVRRIRSLCFEKLVHMEVGWFDEPENSTGIIGARLSADAAAVRGLV GDALAQMVQDSATALIGLAIAFEASWQLALIVLVMIPLIGLSGYLQMKFMTGFSADAKTM YAEASQVANDAVGSIRTVASFCAEEKVMETYRGKCEGPLKAGIKQGLISGMGFGVSNTLM FCVYATSFYAGALLVQNGKITFADVYRVFFALSTAAIGISQSSSLAPDSTKAKNAAASIF AILDRKSKVDPSDESGKTLENVKGDIELRHVSFKYPTRPDVQILRDLCLTIRSGQTVALV GESGCGKSTVISLLQRFYDPDSGQISLDGIEIQKFQVKWLRQQMGLVSQEPVLFNDTIRA NIAYGKEGNAIEAEVLAAAELANAHKFISGLQQGYDTTVGERGTQLSGGQKQRVAIARAI LKNPKILLLDEATSALDAESERIVQDALDRVVVNRTTVVVAHRLSTIKGADVIAVFKNGV IVEKGKHDTLINIKDGFYSSLVALHTRST*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc06g009280.1.1
Transcript Infomation	ABC transporter B family protein (AHRD V3.3 *** G7IBR0_MEDTR)
Sequence	ATGGGTGAAGGGAATGATTTGAATGAAAATAATACAGTTCCTTTTTACAAGCTGAATGAA GCCTCATCAGAAGAACAAGATAATGCAGGAGGCAAACAGGATTCAAACATGATCAAACAA ATACAAACAGTTCCTTTTTACAAGCTCTTTTCCTTTGCGGATTCAACGGATATAGTTTTG ATGATCATTGGAACTATTGGAGCTATTGGAAATGGATTGTCAATCCCCTTCATGACTGTT CTTTTCGGAGAATTGACTGATTCTTTTGGACAAAACCAAAATAACAAAGATGTGCTTCGA CTGGTCTCTAAGATCTCCTTGAAAATGGTTTACTTAGCTGTGGCATGTGGGGTAGCTGCG TTTCTTCAGGTTGCTTGTTGGATGATATCCGGTGAAAGACAAGCTTCTCGAATAAGGAGT TTGTATCTGAAAACTATTTTACAACAAGATATTGCTTTCTATGATAACGAAACAAATACA GGAGAGGTGGTTGGGAGGATGTCTGGTGACACTGTACTTATACAAGACGCGATGGGTGAA AAGGTAGGGAAATGTGTACAGCTGATATCAACATTCATCGGGGGGTTTGCCATTGCATTT ACCCAAGGATGGCTTCTCACGTTTGTTATGTTATCGATCATTCCTCTACTTATAATATCT GGTGGTGTGATGTCCCTCATGTTATCAAGGATGGCGTCGAGTGGACAAGAAGCTTATGCC AAGGCTGCAGGGGTGGTTGAACAGACAATTGGATCCATTAGAATAGTTGCATCATTTACA GGGGAGAAGAAGGCTATAGCCGACTACAACGAGTCTTTAATCAAAGCTTATCATTCAGGT GCAAAAGAAGGGCTGGCAAGTGGATTAGGTCTTGGCTCACTTTTTGCTCTTATGTACTGT AGCTATGCTTTGGCTATTTGGTATGGTGCAAGGCTCATCTTGGAAAAAGGATATACAGGT GGTCAGGTTATCAATATAATTGTTGCTGTGTTAACTGCTTCCATGTCCCTAGGACAGGCA TCTCCGTGTATGTCTGCATTCGCTGCAGGTCAAGCAGCAGCTTTCAAGATGTTCGAAACC ATTGAGAGAAAGCCGGAGATAGATGCTTATGATACCAATGGAAAAATATTGAATGACATT CGTGGCAATATTGAATTGAATGATGTGTACTTCAGTTACCCAGCCAGACCTGATGAGAAA ATATTTGGTGGATTTTCATTATTTGTACCAAGTGGCACAACTGCAGCTTTGGTTGGGCAA AGTGGAAGTGGGAAGTCAACAGTCATAAGTCTAATAGAAAGATTTTATGATCCTCAATCT GGTCAAGTTCTGATTGATGGAATTAATCTCAAGGACTTCCAGCTTAAGTGGATCAGGGGA AAGATTGGTCTTGTGAGCCAAGAACCTGTGCTTTTCACAGCAAGCATTAAGGAAAATATT GTGTATGGAAAGTACGATGCTACTCCTGAAGAGATCAGAGCTGCAGTTAAGTTAGCAAAT GCCGCAAAGTTCTTAGATAAACTCCCACAGGGTCTAGACACCATGGTTGGAGAACATGGA ACTCAACTTTCTGGTGGGCAAAAGCAAAGAATTGCCATTGCAAGAGCAATTTTAAAAGAT CCACGAATATTACTGCTAGATGAAGCAACAAGTGCATTAGATGCAGAATCTGAGAGAGTT GTACAAGAAGCATTGGATAGAATTATGATCAACAGAACAACCGTCATAGTTGCACATCGA TTGACCACAGTTAGGAATGCTGATATGATTGCAGTCATCCATAGGGGAAAAGTTGTTGAA AAAGGCACACATTCCGAACTACTCAAGGATCCAGAGGGAGGGTACTCTCAGCTTATACGC TTACAAGAAGTGAACAAAGAAACAGAAAAATCAGGCTTAGATGAGAGGGGCAGATTACAT AAGTCTATGGAATCTGGTAGACAGTCAAGTAAAAGGATGTCACTATTACGATCTGTCAGT CGGAGTTCATCTGGTGTAGGAAATAGCAGCAGCCGTTCACTCTCCATCTCATTTTCTTTT CCTAATGGACTTAGTGTATCTGAAACAGCTAATGAAGACAGAGAAACAGGTATCCAGGAA GTATCTGGAAAGCCATTAAATGTCCCCATCAGTCGCTTAGCCTATCTCAACAAGCCTGAG GCACCTGTGATCATTATTGGAACAGTGGCTGCAATTATTAATGGTGCTATACTTCCAATT TTCGGCATCTTATTAGCTACCGTGATCAAAATATTTTATAAGCCACCAGAAGAACTTAGG AAGGACTCGAGGTTTTGGGCTGAAATGTTTGTACTTCTTGCAGCTGTAACTTTAATTGCA TTTCCTGCAAGGTCGTACCTTTTCGGTATAGCTGGTTGTAAGTTGGTAAGAAGAATTAGA TCATTGTGCTTTGAGAAGTTGGTCCACATGGAGGTAGGATGGTTTGATGAACCTGAGAAC TCCACTGGTATCATTGGCGCTAGGCTTTCTGCTGATGCAGCAGCAGTCCGTGGCTTAGTA GGAGATGCACTTGCTCAAATGGTCCAAGATAGTGCAACAGCACTTATAGGTTTAGCTATT GCTTTTGAAGCAAGTTGGCAGTTGGCACTTATCGTTCTTGTTATGATACCTCTAATTGGA TTAAGTGGATATCTCCAAATGAAATTTATGACAGGGTTCAGTGCAGATGCAAAGACAATG TATGCGGAAGCAAGTCAAGTTGCGAATGATGCTGTTGGAAGTATAAGAACTGTTGCATCA TTTTGTGCAGAAGAGAAGGTGATGGAAACATACAGAGGGAAGTGTGAAGGCCCATTGAAG GCAGGAATCAAGCAAGGTTTGATTAGCGGAATGGGCTTTGGTGTATCAAATACTTTGATG TTTTGTGTATATGCAACCAGTTTTTATGCTGGAGCTCTTCTTGTTCAGAATGGCAAAATC ACCTTTGCAGACGTTTACCGTGTTTTCTTTGCTCTGTCAACAGCAGCTATAGGAATTTCC CAGTCAAGCTCATTGGCTCCAGATTCAACCAAGGCCAAGAATGCAGCTGCTTCGATATTT GCTATTCTAGACAGAAAATCAAAAGTAGATCCAAGTGATGAGTCTGGTAAGACACTGGAG AATGTGAAGGGAGATATCGAGCTGAGGCACGTAAGCTTTAAGTATCCAACGAGGCCAGAT GTTCAAATTTTAAGAGACCTTTGCTTAACCATCCGCAGTGGACAGACGGTTGCTTTAGTT GGGGAGAGCGGATGTGGAAAGTCTACTGTAATATCTTTGCTGCAAAGGTTTTATGATCCT GATTCAGGCCAGATTTCGTTGGACGGAATAGAGATTCAGAAATTCCAGGTAAAATGGCTA AGGCAGCAAATGGGGCTTGTAAGCCAAGAGCCAGTGTTGTTCAACGACACAATTCGAGCC AATATTGCCTATGGAAAGGAAGGAAATGCAATTGAAGCAGAAGTTTTAGCAGCAGCAGAA CTAGCAAATGCCCACAAGTTCATCAGTGGTCTGCAACAGGGTTATGATACGACAGTGGGA GAGCGAGGAACTCAGCTGTCCGGTGGGCAAAAGCAACGAGTGGCTATAGCGAGGGCCATA TTGAAAAATCCAAAAATCCTACTATTAGATGAGGCTACAAGTGCATTGGATGCAGAATCA GAGCGAATAGTTCAAGATGCACTTGACAGGGTGGTGGTAAATCGTACAACCGTGGTTGTA GCACATAGATTATCTACCATCAAAGGAGCAGATGTGATTGCTGTTTTTAAAAATGGAGTT ATCGTGGAGAAAGGGAAACACGATACTCTTATCAACATCAAGGATGGCTTTTATTCCTCT TTGGTGGCTCTCCACACGCGTTCTACCTAG