Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc05g008370.1.1
CDS Infomation

Ribose-5-phosphate isomerase-like protein (AHRD V3.3 *** T2DNB2_PHAVU)
Sequence

ATGGCTGTTGCATACCCTCAATTTTTTGGGACAAAGAAAGTTGACACTTCATTGATGGTG
TCATCATCTTCCTCTGTTTCCCCTGTTATTTTATCTCAAGATGAGTTGAAAAAGATAGCT
GCTTATAAAGCTGTGGAGTTTGTGGAGTCTGGTATGGTTGTTGGTTTAGGTACAGGGTCA
ACAGCAAAGCATGCTGTTGATAAAATAGCTGAGCTTTTACATAGTGGTAAGTTAAAGAAC
ATTGTAGGGATTCCCACTTCAAAGATTACTCATGAACAAGCTGTTTCACTTGGTATCCCT
TTATCAGATCTGAATAAACATCCTATTGTTGATTTAGCTATTGATGGTGCTGATGAAGTT
GACCCTCAAATGAATTTGGTTAAAGGGAGAGGAGGGTCATTGCTTAGGGAGAAAATGGTT
GAGGCTGCTACTAAGAAGTTTATTGTTATTGTTGATGAGTCAAAATTGGTGAATTACATA
GGTGGTAGTGGACTTGCTATGCCTGTTGAGATTGTTCCCTTTTGTTGGGAGTTTACATTG
AAGAGGCTTGAGATGTTGTTTATTGAAGCTGGATGTGTTGGAAAGTTGAGAACAACAGGT
GGAGGTGGAGATGAAGAGCCTTATGTTACTGATAATGGTAATTATATTATTGATTTGTAT
TTCAAGAAGGATATGGGTGATTTGAAAGATGCAAGTGATGCAATTTTGAGACTTGCTGGT
GTTGTTGAGCATGGCATGTTTATTGATATGGCTACTACTGTGATTGTTGCTGGAAAACTT
GGTGTCTCTGTGACTAATAAGTTATAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc05g008370.1.1
PEP Infomation

Ribose-5-phosphate isomerase-like protein (AHRD V3.3 *** T2DNB2_PHAVU)
Sequence

MAVAYPQFFGTKKVDTSLMVSSSSSVSPVILSQDELKKIAAYKAVEFVESGMVVGLGTGS
TAKHAVDKIAELLHSGKLKNIVGIPTSKITHEQAVSLGIPLSDLNKHPIVDLAIDGADEV
DPQMNLVKGRGGSLLREKMVEAATKKFIVIVDESKLVNYIGGSGLAMPVEIVPFCWEFTL
KRLEMLFIEAGCVGKLRTTGGGGDEEPYVTDNGNYIIDLYFKKDMGDLKDASDAILRLAG
VVEHGMFIDMATTVIVAGKLGVSVTNKL*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc05g008370.1.1
Transcript Infomation

Ribose-5-phosphate isomerase-like protein (AHRD V3.3 *** T2DNB2_PHAVU)
Sequence

ATGGCTGTTGCATACCCTCAATTTTTTGGGACAAAGAAAGTTGACACTTCATTGATGGTG
TCATCATCTTCCTCTGTTTCCCCTGTTATTTTATCTCAAGATGAGTTGAAAAAGATAGCT
GCTTATAAAGCTGTGGAGTTTGTGGAGTCTGGTATGGTTGTTGGTTTAGGTACAGGGTCA
ACAGCAAAGCATGCTGTTGATAAAATAGCTGAGCTTTTACATAGTGGTAAGTTAAAGAAC
ATTGTAGGGATTCCCACTTCAAAGATTACTCATGAACAAGCTGTTTCACTTGGTATCCCT
TTATCAGATCTGAATAAACATCCTATTGTTGATTTAGCTATTGATGGTGCTGATGAAGTT
GACCCTCAAATGAATTTGGTTAAAGGGAGAGGAGGGTCATTGCTTAGGGAGAAAATGGTT
GAGGCTGCTACTAAGAAGTTTATTGTTATTGTTGATGAGTCAAAATTGGTGAATTACATA
GGTGGTAGTGGACTTGCTATGCCTGTTGAGATTGTTCCCTTTTGTTGGGAGTTTACATTG
AAGAGGCTTGAGATGTTGTTTATTGAAGCTGGATGTGTTGGAAAGTTGAGAACAACAGGT
GGAGGTGGAGATGAAGAGCCTTATGTTACTGATAATGGTAATTATATTATTGATTTGTAT
TTCAAGAAGGATATGGGTGATTTGAAAGATGCAAGTGATGCAATTTTGAGACTTGCTGGT
GTTGTTGAGCATGGCATGTTTATTGATATGGCTACTACTGTGATTGTTGCTGGAAAACTT
GGTGTCTCTGTGACTAATAAGTTATAG