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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc05g053530.1.1

CDS Infomation

9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase, putative (AHRD V3.3 *** B9RWM0_RICCO)

Sequence

ATGCAAACTATCAAACCCCTCAATTCTCCTTCATTTTCTTGCAAAATTCTCATCAACCCT
TCTAAAAAAAACACAATAACTCTTCCTAGAACACGAATTCCGCCTCTGTCATCACCATCA
TCATCACCGTCACAATCATCGTCAAATTCAGATGAATCGAAAATATTTCCACTAAAAATT
GACCCGCCCAAATTAAACCTATTTCAAAAAATTGCATCCAGTGCTTTGGACATGCTAGAA
AAATCAATTGTAACAAAGTTAGAGAAAAAACATAAGCTGAACCGGACGGTTGACCCGGAA
ATTCAACTAGAAGGGAATTTTGCACCGGTTCACGAATCCTCTGTTCAGCACGGTCTTGAA
GTTGTGGGTCACATTCCGTCTAATTTAACCGGAGTCTACGTTAGAAACGGCGCCAACCCG
TTATACAAACCGATTAACGGACATCATTTATTTGACGGTGACGGTATGATTCACGCCGTT
AAATTAGATTCGAAAAATAATAAAGCTAGTTACTCGTGCCGGTTCACTCAAACCAGCCGG
TTGGTTCAAGAGGCTTCATTGGGCCGACCGGTTTTCCCTAAGCCAATTGGCGAATTACAT
GGCCATTTAGGGTTAGCTCGGCTCGCGCTATTTTTTGCGCGAGCGAGTTTAGGGTTAGTG
GATGCTACTAAAGGAACCGGTGTAGCAAATGCCGGTTTGGTTTATTTTAACGGTCGACTT
TTAGCTATGTCAGAGGATGATCTTCCGTATAACGTTATTATCAAGGAGGATGGCGATCTA
GAGTCTAACGGACGTTACGATTTTAACGGACAAATTAATGATCCATTGATAGCACATCCT
AAAGTGGACCCTATCACAGGGGAATTTTATACTTTGAGTTATAATATATTAAAAAAACCT
TATCTTAAATTATTCAAATTTGACACGTGTGGTATTAAGTCACGTGACATTTCTATCTCC
CTCCAAAACCCATCCATGATCCATGATTTTGCCATCACGGAAAGTCACGTGATCATTCCG
GATTATCAAGTGGTATTCAAGTTATCCGAGATGATACGGCGCGGATCGCCCGTAGTCCAC
GACCCGAATAAAGTATCTAGGTTTGGTGTGTTGTCGAAAGACGACCACGACGAATCAAGA
ATCAAGTGGATTGATGTTCCTAATTGCTTTTGCATGCATTTGTGGAACGCGTGGGAGGAG
AATCACGAAGAATCAGGTGATATGAACATTGTGATTATAGGTTCATGCATGAGTCCACCT
GACTCAATTTTTTCAGGAAGTGATGAGCCTTTGAAATCTAAACTAACTGAAATTCGATTA
AATTTGAGTACAGGAAGATCAACCAGACGAATTATAGTATCAGGGATGAATTTAGAAGCG
GGACAAGTAAACAAGACTAGACTTGGTGAAAAAACTCGGTACACCTTCATGGCTATAGCT
GAACCATGGCCAAAATGTAGTGGCCTAGCGAAAATCGATTTGGTCACAGGAAATGTGACG
AAATTTTTACATGGAGATGACAGATTCGGGGGTGAACCTTATTTCGTACCGAGCACGAAA
GAAGGAGAAGAAGATGAAGGGTACCTTATGAGTTATGTTCGAGATGAAAGAAATGAAAAA
TCGGAATTAATTATAATTAATGCTAAAAATATGAAGCAAATAGCCTTGGTAAAAATACCT
AAAAGAGTGCCATATGGCTTTCATGGTACATTCGTTAGTTCACAAGATTTATGTAATCAA
TTTTCTTGTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc05g053530.1.1

PEP Infomation

9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase, putative (AHRD V3.3 *** B9RWM0_RICCO)

Sequence

MQTIKPLNSPSFSCKILINPSKKNTITLPRTRIPPLSSPSSSPSQSSSNSDESKIFPLKI
DPPKLNLFQKIASSALDMLEKSIVTKLEKKHKLNRTVDPEIQLEGNFAPVHESSVQHGLE
VVGHIPSNLTGVYVRNGANPLYKPINGHHLFDGDGMIHAVKLDSKNNKASYSCRFTQTSR
LVQEASLGRPVFPKPIGELHGHLGLARLALFFARASLGLVDATKGTGVANAGLVYFNGRL
LAMSEDDLPYNVIIKEDGDLESNGRYDFNGQINDPLIAHPKVDPITGEFYTLSYNILKKP
YLKLFKFDTCGIKSRDISISLQNPSMIHDFAITESHVIIPDYQVVFKLSEMIRRGSPVVH
DPNKVSRFGVLSKDDHDESRIKWIDVPNCFCMHLWNAWEENHEESGDMNIVIIGSCMSPP
DSIFSGSDEPLKSKLTEIRLNLSTGRSTRRIIVSGMNLEAGQVNKTRLGEKTRYTFMAIA
EPWPKCSGLAKIDLVTGNVTKFLHGDDRFGGEPYFVPSTKEGEEDEGYLMSYVRDERNEK
SELIIINAKNMKQIALVKIPKRVPYGFHGTFVSSQDLCNQFSC*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc05g053530.1.1

Transcript Infomation

9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase, putative (AHRD V3.3 *** B9RWM0_RICCO)

Sequence

ATGCAAACTATCAAACCCCTCAATTCTCCTTCATTTTCTTGCAAAATTCTCATCAACCCT
TCTAAAAAAAACACAATAACTCTTCCTAGAACACGAATTCCGCCTCTGTCATCACCATCA
TCATCACCGTCACAATCATCGTCAAATTCAGATGAATCGAAAATATTTCCACTAAAAATT
GACCCGCCCAAATTAAACCTATTTCAAAAAATTGCATCCAGTGCTTTGGACATGCTAGAA
AAATCAATTGTAACAAAGTTAGAGAAAAAACATAAGCTGAACCGGACGGTTGACCCGGAA
ATTCAACTAGAAGGGAATTTTGCACCGGTTCACGAATCCTCTGTTCAGCACGGTCTTGAA
GTTGTGGGTCACATTCCGTCTAATTTAACCGGAGTCTACGTTAGAAACGGCGCCAACCCG
TTATACAAACCGATTAACGGACATCATTTATTTGACGGTGACGGTATGATTCACGCCGTT
AAATTAGATTCGAAAAATAATAAAGCTAGTTACTCGTGCCGGTTCACTCAAACCAGCCGG
TTGGTTCAAGAGGCTTCATTGGGCCGACCGGTTTTCCCTAAGCCAATTGGCGAATTACAT
GGCCATTTAGGGTTAGCTCGGCTCGCGCTATTTTTTGCGCGAGCGAGTTTAGGGTTAGTG
GATGCTACTAAAGGAACCGGTGTAGCAAATGCCGGTTTGGTTTATTTTAACGGTCGACTT
TTAGCTATGTCAGAGGATGATCTTCCGTATAACGTTATTATCAAGGAGGATGGCGATCTA
GAGTCTAACGGACGTTACGATTTTAACGGACAAATTAATGATCCATTGATAGCACATCCT
AAAGTGGACCCTATCACAGGGGAATTTTATACTTTGAGTTATAATATATTAAAAAAACCT
TATCTTAAATTATTCAAATTTGACACGTGTGGTATTAAGTCACGTGACATTTCTATCTCC
CTCCAAAACCCATCCATGATCCATGATTTTGCCATCACGGAAAGTCACGTGATCATTCCG
GATTATCAAGTGGTATTCAAGTTATCCGAGATGATACGGCGCGGATCGCCCGTAGTCCAC
GACCCGAATAAAGTATCTAGGTTTGGTGTGTTGTCGAAAGACGACCACGACGAATCAAGA
ATCAAGTGGATTGATGTTCCTAATTGCTTTTGCATGCATTTGTGGAACGCGTGGGAGGAG
AATCACGAAGAATCAGGTGATATGAACATTGTGATTATAGGTTCATGCATGAGTCCACCT
GACTCAATTTTTTCAGGAAGTGATGAGCCTTTGAAATCTAAACTAACTGAAATTCGATTA
AATTTGAGTACAGGAAGATCAACCAGACGAATTATAGTATCAGGGATGAATTTAGAAGCG
GGACAAGTAAACAAGACTAGACTTGGTGAAAAAACTCGGTACACCTTCATGGCTATAGCT
GAACCATGGCCAAAATGTAGTGGCCTAGCGAAAATCGATTTGGTCACAGGAAATGTGACG
AAATTTTTACATGGAGATGACAGATTCGGGGGTGAACCTTATTTCGTACCGAGCACGAAA
GAAGGAGAAGAAGATGAAGGGTACCTTATGAGTTATGTTCGAGATGAAAGAAATGAAAAA
TCGGAATTAATTATAATTAATGCTAAAAATATGAAGCAAATAGCCTTGGTAAAAATACCT
AAAAGAGTGCCATATGGCTTTCATGGTACATTCGTTAGTTCACAAGATTTATGTAATCAA
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