Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc05g053030.1.1
CDS Infomation	Glycerol-3-phosphate acyltransferase (AHRD V3.3 *** G7KGS4_MEDTR)
Sequence	ATGGATTCTATTGTTTCTGAGCTTGAAGGAGTTCTTTTGAAAAACCCTAATCCCTTTTGT TACTTCATGTTATTAGCTTTCGAGGCATCGAGTGTAATTCGATTTGCTTTTTTACTAATG TTATGGCCAATAATTCGATTCCTCGAATTTTTAGGGAGAGTGGATTACGGATTAAAACTT ACTATTTTCGTAGCCACGATGGGGGTAAAAATATCCGAAATTGAATCAGTGTCTAGAGCT GTTTTACCTAAGTTTTATTTTGATGATATTAATATGGAAGCATGGAGGATATTTAGTTTG TATGATAAAAAAGTTGTGGTGACTAAAATTCCAAAGATTATGGTTGAGAGATTTGTGAAA GTGCATTTAAGATGTGATGAAGTTGTTGGTAGTGAACTTGTTAGTAAATATGGATTTGCA ATTGGATTAATTAAGGATGATTTTGACAAGATTAAAGATGGGATTATTGAATTATTTGGT GATAAACAACCAAGTTTAGGTCTTGGTAGACCAAAATGTGGTTCTTCTTTCCTTTCTTTG TGCAAGGAACAATTACAACCACCATTCTTAAGAAGCAAAAATCAAAACCAACAAATTATT ATCAATCCATTACCAGTAATTTTCCATGATGGTAGACTTGTTATTCGACCAACACCATTT TTAGCCCTAATAATACTTTTATGGATTCCACTAGGTATTATTATAGCTACAATAAGAATT ATAATTGGCTTAATATTTCCAATATGGTCAATTCCCTATTTAACACCTTTATTTGGTGGC AAAGTCATAGTCAAAGGAAATCCACCGTCATCATCAGCTATCACGGTAACCAATTCAGGC GTACTGTTCGTATGCACTCACCGCACCCTTATGGACCCCGTCGTCTTATCGATCGTACTC CAGCGTAAGATTCCCGTTATGACTTACTCAGTCTCTCGATTGACCGAGGTCTTGTCCCCG ATACCGACTGTACGTTTGACGAGAGTTCGAAATGTGGACGCATGGAAAATCAAATGTCAT CTCGAAAAAGGAGATTTGATTATGTGTCCAGAAGGGACAACATGTAGGGAACCGTTTTTA TTGAGGTTCAGTGCACTTTTTGCAGAACTAACTAACAGTATTGTTCCCGTGGCCCTGAAT TATAAAGTAGGGTTTTTTCATGGAACAACAGCTAGGGGATGGAAAGCTATGGATCCAATA TTTTTCTTGATGAATCCTAAACCAATTTATGAGGTGACATTCTTGAATAAATTACCAGAA GATGCCACGTGTTCATCTGGGAAAAGTCCACATGATGTTGCAAATTATGTTCAAAGAATT TTGGGTGAAACATTAGGATTTGAGTGTACAAATTTTACAAGAAAAGATAAGTATAAAATT CTTGCTGGTAATGATGGAATTGAATTAACAAAAAATACTAGCACTAATTATGGGATTAAG AAGTTGATTAACTTCTTCATAAATGTGGTAGGCACAAGAAATAAGATGATTATGAGGTAC TTTATTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc05g053030.1.1
PEP Infomation	Glycerol-3-phosphate acyltransferase (AHRD V3.3 *** G7KGS4_MEDTR)
Sequence	MDSIVSELEGVLLKNPNPFCYFMLLAFEASSVIRFAFLLMLWPIIRFLEFLGRVDYGLKL TIFVATMGVKISEIESVSRAVLPKFYFDDINMEAWRIFSLYDKKVVVTKIPKIMVERFVK VHLRCDEVVGSELVSKYGFAIGLIKDDFDKIKDGIIELFGDKQPSLGLGRPKCGSSFLSL CKEQLQPPFLRSKNQNQQIIINPLPVIFHDGRLVIRPTPFLALIILLWIPLGIIIATIRI IIGLIFPIWSIPYLTPLFGGKVIVKGNPPSSSAITVTNSGVLFVCTHRTLMDPVVLSIVL QRKIPVMTYSVSRLTEVLSPIPTVRLTRVRNVDAWKIKCHLEKGDLIMCPEGTTCREPFL LRFSALFAELTNSIVPVALNYKVGFFHGTTARGWKAMDPIFFLMNPKPIYEVTFLNKLPE DATCSSGKSPHDVANYVQRILGETLGFECTNFTRKDKYKILAGNDGIELTKNTSTNYGIK KLINFFINVVGTRNKMIMRYFI*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc05g053030.1.1
Transcript Infomation	Glycerol-3-phosphate acyltransferase (AHRD V3.3 *** G7KGS4_MEDTR)
Sequence	ATGGATTCTATTGTTTCTGAGCTTGAAGGAGTTCTTTTGAAAAACCCTAATCCCTTTTGT TACTTCATGTTATTAGCTTTCGAGGCATCGAGTGTAATTCGATTTGCTTTTTTACTAATG TTATGGCCAATAATTCGATTCCTCGAATTTTTAGGGAGAGTGGATTACGGATTAAAACTT ACTATTTTCGTAGCCACGATGGGGGTAAAAATATCCGAAATTGAATCAGTGTCTAGAGCT GTTTTACCTAAGTTTTATTTTGATGATATTAATATGGAAGCATGGAGGATATTTAGTTTG TATGATAAAAAAGTTGTGGTGACTAAAATTCCAAAGATTATGGTTGAGAGATTTGTGAAA GTGCATTTAAGATGTGATGAAGTTGTTGGTAGTGAACTTGTTAGTAAATATGGATTTGCA ATTGGATTAATTAAGGATGATTTTGACAAGATTAAAGATGGGATTATTGAATTATTTGGT GATAAACAACCAAGTTTAGGTCTTGGTAGACCAAAATGTGGTTCTTCTTTCCTTTCTTTG TGCAAGGAACAATTACAACCACCATTCTTAAGAAGCAAAAATCAAAACCAACAAATTATT ATCAATCCATTACCAGTAATTTTCCATGATGGTAGACTTGTTATTCGACCAACACCATTT TTAGCCCTAATAATACTTTTATGGATTCCACTAGGTATTATTATAGCTACAATAAGAATT ATAATTGGCTTAATATTTCCAATATGGTCAATTCCCTATTTAACACCTTTATTTGGTGGC AAAGTCATAGTCAAAGGAAATCCACCGTCATCATCAGCTATCACGGTAACCAATTCAGGC GTACTGTTCGTATGCACTCACCGCACCCTTATGGACCCCGTCGTCTTATCGATCGTACTC CAGCGTAAGATTCCCGTTATGACTTACTCAGTCTCTCGATTGACCGAGGTCTTGTCCCCG ATACCGACTGTACGTTTGACGAGAGTTCGAAATGTGGACGCATGGAAAATCAAATGTCAT CTCGAAAAAGGAGATTTGATTATGTGTCCAGAAGGGACAACATGTAGGGAACCGTTTTTA TTGAGGTTCAGTGCACTTTTTGCAGAACTAACTAACAGTATTGTTCCCGTGGCCCTGAAT TATAAAGTAGGGTTTTTTCATGGAACAACAGCTAGGGGATGGAAAGCTATGGATCCAATA TTTTTCTTGATGAATCCTAAACCAATTTATGAGGTGACATTCTTGAATAAATTACCAGAA GATGCCACGTGTTCATCTGGGAAAAGTCCACATGATGTTGCAAATTATGTTCAAAGAATT TTGGGTGAAACATTAGGATTTGAGTGTACAAATTTTACAAGAAAAGATAAGTATAAAATT CTTGCTGGTAATGATGGAATTGAATTAACAAAAAATACTAGCACTAATTATGGGATTAAG AAGTTGATTAACTTCTTCATAAATGTGGTAGGCACAAGAAATAAGATGATTATGAGGTAC TTTATTTAG