Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc05g023750.3.1
CDS Infomation	ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein (AHRD V3.3 *** G5DWI4_SILLA)
Sequence	ATGCATTTTGGTAAACTTGATGACTCTCCCATGTTCCGTAAACAGCTGCAATGTTTTGAA GAAAGTGCTGAATCACTAAGAGAAAGAAGCTTGAAATTTTATAAAGGATGTCGAAAATAT ACGGAGGGACTTGGAGAGGGATATGATGGAGATATTGCTTTCGCGAGCGCCCTGGAAACA TTTGGTGGGGGGCACAATGATCCTATCAGTGTTGCATTTGGAGGCCCTGTAATGACTAAA TTTACTATTGCACTGAGGGAAATCGGGACTTATAAGGAAGTTCTTCGGTCACAGGTTGAG CACATGCTGAATGATCGTTTACTGCAGTTTGTTAACATAGATCTGCAAGATGTCAAGGAA GCTCGGAAGCGCTTTGACAAGGCAAGCCTAATTTATGATCAGGCCCGCGAGAAGTTTTTG TCACTAAGAAAAGGCACAAAAAGTGATGTTGCCAGTGTACTGGAGGAGGAACTTCATAAT GCAAGATCAACTTTTGAGCAAGCTCGATTCAGTTTGGTAACCGCTCTTTCTAATGTGGAA GCAAAGAAACGGTTTGAATTCCTGGAAGCAGTTAGTGGTACAATGGATGCTCATCTTCGT TATTTCAAACAGGGGTATGAGCTTTTGCATCAGATGGAGCCATATATCAATCAGGTCCTG ACTTACGCACAGCAGTCTCAAGAACGCTCCAACTATGAGAAAGCAGCTCTTAATGAAAAG ATGCAAGAATACAAGAGACAAGTAGATCGAGAGAGCAGGTGGTTGTCCAATGGTTCTAAT GGATCCCCTAATGGAGATGGTATACAAGCCATTGGCAGAAGTTCACACAAGCAAATAGAA GCTGTCATGCAATCTGCTGCAAGGGGAAAGGTTCAAACCATTAGACAAGGTTATCTATCA AAGCGCTCATCAAATTTGAGGGGAGACTGGAAAAGAAGGTTCTTTGTTCTTGATAGCCGT GGAATGTTGTATTACTATCGCAAACAGAACACAAAACCATCTGGGTCAGGTAGTCAACAT TCTGGCCAGAGAAATAGTTCAGAGCTTGGTTCTGGACTTCTTAGTCGCTGGCTTTCGTCC CATTATCATGGTGGTGTACACGATGAAAAGTCTGTTGCTCATCACACTGTAAACCTTTTG ACATCAACTATAAAGGTTGATGCTGACCAATCAGATCTGCGGTTTTGCTTCAGGATTATC TCCCCTACAAAGAGCTACACCTTGCAGGCAGAGAGTGCCTTGGACCAAATGGATTGGATT GAGAAAATAACAGGAGTTATTGCTTCTTTGTTGAGTTCTCAGGCCCCTGACAGGTGTTTG ACTGCCAGTCCTATGGGAAGTGGTCATCATCGATCTGCCAGTGAGAGCAGTTCATTTGAA AGTTCAGATTTTGACCCGCCTGCAGTTGAAGACCATCCGTCTGACAGGCTTATCTCAGCA CATCATGATCGCCCTTTCAGAAATTCACAGCAGCTACGATCTGCTCCAAAAAGTGAACAG CCAATTGCCACACTATGTAGAGTATGTGGAAATGATAGATGCGCTGACTGTGGTGCTGCT GAACCAGATTGGGCATCTTTAAATCTTGGTGTTCTTGTTTGTATTGAATGTTCAGGTGTT CATCGTAATCTTGGTGTGCATATATCAAAGGTGAGGTCACTCACACTTGATGTCAAAGTA TGGGAGCCTTCTGTTATAGCTTTATTTCAGTCGTTGGGGAATACCTTTGCAAATTCAGTC TGGGAAGAGTCACTGCAAGCTCGAGGTGCTTTCCAAGTTAATGTTTCCGCTGCCAGCTCA TACAGATCTGATAAACAGCAACAGCTCTACATCAGCAAGCCAAGTCATGCTGATCCCATT TCAACCAAGGAGAAATTCATCCATGCAAAGTATGCAGATAAATCATTTGTTCGTCGGACC AAGGATGGTCACACTGTGGCACAAATGATGTGGGAGGCTGTTCGAGCTAATGATAAGAAA GCTGTGTATCGCCTTATTGTAAGCTCTGAAGCAGATGTTAATGCTCTTTACAAGCAAGTT GTGTCTAATTCTTCCTTAACCCTTGCTAAAGTAATGCTGTTACAAGAACTACCATACACT GATCAGAGTTCAACTTGCTTAGAAATGGACTTGGCAAGTCCAAGTGAGAGGCTTATAGTT GGGGACTTCAATGGGTGCTCCCTTCTACACCTTGCTTGTCAAACAGCTGACCTAGGGATG CTAGAGCTTCTTATGCAGTACGGTGCAAATGTAAATGCTTCAGATTCAAGTGGTCAGACA CCACTTCATTGGTGCATTATAAGAGGCAAAGCTGCATTTGCTAAGTTGCTTATTGCAAGG GGTGCTGATCCACATGCTTTGGATGGGGAAAGTAAAACCCCTTACGATCTTGCATTGGGC TCAAATTTTGATGACGTTGATGTCCTTAATCTCTTGTCAGACACAAATGCTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc05g023750.3.1
PEP Infomation	ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein (AHRD V3.3 *** G5DWI4_SILLA)
Sequence	MHFGKLDDSPMFRKQLQCFEESAESLRERSLKFYKGCRKYTEGLGEGYDGDIAFASALET FGGGHNDPISVAFGGPVMTKFTIALREIGTYKEVLRSQVEHMLNDRLLQFVNIDLQDVKE ARKRFDKASLIYDQAREKFLSLRKGTKSDVASVLEEELHNARSTFEQARFSLVTALSNVE AKKRFEFLEAVSGTMDAHLRYFKQGYELLHQMEPYINQVLTYAQQSQERSNYEKAALNEK MQEYKRQVDRESRWLSNGSNGSPNGDGIQAIGRSSHKQIEAVMQSAARGKVQTIRQGYLS KRSSNLRGDWKRRFFVLDSRGMLYYYRKQNTKPSGSGSQHSGQRNSSELGSGLLSRWLSS HYHGGVHDEKSVAHHTVNLLTSTIKVDADQSDLRFCFRIISPTKSYTLQAESALDQMDWI EKITGVIASLLSSQAPDRCLTASPMGSGHHRSASESSSFESSDFDPPAVEDHPSDRLISA HHDRPFRNSQQLRSAPKSEQPIATLCRVCGNDRCADCGAAEPDWASLNLGVLVCIECSGV HRNLGVHISKVRSLTLDVKVWEPSVIALFQSLGNTFANSVWEESLQARGAFQVNVSAASS YRSDKQQQLYISKPSHADPISTKEKFIHAKYADKSFVRRTKDGHTVAQMMWEAVRANDKK AVYRLIVSSEADVNALYKQVVSNSSLTLAKVMLLQELPYTDQSSTCLEMDLASPSERLIV GDFNGCSLLHLACQTADLGMLELLMQYGANVNASDSSGQTPLHWCIIRGKAAFAKLLIAR GADPHALDGESKTPYDLALGSNFDDVDVLNLLSDTNA*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc05g023750.3.1
Transcript Infomation	ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein (AHRD V3.3 *** G5DWI4_SILLA)
Sequence	ACCTTATAATTTCATATTAAAAGACTTGAATTCGAGACTTTCGTCAATAGTTTCTTTTCA GCTGCCATTAAAATTTAAAAGTAAAGTATGTTTAGTAAAATTAGATTAGAAAGAGAATGA CAAGTTAGTTCTACAGGAGTTTGCTGCTGCTAACAACAATACTACTACATTTATTCAGTT CCCAAGAATTTTTCCTTTTTCTCTCCATTTCTAGGGTTTCTACCCAACCTCTCTAGGGTT TTGTACCAACATACATCTATCCATCGTCTTGATTTGTGGTTACTAGTTGAGCTTTGTTCT TGTCTACTCAATTGAGATCGATAACGACAGTTGAAATGGTAGATCTTTGTTATGGCATTT GATAAAAGTTTAAATCAGGCAAGATCGAACATCTTTTCATATGGTGTGTTGTAATGTTAA TTGAGAATTGGTGTAGAAAAGAAGAATCAGTTGTGTAAACATGCATTTTGGTAAACTTGA TGACTCTCCCATGTTCCGTAAACAGCTGCAATGTTTTGAAGAAAGTGCTGAATCACTAAG AGAAAGAAGCTTGAAATTTTATAAAGGATGTCGAAAATATACGGAGGGACTTGGAGAGGG ATATGATGGAGATATTGCTTTCGCGAGCGCCCTGGAAACATTTGGTGGGGGGCACAATGA TCCTATCAGTGTTGCATTTGGAGGCCCTGTAATGACTAAATTTACTATTGCACTGAGGGA AATCGGGACTTATAAGGAAGTTCTTCGGTCACAGGTTGAGCACATGCTGAATGATCGTTT ACTGCAGTTTGTTAACATAGATCTGCAAGATGTCAAGGAAGCTCGGAAGCGCTTTGACAA GGCAAGCCTAATTTATGATCAGGCCCGCGAGAAGTTTTTGTCACTAAGAAAAGGCACAAA AAGTGATGTTGCCAGTGTACTGGAGGAGGAACTTCATAATGCAAGATCAACTTTTGAGCA AGCTCGATTCAGTTTGGTAACCGCTCTTTCTAATGTGGAAGCAAAGAAACGGTTTGAATT CCTGGAAGCAGTTAGTGGTACAATGGATGCTCATCTTCGTTATTTCAAACAGGGGTATGA GCTTTTGCATCAGATGGAGCCATATATCAATCAGGTCCTGACTTACGCACAGCAGTCTCA AGAACGCTCCAACTATGAGAAAGCAGCTCTTAATGAAAAGATGCAAGAATACAAGAGACA AGTAGATCGAGAGAGCAGGTGGTTGTCCAATGGTTCTAATGGATCCCCTAATGGAGATGG TATACAAGCCATTGGCAGAAGTTCACACAAGCAAATAGAAGCTGTCATGCAATCTGCTGC AAGGGGAAAGGTTCAAACCATTAGACAAGGTTATCTATCAAAGCGCTCATCAAATTTGAG GGGAGACTGGAAAAGAAGGTTCTTTGTTCTTGATAGCCGTGGAATGTTGTATTACTATCG CAAACAGAACACAAAACCATCTGGGTCAGGTAGTCAACATTCTGGCCAGAGAAATAGTTC AGAGCTTGGTTCTGGACTTCTTAGTCGCTGGCTTTCGTCCCATTATCATGGTGGTGTACA CGATGAAAAGTCTGTTGCTCATCACACTGTAAACCTTTTGACATCAACTATAAAGGTTGA TGCTGACCAATCAGATCTGCGGTTTTGCTTCAGGATTATCTCCCCTACAAAGAGCTACAC CTTGCAGGCAGAGAGTGCCTTGGACCAAATGGATTGGATTGAGAAAATAACAGGAGTTAT TGCTTCTTTGTTGAGTTCTCAGGCCCCTGACAGGTGTTTGACTGCCAGTCCTATGGGAAG TGGTCATCATCGATCTGCCAGTGAGAGCAGTTCATTTGAAAGTTCAGATTTTGACCCGCC TGCAGTTGAAGACCATCCGTCTGACAGGCTTATCTCAGCACATCATGATCGCCCTTTCAG AAATTCACAGCAGCTACGATCTGCTCCAAAAAGTGAACAGCCAATTGCCACACTATGTAG AGTATGTGGAAATGATAGATGCGCTGACTGTGGTGCTGCTGAACCAGATTGGGCATCTTT AAATCTTGGTGTTCTTGTTTGTATTGAATGTTCAGGTGTTCATCGTAATCTTGGTGTGCA TATATCAAAGGTGAGGTCACTCACACTTGATGTCAAAGTATGGGAGCCTTCTGTTATAGC TTTATTTCAGTCGTTGGGGAATACCTTTGCAAATTCAGTCTGGGAAGAGTCACTGCAAGC TCGAGGTGCTTTCCAAGTTAATGTTTCCGCTGCCAGCTCATACAGATCTGATAAACAGCA ACAGCTCTACATCAGCAAGCCAAGTCATGCTGATCCCATTTCAACCAAGGAGAAATTCAT CCATGCAAAGTATGCAGATAAATCATTTGTTCGTCGGACCAAGGATGGTCACACTGTGGC ACAAATGATGTGGGAGGCTGTTCGAGCTAATGATAAGAAAGCTGTGTATCGCCTTATTGT AAGCTCTGAAGCAGATGTTAATGCTCTTTACAAGCAAGTTGTGTCTAATTCTTCCTTAAC CCTTGCTAAAGTAATGCTGTTACAAGAACTACCATACACTGATCAGAGTTCAACTTGCTT AGAAATGGACTTGGCAAGTCCAAGTGAGAGGCTTATAGTTGGGGACTTCAATGGGTGCTC CCTTCTACACCTTGCTTGTCAAACAGCTGACCTAGGGATGCTAGAGCTTCTTATGCAGTA CGGTGCAAATGTAAATGCTTCAGATTCAAGTGGTCAGACACCACTTCATTGGTGCATTAT AAGAGGCAAAGCTGCATTTGCTAAGTTGCTTATTGCAAGGGGTGCTGATCCACATGCTTT GGATGGGGAAAGTAAAACCCCTTACGATCTTGCATTGGGCTCAAATTTTGATGACGTTGA TGTCCTTAATCTCTTGTCAGACACAAATGCTTAATACATTCAAGAGAGTATATATCAAAA CGTGGACAGAGATTGAAGCTGTACCCTTGGTTTGAAATGAAACCAGGGTTTCAGTTCTTT GTAATTATGTTAGTAAATTTTGTGCTCACAGATCTCCATTGAAAGACACCGCCACTTGTG CATTAAGGGCCCTTGACGTTGCATGTTGTGGTCTGCAAGATTCCTGGGGACTACACGTCC GAATCTTGTATTGAAGTATAATGTTAGGGTGGTCTTTCATGCTTGATTTTGGAGGTCAGA TGCATTGGAGGGTTGCAGTCTTTTTGTGTTGTAAAGCTGTGTTTTCTCTTAGTTTTATTG TTTTTTTTAGAGTTTTTTTTTTTGGTGGCAGGTTCTAGGCATTGGCTTTGGGTGCTGGTA TTTTGTGTACATTTTGCTGTTAATTTAACTTTTGTGGTGTAGCCTTTGTAGTTTGTATAT CTAAATCTAAGTGTTATTTTAACTGAGGGAAAAGGATTTGCTTGCCCTTCACTGGTTTAG TACATTTGGTGGTGTATCTAAATCAAATGAACTTGCCCTCTGGTTTGTCCAGAGGCAAGT CTTATTGTTATTGTGATGTTCCCTGTACCAACTTGTTTGTGTGGTTGAAGAAGAAAAGAA TAAACACAACTGGAAA