Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc05g026310.3.1

CDS Infomation

Derlin (AHRD V3.3 *** A0A0V0HZ18_SOLCH),Pfam:PF04511

Sequence

ATGTCATCTCCTGCAGAGTTCTATAAATCTCTTCCACCTATAAGCAAGGCTTATGGAACT
GCTTGTCTGCTGTTTACCATTGCATATCAGTTGGGTTTTTATCACCCTGCTGATATTGCA
TTATTATATGAGCTAGTACTCTATCGTTTTCAGGTATGGAGATTGATTACAAATTTCTTC
TTTCTTGGGAAGTTCTCAATTAATTTTGGGATTCGCCTCTTAATGATAGCGAGATATGGA
GTGCAACTAGAGAGTGGACCTTTTCAAAGACGAACAGCAGATTTTCTGTGGATGATGATA
TTTGGAGCTCTGACATTATTGGCTTTATCTGTAATCCCCTTCTTCCGTTCCCCATTCTTG
GGTGTATCACTGGTTTTCATGCTTCTGTATGTCTGGAGTAGAGAATTCCCAACTGCAAAT
ATCAACATTTATGGTCTTGTGACCCTAAAGGCATTTTACTTGCCATGGGCCATGCTAGGT
TTAGATGTTATTTTTGGTTCACCAATTATGCCAGATCTCACGGGGATCATTGCTGGACAT
CTCTATTACTTCTTAACCGTTTTGCATCCACTTGCTACTGGGAAGAACTTTCTGAAGACA
CCAATTTGGGTACATAAGTTGGTTATGCGTTGGAGGATTGGTGCACCAACTGGTACTCCT
GCACAACCTGATAATCCTGGTGCAGCTTTCAGAGGGAGATCTTATCGGGTTGGTGGAGCA
ACAGGGTATCCTGCACAACCTGATAGGGGTTCTGGTGTAGCCACAACTAATCCTGTGCAA
CCTCATAACGGTCCTGGTGTAGCATTTAGAGGGAGATCATATCGCCTTGGTGGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc05g026310.3.1

PEP Infomation

Derlin (AHRD V3.3 *** A0A0V0HZ18_SOLCH),Pfam:PF04511

Sequence

MSSPAEFYKSLPPISKAYGTACLLFTIAYQLGFYHPADIALLYELVLYRFQVWRLITNFF
FLGKFSINFGIRLLMIARYGVQLESGPFQRRTADFLWMMIFGALTLLALSVIPFFRSPFL
GVSLVFMLLYVWSREFPTANINIYGLVTLKAFYLPWAMLGLDVIFGSPIMPDLTGIIAGH
LYYFLTVLHPLATGKNFLKTPIWVHKLVMRWRIGAPTGTPAQPDNPGAAFRGRSYRVGGA
TGYPAQPDRGSGVATTNPVQPHNGPGVAFRGRSYRLGG*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc05g026310.3.1

Transcript Infomation

Derlin (AHRD V3.3 *** A0A0V0HZ18_SOLCH),Pfam:PF04511

Sequence

CTAAGGGGTAAATATGTAAACAAGAATTGTTCTATAAATACGTACCGTAGATATATTTAT
AAATAAGTCCTCTAGAATATTCTAATGATGCTAATATTTGCCAATCGAATATTTTATTAA
ATATCTAAAATTTAAGAGAAATTGTTTCAAACATTCAATAAGAAGACATCGAAGGCAAAT
TTTAGAATGTGTGGCCCACTCTAATACATTCTGGAATTTCCATTCTCGTTGAAATCGTTA
TTGACAAATAGCAATTTCCTTGTTATCGTCGTCCAAAGTTTGATATCTTTTGCTTAGGAA
ACCGAACTTGTCAATTGCTTTTGAGATCTCTTAAGGGTTCTGAATTCGCAATGTCATCTC
CTGCAGAGTTCTATAAATCTCTTCCACCTATAAGCAAGGCTTATGGAACTGCTTGTCTGC
TGTTTACCATTGCATATCAGTTGGGTTTTTATCACCCTGCTGATATTGCATTATTATATG
AGCTAGTACTCTATCGTTTTCAGGTATGGAGATTGATTACAAATTTCTTCTTTCTTGGGA
AGTTCTCAATTAATTTTGGGATTCGCCTCTTAATGATAGCGAGATATGGAGTGCAACTAG
AGAGTGGACCTTTTCAAAGACGAACAGCAGATTTTCTGTGGATGATGATATTTGGAGCTC
TGACATTATTGGCTTTATCTGTAATCCCCTTCTTCCGTTCCCCATTCTTGGGTGTATCAC
TGGTTTTCATGCTTCTGTATGTCTGGAGTAGAGAATTCCCAACTGCAAATATCAACATTT
ATGGTCTTGTGACCCTAAAGGCATTTTACTTGCCATGGGCCATGCTAGGTTTAGATGTTA
TTTTTGGTTCACCAATTATGCCAGATCTCACGGGGATCATTGCTGGACATCTCTATTACT
TCTTAACCGTTTTGCATCCACTTGCTACTGGGAAGAACTTTCTGAAGACACCAATTTGGG
TACATAAGTTGGTTATGCGTTGGAGGATTGGTGCACCAACTGGTACTCCTGCACAACCTG
ATAATCCTGGTGCAGCTTTCAGAGGGAGATCTTATCGGGTTGGTGGAGCAACAGGGTATC
CTGCACAACCTGATAGGGGTTCTGGTGTAGCCACAACTAATCCTGTGCAACCTCATAACG
GTCCTGGTGTAGCATTTAGAGGGAGATCATATCGCCTTGGTGGGTGAATGGCTACATTTT
CTTCTGCCAACCAGTAGCTTCAAGTGACAATGCATTTATATTCACGGTATCTTGATGATG
CAAGTCAAGGGAGTCTTTTAGTTTTATTTCTAAATATAATGTTGAAGGTGTAATTCTGCG
AAGGGTATTGTGTTGAAACATAGGTGAATCCAAAACCATCAGTAATCATCCCTTTCGGAA
GTAAAAACTGATTCTGTAGATTCATTTCCTTCTAAATTTTCCCAGTAGAATATTTTACAG
AAGGTAAACTGAAAACAGATTATGTTCCGTGGGGGAAGAAGTGATAGGTGAAAATTTTCT
TTTAGATGTTTGCTAATTTGCATTGGAAAACTGACAGTGGATGCAAGTCTGGTACTTCAG
CTTCAATTGGGAGTCATATATTCCTTGCTTCTACCACCCAAAATGGTTGATGGTTTTGCT
ATGGTACGAATGTTAGTAGTTATTTTGAATTAAGTTGTACTCTTCTTGACTGCTACTTTT
GTTATAAAAAGAAAAGGTTGCCATTTGAAACATTGATGCATTCATCTGAGCATTTACAGT
TTAAATTTAGGAGTTGAATATCATCTTGACTAATTTCATGCATCTGCTGGGTTTTGTCTT
GGTTCATCAGGTTGTGACAAAAATTACTTTTGCATAGTTACATAATTAGGGAGTTTTGGA
TGCTGAGGATTGGGTTAAAAGGTACCTTATTGTCTTCCCTGAAGTTATGCTGGATTGCTG
GATTCTGTGGTTTCCTGAGCCAGTAAATGCGTTTGAGATTACAGAAGTAAATATTGAGTC
TTGATTATCCATGAGTAAAGTGATTACCTCTTTGGAGTCAGTTTCAATTATGAAGGGGAG
AAAATTGTGACGAGAAGCAATCTAAGGTTCCCTTGAGCAAGGAGGTGATCTCCATGGAAG
TATACCTCCAAGATTTTGATTATACTGTAGTTTCCAATTTCCAAGATCATCACATATAAC
GCCACCTATACTTCCTTTCATAGAGGTAATGGGGAAGGATCCATCAATATTTAGCTTGTA
GTAGCTAGAAGAGGGGTTTCTAGAAAATTTGGATGAAGGTCTTATTAAAGGAATCATAGG
AGGACTTGGTAATATAAGTATATTCAATGGTGAGTGTAAAAACTTGAGAGGGTTGTGAAA
A