Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc06g008840.3.1
CDS Infomation	BRCT domain-containing DNA repair protein, putative isoform 1 (AHRD V3.3 - A0A061ENE5_THECC)
Sequence	ATGGAAGCTAAGAATGCATACACACTTCCCTTTTATGATACTTTTAACATTGAGAGTCCT TCAAATGGAGTGGACAACCTTGATTTTCCTACAATGATCTTGGATGTCCCTGATTGTGTT GAAAATGAGGTCAGTCATATTGCAAATGAATGTGAGGAAGAGGTTGTCCTTGACAGTGAT GATGAAAGAATGCATGGTACTGAAGTCGCAAGTGTCTCAAAGTTGAGATCCTCTGATGAT ACAAGGTATAAACAGCAGCTGGGTGAGTGGAAACTCTCACCGGTTCCTAAACAAACCTAT GTGGGATGTCTACGGAGGTCAAAGAATCTATTTAAGTTTTTGGATTCAGCCAGAAGCACC TCAGATTTTGAGAAAACTGATCAACAGAAACAGTGTTCTGAGATTAATGGCAGACTATCT CTACAAATAGATAAGAGCAGTGTTAATGCAAAACCAAGAGTTGAAGAGGATTGGTGTCAG GCTGGTGAATTAACCAATGAAGAAATCTACAAGGGAAATTTGGAAACGGAAGGCTCAACT GTTTATGGTGTGAATGGAGATAAAGATTTTCCACTTCATTCTTGTAAAATAGAACTACCC AAGTTAAACAAAACTGAATCTCAAGTATCTGGAGAGCTGTCAGAAGCTAATGCTCTGGAC TTTGTTGACCACTACCTATCAGTTTACAATGAGGATGCACTCAATGAAGTCAAAGATAGA GGAGTGAATAAGATTGTATCACCTCCATTTTTCAGCCGTGTGGGATCGCAAAAATTGGCA AGCAGAATGAACGTTCAAAATGCAGTAAAAAACTCTGGAGTTTTTGACTGGCCTGAGAGG CAAAGTGATAGTGCAAATGGTTCTTTTTCAAGACACCGAAAGATATTGACCTATCACAGA AAGAATTACGGACTGAAGAAACAAAAAGTATCTTGTATTCAATCCAGTAAGGAACCAATG GAAAGTAGGACAGATTTAAATAAGGCGGAACCAAAGTTTCTCCCGGAAGCTCACATGAAT GTTGAGTCCAACTTCCTGAGGAAGTCGGATGAGCAATTTGATATGGGTACATTTGAGCAA CAAGTTGATTATGACGGAAATCGATCAGATGGATTAGACACATACGATGTTGGCCTTGAT ACTCAACTGGCTGCTGAAGCTATGGAAACTCTACTACACGCTCCTCCTTTGAAAAGTGAT CTGCTTTTGGCCCCTCCTATTCCAAAAACCAGCCTAGTTAAAGAAAGGAAATATCCTGAG ATCGCTATCTCAAGAGAGTTTAACATTGGTGATAGTTCACCAGAACCTACTTTATGTAGC TCAACTGAAGTAGAGTTGTCTTCTGTTGTTCATAGAACTAGGCATCAAGCATCTTTAAAC TTGAGGAGGTTGGAGAACCCAGCAACCAATTCCATCAGAGAGTCTAATTTTCCAAAGAAA AGAAGGAAGCAACATGAGCTTGAAGAGTTAAATGACAATTTGTTCAAAGTGGCTACTGTA AGAGGGAAAGTTTCCAAATCAAGTACTAACACATCAAGGAAATCTAGAAAAGTTAGCATG AATAATCGAGGAGAAATTTGCCTTAGTGTAGCAGCCACATTGAGTCAAGTGAAATTGGAA AATTGGGTCTCTAAGGGGAAAAGGACACATAAAGGGGTGCGACGGATTTCAAATGGATCA AGCAATCTCTATCCTCTACTGATGCCTGCTGATCAGGGAAATGACTTTAAGTTTCCAGTT TTGAATCATAAGGCAGAGAGAAAATGCCAACCTGTGGAATTTAAAAGTCAGAATCAGTCT TTACAAAAGACCCAGTCAGGACTCTTGTCAATTCAGACCGCAAGTACTAATGTTTTGACA AAAGAGATGAAATCTGACGTACTTTTAAATGGAATCTCAGATCCATCATACTGTCTTAAT GATCATAAGAAAGGCAAGCAACACATGAGAAGTCTCTCCAGATCACCCCTTTCTCAAGAG CTTATTAGATTAGGTTATGCAGAGCAATTACCTGATTTTCTGCCTAGAGGTTCACGACGA CGAAAAGGTGCAGGCGACATTTGTGTCTTGTTCAGCCAGGGCTTGGATAGCAAATTAATC AAGCAGCAGAAAAAGATTTTGGCAAGACTCGGATTTATTTCCACATCAAATTGTTCTGAT GCCACACACTTCGTCACTGACAGCTTTGTTAGAACAAAGAATATGCTAGAAGCCATTGCC TGTGGAAAACCAATTGTAACACATTTGTGGCTTGAGAGCTGTGGAAGAGCAAGCTGTTTT GTTGATGAGAAAAGTTATATCTTAAGAGATGCCAAAAAGGAAAAGGAACTCGGTTTTAGT ATGCCTGTTTCACTTGCTCATGCTAGAAAGCATCCCCTTCTAGAGGGTCAAAGAGTCATT ATTACTCCAAATGCAAAACCTAATAGAGATACCCTTCTAACCTTGGTCAAGGCAGTGCGT GGTGAGGTGGTGGACGAATGTAATAGTAAAATCACTAGTGATGATCTATTAATTCTTTCC TGTGAAGAAGATTACAAAGCATGCATTCCATATCTGGAAAAAGGAACTCTTGTTTATAGT TCGGAGCTCTTGCTTAATGGGATTGTTATCCAGAAACTGGAGTACAATAGGCATCAGCTT TTCACAAAGTTTCATGACGAAAACTGTAAAGAATGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc06g008840.3.1
PEP Infomation	BRCT domain-containing DNA repair protein, putative isoform 1 (AHRD V3.3 - A0A061ENE5_THECC)
Sequence	MEAKNAYTLPFYDTFNIESPSNGVDNLDFPTMILDVPDCVENEVSHIANECEEEVVLDSD DERMHGTEVASVSKLRSSDDTRYKQQLGEWKLSPVPKQTYVGCLRRSKNLFKFLDSARST SDFEKTDQQKQCSEINGRLSLQIDKSSVNAKPRVEEDWCQAGELTNEEIYKGNLETEGST VYGVNGDKDFPLHSCKIELPKLNKTESQVSGELSEANALDFVDHYLSVYNEDALNEVKDR GVNKIVSPPFFSRVGSQKLASRMNVQNAVKNSGVFDWPERQSDSANGSFSRHRKILTYHR KNYGLKKQKVSCIQSSKEPMESRTDLNKAEPKFLPEAHMNVESNFLRKSDEQFDMGTFEQ QVDYDGNRSDGLDTYDVGLDTQLAAEAMETLLHAPPLKSDLLLAPPIPKTSLVKERKYPE IAISREFNIGDSSPEPTLCSSTEVELSSVVHRTRHQASLNLRRLENPATNSIRESNFPKK RRKQHELEELNDNLFKVATVRGKVSKSSTNTSRKSRKVSMNNRGEICLSVAATLSQVKLE NWVSKGKRTHKGVRRISNGSSNLYPLLMPADQGNDFKFPVLNHKAERKCQPVEFKSQNQS LQKTQSGLLSIQTASTNVLTKEMKSDVLLNGISDPSYCLNDHKKGKQHMRSLSRSPLSQE LIRLGYAEQLPDFLPRGSRRRKGAGDICVLFSQGLDSKLIKQQKKILARLGFISTSNCSD ATHFVTDSFVRTKNMLEAIACGKPIVTHLWLESCGRASCFVDEKSYILRDAKKEKELGFS MPVSLAHARKHPLLEGQRVIITPNAKPNRDTLLTLVKAVRGEVVDECNSKITSDDLLILS CEEDYKACIPYLEKGTLVYSSELLLNGIVIQKLEYNRHQLFTKFHDENCKE*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc06g008840.3.1
Transcript Infomation	BRCT domain-containing DNA repair protein, putative isoform 1 (AHRD V3.3 - A0A061ENE5_THECC)
Sequence	ACTAAAAAAAACATACTTGTTAAATGAAATTTCATGTGAGGAATTTCATTACCATTTTTT ATATTATACAACTTGCTAGTTGGTGTCAAATTAAATACATAATTATTGCTATATATAAAA CGTCTACCATTGAAGAACATAGGTGGGCGTTTGGTCTAGTGGTATGATTCTCGCTTTGGG TGCGAGAGGTCCCGAGTTCGATTCTCGGAACGCCCCAAAATTATTTTTTTGTCATTTTCC ATTTACTTTTGCGGAACGCAATTAAAATTTTTTTGATCGGAATTTCTTTACGTATTTTAG GTATAAGTTGTTGTGATTTATGATACTTTTTATAATAATTTTTACATATATAGCTTGTTA TAACAAGTTTTTTGAAATAACTCTATTAAAAAAGAAGTTAATAAACCTTTCAAGAAGAAA ATGCGGCAATAAGCAAGACTAAATTATCACTCGTCAAACCAATAGAGAAAAAAAATTGCC TTTCTCCGATACTCTTTTTTTTCAATTATAGGACAAAAAGAGAAAGACAGTTGAAACTTT TAAAATCGAATTTAACCTCTTTCGATATCACAATTCACCATCAAAGTTTAAATTTTAGAA TTAATTAAAACACTCGATATTATTTTTTTCGTGCCTTAATTTTTAATCAAATTTATTAAG TACATATGTAGTAAAAAATAAATAAATATTTCCCTCCAAAAAGTTGCCGCTTAACTTTTT GTCTTCTCCATTTCTCCTCGAAAAAAAACCCAAATTCGCCATTAACAAAAACTCACAGTT CTACAGTTTACACTGTATCGGCGATTCCATAATCCTCAAGTGGAATCCATATCAATGATT TCAACTGGTTTTCTGTAATCGCATATTATTCAGGAAAAGTTAACAAAATTAGATTTTGGT TGAGGTTGGTCAAAGGCATTGCTCCCTGAATGATAGGCTAGGGATTTCAAATGGGTTGGC TATGAGCTATTAAGAGAGCAAGTTAAAAACGGACAGAATCAGAGTAGAATGGAAGCTAAG AATGCATACACACTTCCCTTTTATGATACTTTTAACATTGAGAGTCCTTCAAATGGAGTG GACAACCTTGATTTTCCTACAATGATCTTGGATGTCCCTGATTGTGTTGAAAATGAGGTC AGTCATATTGCAAATGAATGTGAGGAAGAGGTTGTCCTTGACAGTGATGATGAAAGAATG CATGGTACTGAAGTCGCAAGTGTCTCAAAGTTGAGATCCTCTGATGATACAAGGTATAAA CAGCAGCTGGGTGAGTGGAAACTCTCACCGGTTCCTAAACAAACCTATGTGGGATGTCTA CGGAGGTCAAAGAATCTATTTAAGTTTTTGGATTCAGCCAGAAGCACCTCAGATTTTGAG AAAACTGATCAACAGAAACAGTGTTCTGAGATTAATGGCAGACTATCTCTACAAATAGAT AAGAGCAGTGTTAATGCAAAACCAAGAGTTGAAGAGGATTGGTGTCAGGCTGGTGAATTA ACCAATGAAGAAATCTACAAGGGAAATTTGGAAACGGAAGGCTCAACTGTTTATGGTGTG AATGGAGATAAAGATTTTCCACTTCATTCTTGTAAAATAGAACTACCCAAGTTAAACAAA ACTGAATCTCAAGTATCTGGAGAGCTGTCAGAAGCTAATGCTCTGGACTTTGTTGACCAC TACCTATCAGTTTACAATGAGGATGCACTCAATGAAGTCAAAGATAGAGGAGTGAATAAG ATTGTATCACCTCCATTTTTCAGCCGTGTGGGATCGCAAAAATTGGCAAGCAGAATGAAC GTTCAAAATGCAGTAAAAAACTCTGGAGTTTTTGACTGGCCTGAGAGGCAAAGTGATAGT GCAAATGGTTCTTTTTCAAGACACCGAAAGATATTGACCTATCACAGAAAGAATTACGGA CTGAAGAAACAAAAAGTATCTTGTATTCAATCCAGTAAGGAACCAATGGAAAGTAGGACA GATTTAAATAAGGCGGAACCAAAGTTTCTCCCGGAAGCTCACATGAATGTTGAGTCCAAC TTCCTGAGGAAGTCGGATGAGCAATTTGATATGGGTACATTTGAGCAACAAGTTGATTAT GACGGAAATCGATCAGATGGATTAGACACATACGATGTTGGCCTTGATACTCAACTGGCT GCTGAAGCTATGGAAACTCTACTACACGCTCCTCCTTTGAAAAGTGATCTGCTTTTGGCC CCTCCTATTCCAAAAACCAGCCTAGTTAAAGAAAGGAAATATCCTGAGATCGCTATCTCA AGAGAGTTTAACATTGGTGATAGTTCACCAGAACCTACTTTATGTAGCTCAACTGAAGTA GAGTTGTCTTCTGTTGTTCATAGAACTAGGCATCAAGCATCTTTAAACTTGAGGAGGTTG GAGAACCCAGCAACCAATTCCATCAGAGAGTCTAATTTTCCAAAGAAAAGAAGGAAGCAA CATGAGCTTGAAGAGTTAAATGACAATTTGTTCAAAGTGGCTACTGTAAGAGGGAAAGTT TCCAAATCAAGTACTAACACATCAAGGAAATCTAGAAAAGTTAGCATGAATAATCGAGGA GAAATTTGCCTTAGTGTAGCAGCCACATTGAGTCAAGTGAAATTGGAAAATTGGGTCTCT AAGGGGAAAAGGACACATAAAGGGGTGCGACGGATTTCAAATGGATCAAGCAATCTCTAT CCTCTACTGATGCCTGCTGATCAGGGAAATGACTTTAAGTTTCCAGTTTTGAATCATAAG GCAGAGAGAAAATGCCAACCTGTGGAATTTAAAAGTCAGAATCAGTCTTTACAAAAGACC CAGTCAGGACTCTTGTCAATTCAGACCGCAAGTACTAATGTTTTGACAAAAGAGATGAAA TCTGACGTACTTTTAAATGGAATCTCAGATCCATCATACTGTCTTAATGATCATAAGAAA GGCAAGCAACACATGAGAAGTCTCTCCAGATCACCCCTTTCTCAAGAGCTTATTAGATTA GGTTATGCAGAGCAATTACCTGATTTTCTGCCTAGAGGTTCACGACGACGAAAAGGTGCA GGCGACATTTGTGTCTTGTTCAGCCAGGGCTTGGATAGCAAATTAATCAAGCAGCAGAAA AAGATTTTGGCAAGACTCGGATTTATTTCCACATCAAATTGTTCTGATGCCACACACTTC GTCACTGACAGCTTTGTTAGAACAAAGAATATGCTAGAAGCCATTGCCTGTGGAAAACCA ATTGTAACACATTTGTGGCTTGAGAGCTGTGGAAGAGCAAGCTGTTTTGTTGATGAGAAA AGTTATATCTTAAGAGATGCCAAAAAGGAAAAGGAACTCGGTTTTAGTATGCCTGTTTCA CTTGCTCATGCTAGAAAGCATCCCCTTCTAGAGGGTCAAAGAGTCATTATTACTCCAAAT GCAAAACCTAATAGAGATACCCTTCTAACCTTGGTCAAGGCAGTGCGTGGTGAGGTGGTG GACGAATGTAATAGTAAAATCACTAGTGATGATCTATTAATTCTTTCCTGTGAAGAAGAT TACAAAGCATGCATTCCATATCTGGAAAAAGGAACTCTTGTTTATAGTTCGGAGCTCTTG CTTAATGGGATTGTTATCCAGAAACTGGAGTACAATAGGCATCAGCTTTTCACAAAGTTT CATGACGAAAACTGTAAAGAATGAAAATCTCTCCAGCTTTTTCACGAAGAAAGCTTCGTG CCCAACTGCTTGTGGATCGGTTTAAAATTGCTACTAGTCCAAGTAACAGATGATGATATC ATTGTGTTACTAGATACTCGAAAGTTTAGCTGGACAGAGGTATTGTATCATATTGGTATA GTAACTAATTTTTCATAGTTTGTCCAGAAAAGGTTCTGTTATCTATTCCCATGTAAATTC ACTTCGTTTGCTAATTTTTGAACAAATATAAATTCTCAATTTTCTTTTTTGTTTTGGATT CGTTGAGAAAACAGCTATGGAATATTTTACTGAGGAAATTACCCAACTCACAACATCCCA GAATAAGAAGATATCCTCTCTTTTGTAGGATTTAATAATTAAAAAAAAAACAATTTAAGT TATTTTTACTGATGGTGTAAATAATTTATAACAATATCAATGCATTTTAACTTTTTATAA AAGGTTGCTTTATCTTTCTAAAACATTTGTATAGAGGATTACATATATTTATCTTTTAAA AAATTTATTAGTTTATCATAGAATTTATATACACTTTTATAAAAACAAGAAAATTAGCCC AATTAAGCTCTATTCGTGTTATTTTCAGGTCTTTTTATGAAGTAGTGATTTGTGTCACTA ATAGTAAAATGAAAATATTGAAACTGAAACTAACTATATGTCATTCTTTTAAGATATATT TTTTTTTTCAAAATAAGATACATACATTGAAACGAAAGTAGTATATAATAGTACTATACA TTTTTATTTTTATTTTATTTTATTTTGTAAAAAAAAGAGATTTTAAACTATATATTAGTC TAACATATTCCACAACAACAATCATCCTAATTTGTATTTTGTAAAAAAATTTAGTCTATA TATAAGTACTGATTAATACATTGAACATGCATCAATAATAACTATATATATTATTACTTA AATACACAACTTAATTTTACCATATTTAAAAAAAAAAATT