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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc05g053830.3.1

CDS Infomation

Protein transport protein sec23, putative (AHRD V3.3 *** B9RRN0_RICCO)

Sequence

ATGGCGACAGAGATGGCACAACCTGATGCTGAAGGGATCGATGGAGTTCGTATGACATGG
AATGCTTGGCCTAGGACGAAAGTTGAAGCTAGCAAGTGCGTTATCCCAATTGCTTCATCG
ATCCATCTGATCCGTCCTCATACTGATCTTCCTACACTTCCTTATGTACCTCTCCGATGT
AAAACATGTACCGCTGTTCTCAACCCTTTTGCTCGTGTTGATTTCCAAGCCTTAATCTGG
ATCTGCCCTTTTTGTTTCCAGCGTAACCATTTCCCTCAACATTATTCCGGTATATCTGAA
ACTAATGTACCTGGAGAGCTTTACCCTCAATTCACTACGATTCAATATACGCTTCCTTCT
CAAACCCCACAGAGTTTTAATCCTAACCCACAAAACCCTTTACCGGAATCTTCTGTTTCA
CCGATTTATTTGTTTGTTTTGGATACTTGTATGTTGGAAGAGGAGTTGGAGTTTGCCAAA
TCGGCCTTGAAAAGGGCGATTGATATGTTGCCGGATAATGCTATGGTGGGGTTTATATCA
TATGGGACGCAGGTTCAGGTGCATGAGTTGGGGTTTGCAGATATGTCTAAGGTGTATGTT
TTTCGGGGATCGAAGGAGTTGTCAAAAGATCAAGTTTTGGATCAATTGGGGCTTGGTACT
GCGGGTGGAAGACGGACCGGTGGTGCCCCCGGGATGCAGAAGGGTGGTGGACCAACTGGG
GTTCCTAATCTTGGTGTTGCTAGATTTTTATTGCCTGCTTCGGAGTGTGAATATACCTTG
AATTCTTTGTTAGATGAATTGAGCACGGATCAATGGCCAGTCCCACAGGGGAATAGAGCA
TTACGTTGCACTGGTGTTGCTTTGAGTGTAGCAGCTGGATTGCTTGGAGCTTGTGTGGCT
GGTACTGGTGCTCGGATCATGGCCTTAGTGGGCGGTCCATGCACAGAGGGACCTGGGACG
ATTGTGTCGAAAGATCTATCTGAACCAGTTCGTTCTCATAAGGATCTTCACAAGGATGCA
GCACCTTTTTTCAAGAAGGCTGTCCATTTCTATGAGGAACTCGCAAAACAGCTTGTTAGT
CAAGGTCACGTCTTGGATGTGTTTGCTTCAGCACTTGATCAGGTTGGGGTTGCTGAGATG
AAAGTTTCTATTGAAAAAACAGGAGGATTAGTTGTTCTAGCTGAAAGCTTTGGTCATTCT
GTTTTCAAAGATTCTTTCAAGCAAATCTTTGAAGATGGTGAACAGTCTCTTGGGCTGTCC
TTCAATGGTACATTAGAGATCAACTGCTCCAAGGATATTAAAATTCAAGGGATAATTGGA
CCATGCACATCTTTAGATAAGAAAGGACCTGCTGTTTCCAGCACGGTCACCGGTGAGGGG
AATACTACAGCTTGGAAGCTGTGTGGTCTCGACAAAAACACTTGCTTAACTGTTTTCTTT
GATGTTTCATCTAGCGAAAAATCAGACCCTTCAGGCAATGTAAATCCACAATTGTACATA
CAGTTTCTCACGAGTTACCAGAGCCCTGATGGCCAAACAAAACTACGAGTCACCACCGTT
ACTAGAAGATGGGTTGATGCTGCTGTTAGTAATGAGGAATTGGTGCAAGGATTTGATCAA
GAGACTGCTGCAGTTGTAGTGGCTAGATTAGCTTCTTACAAAATGGAGATGGAGGAAGAT
TTTGATGCCACAAGGTGGCTAGATCGTAATCTCATTCGTCTGTGCTCCAAGTTTGGTGAT
TATCGGAAGGATGAACCCAGCTCATTCACTCTGAATCCCTCTTTTTCATTGTTCCCTCAG
TTCATGTTTCATTTACGGCGATCCCAGTTCTTACAAGTGTTCAATAATAGTCCAGATGAG
ACAGCATATTTCCGCATGTTGCTCAATCGGGAGGGCATAAGCAATGCTGCTGTCATGATT
CAGCCAACACTAACAGCATTTTCATTCAATTCACTGCCTTTCCCTGCTTTGTTGGATGTG
GCATCCATTGCAGCTGATCGCATTCTCTTGTTGGATGCTTATTTTAGTGTAGTTATTTTC
CATGGAATGACAATAGCTCAATGGAGAAACATGGGATACCAGGAACAGCCTGAGCACCAG
GCATTTGCACAACTCTTGCAAGTTCCCCATGATGAGGCCCAAGCAATCATCCGTGAGAGA
TTTCCTGTTCCAAGACTGGTAGTGTGTGATCAGCATGGTTCCCAGGCAAGGTTCCTTTTG
GCAAAGTTGAATCCATCTGCCACGTACAATAATGCAAATGAAATGGCAGCTGGATCAGAC
GTGATCTTTACAGATGATGTGAGCCTTCAAGTTTTCTTTGAGCATCTTCAGCGGCTAGCT
GTGCAATCTTCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc05g053830.3.1

PEP Infomation

Protein transport protein sec23, putative (AHRD V3.3 *** B9RRN0_RICCO)

Sequence

MATEMAQPDAEGIDGVRMTWNAWPRTKVEASKCVIPIASSIHLIRPHTDLPTLPYVPLRC
KTCTAVLNPFARVDFQALIWICPFCFQRNHFPQHYSGISETNVPGELYPQFTTIQYTLPS
QTPQSFNPNPQNPLPESSVSPIYLFVLDTCMLEEELEFAKSALKRAIDMLPDNAMVGFIS
YGTQVQVHELGFADMSKVYVFRGSKELSKDQVLDQLGLGTAGGRRTGGAPGMQKGGGPTG
VPNLGVARFLLPASECEYTLNSLLDELSTDQWPVPQGNRALRCTGVALSVAAGLLGACVA
GTGARIMALVGGPCTEGPGTIVSKDLSEPVRSHKDLHKDAAPFFKKAVHFYEELAKQLVS
QGHVLDVFASALDQVGVAEMKVSIEKTGGLVVLAESFGHSVFKDSFKQIFEDGEQSLGLS
FNGTLEINCSKDIKIQGIIGPCTSLDKKGPAVSSTVTGEGNTTAWKLCGLDKNTCLTVFF
DVSSSEKSDPSGNVNPQLYIQFLTSYQSPDGQTKLRVTTVTRRWVDAAVSNEELVQGFDQ
ETAAVVVARLASYKMEMEEDFDATRWLDRNLIRLCSKFGDYRKDEPSSFTLNPSFSLFPQ
FMFHLRRSQFLQVFNNSPDETAYFRMLLNREGISNAAVMIQPTLTAFSFNSLPFPALLDV
ASIAADRILLLDAYFSVVIFHGMTIAQWRNMGYQEQPEHQAFAQLLQVPHDEAQAIIRER
FPVPRLVVCDQHGSQARFLLAKLNPSATYNNANEMAAGSDVIFTDDVSLQVFFEHLQRLA
VQSS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc05g053830.3.1

Transcript Infomation

Protein transport protein sec23, putative (AHRD V3.3 *** B9RRN0_RICCO)

Sequence

TTTATATATTGAAGTTTAAATTTATTTCTTGATTAATACAATAACCTATACTATTGTTGA
AAATCCCCAAATTCATTCAAGATTAGCATAACCAACTCACCTCAGCCCTGTTTTGTCCTT
CTTCCATCCTCCCCAGTGTTGACTGATTTCTTCATTGTTTCCTCGGTGTGACCCCTATAG
CCCCCCACCCCACCCACCCACCCTTCCTTCTCCCTTTTGGGGTCGCGCCAATTTTGCTTT
TCTGTATCTGGGTATCCAGAATTTCAACCGGAGAACGTTAAAGGGAAGAGCTTTTTCGGT
TTTTGTTGGATCAATGGCGACAGAGATGGCACAACCTGATGCTGAAGGGATCGATGGAGT
TCGTATGACATGGAATGCTTGGCCTAGGACGAAAGTTGAAGCTAGCAAGTGCGTTATCCC
AATTGCTTCATCGATCCATCTGATCCGTCCTCATACTGATCTTCCTACACTTCCTTATGT
ACCTCTCCGATGTAAAACATGTACCGCTGTTCTCAACCCTTTTGCTCGTGTTGATTTCCA
AGCCTTAATCTGGATCTGCCCTTTTTGTTTCCAGCGTAACCATTTCCCTCAACATTATTC
CGGTATATCTGAAACTAATGTACCTGGAGAGCTTTACCCTCAATTCACTACGATTCAATA
TACGCTTCCTTCTCAAACCCCACAGAGTTTTAATCCTAACCCACAAAACCCTTTACCGGA
ATCTTCTGTTTCACCGATTTATTTGTTTGTTTTGGATACTTGTATGTTGGAAGAGGAGTT
GGAGTTTGCCAAATCGGCCTTGAAAAGGGCGATTGATATGTTGCCGGATAATGCTATGGT
GGGGTTTATATCATATGGGACGCAGGTTCAGGTGCATGAGTTGGGGTTTGCAGATATGTC
TAAGGTGTATGTTTTTCGGGGATCGAAGGAGTTGTCAAAAGATCAAGTTTTGGATCAATT
GGGGCTTGGTACTGCGGGTGGAAGACGGACCGGTGGTGCCCCCGGGATGCAGAAGGGTGG
TGGACCAACTGGGGTTCCTAATCTTGGTGTTGCTAGATTTTTATTGCCTGCTTCGGAGTG
TGAATATACCTTGAATTCTTTGTTAGATGAATTGAGCACGGATCAATGGCCAGTCCCACA
GGGGAATAGAGCATTACGTTGCACTGGTGTTGCTTTGAGTGTAGCAGCTGGATTGCTTGG
AGCTTGTGTGGCTGGTACTGGTGCTCGGATCATGGCCTTAGTGGGCGGTCCATGCACAGA
GGGACCTGGGACGATTGTGTCGAAAGATCTATCTGAACCAGTTCGTTCTCATAAGGATCT
TCACAAGGATGCAGCACCTTTTTTCAAGAAGGCTGTCCATTTCTATGAGGAACTCGCAAA
ACAGCTTGTTAGTCAAGGTCACGTCTTGGATGTGTTTGCTTCAGCACTTGATCAGGTTGG
GGTTGCTGAGATGAAAGTTTCTATTGAAAAAACAGGAGGATTAGTTGTTCTAGCTGAAAG
CTTTGGTCATTCTGTTTTCAAAGATTCTTTCAAGCAAATCTTTGAAGATGGTGAACAGTC
TCTTGGGCTGTCCTTCAATGGTACATTAGAGATCAACTGCTCCAAGGATATTAAAATTCA
AGGGATAATTGGACCATGCACATCTTTAGATAAGAAAGGACCTGCTGTTTCCAGCACGGT
CACCGGTGAGGGGAATACTACAGCTTGGAAGCTGTGTGGTCTCGACAAAAACACTTGCTT
AACTGTTTTCTTTGATGTTTCATCTAGCGAAAAATCAGACCCTTCAGGCAATGTAAATCC
ACAATTGTACATACAGTTTCTCACGAGTTACCAGAGCCCTGATGGCCAAACAAAACTACG
AGTCACCACCGTTACTAGAAGATGGGTTGATGCTGCTGTTAGTAATGAGGAATTGGTGCA
AGGATTTGATCAAGAGACTGCTGCAGTTGTAGTGGCTAGATTAGCTTCTTACAAAATGGA
GATGGAGGAAGATTTTGATGCCACAAGGTGGCTAGATCGTAATCTCATTCGTCTGTGCTC
CAAGTTTGGTGATTATCGGAAGGATGAACCCAGCTCATTCACTCTGAATCCCTCTTTTTC
ATTGTTCCCTCAGTTCATGTTTCATTTACGGCGATCCCAGTTCTTACAAGTGTTCAATAA
TAGTCCAGATGAGACAGCATATTTCCGCATGTTGCTCAATCGGGAGGGCATAAGCAATGC
TGCTGTCATGATTCAGCCAACACTAACAGCATTTTCATTCAATTCACTGCCTTTCCCTGC
TTTGTTGGATGTGGCATCCATTGCAGCTGATCGCATTCTCTTGTTGGATGCTTATTTTAG
TGTAGTTATTTTCCATGGAATGACAATAGCTCAATGGAGAAACATGGGATACCAGGAACA
GCCTGAGCACCAGGCATTTGCACAACTCTTGCAAGTTCCCCATGATGAGGCCCAAGCAAT
CATCCGTGAGAGATTTCCTGTTCCAAGACTGGTAGTGTGTGATCAGCATGGTTCCCAGGC
AAGGTTCCTTTTGGCAAAGTTGAATCCATCTGCCACGTACAATAATGCAAATGAAATGGC
AGCTGGATCAGACGTGATCTTTACAGATGATGTGAGCCTTCAAGTTTTCTTTGAGCATCT
TCAGCGGCTAGCTGTGCAATCTTCTTGACCCAAGAAGAAACAATTATGTGAAAATCTCAT
TGAGTTTGCCTCATCTATCCTGCCAGCCTCTTGTCGGAAGTTCATAATTTTCTTCCCATC
ATCCGTAAGATGAGAGGTCAATCCCAGATATTATATGGAAAACTAAGACTACATATGACA
TTCTTTCAGGTATGTGGAGGTACTTTTGCTTCCTAAGAAAATAAACGGTAACTCGACTCA
TTGTTCTCTATGGTTATAATATTAGAAGGGGGGGTATGTTTTAAGTCAAATGGCGTGTGT
TTGCTCCCTCGGGCTGTTGAACGAGAAGATAGTTTATGTCGGCGACTTCCTTTTTTTTGT
TAGTTATTACCAGGCAAAGAGTTTGTGTCATCTGTTGCGTTGAATTCATAGTTGTAGTTT
ATTGGATTATGGCTTGTAGAATAGGAAGTTTTTGAAACCATTTGCTTTATTTTGGATTTC
TTTCATAATTTAAGGTATATCTCATATACACATCTGTGGACCAACAGTTTTGCTTTCTCT
GTGTCATT