Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc06g008190.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9SVN3_RICCO)

Sequence

ATGTATAAAGCTCTTGGTAAGCATAGACTCATATATCGTACTCGCATTTCAAGTTACGTG
AAAACTGGTTTGGTAAACGAAGCACTCCAAGTGTTTGACGAAATGACTCAATCAGATTGT
AGAGTTTTCAGCATTGATTACAATAGAATCATTGGTGTTTTGATTCGTACTTCGCATTTT
GATTTAGCGGAGGGGTATTATAATGAGATGAAACCAGTTGGGTTTTCTTTAAATTCATTG
ACATATTCAAAATTTATTTGTGGGTTGTGTAAAGTTAAGAACTTTGATCTTATTAGTAGG
TTATTAAATGATATGGATAGGGTTGGGATTGTACCCAACTTTTGGGCATATAATATGTAC
TTAAATCTTTTGTGTAGTGAAAATTTGGTGGATATTGCTTTGGAGTTGATTAGAGTAATG
GGAGAGAAAGGGAGAGAGCCAGATGTAGTGAGTTATACTATTGTTATTAGTGGGTTGTGT
AGGATTGGACGTTTCGATAATGCTGTTGAAATGTGGCATACGATGATTAGGAAAGGTTTA
AGACCGGACAATAAGGCTTGTAAAGCTCTTGTTTTTGGGCTGTGTGGGAGTGGTAAGGTT
GATTTGGCTTATGAGCTGACTTTGGGTATTCTAAGGGGTCAAGTCAAATTCAACACGGAA
ATATACAATACGCTGATAAATGGATTTTGTCGAGCTGGTAGGATTGACAAAGCACAAGCA
ATTAAGACATTCATGAAGAGAAACGGGTGTGAACCAGATTTGGTTACTTATAATGTGTTC
TTGAATTATTGTTGTAACGAGCTTATGTTGGAAGAGGCGATGAAGTTGATCGAGAAGATG
GAAGGAATTGGGTTGGAACCTGATGGTTACAGCTATAACCAGCTTCTCAGAGGTTTCTGC
AAAGCGAATAGATTAGATAAGGCTTATAAGTTAATGGTTGACAAGATGGAAACCAAAGGA
TTAGTAGATGTTGTATCTTACAATACTATTATTAGAGCACTCTGCAAGACAGACCAAAGT
AAGAAGGCATACATTCTCTTCAAGGAGATGGAGCAAAAAAAAATTCTCCCTGACGTTGTA
ACTTTTACGATTCTTATAGAAGCTTCTCTAAAAGAAGGCAATTCTAGTGTAGCTAAGGCA
CTTGTTGATCAGATGACCAGCATGGGCCTTTTTCCTGATCGTGTACTGTACACTTCTATT
ATAGATAACCTGTGCAAGACAGGTAAATTAGGGGTGGCTGAGAGCATTTTCCGTGATATG
GTGGAACAGGGTGTTGCTCCTGATGTTATTTCGTATAATGCACTAATCAGTGGATTTTGC
AAGGCTTCTAGAGTAACAGAAGCACTGAGTCTTTATGAAGATATGCAAACCAGAGGTTTA
AATCCTGATGAAATCACCTTCAAATTGATTATTGGAGGTCTCATACAGGGGAAGAACCTC
TCAGTGGCTTGTGCAATCTGGGATCAGATGATGGAAAAGGGTTTTACTCTTGACCGAGAT
TTATCTCAGACTCTTATTAATGCAATCAACCCATAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc06g008190.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9SVN3_RICCO)

Sequence

MYKALGKHRLIYRTRISSYVKTGLVNEALQVFDEMTQSDCRVFSIDYNRIIGVLIRTSHF
DLAEGYYNEMKPVGFSLNSLTYSKFICGLCKVKNFDLISRLLNDMDRVGIVPNFWAYNMY
LNLLCSENLVDIALELIRVMGEKGREPDVVSYTIVISGLCRIGRFDNAVEMWHTMIRKGL
RPDNKACKALVFGLCGSGKVDLAYELTLGILRGQVKFNTEIYNTLINGFCRAGRIDKAQA
IKTFMKRNGCEPDLVTYNVFLNYCCNELMLEEAMKLIEKMEGIGLEPDGYSYNQLLRGFC
KANRLDKAYKLMVDKMETKGLVDVVSYNTIIRALCKTDQSKKAYILFKEMEQKKILPDVV
TFTILIEASLKEGNSSVAKALVDQMTSMGLFPDRVLYTSIIDNLCKTGKLGVAESIFRDM
VEQGVAPDVISYNALISGFCKASRVTEALSLYEDMQTRGLNPDEITFKLIIGGLIQGKNL
SVACAIWDQMMEKGFTLDRDLSQTLINAINP*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc06g008190.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9SVN3_RICCO)

Sequence

ATGTATAAAGCTCTTGGTAAGCATAGACTCATATATCGTACTCGCATTTCAAGTTACGTG
AAAACTGGTTTGGTAAACGAAGCACTCCAAGTGTTTGACGAAATGACTCAATCAGATTGT
AGAGTTTTCAGCATTGATTACAATAGAATCATTGGTGTTTTGATTCGTACTTCGCATTTT
GATTTAGCGGAGGGGTATTATAATGAGATGAAACCAGTTGGGTTTTCTTTAAATTCATTG
ACATATTCAAAATTTATTTGTGGGTTGTGTAAAGTTAAGAACTTTGATCTTATTAGTAGG
TTATTAAATGATATGGATAGGGTTGGGATTGTACCCAACTTTTGGGCATATAATATGTAC
TTAAATCTTTTGTGTAGTGAAAATTTGGTGGATATTGCTTTGGAGTTGATTAGAGTAATG
GGAGAGAAAGGGAGAGAGCCAGATGTAGTGAGTTATACTATTGTTATTAGTGGGTTGTGT
AGGATTGGACGTTTCGATAATGCTGTTGAAATGTGGCATACGATGATTAGGAAAGGTTTA
AGACCGGACAATAAGGCTTGTAAAGCTCTTGTTTTTGGGCTGTGTGGGAGTGGTAAGGTT
GATTTGGCTTATGAGCTGACTTTGGGTATTCTAAGGGGTCAAGTCAAATTCAACACGGAA
ATATACAATACGCTGATAAATGGATTTTGTCGAGCTGGTAGGATTGACAAAGCACAAGCA
ATTAAGACATTCATGAAGAGAAACGGGTGTGAACCAGATTTGGTTACTTATAATGTGTTC
TTGAATTATTGTTGTAACGAGCTTATGTTGGAAGAGGCGATGAAGTTGATCGAGAAGATG
GAAGGAATTGGGTTGGAACCTGATGGTTACAGCTATAACCAGCTTCTCAGAGGTTTCTGC
AAAGCGAATAGATTAGATAAGGCTTATAAGTTAATGGTTGACAAGATGGAAACCAAAGGA
TTAGTAGATGTTGTATCTTACAATACTATTATTAGAGCACTCTGCAAGACAGACCAAAGT
AAGAAGGCATACATTCTCTTCAAGGAGATGGAGCAAAAAAAAATTCTCCCTGACGTTGTA
ACTTTTACGATTCTTATAGAAGCTTCTCTAAAAGAAGGCAATTCTAGTGTAGCTAAGGCA
CTTGTTGATCAGATGACCAGCATGGGCCTTTTTCCTGATCGTGTACTGTACACTTCTATT
ATAGATAACCTGTGCAAGACAGGTAAATTAGGGGTGGCTGAGAGCATTTTCCGTGATATG
GTGGAACAGGGTGTTGCTCCTGATGTTATTTCGTATAATGCACTAATCAGTGGATTTTGC
AAGGCTTCTAGAGTAACAGAAGCACTGAGTCTTTATGAAGATATGCAAACCAGAGGTTTA
AATCCTGATGAAATCACCTTCAAATTGATTATTGGAGGTCTCATACAGGGGAAGAACCTC
TCAGTGGCTTGTGCAATCTGGGATCAGATGATGGAAAAGGGTTTTACTCTTGACCGAGAT
TTATCTCAGACTCTTATTAATGCAATCAACCCATAG