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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc05g051350.2.1

CDS Infomation

Rhamnogalacturonate lyase family protein (AHRD V3.3 *** AT1G09910.1)

Sequence

ATGAAGAATACGATAGGGTGGAAGAGGCAACTACAACATCTTGTATTATGGTTTTTTGCA
GTTGTTTTCCATCTTTTCTTGCTTGTTAATGGTTCAAGAACGGACTATTTTAGGCATACT
CCACTAAGAAATAGTCAAAAGTTGTCATCAACTACTCCTCCTGTCAAACTGCTTATCTCA
AGTAATTATGTGGTGATGGATAATGGCATTGTCAAGGTTAACCTAACTAATCCCACTGGA
TCCATTGCTGGGGTGAGCTACAATGGTATTGATAATGTACTAGAGACAGACTTCAAAGAT
ACAAATAGAGGATATTGGGATACAGTGTGGGAACGTCCTGGAGACAAAGATCACACTTTT
GATATGCTTTTAGGGACAAAATTCAGAGTCATTGCTAGTGACAAAAATAAAGTTGAAGTT
TCTTTTACAAAAACATGGAATCCTTCAAATAATGGTACTACACATGATCTTCCTCTTAAC
ATTGACAAAAGGTTTGTTATGTTGAGGGGAAGTTCTGGATTTTATTCATATGGAATATTT
GAACACTTGAAAGGCTGGCCAAGCCTAATTCTTGAAGAAGCCAGAATTGCCTTTAAGCTC
AAAAGGACACTGTTCCATTATATGGCAATATCAGATGATATTCAAAGGATGATGCCAACT
GATGAAGATCGATCTGATGGACAAATTCTTGACTATAGAGAAGCTGTTAGACTAACAAAT
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GAAACTGCAAAATGGCCATATGATTTCCCAGAATCTATTGATTATCCTCATGCTAATGAA
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TATGCAAAATCAGCATATATTGGATTAGCACTTCCTGGACATGTTGGGTCATGGCAATAT
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AGTGTTAGACCTGGAACTTATAACTTGTATTCTTGGGTCCCTGGAATTATTGGAGATTAC
AAATACAACTATGACATTATTGTCAAACAAGGAAGTGATATAAACTTAGGTAACCTAATT
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GGAGAATTTTTTGTGCCTGATCCATTGCCTGCCCTAACAAATCAATTATTCAACAATACT
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GATTTGGCGTATAAAGTTGGTGTTAGTGATTATAGTAAAGATTGGTTCTTTGCTCATGTA
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TCCCATTTACAGGGGAGGATCAACAACCCCTCAAGAACAATGCCTCACTTTGAAACTCCA
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AATTTTAAAATTCAAGGATTACATCTACAAAAGGGAGAAAATACAATATATTTAAAGCAA
ATAAAAGGGGGTAATCCTTTCTATGGCCATCAATATGACTATATTCGTTTGGAAGGACCT
CCACAACAAAATTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc05g051350.2.1

PEP Infomation

Rhamnogalacturonate lyase family protein (AHRD V3.3 *** AT1G09910.1)

Sequence

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EHLKGWPSLILEEARIAFKLKRTLFHYMAISDDIQRMMPTDEDRSDGQILDYREAVRLTN
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ETAKWPYDFPESIDYPHANERGTIRGQLFVRDRYINKNPVYAKSAYIGLALPGHVGSWQY
ETKGYQFWIQTDETGHFNITSVRPGTYNLYSWVPGIIGDYKYNYDIIVKQGSDINLGNLI
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IKGGNPFYGHQYDYIRLEGPPQQN*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc05g051350.2.1

Transcript Infomation

Rhamnogalacturonate lyase family protein (AHRD V3.3 *** AT1G09910.1)

Sequence

ATGTATATTTTGAAGTCTACATATTTAATTTAATTTGAATACTTAAAATTGTGAAAAATT
ATGTAGATACTTTATAATTGTGTCAAATATTTTGGAACTCTCCAAGAAGTGAAGAAAAAA
AATGTACCACAAATATATAAAATTACAACGATTCTAATATTCTTTTTAATATTTTGTAGC
AATTGCCGTGTATAGAAAAAAACCCTGTGTCTGCGTTTTTGCCCAATTAAAAAAGCACAT
TGGTCAACAGTAAATACCTAAATACCTAAATACCTAATATAAATTAAAAGTCAAACTTCT
ATTCAACGTGAAATTATATTTTCTATACTATGTAATATAATATAATAAACAAAACACACT
TTTTTGGTATAGGATTCAGCTAGATTTTTCATATACTAACTGCACTATTATATTACAATA
AATAAATATTAGACCATCTAAACCTATAAGCTTCGAAGCCTATCTAATACCTATAAGCTT
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TCATTTCTAGTGATTATTAAGAGTTAAAAAAATGAAGAATACGATAGGGTGGAAGAGGCA
ACTACAACATCTTGTATTATGGTTTTTTGCAGTTGTTTTCCATCTTTTCTTGCTTGTTAA
TGGTTCAAGAACGGACTATTTTAGGCATACTCCACTAAGAAATAGTCAAAAGTTGTCATC
AACTACTCCTCCTGTCAAACTGCTTATCTCAAGTAATTATGTGGTGATGGATAATGGCAT
TGTCAAGGTTAACCTAACTAATCCCACTGGATCCATTGCTGGGGTGAGCTACAATGGTAT
TGATAATGTACTAGAGACAGACTTCAAAGATACAAATAGAGGATATTGGGATACAGTGTG
GGAACGTCCTGGAGACAAAGATCACACTTTTGATATGCTTTTAGGGACAAAATTCAGAGT
CATTGCTAGTGACAAAAATAAAGTTGAAGTTTCTTTTACAAAAACATGGAATCCTTCAAA
TAATGGTACTACACATGATCTTCCTCTTAACATTGACAAAAGGTTTGTTATGTTGAGGGG
AAGTTCTGGATTTTATTCATATGGAATATTTGAACACTTGAAAGGCTGGCCAAGCCTAAT
TCTTGAAGAAGCCAGAATTGCCTTTAAGCTCAAAAGGACACTGTTCCATTATATGGCAAT
ATCAGATGATATTCAAAGGATGATGCCAACTGATGAAGATCGATCTGATGGACAAATTCT
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GGATGATAAGTACCAATATTCATTTGAGAATAAGGATATAAAAGTACATGGATGGGTTTG
CAATACTCCACATGTAGGATTTTGGGTTATAACACCTAGTTATGAAGATCGTAATGGTGG
ACCCACCAAGCTTGATCTTACTTCTCATGCTGGTCCCACCTCTTTAGCGATATTTTTCAG
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TTGGGAAGATGCTAAAAGACAGATGGAAGACGAAACTGCAAAATGGCCATATGATTTCCC
AGAATCTATTGATTATCCTCATGCTAATGAACGTGGTACAATTAGAGGTCAATTATTCGT
ACGAGACAGGTACATAAACAAAAATCCTGTCTATGCAAAATCAGCATATATTGGATTAGC
ACTTCCTGGACATGTTGGGTCATGGCAATATGAGACTAAAGGTTATCAATTTTGGATTCA
AACAGATGAGACTGGACACTTCAATATTACTAGTGTTAGACCTGGAACTTATAACTTGTA
TTCTTGGGTCCCTGGAATTATTGGAGATTACAAATACAACTATGACATTATTGTCAAACA
AGGAAGTGATATAAACTTAGGTAACCTAATTTATGATCCTCCAAGATATGGTCCAACTTT
ATGGGAAATTGGAATTCCTGATAGGAGTGCTGGAGAATTTTTTGTGCCTGATCCATTGCC
TGCCCTAACAAATCAATTATTCAACAATACTACACAAAAATTTAGGCAATATGGTTTGTG
GGATCGATACACTGATTTATATCCAAATAAAGATTTGGCGTATAAAGTTGGTGTTAGTGA
TTATAGTAAAGATTGGTTCTTTGCTCATGTAACCAGGAGAACTAGAAGCAAGAATTATAT
ACCAACAACATGGCAAATTTCATTTAAACTCCCAAGTGTTGATCCAAAGGGAACTTATAC
ACTACGTGTGGCACTGGCTTCTGCAACCTATTCCCATTTACAGGGGAGGATCAACAACCC
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ACATGGGATACATGGATTATATTGGCTCTTCAATTTTAAAATTCAAGGATTACATCTACA
AAAGGGAGAAAATACAATATATTTAAAGCAAATAAAAGGGGGTAATCCTTTCTATGGCCA
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TTTCTTTTTTCTTACATGATATTGAGTGCGGGGTTAATTTCTTTATTAATTATCATTATT
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