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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc05g046280.2.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XBJ8_CYNCS)

Sequence

ATGAAGTTAAGTGAAAGCTCCATAAAACAACTCAATTCCCTTCTTTCAAACTTCACTCAT
TCCCACCAATTCTCCGATGCTCTCTCTCTCTTCAACCAAATTCACTCTTCCCTTCATCTC
AGACCTGATCATTACACCCTTTCAACCACTCTCACCGCCTCTGCCAACATCCTTAACACT
ACCTTCGGCAATCAGCTCCACGGTTTCGCCATTAAAACACACCTTAAACAATACCCATAT
GTATCGAATTCTCTCCTTTCATTCTATGCCAAATCTAAAGATTTGGGTTCAGTTAAAAGG
GTCTTTAAAGAAATTGAATCCCCAGATGTTTATTCTTGGACTACGCTATTGTCTGCTTCT
ACCAAGTTGGGTGAAGTTGGGTATGCTTGTAAGGTGTTTGATGAAATGCCGCACAGGAAT
TTGGCTGTGTGGAATGCAATGATTACTGGGTGTGCTGAAAGTGGGTATCACGGGATTGCT
TTGGATTTTTTTCAAAGAATGCATTTTTTGGGTGTTAGATATGATAATTATGCTTTTGCT
AGTATTTTAAGTTTGTGTGATATGGAGTTATTGGATTTTGGAAGACAAGTGCATTCGATG
GTCATCAAGACGGGGTTTTTGGTAAGAGCTTCGGTGATTAATGCTTTGGTTACCATGTAT
TTTAACTGTAAGAATGATTTTGATGCTTTTGGAGTATTTGAAGAAGCTGAGGATGAAGTG
CTTGATACTGTAACTTATAATGCAATGATCGCTGGTTTAGTGAGTATGGAAAGAGCTGAG
GAGGCATTAATAATGTTCAAGGATATGTGTAAGTTTTCTTTGAGACCTACCAAGCTCACA
TTTGTGACCATAATGAGTTCATGTACGTGTACTAGAATTGCTTCTCAATTGCATGCTCAA
GTTGCTAGAATAGGTTTGGAAAACTATACATCTATCGCTAATGCAACAATAACCATGTAT
GCTAGTTGTGGGAACTTGAATGAAGCCCTTTTAGTTTTTGAAAGACTAAGGGTGAAGGAT
AACGTGTCGTGGAATGCCATGATTACGAGCTATGCCCAAAATTGTCTGGACAGTGCAGCA
ATTTCTGCATACATTCAAATGCAGAAGGAAGGGTTAGAGCCAGACGAGTTTACCATAGGA
AGCATACTTGCAAGCTCAGAGTCTCTAGTAATTGTTGAAATAATTTTGGGTGTTGTTTTG
AAGAAGGCCCTTATCTTTAAGACTGAAGTATCTAATGCTCTGCTCTCTGCCTTCTGCAAG
CATGGTGAAATGAAGCAGGCTTATCAAGTTTTTCATGACATGTTTCCTAGAAACATGATC
TCTTGGAATACATTGATTTCTGGTTGTCATCTCAACGGACTACCCATGGGGTGCTTGCAC
CTCTTCTCTGAGATTGTTAGTGAATGTTTGATGCCTAACCCTTTTACTCTTAGCATCATT
TTGAGTGTTTGTGCCAGCATTTCAGCTCTTCAACAAGGGAAGGAGATTCATACTTTCATT
CTCAAATCTGGATTCATTTCAGAAATATCTTTAGGAAATGCCCTCATCACATTGTATGCA
AAATGTGGACTGTTGCATTGGTCTCTTAAGGTTTTCCAAATAATGACACAAAAAGACATA
GTTTCTTGGAATTCAATTATTACTGCATATGCACAGCATGGGAAAGGCAAAGAAGCTGTA
CATTGCTTTGAGATGATGCAAGAATTAGGTGGGGTCATACCAGATAACACAACCTTTAAT
GCAGTTCTATCAGCTTGCAGCCATTCAGGCTTAATCAATAAAGGCATTGAAGTTTTTACC
TCCATGGTTCATAGCTACGGTATAGAACCTACAGCAGACCACTTCTCTTGCATTGTTGAT
CTTCTAGGCCGGGCTGGATATCTTGATGAGGCAGAAAAACTGGTAAAAGATAGGCATGTT
GATGTAGATTCCACTGTTTGGTGGACATTATTCAGTTCCTGTGCTGCTTATGGCAATGTT
AAACTAGGCAGAATTGCTGCGGGATTTCTGCTTGAGACTGAGAAGAATAACCCCTCTGTT
TATGTGCTTTTATCCAATATTTATGCCAGTGCAGAGAACTGGGAGGGCTCTGCTAATGTG
AGGAAACTGATGAATAAATGTGGAGTGTTAAAGCAACCTGGAAGCATCTTGACGTGTTTG
GTTTCGAAGTTCAACCTTACTTATCAAAAGGAGATTGTTCATGGTGGAAGAAAGGTACTA
TGTCTTAAGAATTTAGACTATAATATGACAAACTTATGGGTAGAACCAAAACTAGTGATA
TTACTTTTATATGGTATATGCTTTTTATTTTTTTTTATTTTTATCAACCACACAGGAGGC
TACAGTGTTGATGTAACTATTAAAGCTTTGGGTCGATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc05g046280.2.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XBJ8_CYNCS)

Sequence

MKLSESSIKQLNSLLSNFTHSHQFSDALSLFNQIHSSLHLRPDHYTLSTTLTASANILNT
TFGNQLHGFAIKTHLKQYPYVSNSLLSFYAKSKDLGSVKRVFKEIESPDVYSWTTLLSAS
TKLGEVGYACKVFDEMPHRNLAVWNAMITGCAESGYHGIALDFFQRMHFLGVRYDNYAFA
SILSLCDMELLDFGRQVHSMVIKTGFLVRASVINALVTMYFNCKNDFDAFGVFEEAEDEV
LDTVTYNAMIAGLVSMERAEEALIMFKDMCKFSLRPTKLTFVTIMSSCTCTRIASQLHAQ
VARIGLENYTSIANATITMYASCGNLNEALLVFERLRVKDNVSWNAMITSYAQNCLDSAA
ISAYIQMQKEGLEPDEFTIGSILASSESLVIVEIILGVVLKKALIFKTEVSNALLSAFCK
HGEMKQAYQVFHDMFPRNMISWNTLISGCHLNGLPMGCLHLFSEIVSECLMPNPFTLSII
LSVCASISALQQGKEIHTFILKSGFISEISLGNALITLYAKCGLLHWSLKVFQIMTQKDI
VSWNSIITAYAQHGKGKEAVHCFEMMQELGGVIPDNTTFNAVLSACSHSGLINKGIEVFT
SMVHSYGIEPTADHFSCIVDLLGRAGYLDEAEKLVKDRHVDVDSTVWWTLFSSCAAYGNV
KLGRIAAGFLLETEKNNPSVYVLLSNIYASAENWEGSANVRKLMNKCGVLKQPGSILTCL
VSKFNLTYQKEIVHGGRKVLCLKNLDYNMTNLWVEPKLVILLLYGICFLFFFIFINHTGG
YSVDVTIKALGR*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc05g046280.2.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XBJ8_CYNCS)

Sequence

ATGAAGTTAAGTGAAAGCTCCATAAAACAACTCAATTCCCTTCTTTCAAACTTCACTCAT
TCCCACCAATTCTCCGATGCTCTCTCTCTCTTCAACCAAATTCACTCTTCCCTTCATCTC
AGACCTGATCATTACACCCTTTCAACCACTCTCACCGCCTCTGCCAACATCCTTAACACT
ACCTTCGGCAATCAGCTCCACGGTTTCGCCATTAAAACACACCTTAAACAATACCCATAT
GTATCGAATTCTCTCCTTTCATTCTATGCCAAATCTAAAGATTTGGGTTCAGTTAAAAGG
GTCTTTAAAGAAATTGAATCCCCAGATGTTTATTCTTGGACTACGCTATTGTCTGCTTCT
ACCAAGTTGGGTGAAGTTGGGTATGCTTGTAAGGTGTTTGATGAAATGCCGCACAGGAAT
TTGGCTGTGTGGAATGCAATGATTACTGGGTGTGCTGAAAGTGGGTATCACGGGATTGCT
TTGGATTTTTTTCAAAGAATGCATTTTTTGGGTGTTAGATATGATAATTATGCTTTTGCT
AGTATTTTAAGTTTGTGTGATATGGAGTTATTGGATTTTGGAAGACAAGTGCATTCGATG
GTCATCAAGACGGGGTTTTTGGTAAGAGCTTCGGTGATTAATGCTTTGGTTACCATGTAT
TTTAACTGTAAGAATGATTTTGATGCTTTTGGAGTATTTGAAGAAGCTGAGGATGAAGTG
CTTGATACTGTAACTTATAATGCAATGATCGCTGGTTTAGTGAGTATGGAAAGAGCTGAG
GAGGCATTAATAATGTTCAAGGATATGTGTAAGTTTTCTTTGAGACCTACCAAGCTCACA
TTTGTGACCATAATGAGTTCATGTACGTGTACTAGAATTGCTTCTCAATTGCATGCTCAA
GTTGCTAGAATAGGTTTGGAAAACTATACATCTATCGCTAATGCAACAATAACCATGTAT
GCTAGTTGTGGGAACTTGAATGAAGCCCTTTTAGTTTTTGAAAGACTAAGGGTGAAGGAT
AACGTGTCGTGGAATGCCATGATTACGAGCTATGCCCAAAATTGTCTGGACAGTGCAGCA
ATTTCTGCATACATTCAAATGCAGAAGGAAGGGTTAGAGCCAGACGAGTTTACCATAGGA
AGCATACTTGCAAGCTCAGAGTCTCTAGTAATTGTTGAAATAATTTTGGGTGTTGTTTTG
AAGAAGGCCCTTATCTTTAAGACTGAAGTATCTAATGCTCTGCTCTCTGCCTTCTGCAAG
CATGGTGAAATGAAGCAGGCTTATCAAGTTTTTCATGACATGTTTCCTAGAAACATGATC
TCTTGGAATACATTGATTTCTGGTTGTCATCTCAACGGACTACCCATGGGGTGCTTGCAC
CTCTTCTCTGAGATTGTTAGTGAATGTTTGATGCCTAACCCTTTTACTCTTAGCATCATT
TTGAGTGTTTGTGCCAGCATTTCAGCTCTTCAACAAGGGAAGGAGATTCATACTTTCATT
CTCAAATCTGGATTCATTTCAGAAATATCTTTAGGAAATGCCCTCATCACATTGTATGCA
AAATGTGGACTGTTGCATTGGTCTCTTAAGGTTTTCCAAATAATGACACAAAAAGACATA
GTTTCTTGGAATTCAATTATTACTGCATATGCACAGCATGGGAAAGGCAAAGAAGCTGTA
CATTGCTTTGAGATGATGCAAGAATTAGGTGGGGTCATACCAGATAACACAACCTTTAAT
GCAGTTCTATCAGCTTGCAGCCATTCAGGCTTAATCAATAAAGGCATTGAAGTTTTTACC
TCCATGGTTCATAGCTACGGTATAGAACCTACAGCAGACCACTTCTCTTGCATTGTTGAT
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GATGTAGATTCCACTGTTTGGTGGACATTATTCAGTTCCTGTGCTGCTTATGGCAATGTT
AAACTAGGCAGAATTGCTGCGGGATTTCTGCTTGAGACTGAGAAGAATAACCCCTCTGTT
TATGTGCTTTTATCCAATATTTATGCCAGTGCAGAGAACTGGGAGGGCTCTGCTAATGTG
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TACAGTGTTGATGTAACTATTAAAGCTTTGGGTCGATGA