Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc05g052320.3.1
CDS Infomation	LOW QUALITY:Cation/H(+) antiporter (AHRD V3.3 *** A0A0K9NPK0_ZOSMR)
Sequence	ATGGCAACAGCGGCGATATCATCAGTGAAATTAACCGGGGAATTACCCGGTGCCGTTAGT GAAAAATGTTATGCTGAAATACCTCTTCATTCACCTGGTATATGGGGTTTACCCGATGCA AGTTTATTCCTCGATTTCAATTTGCCGCTGTTGCTTCTCCAATTAGCCCTCATTTTTTTC CTCACACAGTCCCTTCATTTGGTTCTCAAGCGTATCCGTCTTCCCCGTCTTATCTCTGAG ATTTTGGCAGGTATCATACTGGGACCAACAATGTTAGGAAAGATCCCTAACTTTACGGAG AATTTATTCCCACAATCAGGAGAAATTTTCATAGATTTAATGTCGAAAATTGGTTATATC TTCTTTATATTCCTAAGTGGAGTGAAGATGGACCCAAAAGTGGTGTTGAGAAGTGGTTCA AGGGCATGGACAGTAGGATTACTTGCTGTCATTCTACCAGTTGCTTCTTTTGCGAGCTTC TATTTTGGATTCTTTTCAGACGATGCAAATTTGCACAGATATCGACAACCAGCCGCCCAA AATATTTTCTTGATACAGAGTTTGATTGCATTTCCTGTGGTTGCATCTCTCCTTGTTGAC CTGAAAATCATGAATTCCGAGCTTGGTCGTCTTGCTCTGGCATCAAGTTTGATCAGTGAC TTATTTAGTAATCTCGGATTGACTATCTTCTCCACTCTTAGAATTGGATTGTTAGCAGAG ATTACGACAGTTATCTCTGTACAGTCTTTCGTTCTACTTCTTGGTATAATCTTGCTTATT GTGTTTACTGTTCGACCTATTTCACTTTGGATTATCAAAAGGACTCCAGAAGGCAGGCCT GTAAATTCCATTTACATTACTTGGGCATCGGTCTGTGTCCTGTTAGCTGTGATTCTTGTT GATAATGCAGGGCTTAATTACCAATATGGTCCTTTTATCTTAGGTCTTGTCATACCAGAC GGTCCACCTCTCGGTTCAACATTGGTAGATAAATTAGAAACCTTAGTATCCGGTTTGCTT GCACCGCTTCTGGTTACTTATTGTGGTATGAAAGTAAATCTGGTTGATTTGTATGATCTC GTCTTCCTGAATTGGGTATGGGTTATGGTGTTCTTTTGTCTCACCGTGAAGTACGCATCA GTTTTCCTTTCATCATTGGCCTGCAAGGTTCCACCTAAAGATGCTGCGGCTCTTGCCTTC ATTATGACCTCACAAGGTGTTATTCAGATGTCTTTTTACTTGAACAATGTTATTAATCAG ACAGTTGATGGAGAAACCTTTTCGATGCTAACTGCATCTGTATTACTGATAGCTGCACTC TCACATTTCTGCGTTGGAACGCTCTATGATCATACAAGGATATATGCTGGTTATCAGAAA AGAGACATCCAACATGCTTCAAGTAATTCTGAGTTGCGTTTGCTTTCATGTGCTCATCGA TTTGATGATGTAGCAGGTGTCCGAAAGATCTTAGATGCTTCTTTTCCATGTAAAGAAAGT CCTTTATCTGTTTACGCGCTCCACTTGGTTGAACTTGCTGGTCGAGCATCCCCAGTTCTA ATTGATCATCAGCTTGGACAAAAGAATACTTCTGGTGTTGCTCGATCGCAAAAGATGGTG GAAGTTTTTATAGCATTTGAGACCCAGTTCTTGGGATCTGCTAGTACTCATTTCTTCACC TCAATGTCATTGCCAAGGTTCATGCATCAGGACATATGTTCACTTGCATTCGACAAGTTA GCGTCCATGATCATACTCCCGTTTCACAGGAAATGGAATCAGCAGGGGAAGATTATCTTG GACAGCAGTAACTTGAGAACAATCAACAACAATGTACTGGACTTGGCCCCTTGTTCTGTC GGTATCCTAATTGACCGTCAGAAAATAAAACGTCTAGCTAGTCAATCCGGTAATGAGTCA TCAATGTATCAAGTGGCCGTGGTTTTCATGGGAGGCAATGATGATCGCGAGGCGTTAGCT TATGCTAAACGTATGTCAAGATCACCTGAACTTCAACTGACTGTGGTTAGATTCGTCTCA TGGGACATCGACGTACGTGAAAACCAGTGGGATGCTGTACTTGATGCTGAGATGTTGAAG GAGGTAAGACTTCTAGGTCAGCACCAGGATAACATTGTATACAGAGAGGAAAGAGTTAAA GATGGAGCTGAAACAGCTTTGATCATACATGCTATGGAAGAAGCCTTTGATCTAATCATG GTCGGAAGACGTCATCGCGACGATCTACAACAACTATTAGGTCTTAATGAATGGAATGAT TTGCCAGAACTTGGACAGTTGGTGACATGCTTGCTGCTGCAGAGATCAATAGACCAGTTT CAGTCTTGGTGGTGCAACAACAAATTGTTAAGAACAAATGAGAAGAGTAATCCATTATTT GAAAAGTTACATATGTTAAATGCCAAATTTCTCTGTGTAGATTTCATCACACAATTAAAG TTAAAGGCCATGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc05g052320.3.1
PEP Infomation	LOW QUALITY:Cation/H(+) antiporter (AHRD V3.3 *** A0A0K9NPK0_ZOSMR)
Sequence	MATAAISSVKLTGELPGAVSEKCYAEIPLHSPGIWGLPDASLFLDFNLPLLLLQLALIFF LTQSLHLVLKRIRLPRLISEILAGIILGPTMLGKIPNFTENLFPQSGEIFIDLMSKIGYI FFIFLSGVKMDPKVVLRSGSRAWTVGLLAVILPVASFASFYFGFFSDDANLHRYRQPAAQ NIFLIQSLIAFPVVASLLVDLKIMNSELGRLALASSLISDLFSNLGLTIFSTLRIGLLAE ITTVISVQSFVLLLGIILLIVFTVRPISLWIIKRTPEGRPVNSIYITWASVCVLLAVILV DNAGLNYQYGPFILGLVIPDGPPLGSTLVDKLETLVSGLLAPLLVTYCGMKVNLVDLYDL VFLNWVWVMVFFCLTVKYASVFLSSLACKVPPKDAAALAFIMTSQGVIQMSFYLNNVINQ TVDGETFSMLTASVLLIAALSHFCVGTLYDHTRIYAGYQKRDIQHASSNSELRLLSCAHR FDDVAGVRKILDASFPCKESPLSVYALHLVELAGRASPVLIDHQLGQKNTSGVARSQKMV EVFIAFETQFLGSASTHFFTSMSLPRFMHQDICSLAFDKLASMIILPFHRKWNQQGKIIL DSSNLRTINNNVLDLAPCSVGILIDRQKIKRLASQSGNESSMYQVAVVFMGGNDDREALA YAKRMSRSPELQLTVVRFVSWDIDVRENQWDAVLDAEMLKEVRLLGQHQDNIVYREERVK DGAETALIIHAMEEAFDLIMVGRRHRDDLQQLLGLNEWNDLPELGQLVTCLLLQRSIDQF QSWWCNNKLLRTNEKSNPLFEKLHMLNAKFLCVDFITQLKLKAM*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc05g052320.3.1
Transcript Infomation	LOW QUALITY:Cation/H(+) antiporter (AHRD V3.3 *** A0A0K9NPK0_ZOSMR)
Sequence	ATGGCAACAGCGGCGATATCATCAGTGAAATTAACCGGGGAATTACCCGGTGCCGTTAGT GAAAAATGTTATGCTGAAATACCTCTTCATTCACCTGGTATATGGGGTTTACCCGATGCA AGTTTATTCCTCGATTTCAATTTGCCGCTGTTGCTTCTCCAATTAGCCCTCATTTTTTTC CTCACACAGTCCCTTCATTTGGTTCTCAAGCGTATCCGTCTTCCCCGTCTTATCTCTGAG ATTTTGGCAGGTATCATACTGGGACCAACAATGTTAGGAAAGATCCCTAACTTTACGGAG AATTTATTCCCACAATCAGGAGAAATTTTCATAGATTTAATGTCGAAAATTGGTTATATC TTCTTTATATTCCTAAGTGGAGTGAAGATGGACCCAAAAGTGGTGTTGAGAAGTGGTTCA AGGGCATGGACAGTAGGATTACTTGCTGTCATTCTACCAGTTGCTTCTTTTGCGAGCTTC TATTTTGGATTCTTTTCAGACGATGCAAATTTGCACAGATATCGACAACCAGCCGCCCAA AATATTTTCTTGATACAGAGTTTGATTGCATTTCCTGTGGTTGCATCTCTCCTTGTTGAC CTGAAAATCATGAATTCCGAGCTTGGTCGTCTTGCTCTGGCATCAAGTTTGATCAGTGAC TTATTTAGTAATCTCGGATTGACTATCTTCTCCACTCTTAGAATTGGATTGTTAGCAGAG ATTACGACAGTTATCTCTGTACAGTCTTTCGTTCTACTTCTTGGTATAATCTTGCTTATT GTGTTTACTGTTCGACCTATTTCACTTTGGATTATCAAAAGGACTCCAGAAGGCAGGCCT GTAAATTCCATTTACATTACTTGGGCATCGGTCTGTGTCCTGTTAGCTGTGATTCTTGTT GATAATGCAGGGCTTAATTACCAATATGGTCCTTTTATCTTAGGTCTTGTCATACCAGAC GGTCCACCTCTCGGTTCAACATTGGTAGATAAATTAGAAACCTTAGTATCCGGTTTGCTT GCACCGCTTCTGGTTACTTATTGTGGTATGAAAGTAAATCTGGTTGATTTGTATGATCTC GTCTTCCTGAATTGGGTATGGGTTATGGTGTTCTTTTGTCTCACCGTGAAGTACGCATCA GTTTTCCTTTCATCATTGGCCTGCAAGGTTCCACCTAAAGATGCTGCGGCTCTTGCCTTC ATTATGACCTCACAAGGTGTTATTCAGATGTCTTTTTACTTGAACAATGTTATTAATCAG ACAGTTGATGGAGAAACCTTTTCGATGCTAACTGCATCTGTATTACTGATAGCTGCACTC TCACATTTCTGCGTTGGAACGCTCTATGATCATACAAGGATATATGCTGGTTATCAGAAA AGAGACATCCAACATGCTTCAAGTAATTCTGAGTTGCGTTTGCTTTCATGTGCTCATCGA TTTGATGATGTAGCAGGTGTCCGAAAGATCTTAGATGCTTCTTTTCCATGTAAAGAAAGT CCTTTATCTGTTTACGCGCTCCACTTGGTTGAACTTGCTGGTCGAGCATCCCCAGTTCTA ATTGATCATCAGCTTGGACAAAAGAATACTTCTGGTGTTGCTCGATCGCAAAAGATGGTG GAAGTTTTTATAGCATTTGAGACCCAGTTCTTGGGATCTGCTAGTACTCATTTCTTCACC TCAATGTCATTGCCAAGGTTCATGCATCAGGACATATGTTCACTTGCATTCGACAAGTTA GCGTCCATGATCATACTCCCGTTTCACAGGAAATGGAATCAGCAGGGGAAGATTATCTTG GACAGCAGTAACTTGAGAACAATCAACAACAATGTACTGGACTTGGCCCCTTGTTCTGTC GGTATCCTAATTGACCGTCAGAAAATAAAACGTCTAGCTAGTCAATCCGGTAATGAGTCA TCAATGTATCAAGTGGCCGTGGTTTTCATGGGAGGCAATGATGATCGCGAGGCGTTAGCT TATGCTAAACGTATGTCAAGATCACCTGAACTTCAACTGACTGTGGTTAGATTCGTCTCA TGGGACATCGACGTACGTGAAAACCAGTGGGATGCTGTACTTGATGCTGAGATGTTGAAG GAGGTAAGACTTCTAGGTCAGCACCAGGATAACATTGTATACAGAGAGGAAAGAGTTAAA GATGGAGCTGAAACAGCTTTGATCATACATGCTATGGAAGAAGCCTTTGATCTAATCATG GTCGGAAGACGTCATCGCGACGATCTACAACAACTATTAGGTCTTAATGAATGGAATGAT TTGCCAGAACTTGGACAGTTGGTGACATGCTTGCTGCTGCAGAGATCAATAGACCAGTTT CAGTCTTGGTGGTGCAACAACAAATTGTTAAGAACAAATGAGAAGAGTAATCCATTATTT GAAAAGTTACATATGTTAAATGCCAAATTTCTCTGTGTAGATTTCATCACACAATTAAAG TTAAAGGCCATGTAAATTAACATTTGAATTTTCATGGCAATACAACATCACACATCTCTC AATATCAATTGCTCTAATTTTTATAATTG