Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc05g008860.3.1
CDS Infomation	Non-specific serine/threonine protein kinase (AHRD V3.3 *** K4BX60_SOLLC)
Sequence	ATGCAATCTTTTTTGTGTTTTAGCATTTTCTTGATTCTGTGTAGTTGTTGTGTTTTTGTT ACTTCTTTGAATGATGAAGGGATAGCTCTTTGGTCATTTAAAAAGGGTATTGGACAAGAC CCTGAAGGGTCACTTAAAAATTGGAACTTTTCTGATGAAACCCCTTGTTCTTGGAATGGT GTTACATGCAAAGACCTAAAAGTTGTATCTGTTAGTATACCTAGAAAGAAACTCACTGGG TTTCTTTCTTCTAGTCTTGGATCTCTTACTGAGCTTAGACATGTTAATTTAAGAAGTAAT TTGTTTTCTGGTAGTTTGCCTGTTGAGCTTTTTGAGGTTCAAGGTTTGCAAAGTTTGGTT CTTTATGGGAATTCCTTTTCTGGGGTTATACCTTTTGAGGTTGGGAAGCTAAATTATCTT CAAACTTTGGATTTATCACAAAATTTCTTGAATGGGTCTGTGCCTATAACATTGCTTCAG TGTAAGAGATTGAAGGTTCTTGATTTAAGTCATAATAACTTTACTGGTGTTGTACCAGAA GGGTTTGGGGGTAATTTGTCTGCATTGGAAGAACTTAATCTTGGATTCAACAAATTTGGT GGTAAAATTCCAACTGATTTGGGAAATTTGTCTAATTTGAAAGGAACTGTTGATTTGTCT CATAATATGTTTAGTGGTTCAATTCCGGCTAGTCTTGGTAATCTTCCTGAGAAGGTGTAT ATTGATTTGACTTATAACAATTTGAGTGGTCCAATTCCACAAAATGGTGCTTTGATTAAC AGAGGACCTACTGCTTTTATTGGAAATCTTGGGCTCTGTGGACCTCCATTGAAAAACCCG TGTTCTGCGCAAAGTGACGCGAGTTCACCGTCCTCGGAACCTTTCTTGCCTAATAACATA CCTCCATTAGATGGTGCTGGAGGGGATGTGAATGGTAGAGGTTTGAGTAGAGGTGCTGTA ATCGCGATAATTGTGGGGGATGTGGTTGGGATTTGTGTTATTGGGTTGTTGTTCTCGTAT TGTTATTCGAGAATCTGTGGTTGTGGGAGGAAAAAAGATGAACCCGGATTTGGTTTTCAG AAGGGGGGAGGGAAAGGAAGGAAAGAGTGTTTATGTTTTAGGAAGGATGAGTCAGAGACG TTATCGGAAAATGTTGAACAATATGATCTAGTGGCACTAGATAATCAAGTGGCATTTGAT CTTGATGAACTTCTCAAGGCATCTGCATTTGTCCTTGGTAAAAGTGGTATCGGCATTGTG TACAAAGTTGTGCTCGAAGACGGGCTTAACTTGGCTGTAAGGAGATTAGGCGAGGGTGGT TCACAAAGATTTAAGGAATTCCAGACGGAGGTCGAAGCAATTGGAAAACTGAGACATCAA AATATTGTGACTCTTCGTGCCTATTATTGGTCTGTCGATGAGAAGCTACTGATATATGAC TTCATTCCAAATGGAAACCTTACCACTGCAATTCACGGAAAACCTGGTATGGTGTCGTTT ACACCGCTTTCATGGTCCATTCGACTGAAAATAATGAAGGGAACTGCAAAAGGTTTGGTT TATTTACATGAGTACAGTCCCAAGAAATATGTTCACGGCGATCTAAAGCCTTCTAATATA TTACTTGGGCACGACATGGAGCCCAAAATCTCGGACTTTGGACTTGGACGTCTTGCTAAT ATAGCTGGAACATCCCCTACGTTGCAATCCAACCACATGACCTCTGAGAAACCACAACAA AGTAAGCAAGGCAGTGCGCCATCAGAGTCCGGGACAGTTACATCAACTACAACATCTGGT TCTTGCTACCAAGCTCCCGAGGCGTTAAAAGTGGTGAAACCATCACAAAAATGGGACATT TACTCGTACGGAGTGATCTTGCTTGAAATGATCACGGGAAGAACCCCGATTATCCAAGTA GGTTCTACTGAAATGGATCTCGTAAACTGGATTCACTGGTGCATTGAAGAGAAGAAGCCA CTTTCGGATGTATTGGACTCGTGTTTAGCACAAGATGCTGATAAAGAAGAGGAAATGATC GCGGTTTTGAAGATTGCAATGGCGTGTGTTCACAGCAGCCCGGAGAGAAGACCTTCAATG AGACACATATCTGATGCATTAGACAGACTGCAAGCTTCCTCTGAATGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc05g008860.3.1
PEP Infomation	Non-specific serine/threonine protein kinase (AHRD V3.3 *** K4BX60_SOLLC)
Sequence	MQSFLCFSIFLILCSCCVFVTSLNDEGIALWSFKKGIGQDPEGSLKNWNFSDETPCSWNG VTCKDLKVVSVSIPRKKLTGFLSSSLGSLTELRHVNLRSNLFSGSLPVELFEVQGLQSLV LYGNSFSGVIPFEVGKLNYLQTLDLSQNFLNGSVPITLLQCKRLKVLDLSHNNFTGVVPE GFGGNLSALEELNLGFNKFGGKIPTDLGNLSNLKGTVDLSHNMFSGSIPASLGNLPEKVY IDLTYNNLSGPIPQNGALINRGPTAFIGNLGLCGPPLKNPCSAQSDASSPSSEPFLPNNI PPLDGAGGDVNGRGLSRGAVIAIIVGDVVGICVIGLLFSYCYSRICGCGRKKDEPGFGFQ KGGGKGRKECLCFRKDESETLSENVEQYDLVALDNQVAFDLDELLKASAFVLGKSGIGIV YKVVLEDGLNLAVRRLGEGGSQRFKEFQTEVEAIGKLRHQNIVTLRAYYWSVDEKLLIYD FIPNGNLTTAIHGKPGMVSFTPLSWSIRLKIMKGTAKGLVYLHEYSPKKYVHGDLKPSNI LLGHDMEPKISDFGLGRLANIAGTSPTLQSNHMTSEKPQQSKQGSAPSESGTVTSTTTSG SCYQAPEALKVVKPSQKWDIYSYGVILLEMITGRTPIIQVGSTEMDLVNWIHWCIEEKKP LSDVLDSCLAQDADKEEEMIAVLKIAMACVHSSPERRPSMRHISDALDRLQASSE*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc05g008860.3.1
Transcript Infomation	Non-specific serine/threonine protein kinase (AHRD V3.3 *** K4BX60_SOLLC)
Sequence	ATGCAATCTTTTTTGTGTTTTAGCATTTTCTTGATTCTGTGTAGTTGTTGTGTTTTTGTT ACTTCTTTGAATGATGAAGGGATAGCTCTTTGGTCATTTAAAAAGGGTATTGGACAAGAC CCTGAAGGGTCACTTAAAAATTGGAACTTTTCTGATGAAACCCCTTGTTCTTGGAATGGT GTTACATGCAAAGACCTAAAAGTTGTATCTGTTAGTATACCTAGAAAGAAACTCACTGGG TTTCTTTCTTCTAGTCTTGGATCTCTTACTGAGCTTAGACATGTTAATTTAAGAAGTAAT TTGTTTTCTGGTAGTTTGCCTGTTGAGCTTTTTGAGGTTCAAGGTTTGCAAAGTTTGGTT CTTTATGGGAATTCCTTTTCTGGGGTTATACCTTTTGAGGTTGGGAAGCTAAATTATCTT CAAACTTTGGATTTATCACAAAATTTCTTGAATGGGTCTGTGCCTATAACATTGCTTCAG TGTAAGAGATTGAAGGTTCTTGATTTAAGTCATAATAACTTTACTGGTGTTGTACCAGAA GGGTTTGGGGGTAATTTGTCTGCATTGGAAGAACTTAATCTTGGATTCAACAAATTTGGT GGTAAAATTCCAACTGATTTGGGAAATTTGTCTAATTTGAAAGGAACTGTTGATTTGTCT CATAATATGTTTAGTGGTTCAATTCCGGCTAGTCTTGGTAATCTTCCTGAGAAGGTGTAT ATTGATTTGACTTATAACAATTTGAGTGGTCCAATTCCACAAAATGGTGCTTTGATTAAC AGAGGACCTACTGCTTTTATTGGAAATCTTGGGCTCTGTGGACCTCCATTGAAAAACCCG TGTTCTGCGCAAAGTGACGCGAGTTCACCGTCCTCGGAACCTTTCTTGCCTAATAACATA CCTCCATTAGATGGTGCTGGAGGGGATGTGAATGGTAGAGGTTTGAGTAGAGGTGCTGTA ATCGCGATAATTGTGGGGGATGTGGTTGGGATTTGTGTTATTGGGTTGTTGTTCTCGTAT TGTTATTCGAGAATCTGTGGTTGTGGGAGGAAAAAAGATGAACCCGGATTTGGTTTTCAG AAGGGGGGAGGGAAAGGAAGGAAAGAGTGTTTATGTTTTAGGAAGGATGAGTCAGAGACG TTATCGGAAAATGTTGAACAATATGATCTAGTGGCACTAGATAATCAAGTGGCATTTGAT CTTGATGAACTTCTCAAGGCATCTGCATTTGTCCTTGGTAAAAGTGGTATCGGCATTGTG TACAAAGTTGTGCTCGAAGACGGGCTTAACTTGGCTGTAAGGAGATTAGGCGAGGGTGGT TCACAAAGATTTAAGGAATTCCAGACGGAGGTCGAAGCAATTGGAAAACTGAGACATCAA AATATTGTGACTCTTCGTGCCTATTATTGGTCTGTCGATGAGAAGCTACTGATATATGAC TTCATTCCAAATGGAAACCTTACCACTGCAATTCACGGAAAACCTGGTATGGTGTCGTTT ACACCGCTTTCATGGTCCATTCGACTGAAAATAATGAAGGGAACTGCAAAAGGTTTGGTT TATTTACATGAGTACAGTCCCAAGAAATATGTTCACGGCGATCTAAAGCCTTCTAATATA TTACTTGGGCACGACATGGAGCCCAAAATCTCGGACTTTGGACTTGGACGTCTTGCTAAT ATAGCTGGAACATCCCCTACGTTGCAATCCAACCACATGACCTCTGAGAAACCACAACAA AGTAAGCAAGGCAGTGCGCCATCAGAGTCCGGGACAGTTACATCAACTACAACATCTGGT TCTTGCTACCAAGCTCCCGAGGCGTTAAAAGTGGTGAAACCATCACAAAAATGGGACATT TACTCGTACGGAGTGATCTTGCTTGAAATGATCACGGGAAGAACCCCGATTATCCAAGTA GGTTCTACTGAAATGGATCTCGTAAACTGGATTCACTGGTGCATTGAAGAGAAGAAGCCA CTTTCGGATGTATTGGACTCGTGTTTAGCACAAGATGCTGATAAAGAAGAGGAAATGATC GCGGTTTTGAAGATTGCAATGGCGTGTGTTCACAGCAGCCCGGAGAGAAGACCTTCAATG AGACACATATCTGATGCATTAGACAGACTGCAAGCTTCCTCTGAATGAACAATTGAAACA GAACCTTCAGGCTGGCTTCACATTGCTGCAAGGATTACAGCATCTAACCGATAACCATGA AGCACGATCACTGCTTGGTGCGCGATACATATTGACTAACAGTAGTAATCTCCACTTGTT TGTGAAGGAATATCTGTTTGAATATTGGCCTTTTTGCTCTCTGATAGCAAGCTTTTTCTT GTGTCTATTTGATTAAGAACATAAATTATTTGTTTCTCTCCTTATTACTACATTACTATT CATCTTTTGTTTGTCACAAATGAGTATATGTAAATAAAAATGATTTGTCAAAAATATTAA ATAAGATGGTGTAAGCAATAACTGTATGTCTGTTGTGAGTCTGTCTGCAAGTCTTGGTAC TATTTTTGTTAATGTTCTTTGACAGTATATGAAATTCTTCTAACAAACAGATATTAATGT CTT