Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc05g025500.3.1
CDS Infomation

Glucan endo-1,3-beta-glucosidase, putative (AHRD V3.3 *** B9SWK2_RICCO)
Sequence

ATGGGGTTGTTTCCATTTTCAAAATCATTTCCGGTGTTATTTCTTCTAGCTATGTTATTG
TTTTCCCCAACAGTGAGTGGGATAGGTGCTAACTGGGGTACTCAGTCAACACATCGTTTG
CCTCCTGAAATAGTAGTAAGAATGCTAAAAGATAATGGGATCCAAAAGGTTAAACTTTTT
GATGCTGATTATGACACACTTAAAGCTTTGGGAAAATCAGGTCTTGAAGTTATGGTTGGT
ATTCCTAATGATATGCTTTCAAGTATGGGTAGCTTGAAAGCTGCTGAGAAATGGGTTTCT
AAAAATGTTTCTGTTCATATCAATGATAACAATGTCAACATCAGGTATGTTGCAGTTGGA
AATGAACCTTACTTGACAACTTACAATGGCACTTACCTTCGAACAACTCTTCCTGCTATG
CAAAATATCCAAACTGCACTCGTAAAAGCTGGCCTCGGTAGTCAAGTAAAGGTTACTTGT
CCTCTCAATGCAGATGTTTATGAGAGCTCCAACACTTTCCCATCAGGTGGTGATTTTCGA
GCTGAGATCCATGGCTATGTAAGCCAACTTGTCAAGTTCTTAAGCGACAATGGTTGTCCT
TTTACAATCAATATCTATCCATTTATAAGTCTTTATATTGACCCCAACTTCCCAGTTGAA
TATGCATTCTTTGATGGAAATGCAACACCTCTAAATGATGGTGGGACAATCTACAGCAAC
ATGTTTGATGCAAATCACGACACTCTTGTGTGGGCTTTACAGAAGAATGGGTTTGGGAAC
GTGCCTATAATTATTGGAGAAATTGGTTGGCCCACTGATGGTGACCGCAATGCTAATGCA
CAACTTGCACAGCGATTCAACCAAGGATTCATGCAGCATATATCCGGAGGAAAAGGCACC
CCTATGAGGCCTGGGCCTGTTGATGCCTATCTGTTTAGTTTGATTGATGAGGATGCTAAG
AGTATCCAACCTGGAAATTTTGAACGTCACTGGGGAATACTTACATATGATGGACTACCG
AAATACTCGCTAAATCTTGGCACCACGAATTCAGGGTCATTAGTTCCAGCTAGAAATGTG
AAGTATCTGGAGAGGAAATGGTGTGTGTTAAAGCCGAATGCTAAGCTTGATGACCCCCAG
ATTGCACCTAGCATGAGCTATGCTTGTGGACTTGCTGACTGCACGAGCCTTGGATATCAG
ACATCTTGTGGAGGTTTGGATGCACGAGGAAATATTTCATATGCATTCAACAGCTACTAC
CAGATAAACAATCAGCTTGATGATGCTTGCAAGTTCTCTGGCCTCGCAACTGTCACAAAG
TCAGATCCATCAACTGGTACTTGTCGATTTGGGCTCATGATAGAACCATACTACGGAGGT
GCTCAACCAAAATGTGGCTATACTAAGACGACATTGGCTCTCATCCTCTTTCTGTGGACA
ATTGTGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc05g025500.3.1
PEP Infomation

Glucan endo-1,3-beta-glucosidase, putative (AHRD V3.3 *** B9SWK2_RICCO)
Sequence

MGLFPFSKSFPVLFLLAMLLFSPTVSGIGANWGTQSTHRLPPEIVVRMLKDNGIQKVKLF
DADYDTLKALGKSGLEVMVGIPNDMLSSMGSLKAAEKWVSKNVSVHINDNNVNIRYVAVG
NEPYLTTYNGTYLRTTLPAMQNIQTALVKAGLGSQVKVTCPLNADVYESSNTFPSGGDFR
AEIHGYVSQLVKFLSDNGCPFTINIYPFISLYIDPNFPVEYAFFDGNATPLNDGGTIYSN
MFDANHDTLVWALQKNGFGNVPIIIGEIGWPTDGDRNANAQLAQRFNQGFMQHISGGKGT
PMRPGPVDAYLFSLIDEDAKSIQPGNFERHWGILTYDGLPKYSLNLGTTNSGSLVPARNV
KYLERKWCVLKPNAKLDDPQIAPSMSYACGLADCTSLGYQTSCGGLDARGNISYAFNSYY
QINNQLDDACKFSGLATVTKSDPSTGTCRFGLMIEPYYGGAQPKCGYTKTTLALILFLWT
IV*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc05g025500.3.1
Transcript Infomation

Glucan endo-1,3-beta-glucosidase, putative (AHRD V3.3 *** B9SWK2_RICCO)
Sequence

GAGATTTTTTTTAGATCAAAATATTAGTGATGGAATTAAAGGTTACTATGATTAATCGTT
ATCTAAATAAAAATTAATCATAATGTTATTATAATTGTATATATTGCTTATATGTTATCA
GTTTAAAAAATGTAGAGGTAATTTCATTTTAATTAGTAAAAACAATTTAAAAGAAAAAAA
CCGCTCTCTACTATTCGATTAATAAAAAAGTTTTTTCTAAAAATTTCTTTGTAAATAATG
TATGTATAAAGAATTTTCTTATATATATTTATTAAAAATAATAATATTTCTCCCAAAGAT
AATATTTTGGATATTTTAAAAATAAAATATTAATGATAAAAATAATTTTAAAGCAAACTT
TTTATTTAATTTTATATAAGTACATTTTTTTAACAAAATAAAGATGTTCAGTCGTGTAAA
TGAAAAAAGATGAGTGTGTAACACTATTGTCTGTTCTGATTGTTGATAAAGACAAGTCCT
TTAAAATATTGATGAGACTGTCTGCCAGATGACCCCCAAGTACAAGTGCATTTTAGTTTT
TATCTCATTATTTTTACTATAGTAACATTATTTTAAAATAATTTATATCAAAAGAACTTG
TTCCAACTAAACAAGCCTAATAATACAATCTATGTTTCATCTTCACTAGTATGCTATTGG
GATTCACACTACGTTGTGTTAATGACTCACACTTGGGATAGATAGATAAGTCCCTTTGTT
TTTTGTTGCCTTTCTTTCCATAAGGAAGAAAAAGTTCTTTTTGGCTTGAAATATTTAACC
CTTTTCTTGCTCGGGTTATTCCCTCTTCCACTTGTCTCTCCTTTTCAATAAAAATTCAAG
TTCTTTTTTCTCTTCTTAGGTGGAATTTGAAGTTACCCTAAACACTTACTTTTGAGCTGT
AGACAAAGAATCTTTTCCATTACAGACAAGAATCAACTGTTGCTAGCTTAGAGCTCACTT
TAGTTGTAGAACAAACTCTATTGTAGTTCCTAGTTTTGTTTAGTCTAAAGAAGTGAATTT
TCTTGAAAAAATATGGGGTTGTTTCCATTTTCAAAATCATTTCCGGTGTTATTTCTTCTA
GCTATGTTATTGTTTTCCCCAACAGTGAGTGGGATAGGTGCTAACTGGGGTACTCAGTCA
ACACATCGTTTGCCTCCTGAAATAGTAGTAAGAATGCTAAAAGATAATGGGATCCAAAAG
GTTAAACTTTTTGATGCTGATTATGACACACTTAAAGCTTTGGGAAAATCAGGTCTTGAA
GTTATGGTTGGTATTCCTAATGATATGCTTTCAAGTATGGGTAGCTTGAAAGCTGCTGAG
AAATGGGTTTCTAAAAATGTTTCTGTTCATATCAATGATAACAATGTCAACATCAGGTAT
GTTGCAGTTGGAAATGAACCTTACTTGACAACTTACAATGGCACTTACCTTCGAACAACT
CTTCCTGCTATGCAAAATATCCAAACTGCACTCGTAAAAGCTGGCCTCGGTAGTCAAGTA
AAGGTTACTTGTCCTCTCAATGCAGATGTTTATGAGAGCTCCAACACTTTCCCATCAGGT
GGTGATTTTCGAGCTGAGATCCATGGCTATGTAAGCCAACTTGTCAAGTTCTTAAGCGAC
AATGGTTGTCCTTTTACAATCAATATCTATCCATTTATAAGTCTTTATATTGACCCCAAC
TTCCCAGTTGAATATGCATTCTTTGATGGAAATGCAACACCTCTAAATGATGGTGGGACA
ATCTACAGCAACATGTTTGATGCAAATCACGACACTCTTGTGTGGGCTTTACAGAAGAAT
GGGTTTGGGAACGTGCCTATAATTATTGGAGAAATTGGTTGGCCCACTGATGGTGACCGC
AATGCTAATGCACAACTTGCACAGCGATTCAACCAAGGATTCATGCAGCATATATCCGGA
GGAAAAGGCACCCCTATGAGGCCTGGGCCTGTTGATGCCTATCTGTTTAGTTTGATTGAT
GAGGATGCTAAGAGTATCCAACCTGGAAATTTTGAACGTCACTGGGGAATACTTACATAT
GATGGACTACCGAAATACTCGCTAAATCTTGGCACCACGAATTCAGGGTCATTAGTTCCA
GCTAGAAATGTGAAGTATCTGGAGAGGAAATGGTGTGTGTTAAAGCCGAATGCTAAGCTT
GATGACCCCCAGATTGCACCTAGCATGAGCTATGCTTGTGGACTTGCTGACTGCACGAGC
CTTGGATATCAGACATCTTGTGGAGGTTTGGATGCACGAGGAAATATTTCATATGCATTC
AACAGCTACTACCAGATAAACAATCAGCTTGATGATGCTTGCAAGTTCTCTGGCCTCGCA
ACTGTCACAAAGTCAGATCCATCAACTGGTACTTGTCGATTTGGGCTCATGATAGAACCA
TACTACGGAGGTGCTCAACCAAAATGTGGCTATACTAAGACGACATTGGCTCTCATCCTC
TTTCTGTGGACAATTGTGTAACAATTTTTTTTCTGGTTATTTAGTTCGATTGTTGACCCT
GCCTGCCTGCTATGTAATGTAGCTATTACCAAATCAACATATATTTTTTCTTCTTACGGT
TACTGTTGACAGCAAACACTGATATTCGTTAATTCAGAACTTTGGATGGTGAAATTAATG
TTTGCTTCTGATTTCGAACGTCATGCACTGGTGTTCCTAATTATTTTTATCCGTCTATTT
TGTATGTGACCTGTAACATTTTCAGGAATACAAGTCATTTTTTTGAGTAATG