Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc06g009200.3.1

CDS Infomation

Pectin lyase-like superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT3G07830.1)

Sequence

ATGGCTATTCCAAAAGGATTAGAAATCAATAATATTGTAGGATTATTCTTACTTTTGGGT
ATAGCCATTTTATCATCAAAAGTTGCAGAATGTGCACCTTTTGGTTCGCGTCGTGGCCTT
ATGGAGACAGTTTTCGATGTTACCAAGCACGGAGCTAGACCAGATCCCACTGCAGATAGC
ACTCGGGGATTTATGATGGCATGGAGAGCAGCATGTCAATCAACAGGCCCAGCAAAAGTT
GTTATTCCACCAGGAACATTTACTACAGGAGAAACTATTTTTCAAGGCCCATGTACATGT
CCAAAGCCCATTATTATTGAAATTCAAGGGACAGTATTGTCAAATACAGACATAAGTTTG
TACTCACGTGCCTCATGGATATCCCTCGAACACGTGGACGGTGTCGTTATTACAGGTGGC
GGAACTCTAAACGGACAAGGAAATGCCAGCTGGCAGTATGCTGACAAAAGCGGAAACTCT
CCTCCTCTCCCTACGTCTCTTGTATTTCAAACTGTGAAGAGTTCTTCCATCAATGGCATA
AATTTTGTGGATTCCAAAGGTGTCCATTTGAAAGTTACTGATAGTAATGACATTACAGTT
TCAAAAATCAAGATTACAGCACCAGCAACAAGTCCAAATACTGATGGAATTCATATAAGT
GAAACAATTAATATCAATGTTACTGATAGCAACATTGGGACAGGTGATGATTGCATTAGT
GTTGGACATGGTACTACCAATATTTTTGTCAATAATATTCATTGTGGCCCTGGACATGGA
ATAAGTATTGGAAGCCTTGGAAAGAGACCAGATGAGAAGGATGTTACAAAAGTTTATATA
AAAAATTGTACATTCCACAGTACAACAAATGGTGCAAGAATCAAGACTTATATGGATTCA
TCTCCACTACAAGTTTCTGATGTTGTTTATGAAGATATTGTCTTGGAGGATGTTAAAAAT
CCAATTCTTATTGATCAACACTATAATTCCAAGAACAAGGTTGAGCCATCAAAAGTGAAA
CTAAAAGATATTCACTTCAAGAACATAAGGGGGACAACAAATACAAAAGCTCCAGTATCA
CTTAATTGCAGTGAAGCAGCTCCATGTGAAGGAGTTGAATTGGCTGATATTGATATAGCT
CCATCTGGTACAACTGGACCTCTACAAGGAGCAACATGTCAAAATGCCAAGACAGTATTC
AATGGAAAAACTAATGTTCCAGCATGTAAATAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc06g009200.3.1

PEP Infomation

Pectin lyase-like superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT3G07830.1)

Sequence

MAIPKGLEINNIVGLFLLLGIAILSSKVAECAPFGSRRGLMETVFDVTKHGARPDPTADS
TRGFMMAWRAACQSTGPAKVVIPPGTFTTGETIFQGPCTCPKPIIIEIQGTVLSNTDISL
YSRASWISLEHVDGVVITGGGTLNGQGNASWQYADKSGNSPPLPTSLVFQTVKSSSINGI
NFVDSKGVHLKVTDSNDITVSKIKITAPATSPNTDGIHISETININVTDSNIGTGDDCIS
VGHGTTNIFVNNIHCGPGHGISIGSLGKRPDEKDVTKVYIKNCTFHSTTNGARIKTYMDS
SPLQVSDVVYEDIVLEDVKNPILIDQHYNSKNKVEPSKVKLKDIHFKNIRGTTNTKAPVS
LNCSEAAPCEGVELADIDIAPSGTTGPLQGATCQNAKTVFNGKTNVPACK*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc06g009200.3.1

Transcript Infomation

Pectin lyase-like superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT3G07830.1)

Sequence

TCAATTTCCTATTTAGGCCACAACCACAATGGCTATTCCAAAAGGATTAGAAATCAATAA
TATTGTAGGATTATTCTTACTTTTGGGTATAGCCATTTTATCATCAAAAGTTGCAGAATG
TGCACCTTTTGGTTCGCGTCGTGGCCTTATGGAGACAGTTTTCGATGTTACCAAGCACGG
AGCTAGACCAGATCCCACTGCAGATAGCACTCGGGGATTTATGATGGCATGGAGAGCAGC
ATGTCAATCAACAGGCCCAGCAAAAGTTGTTATTCCACCAGGAACATTTACTACAGGAGA
AACTATTTTTCAAGGCCCATGTACATGTCCAAAGCCCATTATTATTGAAATTCAAGGGAC
AGTATTGTCAAATACAGACATAAGTTTGTACTCACGTGCCTCATGGATATCCCTCGAACA
CGTGGACGGTGTCGTTATTACAGGTGGCGGAACTCTAAACGGACAAGGAAATGCCAGCTG
GCAGTATGCTGACAAAAGCGGAAACTCTCCTCCTCTCCCTACGTCTCTTGTATTTCAAAC
TGTGAAGAGTTCTTCCATCAATGGCATAAATTTTGTGGATTCCAAAGGTGTCCATTTGAA
AGTTACTGATAGTAATGACATTACAGTTTCAAAAATCAAGATTACAGCACCAGCAACAAG
TCCAAATACTGATGGAATTCATATAAGTGAAACAATTAATATCAATGTTACTGATAGCAA
CATTGGGACAGGTGATGATTGCATTAGTGTTGGACATGGTACTACCAATATTTTTGTCAA
TAATATTCATTGTGGCCCTGGACATGGAATAAGTATTGGAAGCCTTGGAAAGAGACCAGA
TGAGAAGGATGTTACAAAAGTTTATATAAAAAATTGTACATTCCACAGTACAACAAATGG
TGCAAGAATCAAGACTTATATGGATTCATCTCCACTACAAGTTTCTGATGTTGTTTATGA
AGATATTGTCTTGGAGGATGTTAAAAATCCAATTCTTATTGATCAACACTATAATTCCAA
GAACAAGGTTGAGCCATCAAAAGTGAAACTAAAAGATATTCACTTCAAGAACATAAGGGG
GACAACAAATACAAAAGCTCCAGTATCACTTAATTGCAGTGAAGCAGCTCCATGTGAAGG
AGTTGAATTGGCTGATATTGATATAGCTCCATCTGGTACAACTGGACCTCTACAAGGAGC
AACATGTCAAAATGCCAAGACAGTATTCAATGGAAAAACTAATGTTCCAGCATGTAAATA
ATTACATTACATTATTAATCAAATCATGTCCATATGAAAAAATGTGTATAAATTTCAATA
TAACCATGTAATTTTGTTTATGGTTTATTATAATATTTATTTATATTTTTTTTTTCGATG
CCTGGAAATAGAAAAAAAAGAAGAAGATAAAATTTAGCGCTTGACGCATATTAGCTAGTT
AGGGTTAGTTTCTTAGCCATAATAATGCATGTTATAAGTAGTTAGGGATACCAACCCCTA
GCTAAATACATGCATGTGTTCTTGTGTATCCACATAATTTATTTATGGTTAATTACGATG
TTTTTTCTTTTTTTCTTGGGTTTTTTGGGAAAAAAATAATTGAAATTTAGCTTGGTTCAT
ATTAGCTATAAAATTATATATAGTAAAGGTTATTTTCTAATGGAAAATATTTCATTCTTT
TCCACAAATTTCAATCTATCACCAAATAAGAAAGGTTTTAATTTTTTTTGTTAGAATTGA
GAAATTATCTAATCTTATAAGTAGACAAAGTTATTTTTTATTATTAAATAGAAGTGACAT
GAGAAAAG