Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc05g015510.3.1
CDS Infomation

Squamosa promoter-binding protein 10
Sequence

ATGGAGTGGAATGTGAAGTGGGACTGGGGAAATCTGGTAATGTTTGGTTCAAAGGCCTCT
GAAAGTCCAAAAGAACTACAATTAACAGATTGGGGAGTTGAAGAAGAGGGAGAACTTGAT
GGGGGATCTTTTAATTTGTCAAGTGGTGGTAGTGGCACGGGTGGCTATGGTTCTGATCTG
AAGTGTGGTTCTTCCATCAAAAGCTCAATATCAGCTTCTACTGACTCTTCACCAAAGGAT
GGCTTTAAAGTATCCAACTTTGCTTTTGAGACATTTAATGCCTCTCCTGAGGATCCTAGT
AAGAAATTGGAATCCTCCAAAGCCGAGGTCTCTAGAAATTCACCACCCATGGAGGCTTCA
GTAGGCTCTGTTGAACCAGTGATAGGTCTAAAAATTGGTAAGCGGACATGTGAAACCTTT
GGTGGTGGAAGCAGTGCTAAGGTTTCATCCTTCCCCCCGAACCCCGCATCATCTGCTGCT
GCAACAAAGAAAGCAAAATCATCTACTCAGAATGCACCAATTCCTCACTGTCAGGTTGAA
GGTTGCAACCTTGATCTTTCTTCAGCTAAAGAATATTATCGTAAGCATAGAGTTTGTGAC
AGTCATTCCAAAAGCCCAAAGGTTATTGTAGCAGGTGTAGCACGCCGCTTTTGTCAACAG
TGTAGCAGGTTCCATAGCGTGTCTGAATTTGATGACAAGAAGCGAAGCTGTCGTAGGAGG
CTCTCTGATCACAATGCACGGCGCCGCAAACCTCACCAGGAAACTATCCAGTTCAATTCA
GCGAGGCTTTCGTCGTTGTTTTATGATAGCAGGCAACCTATGAATCTTGTGCTCAACGAA
GCACAACTCATTCACTCCAGAGCTGCTGCAAACGCTACCTGGGAGAGCACTCAAGACTCT
AAGTTCAGTATAACAAGAGAGTTTACTCCAAAGCCTGAAAGAACTGGCAGCACAAATGGG
AAGTCATTACTGGAGAGGAACCAGTTTTCACGGGCTGTGGGTGCACACAGTAACGCATCT
AGCTTGCTCTTGCCCTCCAAGGGCACCACAGCCGAGGTTTTTAATCGAGGTGCCAAGGAA
TCCATGTTCAATATGGTTACAGGACCGGAATTTCCTCGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAACT
AATTCGTGGGGTTCATCCGAGCCTGAGAGTGTTTCACTCAACCATGCAAATCAGACCAGC
ATGCCCGAGCAGATGATGCAGGCAATTCCACCGCATATGTCCAGTCAATACTGGCAGGCT
GGACAACATTCATCCGATCCTCGTTACCATACATTGGCTGCTGCAAATAGTAACAGTGGT
GGTAGCTTTCAGGAAATGGGAGTGTTCAAAGCTCCTTTCGACACGGACTTTTATCTCAAT
GCATTGAACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc05g015510.3.1
PEP Infomation

Squamosa promoter-binding protein 10
Sequence

MEWNVKWDWGNLVMFGSKASESPKELQLTDWGVEEEGELDGGSFNLSSGGSGTGGYGSDL
KCGSSIKSSISASTDSSPKDGFKVSNFAFETFNASPEDPSKKLESSKAEVSRNSPPMEAS
VGSVEPVIGLKIGKRTCETFGGGSSAKVSSFPPNPASSAAATKKAKSSTQNAPIPHCQVE
GCNLDLSSAKEYYRKHRVCDSHSKSPKVIVAGVARRFCQQCSRFHSVSEFDDKKRSCRRR
LSDHNARRRKPHQETIQFNSARLSSLFYDSRQPMNLVLNEAQLIHSRAAANATWESTQDS
KFSITREFTPKPERTGSTNGKSLLERNQFSRAVGAHSNASSLLLPSKGTTAEVFNRGAKE
SMFNMVTGPEFPRALSLLSTNSWGSSEPESVSLNHANQTSMPEQMMQAIPPHMSSQYWQA
GQHSSDPRYHTLAAANSNSGGSFQEMGVFKAPFDTDFYLNALN*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc05g015510.3.1
Transcript Infomation

Squamosa promoter-binding protein 10
Sequence

CTTCTTAGTGAGCCAAAAGGTTTAAAATATGTCATTTACTGCGTGGATTGCACTTCTTAG
AGAGATGATGTGAGAAGATTAATGAAGTTTTACACTCCCTCGACTTATTGAGAATATTTC
CTAATAGTTATCTATTTATCCATCCAGACATCCACATCAGCTATTTTTTCAACATGTTAT
GCGTGTGTAAACACGGTTGACGGAGATAGAGAATACAGATTTACTCAATTAACGAATAAA
CAAGTTCATGAATATTTAAAACAAGTTGAAGTTTAAATATACACAACATAAAAAAAACTT
CAAATTTCGGAGTAATAATCATTTTTGCCTTTTAAAAAAAATAATTAATTAAAAATTAGG
GCTAAAGTTTGCATAGTAAAATTGATTGGTTAAAACTCAAAACGTATAACTAATATAACT
TAAAAATAAAAATACTATTTTAAATTTATTTATTAAAACTTTTGTTCTTCAATACACCAC
AAAATATGACCCTTACCCCAAATATCAAACCGAATAATCAATATTCTAAAAAAAATCCAA
CCAAAATACTAAAAAACTAGATTAATCCAATTTTTAGATATTTATATCCACCACATCTAA
CACAAACCTAAATCTATCTCACGGAAGATGAAGAAAAGTATTCCATTAAAAAACAAAAAA
AGGGGGTGGGGGGATAGTGATTAGTGGGTAGGGGAAGAAAAGGAAGTGCCAAGAGAAAGG
AGCCAAAAAAAAACCCTCTATGCAACAGTAAAAAAATAAAAGCTGTCACTAAATAGGTAA
ACACTTGGCACCTACAGAAACAATGATCTCGTTGTATTTTCTGCTTTATATCAACAGTGC
AAAAAAAGAGAGTGCTAAAAATGAGGCTTACCATGTAATAGCACACATATTATAAAATCT
GTCCGTTCGCACCAGCTCACACACTGTCGTTCTCTCACTGACAGAGTCACTCACCAGTCA
CCACTCTTCCTCTACTGTATCCCCTATTTCTTTCTTTCTTCTTTTTCTTCATTTGGTAAA
GTTATAACTCACAAAAACTTGCTCTTCTCAAACAAAAATTGGTGAGATTTTTCTTCTATT
CTATATCTTATTTACCAAGTTAATCATTTTTCTTTAACAACCTTTTGTTCTCTCAATCTG
AGTTTTGCTTCTTCTTATCGATTCTTGGAGAAATTGATTAATGGTGATGAAACAAGTAGC
TGAAAATGATGTTGTGGAGTTAACAGATGGGAGAAACATTTGTTGTCTTGGACTGGAAGG
GATTGAGCTCTGTTTCTGTATTTGAATAGTTATCCTTGTCTCCTTATAGTCTTAATCAGC
TTCGTACTAGTTACTGGAATCATACAGCTCTGTCAAAGAGATTCAAGTCTTAATTACTCT
TTTGCATTCCATGAGTCTGGGAATTTGGTAAAGCCATCTCGTAGTTTCTTTCCCAAGATG
GAGTGGAATGTGAAGTGGGACTGGGGAAATCTGGTAATGTTTGGTTCAAAGGCCTCTGAA
AGTCCAAAAGAACTACAATTAACAGATTGGGGAGTTGAAGAAGAGGGAGAACTTGATGGG
GGATCTTTTAATTTGTCAAGTGGTGGTAGTGGCACGGGTGGCTATGGTTCTGATCTGAAG
TGTGGTTCTTCCATCAAAAGCTCAATATCAGCTTCTACTGACTCTTCACCAAAGGATGGC
TTTAAAGTATCCAACTTTGCTTTTGAGACATTTAATGCCTCTCCTGAGGATCCTAGTAAG
AAATTGGAATCCTCCAAAGCCGAGGTCTCTAGAAATTCACCACCCATGGAGGCTTCAGTA
GGCTCTGTTGAACCAGTGATAGGTCTAAAAATTGGTAAGCGGACATGTGAAACCTTTGGT
GGTGGAAGCAGTGCTAAGGTTTCATCCTTCCCCCCGAACCCCGCATCATCTGCTGCTGCA
ACAAAGAAAGCAAAATCATCTACTCAGAATGCACCAATTCCTCACTGTCAGGTTGAAGGT
TGCAACCTTGATCTTTCTTCAGCTAAAGAATATTATCGTAAGCATAGAGTTTGTGACAGT
CATTCCAAAAGCCCAAAGGTTATTGTAGCAGGTGTAGCACGCCGCTTTTGTCAACAGTGT
AGCAGGTTCCATAGCGTGTCTGAATTTGATGACAAGAAGCGAAGCTGTCGTAGGAGGCTC
TCTGATCACAATGCACGGCGCCGCAAACCTCACCAGGAAACTATCCAGTTCAATTCAGCG
AGGCTTTCGTCGTTGTTTTATGATAGCAGGCAACCTATGAATCTTGTGCTCAACGAAGCA
CAACTCATTCACTCCAGAGCTGCTGCAAACGCTACCTGGGAGAGCACTCAAGACTCTAAG
TTCAGTATAACAAGAGAGTTTACTCCAAAGCCTGAAAGAACTGGCAGCACAAATGGGAAG
TCATTACTGGAGAGGAACCAGTTTTCACGGGCTGTGGGTGCACACAGTAACGCATCTAGC
TTGCTCTTGCCCTCCAAGGGCACCACAGCCGAGGTTTTTAATCGAGGTGCCAAGGAATCC
ATGTTCAATATGGTTACAGGACCGGAATTTCCTCGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAACTAAT
TCGTGGGGTTCATCCGAGCCTGAGAGTGTTTCACTCAACCATGCAAATCAGACCAGCATG
CCCGAGCAGATGATGCAGGCAATTCCACCGCATATGTCCAGTCAATACTGGCAGGCTGGA
CAACATTCATCCGATCCTCGTTACCATACATTGGCTGCTGCAAATAGTAACAGTGGTGGT
AGCTTTCAGGAAATGGGAGTGTTCAAAGCTCCTTTCGACACGGACTTTTATCTCAATGCA
TTGAACTGAAGCCAACAACTGATGACTTTTGTGTATTTTCAGGACTTGGCGAGATGAAGC
AGGTCTGTTAGTATGATGATGATCTTGAAGCAAATTAGTTCTGGTATATATTATATATAA
TATAGGTCGGGCTTTTAAACTATTATGAAAGTCTAATATTATGAATTATGCACTAAATTT
TTGTTTGCTTTATTTAAGCAGTGAGACATGAATTCCCAAGAATTGTAATTTCTTGATTCT
GCAACTTGGAATATAACTGCACAGTTTATCCTTTTTTTAAAAAAATCAAATGTTTGACTT
ATTATTTTAACATTAGTTTC