Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc05g015890.3.1
CDS Infomation	transmembrane protein (AHRD V3.3 *** AT1G27990.1)
Sequence	ATGTCAGGTGTAACGCTAGCTACGGGTCGAGAAGAGACAACATCTTCAACAAGAGAGCCT AAGCGACAACAAGGTGGTGTGGGTGTAATGGGATCACTACGAGTAATTGAGTTACAATTA GTAGCTTTCATTATGGTTTTCTCAGCTAGTGGTCTTGTACCATTACTTGATTTGATTTTC CCAGCTTTAGCATCCGCGTATCTTTTGCTTCTTTCGCGATTTGCGTTTCCATCACTTGGT ACAACTAGTTCTAGTTCCGACGAAACACTATTTCAGGGAAGCCGGTTATTTCGTCTTTAT ATGGTTGCTGGTACTAGTATTGGATTGTTTTTGCCATTGGCATATGTTTTGGGTGGATTT GCTAGGGGTGATCAGCATGCGGTTCGCTCTGCTACTCCTCATTTGTTTTTACTTTCTTTC CAAATTCTAACTGAGAATATTATAAGTGGACTGTCCCTGTTTTCTCCGCCGATTAGAGCA CTTGTTCCCCTGCTTTATACAGTTAGAAGGATCTTTGTTTTAATTGATTGGATACAAGAT GTGTGGATCAACAAGACTTTGCCCCCAAATGCACAAGTCAAGGATGTTACATGGTACTGG TTTGGGAAGGGATTGGCAGTGGCTAATCTGGCGTATTTTTCGATCAATCTGTTTGGTTTC TTGATTCCGCAATTTCTTCCACGAGCTTTCGAGAGGTACTTCAGGGAGAGGAGTGAGGTG AACTCGAAGTTGGCTGAAGATAAGCACTCACAAGCTATCAACAGAACAAAACACGCAGAC AAAAAGGCAGAGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc05g015890.3.1
PEP Infomation	transmembrane protein (AHRD V3.3 *** AT1G27990.1)
Sequence	MSGVTLATGREETTSSTREPKRQQGGVGVMGSLRVIELQLVAFIMVFSASGLVPLLDLIF PALASAYLLLLSRFAFPSLGTTSSSSDETLFQGSRLFRLYMVAGTSIGLFLPLAYVLGGF ARGDQHAVRSATPHLFLLSFQILTENIISGLSLFSPPIRALVPLLYTVRRIFVLIDWIQD VWINKTLPPNAQVKDVTWYWFGKGLAVANLAYFSINLFGFLIPQFLPRAFERYFRERSEV NSKLAEDKHSQAINRTKHADKKAE*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc05g015890.3.1
Transcript Infomation	transmembrane protein (AHRD V3.3 *** AT1G27990.1)
Sequence	TTCTTTAATTAAATAAATGGTATTAATTGAGCGGACCTTTGAGATTTTAGCTCTAATAAT ATAAATCATAGTATACAATACTTTCCTTAAATTTTGCATTTAAAATAAAATCTTGTTACG TATTGTAAGTTTAATAATAAAAAATTATCCAATAGTTTCTTTCTTTTTGTTATTATAAAA TATTTATATACTTTTTTTTAAAAAAAAAGTATGTGCATGCTAGTGATGTATGATACTTGC TAAGCTTTCTTAGAGACCTCCACGTACACCCTTAGACACGTAGAATCGGTTACACGTGGC AACTCCTCGGACATGAGAAAATCTCACAAAAACAAAATTCATCAATTTCCTTTTGTCTCT CTACCGTGAGTTCAAACTTGTGTACGCTTTACTCGAAAAAAAATTATAATCGGAAGGCGA TTAAAATGTCAGGTGTAACGCTAGCTACGGGTCGAGAAGAGACAACATCTTCAACAAGAG AGCCTAAGCGACAACAAGGTGGTGTGGGTGTAATGGGATCACTACGAGTAATTGAGTTAC AATTAGTAGCTTTCATTATGGTTTTCTCAGCTAGTGGTCTTGTACCATTACTTGATTTGA TTTTCCCAGCTTTAGCATCCGCGTATCTTTTGCTTCTTTCGCGATTTGCGTTTCCATCAC TTGGTACAACTAGTTCTAGTTCCGACGAAACACTATTTCAGGGAAGCCGGTTATTTCGTC TTTATATGGTTGCTGGTACTAGTATTGGATTGTTTTTGCCATTGGCATATGTTTTGGGTG GATTTGCTAGGGGTGATCAGCATGCGGTTCGCTCTGCTACTCCTCATTTGTTTTTACTTT CTTTCCAAATTCTAACTGAGAATATTATAAGTGGACTGTCCCTGTTTTCTCCGCCGATTA GAGCACTTGTTCCCCTGCTTTATACAGTTAGAAGGATCTTTGTTTTAATTGATTGGATAC AAGATGTGTGGATCAACAAGACTTTGCCCCCAAATGCACAAGTCAAGGATGTTACATGGT ACTGGTTTGGGAAGGGATTGGCAGTGGCTAATCTGGCGTATTTTTCGATCAATCTGTTTG GTTTCTTGATTCCGCAATTTCTTCCACGAGCTTTCGAGAGGTACTTCAGGGAGAGGAGTG AGGTGAACTCGAAGTTGGCTGAAGATAAGCACTCACAAGCTATCAACAGAACAAAACACG CAGACAAAAAGGCAGAGTAATTGGCCAAAATGTATGTGTAGCAGCTTTTTTTTTCCTTCT TGATTTCACTATAATAAGCTGAATGGACTTGTTTTCTTTTTGAGATGGTTAGCGTAAGTG TGTTTTTCCAGGAACTTACACATCCTAGGAACTTAGAAATGCATTTTGTTGTATTTGATG TTACTGTTATATGATCGCGCGAATATTGTGTATATATTATGTATAAGGGCGCTGCAGCAA CAAAAAGGATGAGCGGGGAACTTATCTTATTTTCCAACTGATAATTTGCAGTCATACTAG AGATATTTGACTTGACTTTCGTCATCATTTGCCGTACTAGTATTCAAGTTTTGATAACGG GCTGCGTTGGTTATTTGGTACGATGTATGTAATTGAATTGTATTTATACAAAGTACCAAA GAAAATATCTTTGGTACGATGTATGTAATTGAATTGTATTTATACAAAAGTACCAAAGAA TCTATCTATAACTGACTAGGTGAGTGTCTAAATCTGACCGACTAGTCTATTGAATTGTAT TCATGCAAGTAACAAAGAATCTATTCTGGAACTGACTAGGCAAGTGTCTGCAGCAATCTG ACTAGTATAAAAC