Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc05g007770.3.1
CDS Infomation	NAC domain TF
Sequence	ATGGTTGGAAAAATTAGCTCTGATCTTCCTCCTGGATTTAGGTTTCATCCAACAGATGAG GAATTAATCATGTACTATCTTCGATATCAAGCTACTTCAAGGCCATGCCCTGTCTCAATT ATCCCCGAAATTGATGTCTACAAGTTCGATCCCTGGGTATTACCTGAAAAGGCAGAATTT GGAGACAATGAGTGGTATTTTTTTACCCCTAGAGATAGAAAATATCCAAATGGTGTTAGG CCAAATAGAGCAGCTGTGTCAGGTTATTGGAAGGCTACTGGCACTGATAAAGCAATTTAT AGTGCAAATAAATATGTTGGAATTAAAAAAGCACTTGTTTTTTACAAAGGCAAACCACCA AAAGGTGTCAAGACTGATTGGATCATGCATGAATATCGTTTGAGTGATTCAAAGTCTCAA ACATCTAAGCAAAGTGGATCTATGAGGTTAGATGATTGGGTACTATGTAGAATTTATAAG AAGAAAAATTTGGGGAGAACTATAGAGATGATGAAAGTTGAAGAAGAAGAATTAGAGGCA CAAAATGTGAGTACTACAAATAATGAAATTGAAGTTGTTGGTGGACCACAAACAATGAAA TTACCAAGAATTTGTTCATTGTCACATCTATTGGAATTGGATTATTTTGGATCAATTCCA CAATTACTAAGTGACAATTTATTATATGATGACCAAGGTTACACAATGAATAATGTGAAT AACACAAGTAATGTGGATCAAGTATCATCACAACAACAAAATACAAATAATATTACAAGC AATAATTGTAATATTTTCTTCAATTATCAACAACCACTTTTTGTGAATCCAACATTTCAA TCTCAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc05g007770.3.1
PEP Infomation	NAC domain TF
Sequence	MVGKISSDLPPGFRFHPTDEELIMYYLRYQATSRPCPVSIIPEIDVYKFDPWVLPEKAEF GDNEWYFFTPRDRKYPNGVRPNRAAVSGYWKATGTDKAIYSANKYVGIKKALVFYKGKPP KGVKTDWIMHEYRLSDSKSQTSKQSGSMRLDDWVLCRIYKKKNLGRTIEMMKVEEEELEA QNVSTTNNEIEVVGGPQTMKLPRICSLSHLLELDYFGSIPQLLSDNLLYDDQGYTMNNVN NTSNVDQVSSQQQNTNNITSNNCNIFFNYQQPLFVNPTFQSQ*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc05g007770.3.1
Transcript Infomation	NAC domain TF
Sequence	TATACTCATACTAGGTATGCAGGTCAAAAAAAAATAATCAAAATATGACAAAATTTTTAA ACCTCCAACAATTATAAATTGGGCAGCCTTCTCCTTGCAAACATTTCAAACACTCACACT TCTCATTTTCCTCCCTATAGAATTAAAAAAAAAAAAACTAAAATTTCATTTTCTCTCAAT TTCCTTGCTTTTGTTTAAAAAAAACAAAGAAAAAGAAGAATTGTTCCATTTTATTTATTT CTATATTTTTGTATAAAATGGTTGGAAAAATTAGCTCTGATCTTCCTCCTGGATTTAGGT TTCATCCAACAGATGAGGAATTAATCATGTACTATCTTCGATATCAAGCTACTTCAAGGC CATGCCCTGTCTCAATTATCCCCGAAATTGATGTCTACAAGTTCGATCCCTGGGTATTAC CTGAAAAGGCAGAATTTGGAGACAATGAGTGGTATTTTTTTACCCCTAGAGATAGAAAAT ATCCAAATGGTGTTAGGCCAAATAGAGCAGCTGTGTCAGGTTATTGGAAGGCTACTGGCA CTGATAAAGCAATTTATAGTGCAAATAAATATGTTGGAATTAAAAAAGCACTTGTTTTTT ACAAAGGCAAACCACCAAAAGGTGTCAAGACTGATTGGATCATGCATGAATATCGTTTGA GTGATTCAAAGTCTCAAACATCTAAGCAAAGTGGATCTATGAGGTTAGATGATTGGGTAC TATGTAGAATTTATAAGAAGAAAAATTTGGGGAGAACTATAGAGATGATGAAAGTTGAAG AAGAAGAATTAGAGGCACAAAATGTGAGTACTACAAATAATGAAATTGAAGTTGTTGGTG GACCACAAACAATGAAATTACCAAGAATTTGTTCATTGTCACATCTATTGGAATTGGATT ATTTTGGATCAATTCCACAATTACTAAGTGACAATTTATTATATGATGACCAAGGTTACA CAATGAATAATGTGAATAACACAAGTAATGTGGATCAAGTATCATCACAACAACAAAATA CAAATAATATTACAAGCAATAATTGTAATATTTTCTTCAATTATCAACAACCACTTTTTG TGAATCCAACATTTCAATCTCAGTGATGATCAATAGCGGAGACAGAATTTTCATCAAGAA TCTTCTAAATAGATTCTCAGTTATATCAAAGGGGTTCAATATGTAGATAATTATATATAA AATATTTTTTCAACGAAGAGGTTCATGGCCGGGTGAAAATATATTTATATGAAGGCTATT GGATGAAAAGGTGACATCAAAAGTTTATGACAACAATTGTAAAATATAATCAAATGTTAT GTCATTAGTATTATTAGCAACAAACCTTGTAGTAGGGCAACAAATTGTTGTTGTATTATT TTAGAATTTAGTTTCTCAGTTTGTATTTGGAAAAAAAAAACTAATTTACTTTGTGAAATT TTAATAAATATTTTTCAGTATTCTATCTTTGATTTTTTTTAAAAAAAATTCTACAATGAA ATGTCAATAATTTTACTATTCAATTTTCTTTTCTTTGGTTTTTTGTCTTCTGATTAGTAG CATAAGGATAGTTTACATTAATGAATTACCTAATTTATTAGTATTATTTTTGAAGGAGAC TTATTTTTTAAAAGTTAATTATGTGATGTAAATCCGCGTAGAAAAATTAATCATACTCCT AAGTAAGACTTTTCGAATAATATTCAAAATCGAATCGAATTATCCAATTGGTTCATTAGT AAATATTTTTATTAGATTAAGAATTAATTAATATTTATCATTAAAAAATTACATGAATTA TCTCTTAGCTAACTTAAGTGTGATACTTTTTGTATGATTATCCCTACCTAACTTAAATTC ATATTGAAGTTAATGAATATAATAATCAAGGAAATGAGAGACCAATTTTAAAAAATTAAA AAATTCCACATAAATGAGGAAAATAGAACAAAGCAATAAGAAGAGCATATATCACCACTA GAAAAAAAAAAAAGCTACTTTTTTATTGAAAAATA