Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc05g024415.1.1
CDS Infomation	Galactose oxidase/kelch repeat protein (AHRD V3.3 *** G7IH11_MEDTR)
Sequence	ATGGCTGCAGCAGCAACACAAGGCAAATGGATCAAGCTGGAGGAAAAAGGCGCCGGACCT GGGGCAAGAAGCTCACATGCCATCACCATTGTGGGACATAAGGTCTATTCCTTCGGGGGT GAGTTCACACCTCGTGTCCCTGTTGACAACAAATTGTACGTGTTTGATCTCAATAGCCAA GAATGGTCTGTGGCTGATGCTGCTGGGGATGTCCCTCCCCCTCGTGTAGGTGTCACTATG GCCACTGTAGGGGAGACTGTCTTCATCTTTGGTGGCAGAGATGCCGAACATATGGAGCTT AACGAGCTTTATTCTTTCGACACAACTACCAACAAATGGACCTTATTGTCTAGTGGTGAT GACGATGACCCTCCTCATCGGAGCTACCACTCGATGACTGCTGATGATCGGAGGATCTAT GTCTTTGGTGGTTGTGGAAATGCTGGAAGGTTAAATGATCTTTGGGGTTACGACGTTGTT GATAAGAAATGGATCAAATATCCTGTACCAGGGGAAAATTGTAAACCAAGAGGTGGACCT GGTTTGACAGTGGTCCTAGGAAAAATATGGGTTGTCTACGGATTTTCCGGTGATGAGCTT GATGATGTACATTACTTTGATACAATTGAAGAAAAGTGGATGCAAGTTGGGACAAATGGT GAAAAACCTACTGCTAGGAGTGTATTTTCAACAGTTGGGATTGGGAAATTCATTTTTATC TATGGTGGTGAAACAGACCCTAGTGACTTAGGTCATTTAGGTGCTGGGAAATTTGCAGGC GATGTCTATGCACTTGATACAGAGACACTAGTTTGGAAGCGGTGGATGGATTCCGGTGAC CATCCAGGGCCACGAGGGTGGTGCGCCTTTGCTAGTGGACAGCGAGATGGCCAAGAGGGG CTGCTGGTTTATGGTGGCAATACACCATGCAATGATAGGCTTGGTGACATTTTCTTTTTC ACTCCCCTGGTGGAGATTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc05g024415.1.1
PEP Infomation	Galactose oxidase/kelch repeat protein (AHRD V3.3 *** G7IH11_MEDTR)
Sequence	MAAAATQGKWIKLEEKGAGPGARSSHAITIVGHKVYSFGGEFTPRVPVDNKLYVFDLNSQ EWSVADAAGDVPPPRVGVTMATVGETVFIFGGRDAEHMELNELYSFDTTTNKWTLLSSGD DDDPPHRSYHSMTADDRRIYVFGGCGNAGRLNDLWGYDVVDKKWIKYPVPGENCKPRGGP GLTVVLGKIWVVYGFSGDELDDVHYFDTIEEKWMQVGTNGEKPTARSVFSTVGIGKFIFI YGGETDPSDLGHLGAGKFAGDVYALDTETLVWKRWMDSGDHPGPRGWCAFASGQRDGQEG LLVYGGNTPCNDRLGDIFFFTPLVEI*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc05g024415.1.1
Transcript Infomation	Galactose oxidase/kelch repeat protein (AHRD V3.3 *** G7IH11_MEDTR)
Sequence	ATGGCTGCAGCAGCAACACAAGGCAAATGGATCAAGCTGGAGGAAAAAGGCGCCGGACCT GGGGCAAGAAGCTCACATGCCATCACCATTGTGGGACATAAGGTCTATTCCTTCGGGGGT GAGTTCACACCTCGTGTCCCTGTTGACAACAAATTGTACGTGTTTGATCTCAATAGCCAA GAATGGTCTGTGGCTGATGCTGCTGGGGATGTCCCTCCCCCTCGTGTAGGTGTCACTATG GCCACTGTAGGGGAGACTGTCTTCATCTTTGGTGGCAGAGATGCCGAACATATGGAGCTT AACGAGCTTTATTCTTTCGACACAACTACCAACAAATGGACCTTATTGTCTAGTGGTGAT GACGATGACCCTCCTCATCGGAGCTACCACTCGATGACTGCTGATGATCGGAGGATCTAT GTCTTTGGTGGTTGTGGAAATGCTGGAAGGTTAAATGATCTTTGGGGTTACGACGTTGTT GATAAGAAATGGATCAAATATCCTGTACCAGGGGAAAATTGTAAACCAAGAGGTGGACCT GGTTTGACAGTGGTCCTAGGAAAAATATGGGTTGTCTACGGATTTTCCGGTGATGAGCTT GATGATGTACATTACTTTGATACAATTGAAGAAAAGTGGATGCAAGTTGGGACAAATGGT GAAAAACCTACTGCTAGGAGTGTATTTTCAACAGTTGGGATTGGGAAATTCATTTTTATC TATGGTGGTGAAACAGACCCTAGTGACTTAGGTCATTTAGGTGCTGGGAAATTTGCAGGC GATGTCTATGCACTTGATACAGAGACACTAGTTTGGAAGCGGTGGATGGATTCCGGTGAC CATCCAGGGCCACGAGGGTGGTGCGCCTTTGCTAGTGGACAGCGAGATGGCCAAGAGGGG CTGCTGGTTTATGGTGGCAATACACCATGCAATGATAGGCTTGGTGACATTTTCTTTTTC ACTCCCCTGGTGGAGATTTGAGTGCTGGAAATGACATGTTTTCAATGTTGTAAGAAAAAA CAATCTTCAAGTTTGAATTTGAGTTTTTAGCCTTGTGTTGGATAATGGGGGAAAATATCT TCAGTACTGTTTATTGATGTTCTTATAAAGGTTTGTTCAATTTGTTAAACCAGGGTGTAT GTTGTTGAAAGTCTTGCTTTCGATCACTAATTTTTATGTTTAAATTTACATATAAT