Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc05g054080.3.1

CDS Infomation

E3 ubiquitin-protein ligase-like protein (AHRD V3.3 *** A0A1B1LUK2_VITPS)

Sequence

ATGACCGGAGTTAATCCTAAACGGAAGCTTGAAGATTATGCTGCCGACGAAGACGCTGTT
TCATCGGAGCTATACTTAGTACACTCCGCCGTCAGGATGAGAAAAGACCAATTTGTCCTT
ACCTCTTTCACCGATTCTGCTCCACGTCATCATCAGAACAACAGCTCTGACTCAGCTTCA
TCATCGCTGCAACAGCTTCCGTCATCGTCATCTTCATCTTCATCGTCGGTGTTCACTCAG
TCAACTAGGTTTCCGGGTCGTCTTCAGTTTTTTGTCAGGTTATTATCCCGCGGGAATACT
TTGGTGCTTCAAGCTGAGTCTACTGACTCAGTAAAATCAATTCATGAGAAAATCCAGTTC
ATTACCGGAATGCCCATAACTGAGCAGAGATTAATATACAGAGGGAAGCAGCTACAATGG
GAGCAAACGTTAGCAGGCTGCGATATTCAAAATGATGCTGGATTGCAATTGGTTGGACGA
ATGCGGAGCACAGGGCATCCACAAGCATGGCAGCTGATAAATGACTTGGTTTCTCAGATA
TTTGATCTGTGTAAGAGTGGTAATCCTCGTCCTTCGAATCGTATAAAGACTAGACTGATT
GAGTTTCTTACTATGACACCGCGAAATGCTACTGAAAAATCTGCCGAGCACCTTCAGATT
TTTCTCTCTTCGTGCGCCCCGGCAGCTTTGGTAATGCTCTATATGTCTCAAGCTAAAGTG
AACAAGGATACTGCTGATGAATCGATTCGTCAATTTATTAATTCGAGTAAGACTGTTTTG
CCTAATCCTATATATACGCAATGTGCTCCTATAATTTTAGAATTCTGTAAGTTGCTTAGG
GCGTCTGCTGGTGTTGATGATTCTTTATATGGTGTTTGTCGGAGTAGTTTAGGGGGTATT
GTAGAGTCTGTTGGGGTTCTAAGTTGGGAGAGTAAGAAGACTGATGGTAAAGATGTAATG
GAATTGCAAGACATTTTCCCATTTGTTCGCGAACTAGCAGCTAAGTTATCACAGGCTTTA
GAATCAAGTGTGGGATCAGACATGGTAATGGGGCCTTCTTCGAGTGATGTGCGTGATTTT
ACTGCATTTATAGGTCCTATTATGAATTTGATCGGGGATCATGTAGCGATTTGCAGTCCA
ATCGCTTTTCCGTTGCAGGAGGAAGGCACCAGTGAGGAGGAAAGCAAAAGATTTGAGATG
TTGTATTACAGACAGCAGATTAAATGTTTGCATGATATTTACTTTGATTTGCTTGAGAAA
TTAGAGCTATGTCTAAAGAAAATGGAAGAATCTTTAGCATTGAAAGAGAAAGGAGAAGGT
GAGCCTCTTGTATCCGGGTGGTCCCAGTACTTTGCAATTCTGAAGGAGATAAATGCTATA
TCAAAACTTTATAAGGGCTCAGAGGATGAATTTTGGAATAGAATGAGGCATAGAAAAGTT
TCATTGTGTTTTCTGATTATGAGATTTGCTAAACGATCTGAAGATCATCGGTGGATTTTG
GAGCACAAGGAAGTGACTAATTTTGAGGTGAGGAGGTATCTAGCCATGATGATGCTTCCA
GAAGTGAAGGACGAGTACGAGGAGCTTCACGAGATGCTCATTGACCGCGCTCAGTTGCTC
TCAGAATCTTTTGAGTACATTGCACATGCAGATCCTGAGTCATTACGTGGTGGTTTGTTT
ATGGAGTTCAAGAGTGAAGAAGCTACGGGGCCTGGCGTCTTGAGGGAGTGGTTTTTCTTG
GTATGTCGAGCAATCTTCAACCCTCAGAACGCACTGTTTGTTGCTTGTCCAAATGACCGC
AGAAGGTTCTTTCCAAATCCAGCGTCGAAGGTGGACCCGTTGCACCTTGAGTATTTTAGC
TTCTCTGGCAGGGTAATTGCTTTGGCCTTAATGCATAAAATACAAGTTGGCATTGTCTTT
GACCGCGTGTTCTTCTTACAATTGTCGGGCAAGAGTATTTCCTTGGATGACATAAGGGAT
GCAGATCCATTCTTGTACAGCAGCTGCAGGCAGATATTGGAGATGGATCCGGAGATGGTA
GATCAAGATACTCTTGGTTTGACATTTGTTCGTGAAGTAGAAGAGTTAGGATCCAGGAAG
GTTGTCGAGCTGTGCCCTAATGGGAAAAGTACCATGGTGAATAGTAAAAATAGGAAGCAG
TATGTTGAGCTTCTTATTCAGCACCGCTTTGTCACATCCATTGCTGAGCAGGTAGCTCAT
TTTGCTCAAGGTTTTGCTGACATTATAACCTCCGTAAGGCTCCAGAAATCCTTTTTCCAG
AGCTTAAATCTTGAAGATCTTGATTGGATGCTCCACGGGAGTGAAACTGCTGTTTCTGTG
GAAGACTGGAAAGCACATACTGATTATAATGGCTATAAAGAAAGTGATCCTCAAATATCT
TGGTTTTGGAAGATTGTTGGGTGCATGACAGCTGAGCAGAGAAAGGTTCTCCTCTTCTTT
TGGACTTCAATAAAGTATCTTCCCGTCGAGGGTTTTGGAGGTTTGGCCTCTAGGCTTTAC
ATCTACAAAACCAGAGAGTCAAATGATCGTTTGCCTTCTTCACACACGTGCTTCTTCCGC
CTATGCTTTCCTCCTTATCCATCCATGGATGCCATGCAAGATCGACTTCACATTATCACC
CAAGAGCATGTAGGTTGCAGCTTTGGTACGTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc05g054080.3.1

PEP Infomation

E3 ubiquitin-protein ligase-like protein (AHRD V3.3 *** A0A1B1LUK2_VITPS)

Sequence

MTGVNPKRKLEDYAADEDAVSSELYLVHSAVRMRKDQFVLTSFTDSAPRHHQNNSSDSAS
SSLQQLPSSSSSSSSSVFTQSTRFPGRLQFFVRLLSRGNTLVLQAESTDSVKSIHEKIQF
ITGMPITEQRLIYRGKQLQWEQTLAGCDIQNDAGLQLVGRMRSTGHPQAWQLINDLVSQI
FDLCKSGNPRPSNRIKTRLIEFLTMTPRNATEKSAEHLQIFLSSCAPAALVMLYMSQAKV
NKDTADESIRQFINSSKTVLPNPIYTQCAPIILEFCKLLRASAGVDDSLYGVCRSSLGGI
VESVGVLSWESKKTDGKDVMELQDIFPFVRELAAKLSQALESSVGSDMVMGPSSSDVRDF
TAFIGPIMNLIGDHVAICSPIAFPLQEEGTSEEESKRFEMLYYRQQIKCLHDIYFDLLEK
LELCLKKMEESLALKEKGEGEPLVSGWSQYFAILKEINAISKLYKGSEDEFWNRMRHRKV
SLCFLIMRFAKRSEDHRWILEHKEVTNFEVRRYLAMMMLPEVKDEYEELHEMLIDRAQLL
SESFEYIAHADPESLRGGLFMEFKSEEATGPGVLREWFFLVCRAIFNPQNALFVACPNDR
RRFFPNPASKVDPLHLEYFSFSGRVIALALMHKIQVGIVFDRVFFLQLSGKSISLDDIRD
ADPFLYSSCRQILEMDPEMVDQDTLGLTFVREVEELGSRKVVELCPNGKSTMVNSKNRKQ
YVELLIQHRFVTSIAEQVAHFAQGFADIITSVRLQKSFFQSLNLEDLDWMLHGSETAVSV
EDWKAHTDYNGYKESDPQISWFWKIVGCMTAEQRKVLLFFWTSIKYLPVEGFGGLASRLY
IYKTRESNDRLPSSHTCFFRLCFPPYPSMDAMQDRLHIITQEHVGCSFGTW*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc05g054080.3.1

Transcript Infomation

E3 ubiquitin-protein ligase-like protein (AHRD V3.3 *** A0A1B1LUK2_VITPS)

Sequence

TCTCTCTCTACACTTTCTCTCTCCTCTTCATCTTCTTCGTTCTTCGTGTTGTTGTTTTCA
GTTTTGATTGAGGGAAATTTTGAACTCAGCAGAAAAAATTAGTGGGTGTAGTTTTTTTTT
TGGTGGATTTTGGTGTTATGATTCTTCTATGGAGTAAAACCCCGGAATTTCAATGACCGG
AGTTAATCCTAAACGGAAGCTTGAAGATTATGCTGCCGACGAAGACGCTGTTTCATCGGA
GCTATACTTAGTACACTCCGCCGTCAGGATGAGAAAAGACCAATTTGTCCTTACCTCTTT
CACCGATTCTGCTCCACGTCATCATCAGAACAACAGCTCTGACTCAGCTTCATCATCGCT
GCAACAGCTTCCGTCATCGTCATCTTCATCTTCATCGTCGGTGTTCACTCAGTCAACTAG
GTTTCCGGGTCGTCTTCAGTTTTTTGTCAGGTTATTATCCCGCGGGAATACTTTGGTGCT
TCAAGCTGAGTCTACTGACTCAGTAAAATCAATTCATGAGAAAATCCAGTTCATTACCGG
AATGCCCATAACTGAGCAGAGATTAATATACAGAGGGAAGCAGCTACAATGGGAGCAAAC
GTTAGCAGGCTGCGATATTCAAAATGATGCTGGATTGCAATTGGTTGGACGAATGCGGAG
CACAGGGCATCCACAAGCATGGCAGCTGATAAATGACTTGGTTTCTCAGATATTTGATCT
GTGTAAGAGTGGTAATCCTCGTCCTTCGAATCGTATAAAGACTAGACTGATTGAGTTTCT
TACTATGACACCGCGAAATGCTACTGAAAAATCTGCCGAGCACCTTCAGATTTTTCTCTC
TTCGTGCGCCCCGGCAGCTTTGGTAATGCTCTATATGTCTCAAGCTAAAGTGAACAAGGA
TACTGCTGATGAATCGATTCGTCAATTTATTAATTCGAGTAAGACTGTTTTGCCTAATCC
TATATATACGCAATGTGCTCCTATAATTTTAGAATTCTGTAAGTTGCTTAGGGCGTCTGC
TGGTGTTGATGATTCTTTATATGGTGTTTGTCGGAGTAGTTTAGGGGGTATTGTAGAGTC
TGTTGGGGTTCTAAGTTGGGAGAGTAAGAAGACTGATGGTAAAGATGTAATGGAATTGCA
AGACATTTTCCCATTTGTTCGCGAACTAGCAGCTAAGTTATCACAGGCTTTAGAATCAAG
TGTGGGATCAGACATGGTAATGGGGCCTTCTTCGAGTGATGTGCGTGATTTTACTGCATT
TATAGGTCCTATTATGAATTTGATCGGGGATCATGTAGCGATTTGCAGTCCAATCGCTTT
TCCGTTGCAGGAGGAAGGCACCAGTGAGGAGGAAAGCAAAAGATTTGAGATGTTGTATTA
CAGACAGCAGATTAAATGTTTGCATGATATTTACTTTGATTTGCTTGAGAAATTAGAGCT
ATGTCTAAAGAAAATGGAAGAATCTTTAGCATTGAAAGAGAAAGGAGAAGGTGAGCCTCT
TGTATCCGGGTGGTCCCAGTACTTTGCAATTCTGAAGGAGATAAATGCTATATCAAAACT
TTATAAGGGCTCAGAGGATGAATTTTGGAATAGAATGAGGCATAGAAAAGTTTCATTGTG
TTTTCTGATTATGAGATTTGCTAAACGATCTGAAGATCATCGGTGGATTTTGGAGCACAA
GGAAGTGACTAATTTTGAGGTGAGGAGGTATCTAGCCATGATGATGCTTCCAGAAGTGAA
GGACGAGTACGAGGAGCTTCACGAGATGCTCATTGACCGCGCTCAGTTGCTCTCAGAATC
TTTTGAGTACATTGCACATGCAGATCCTGAGTCATTACGTGGTGGTTTGTTTATGGAGTT
CAAGAGTGAAGAAGCTACGGGGCCTGGCGTCTTGAGGGAGTGGTTTTTCTTGGTATGTCG
AGCAATCTTCAACCCTCAGAACGCACTGTTTGTTGCTTGTCCAAATGACCGCAGAAGGTT
CTTTCCAAATCCAGCGTCGAAGGTGGACCCGTTGCACCTTGAGTATTTTAGCTTCTCTGG
CAGGGTAATTGCTTTGGCCTTAATGCATAAAATACAAGTTGGCATTGTCTTTGACCGCGT
GTTCTTCTTACAATTGTCGGGCAAGAGTATTTCCTTGGATGACATAAGGGATGCAGATCC
ATTCTTGTACAGCAGCTGCAGGCAGATATTGGAGATGGATCCGGAGATGGTAGATCAAGA
TACTCTTGGTTTGACATTTGTTCGTGAAGTAGAAGAGTTAGGATCCAGGAAGGTTGTCGA
GCTGTGCCCTAATGGGAAAAGTACCATGGTGAATAGTAAAAATAGGAAGCAGTATGTTGA
GCTTCTTATTCAGCACCGCTTTGTCACATCCATTGCTGAGCAGGTAGCTCATTTTGCTCA
AGGTTTTGCTGACATTATAACCTCCGTAAGGCTCCAGAAATCCTTTTTCCAGAGCTTAAA
TCTTGAAGATCTTGATTGGATGCTCCACGGGAGTGAAACTGCTGTTTCTGTGGAAGACTG
GAAAGCACATACTGATTATAATGGCTATAAAGAAAGTGATCCTCAAATATCTTGGTTTTG
GAAGATTGTTGGGTGCATGACAGCTGAGCAGAGAAAGGTTCTCCTCTTCTTTTGGACTTC
AATAAAGTATCTTCCCGTCGAGGGTTTTGGAGGTTTGGCCTCTAGGCTTTACATCTACAA
AACCAGAGAGTCAAATGATCGTTTGCCTTCTTCACACACGTGCTTCTTCCGCCTATGCTT
TCCTCCTTATCCATCCATGGATGCCATGCAAGATCGACTTCACATTATCACCCAAGAGCA
TGTAGGTTGCAGCTTTGGTACGTGGTAACATCATCGATCTTTTTGGACCTGAATCAGACT
GCACATAAGTTATGTAATCAACTTGTACATATGTATAGCGTATGCTCCTATCTGGAACTT
GACTTTGGTAAGTTTTTTTCTAGTTGGTTTAAATGGTGGAAGGTTGTAGTTTATTCTCAC
CTTAATTTAACTTTTATACAGGTATAATATCTGTTAATAAAAAAAATGTAAGAAGGGTCA
AGTTTTTTCTTTTAACTTGTAGTTATATTTCTTCATGTGTGTGTGTTGTTTATATCTGTA
AAGCTTAGTTCTTTTTTTCAATCTTTGTCATGCTAAAAACAGCATGCCTTGGGAAGTGAT
TGTAATATTGCCCTCTCCTTTTATTTAGATAACAAATGTACTATATTTGTATTGTGAGTA
CAGATTTGATTGGCATTTCACTTCTTTTATGGTTAGAATCATCA