Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc05g013040.3.1

CDS Infomation

Pattern formation EMB30-like protein (AHRD V3.3 *** A0A0B0NVB0_GOSAR)

Sequence

ATGGGGCGTTTAAGGCCACAATCTAGTATTAAGGCAATTGAAGAGGAACCAGAAGATTGT
GAGACAACCTCTTCCAACAAAACTTCTATAGCTTGTATGATTAACTCTGAAGTAAGTGCT
GTTTTAGCAGTCATGAGAAGAAATGTTAGGTGGGGTGGTCGTTATGTTTCAGGAGATGAT
CAGCTAGAACACTCTCTAATCCAGTCTCTTAAGACATTGCGTAAGCAGATGTTTTCGTGG
CAGCATTCTGGGCAAACCATCAGTCCGGCCTTATGTCTCCAGCCATTTCTGGATGTAATT
CGGTCTGATGAAACTGGGGCTCCAATCACTGGTGTTGCATTGTCTTCTGTTTTCAAGATT
TTGACCCTTGATATTCTTGATCTTGATGCTGTCAATATTGAAGATGCAATGCACTCTGTT
GTGGATGCTGTGACTAGTTGCAGATTTGAGGTGACAGATCCTGCATCAGAAGAAGTTGTA
TTGATGAAGATACTTCAAGTTCTTTTGGCATGCATGAGAAGTAAAACATCAGTTGTGTTG
AGTAACCAGCATGTTTGCACCATTGTCAACACATGCTTCAGAGTAGTTCATCAAGCTGGA
ACTAAAAGTGAGGTCTTACAGCGGATAGCACGTCACACCATGCATGAGCTTGTGAGATGT
ATTTTTGCACACCTTCCGGAAGTTGACAACATACAACATTCCATAGTTAGACAGCATGGT
TCCTCCAAAAACGAGGTTGCTGGTATCGTTAACGAGTACAGTTTGAGTAGCAAGTCGGAG
AATGGGAGTGGTCCTTCTGAATATGATAGTCTACCACCTTCTGGAGGTTTCACGTCTGCT
TCAACAGGTCTTCTTAGCAGTGTTACAGAAGAAGGCATGGTCATGGGTGACAATGGGAAG
GATAGTGTTCCTTATGACCTACATTTAATGACTGAACCATATGGAGTCCCATGCATGGTA
GAGATATTTCACTTCTTGTGCTCTTTGTTGAATGTTGTAGAACATGTAGGGATGGGTCCT
AGAGCAAATACTATGGCATTCGATGAAGATGTTCCTCTATTTGCCCTTGGTTTGATCAAC
TCAGCCATTGAACTGGGAGGCCCTGCTATTTGTAGCCACCCCAGATTGTTGAGTTTGGTC
CAGGATGAATTATTCCGTAATCTAATGCAGTTTGGTTTGTCAATGAGTCCATTGATTCTT
TCAATGGTCTGCAGTATCGTTCTAAATCTGTATCAGCACTTGGGTACTGAACTGAAACTA
CAGCTTGAGGCTTTCTTTTCCTGTGTGGTCCTGAGACTTGCACAAAGCCGTTACGGGGCT
TCATACCAGCAGCAGGAAGTAGCAATGGAGGCTCTTGTTGACTTTTGCAGGCAAAAGTCC
TTCATGGTAGAAATGTATGCAAATTTAGATTGCGATATCACCTGCAGTAACATTTTTGAA
GAACTTGCAAATTTATTATCTAAGAGTGCATTCCCGGTGAACTCTCCATTGTCTTCCATG
CACATTCTTGCTTTGGATGGTCTGATTGCTGTTATCCAGGGAATGGCTGAGAGGATAGGC
AATGGATCCTATAGTTCAGAATACACTCCAATAAATTTAGAGGAATATAGCCCATTTTGG
ATGGTCAAGTGTGAGAACTATAGCGACCCTGATCATTGGGTACCATTTGTACGTCGACGG
AAATACATCAAGAGAAGATTAATGATTGGAGCTGATCACTTTAATAGGGACCCAAAGAAA
GGTCTAGAGTTTCTTCAAGGAACACATCTATTGCCGGAAAAACTTGATCCCCAGAGTGTG
GCTTGCTTTTTCAGGTTCACAGCTGGGTTAGATAAGAATCTCGTTGGGGATTTTCTTGGA
AATCATGATGAATTTTGTGTTCAGGTGCTTCATGAGTTTGCTGGAACATTTGATTTCCAA
GACATGAACCTAGATACTGCATTGAGGCTGTTTTTGGAAACTTTTCGACTGCCTGGGGAA
TCTCAAAAGATAGCAAGGGTGCTTGAGGCATTTTCAGAGAGATACTATGAGCAATCTCCA
CAGATTCTAGCTAATAAAGATGCTGCTCTGTTGTTATCATATTCAATAATAATGCTCAAC
ACTGACCAGCATAATGTTCAGGTAAAGAAGAAGATGACAGAGGAGGATTTCATCCGTAAC
AATCGGCACATTAACGGAGGTAATGATCTTCCTCGTGATTTTCTATCTGAATTGTACCAC
TCAATCTGCAACAATGAGATCCGGACAACACCAGAACAAGGTGCTGGTTTTGCTGAAATG
AACCCAAGCCGTTGGATTGATTTGATGCACAAATCTAAAAAAACTTCTCCATACATCATG
TGTGATTCTAAAGCCTACCTTGATCATGATATGTTTGCAATAATGTCGGGCCCTACTATT
GCTGCTATCTCTGTGGTGTTTGATCATGCTGAACATGAGGATGTCTACCAGACTTGTATT
GATGGTTTCTTGGCTGTTGCAAAGATTTCGGCGTGCCATCATCTTGAAGATGTCTTGGAT
GATCTAGTGGTATCTCTATGTAAGTTCACAACCCTGTTGAATCCCTCATTGGTGGAGGAA
CCTGTTTTAGCCTTTGGCGATGATGCGAAAGCAAGAAAGGCAACTGTTACAGTTTTCACT
ATAGCAAACAAATGTGGTGATTTTATCCGTACTGGCTGGAGAAATATCTTGGATTGCATC
TTAAGACTGCACAAGCTTGGTCTTCTTCCTGCTCGTGTAGCCAGTGATGCAGCTGATGAC
TCAGAGGCATCTTCTGATCCAGGACATGGGAAACCCCTCCCTAATTCATTGACTGCTGCT
CATATGCAATCCTTAGGTACTCCCAGAAGATCTTCAGGACTTATGGGACGATTTAGTCAA
CTCCTATCTATAGATACAGAAGAGCCTAGGTCTCAACCTACTGAGCAACAACTTGCGGCT
CATCAGCGCACACTGCAGACAATTCAGAAGTGTCAAATTGATACCATCTTCACAGAAAGT
AAGTTTCTCCTAGCTGATTCTTTGTTGCAGTTGGCAAGGGCCCTCATATGGGCAGCTGGG
AGACCTCAGAAAGGTAGTAGTTCCCCTGAGGATGAAGATACTGCAGTGTTCTGCTTGGAA
TTGCTGATTGCAATCACTTTGAACAATAGAGATAGAATAGCACTTCTTTGGCAGGGAGTT
TACGAGCATATTGCTCATATTGTACACTCAACAATTATGCCCTGTGCTCTAATTGAGAAA
GCTGTTTTTGGACTACTACGCATCTGTCAGAGGCTGCTTCCTTATAAAGAGAACTTAGCT
GATGATCTTCTCAGATCATTACAACTTGTAACCAAGCTTGATGCCCGGGTAACTGATGCA
TATTGCGAACAAATTACACAGGAAGTCAGCCGGCTGGTTAGAGCAAATGCTTCACATATC
CGATCTCAAATGGGATGGCGAACTATTACTCAGTTACTTTCTATAACAGCTAGACATCCA
GAAGCTTCGGAAGCAGGATTTGATGTCCTAGGTTTCATCATGTCTGATGGATCCCATTTG
TCTCCGGCTAATTTTGTTCTTTGCATTGATGTAGCAAGAAATTTTGCAGAGTCTCGTGTT
GGACCAGCCGATAGACCTATTCGTGCGGTGGATCTTATGACAGGTTCTGCCGCTTGTTTA
GCAATCTGGTCTAAAGATACCAGGGAAGCGATGGCAGAGGCAGAAGCTTTGAAGCTGTCT
CAGGATATAGGGGAAATGTGGCTGAGGCTTGTACAGGGTCTGAGGAAAGTTTGTCTGGAT
CAGAGAGAAGTTAGGAATCATGCTCTTTCATCCCTACAGACGTGCTTGACAGGAGTAGAT
GAAATGTACCTTTCACATGGTCTCTGGTTGCAGTGCTTTGATATTGTCATTTTCACAATG
CTGGACGACTTGATTGAGCTCACATCACAGAAAGATTATAGAAACATGGAAGAGACACTT
ATTCTTGCCTTGAAGCTGTTAACCAAGGTGTTTTTACAATTGCTTCATGAGCTATCTCAA
TTGACCACCTTCTGTAAACTCTGGCTTGGAGTCCTCAACCGGATGGAGAAATACATGAAG
GTGAAGGTCAGAGGTAAGAAGAGTGAAAAACTTCAGGAGCTAGTCCCTGAACTTCTTAAG
AACACCTTGGTTGTAATGAAATCTAAGGGGGTACTCGTTCAGAGGGGTGCTCTCGGTGGA
GATAGCTTGTGGGAACTGACATGGTTGCATGTCAATAACATTGTTCCTTCTCTGCAAGCT
GAGGTTTTCCCTGAGAATGAGTTGGGGCATGTAGAGTCTGACCAGACAGACGCAAGAGGA
GCTGCATATGATGTTGCTGATCCGAGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc05g013040.3.1

PEP Infomation

Pattern formation EMB30-like protein (AHRD V3.3 *** A0A0B0NVB0_GOSAR)

Sequence

MGRLRPQSSIKAIEEEPEDCETTSSNKTSIACMINSEVSAVLAVMRRNVRWGGRYVSGDD
QLEHSLIQSLKTLRKQMFSWQHSGQTISPALCLQPFLDVIRSDETGAPITGVALSSVFKI
LTLDILDLDAVNIEDAMHSVVDAVTSCRFEVTDPASEEVVLMKILQVLLACMRSKTSVVL
SNQHVCTIVNTCFRVVHQAGTKSEVLQRIARHTMHELVRCIFAHLPEVDNIQHSIVRQHG
SSKNEVAGIVNEYSLSSKSENGSGPSEYDSLPPSGGFTSASTGLLSSVTEEGMVMGDNGK
DSVPYDLHLMTEPYGVPCMVEIFHFLCSLLNVVEHVGMGPRANTMAFDEDVPLFALGLIN
SAIELGGPAICSHPRLLSLVQDELFRNLMQFGLSMSPLILSMVCSIVLNLYQHLGTELKL
QLEAFFSCVVLRLAQSRYGASYQQQEVAMEALVDFCRQKSFMVEMYANLDCDITCSNIFE
ELANLLSKSAFPVNSPLSSMHILALDGLIAVIQGMAERIGNGSYSSEYTPINLEEYSPFW
MVKCENYSDPDHWVPFVRRRKYIKRRLMIGADHFNRDPKKGLEFLQGTHLLPEKLDPQSV
ACFFRFTAGLDKNLVGDFLGNHDEFCVQVLHEFAGTFDFQDMNLDTALRLFLETFRLPGE
SQKIARVLEAFSERYYEQSPQILANKDAALLLSYSIIMLNTDQHNVQVKKKMTEEDFIRN
NRHINGGNDLPRDFLSELYHSICNNEIRTTPEQGAGFAEMNPSRWIDLMHKSKKTSPYIM
CDSKAYLDHDMFAIMSGPTIAAISVVFDHAEHEDVYQTCIDGFLAVAKISACHHLEDVLD
DLVVSLCKFTTLLNPSLVEEPVLAFGDDAKARKATVTVFTIANKCGDFIRTGWRNILDCI
LRLHKLGLLPARVASDAADDSEASSDPGHGKPLPNSLTAAHMQSLGTPRRSSGLMGRFSQ
LLSIDTEEPRSQPTEQQLAAHQRTLQTIQKCQIDTIFTESKFLLADSLLQLARALIWAAG
RPQKGSSSPEDEDTAVFCLELLIAITLNNRDRIALLWQGVYEHIAHIVHSTIMPCALIEK
AVFGLLRICQRLLPYKENLADDLLRSLQLVTKLDARVTDAYCEQITQEVSRLVRANASHI
RSQMGWRTITQLLSITARHPEASEAGFDVLGFIMSDGSHLSPANFVLCIDVARNFAESRV
GPADRPIRAVDLMTGSAACLAIWSKDTREAMAEAEALKLSQDIGEMWLRLVQGLRKVCLD
QREVRNHALSSLQTCLTGVDEMYLSHGLWLQCFDIVIFTMLDDLIELTSQKDYRNMEETL
ILALKLLTKVFLQLLHELSQLTTFCKLWLGVLNRMEKYMKVKVRGKKSEKLQELVPELLK
NTLVVMKSKGVLVQRGALGGDSLWELTWLHVNNIVPSLQAEVFPENELGHVESDQTDARG
AAYDVADPS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc05g013040.3.1

Transcript Infomation

Pattern formation EMB30-like protein (AHRD V3.3 *** A0A0B0NVB0_GOSAR)

Sequence

ATGGGGCGTTTAAGGCCACAATCTAGTATTAAGGCAATTGAAGAGGAACCAGAAGATTGT
GAGACAACCTCTTCCAACAAAACTTCTATAGCTTGTATGATTAACTCTGAAGTAAGTGCT
GTTTTAGCAGTCATGAGAAGAAATGTTAGGTGGGGTGGTCGTTATGTTTCAGGAGATGAT
CAGCTAGAACACTCTCTAATCCAGTCTCTTAAGACATTGCGTAAGCAGATGTTTTCGTGG
CAGCATTCTGGGCAAACCATCAGTCCGGCCTTATGTCTCCAGCCATTTCTGGATGTAATT
CGGTCTGATGAAACTGGGGCTCCAATCACTGGTGTTGCATTGTCTTCTGTTTTCAAGATT
TTGACCCTTGATATTCTTGATCTTGATGCTGTCAATATTGAAGATGCAATGCACTCTGTT
GTGGATGCTGTGACTAGTTGCAGATTTGAGGTGACAGATCCTGCATCAGAAGAAGTTGTA
TTGATGAAGATACTTCAAGTTCTTTTGGCATGCATGAGAAGTAAAACATCAGTTGTGTTG
AGTAACCAGCATGTTTGCACCATTGTCAACACATGCTTCAGAGTAGTTCATCAAGCTGGA
ACTAAAAGTGAGGTCTTACAGCGGATAGCACGTCACACCATGCATGAGCTTGTGAGATGT
ATTTTTGCACACCTTCCGGAAGTTGACAACATACAACATTCCATAGTTAGACAGCATGGT
TCCTCCAAAAACGAGGTTGCTGGTATCGTTAACGAGTACAGTTTGAGTAGCAAGTCGGAG
AATGGGAGTGGTCCTTCTGAATATGATAGTCTACCACCTTCTGGAGGTTTCACGTCTGCT
TCAACAGGTCTTCTTAGCAGTGTTACAGAAGAAGGCATGGTCATGGGTGACAATGGGAAG
GATAGTGTTCCTTATGACCTACATTTAATGACTGAACCATATGGAGTCCCATGCATGGTA
GAGATATTTCACTTCTTGTGCTCTTTGTTGAATGTTGTAGAACATGTAGGGATGGGTCCT
AGAGCAAATACTATGGCATTCGATGAAGATGTTCCTCTATTTGCCCTTGGTTTGATCAAC
TCAGCCATTGAACTGGGAGGCCCTGCTATTTGTAGCCACCCCAGATTGTTGAGTTTGGTC
CAGGATGAATTATTCCGTAATCTAATGCAGTTTGGTTTGTCAATGAGTCCATTGATTCTT
TCAATGGTCTGCAGTATCGTTCTAAATCTGTATCAGCACTTGGGTACTGAACTGAAACTA
CAGCTTGAGGCTTTCTTTTCCTGTGTGGTCCTGAGACTTGCACAAAGCCGTTACGGGGCT
TCATACCAGCAGCAGGAAGTAGCAATGGAGGCTCTTGTTGACTTTTGCAGGCAAAAGTCC
TTCATGGTAGAAATGTATGCAAATTTAGATTGCGATATCACCTGCAGTAACATTTTTGAA
GAACTTGCAAATTTATTATCTAAGAGTGCATTCCCGGTGAACTCTCCATTGTCTTCCATG
CACATTCTTGCTTTGGATGGTCTGATTGCTGTTATCCAGGGAATGGCTGAGAGGATAGGC
AATGGATCCTATAGTTCAGAATACACTCCAATAAATTTAGAGGAATATAGCCCATTTTGG
ATGGTCAAGTGTGAGAACTATAGCGACCCTGATCATTGGGTACCATTTGTACGTCGACGG
AAATACATCAAGAGAAGATTAATGATTGGAGCTGATCACTTTAATAGGGACCCAAAGAAA
GGTCTAGAGTTTCTTCAAGGAACACATCTATTGCCGGAAAAACTTGATCCCCAGAGTGTG
GCTTGCTTTTTCAGGTTCACAGCTGGGTTAGATAAGAATCTCGTTGGGGATTTTCTTGGA
AATCATGATGAATTTTGTGTTCAGGTGCTTCATGAGTTTGCTGGAACATTTGATTTCCAA
GACATGAACCTAGATACTGCATTGAGGCTGTTTTTGGAAACTTTTCGACTGCCTGGGGAA
TCTCAAAAGATAGCAAGGGTGCTTGAGGCATTTTCAGAGAGATACTATGAGCAATCTCCA
CAGATTCTAGCTAATAAAGATGCTGCTCTGTTGTTATCATATTCAATAATAATGCTCAAC
ACTGACCAGCATAATGTTCAGGTAAAGAAGAAGATGACAGAGGAGGATTTCATCCGTAAC
AATCGGCACATTAACGGAGGTAATGATCTTCCTCGTGATTTTCTATCTGAATTGTACCAC
TCAATCTGCAACAATGAGATCCGGACAACACCAGAACAAGGTGCTGGTTTTGCTGAAATG
AACCCAAGCCGTTGGATTGATTTGATGCACAAATCTAAAAAAACTTCTCCATACATCATG
TGTGATTCTAAAGCCTACCTTGATCATGATATGTTTGCAATAATGTCGGGCCCTACTATT
GCTGCTATCTCTGTGGTGTTTGATCATGCTGAACATGAGGATGTCTACCAGACTTGTATT
GATGGTTTCTTGGCTGTTGCAAAGATTTCGGCGTGCCATCATCTTGAAGATGTCTTGGAT
GATCTAGTGGTATCTCTATGTAAGTTCACAACCCTGTTGAATCCCTCATTGGTGGAGGAA
CCTGTTTTAGCCTTTGGCGATGATGCGAAAGCAAGAAAGGCAACTGTTACAGTTTTCACT
ATAGCAAACAAATGTGGTGATTTTATCCGTACTGGCTGGAGAAATATCTTGGATTGCATC
TTAAGACTGCACAAGCTTGGTCTTCTTCCTGCTCGTGTAGCCAGTGATGCAGCTGATGAC
TCAGAGGCATCTTCTGATCCAGGACATGGGAAACCCCTCCCTAATTCATTGACTGCTGCT
CATATGCAATCCTTAGGTACTCCCAGAAGATCTTCAGGACTTATGGGACGATTTAGTCAA
CTCCTATCTATAGATACAGAAGAGCCTAGGTCTCAACCTACTGAGCAACAACTTGCGGCT
CATCAGCGCACACTGCAGACAATTCAGAAGTGTCAAATTGATACCATCTTCACAGAAAGT
AAGTTTCTCCTAGCTGATTCTTTGTTGCAGTTGGCAAGGGCCCTCATATGGGCAGCTGGG
AGACCTCAGAAAGGTAGTAGTTCCCCTGAGGATGAAGATACTGCAGTGTTCTGCTTGGAA
TTGCTGATTGCAATCACTTTGAACAATAGAGATAGAATAGCACTTCTTTGGCAGGGAGTT
TACGAGCATATTGCTCATATTGTACACTCAACAATTATGCCCTGTGCTCTAATTGAGAAA
GCTGTTTTTGGACTACTACGCATCTGTCAGAGGCTGCTTCCTTATAAAGAGAACTTAGCT
GATGATCTTCTCAGATCATTACAACTTGTAACCAAGCTTGATGCCCGGGTAACTGATGCA
TATTGCGAACAAATTACACAGGAAGTCAGCCGGCTGGTTAGAGCAAATGCTTCACATATC
CGATCTCAAATGGGATGGCGAACTATTACTCAGTTACTTTCTATAACAGCTAGACATCCA
GAAGCTTCGGAAGCAGGATTTGATGTCCTAGGTTTCATCATGTCTGATGGATCCCATTTG
TCTCCGGCTAATTTTGTTCTTTGCATTGATGTAGCAAGAAATTTTGCAGAGTCTCGTGTT
GGACCAGCCGATAGACCTATTCGTGCGGTGGATCTTATGACAGGTTCTGCCGCTTGTTTA
GCAATCTGGTCTAAAGATACCAGGGAAGCGATGGCAGAGGCAGAAGCTTTGAAGCTGTCT
CAGGATATAGGGGAAATGTGGCTGAGGCTTGTACAGGGTCTGAGGAAAGTTTGTCTGGAT
CAGAGAGAAGTTAGGAATCATGCTCTTTCATCCCTACAGACGTGCTTGACAGGAGTAGAT
GAAATGTACCTTTCACATGGTCTCTGGTTGCAGTGCTTTGATATTGTCATTTTCACAATG
CTGGACGACTTGATTGAGCTCACATCACAGAAAGATTATAGAAACATGGAAGAGACACTT
ATTCTTGCCTTGAAGCTGTTAACCAAGGTGTTTTTACAATTGCTTCATGAGCTATCTCAA
TTGACCACCTTCTGTAAACTCTGGCTTGGAGTCCTCAACCGGATGGAGAAATACATGAAG
GTGAAGGTCAGAGGTAAGAAGAGTGAAAAACTTCAGGAGCTAGTCCCTGAACTTCTTAAG
AACACCTTGGTTGTAATGAAATCTAAGGGGGTACTCGTTCAGAGGGGTGCTCTCGGTGGA
GATAGCTTGTGGGAACTGACATGGTTGCATGTCAATAACATTGTTCCTTCTCTGCAAGCT
GAGGTTTTCCCTGAGAATGAGTTGGGGCATGTAGAGTCTGACCAGACAGACGCAAGAGGA
GCTGCATATGATGTTGCTGATCCGAGTTGA